单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 38102 篇文献，本页显示第 741 - 760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 741 | 2026-03-28 |
Integrating Microscopy Methods to Study Gene and Protein Expression alongside Metal Ion Distribution and Speciation: A Case Study of Iron within Pyramidal Neurons from Distinct Hippocampal CA1 Subregions
2026-Mar-23, Chemical & biomedical imaging
DOI:10.1021/cbmi.5c00059
PMID:41889472
|
研究论文 | 本文通过整合四种显微镜和生物分析技术，研究了海马CA1区不同亚区域中锥体神经元内铁离子的分布、氧化状态、储存蛋白表达及基因表达通路，以揭示其与神经退行性疾病易感性的关联 | 首次将X射线荧光显微镜、XANES光谱、免疫荧光和空间转录组学四种技术整合应用于海马CA1区铁代谢组学的空间解析研究，揭示了该区域内侧与外侧神经元在铁代谢和氧化环境上的关键差异 | 研究仅聚焦于海马CA1区，样本范围有限，且为案例研究，结果可能需要更大规模验证 | 探究大脑特定区域（海马CA1区）内铁离子的分布、化学形态及其与神经退行性疾病易感性的关系 | 海马CA1区（cornu ammonis sector 1）的锥体神经元，特别是其内侧和外侧亚区域 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | X射线荧光显微镜，X射线吸收近边结构光谱，免疫荧光，空间转录组学 | NA | 图像，光谱数据，基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 742 | 2026-03-28 |
Single-cell spatial multi-omics molecular pathology enabled by SuperFocus
2026-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.26.696575
PMID:41890079
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SuperFocus的计算平台，用于实现单细胞空间多组学分子病理学，通过整合组织病理学图像与基因组尺度分子信息 | SuperFocus是一个模态无关的计算平台，无需外部参考数据，通过约束级联插补和质控评分，在空间转录组学基准数据集上比现有方法提高关键准确度指标28-73% | 未在摘要中明确提及具体限制，可能依赖于点基空间测量数据的质量 | 开发下一代分子病理学技术，实现全组织切片单细胞分辨率下的空间多组学分析 | 包括MALT淋巴瘤微环境、人海马体基因调控程序、人MASH中的脂毒性肝细胞状态，以及帕金森病小鼠脑中的转录组-代谢组状态 | 数字病理学 | 淋巴瘤、神经退行性疾病、代谢相关脂肪性肝炎 | 空间转录组学、空间ATAC-RNA、空间CITE-seq、Visium-MALDI-MSI | 约束级联插补模型 | 空间多组学数据、组织病理学图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学、单细胞多组学 | Visium | Visium-MALDI-MSI (SMA) 数据集 |
| 743 | 2026-03-28 |
Protocol to evaluate mouse brain spatial cell type-resolved transcriptomic discoveries using 10× Visium spatial transcriptomics and FLEX scRNA-seq
2026-Mar-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104277
PMID:41456279
|
研究论文 | 本文介绍了一种结合10× Genomics Visium空间转录组学和FLEX单细胞RNA测序技术，用于研究小鼠脑组织中空间区域基因表达和细胞间信号变化的实验方案 | 整合了空间转录组学和单细胞RNA测序技术，提供了一种系统性的实验方案来解析小鼠脑组织在疾病状态下的空间分子特征 | NA | 研究疾病组织中空间区域基因表达和细胞间信号的变化机制 | 小鼠脑组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | 10x Visium, 10x FLEX | 10× Genomics Visium空间转录组学和10× Genomics FLEX单细胞RNA测序 |
| 744 | 2026-03-28 |
Protocol for dual spatial transcriptomic profiling of infected tissues
2026-Mar-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104282
PMID:41538322
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于感染组织的双重空间转录组学分析协议，旨在分析宿主和病原体的转录模式 | 开发了一种双重空间转录组学分析协议，能够同时分析宿主和病原体的转录模式，并建立病理适应特征以预测感染结果 | 协议的具体应用效果和局限性未在摘要中详细说明，需参考原始文献 | 建立感染组织中宿主和病原体转录模式的分析方法 | 感染组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 745 | 2026-03-28 |
Protocol for the generation of a human-derived nasal epithelial model and induction of tissue-resident memory-like T cells in a co-culture system
2026-Mar-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104401
PMID:41758640
|
研究论文 | 本文介绍了一种生成人源性鼻上皮模型并在共培养系统中诱导组织驻留记忆样T细胞的实验方案 | 开发了一种体外模型系统，用于研究人源性组织驻留记忆T细胞（TRMs），通过共培养诱导TRM样T细胞 | NA | 研究人源性组织驻留记忆T细胞（TRMs）的诱导和分析方法 | 人源性鼻上皮模型和自体免疫细胞 | NA | NA | 流式细胞术、单细胞RNA测序、细胞因子释放分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 746 | 2026-03-28 |
Insights into tick-pathogen interactions - a single cell RNA sequencing approach of transcriptional changes during ehrlichial infection
2026-Mar-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.19.712879
PMID:41889848
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了蜱胚胎细胞系ISE6在埃里希体感染期间的转录变化，揭示了细胞异质性和时间依赖性基因表达模式 | 首次应用单细胞RNA测序于蜱细胞系，识别出15个细胞簇并揭示感染早期与晚期的差异转录响应 | ISE6细胞转录组与已知蜱组织缺乏相似性，可能限制其作为体内模型的直接适用性 | 探究蜱-病原体相互作用机制，特别是埃里希体感染过程中的细胞响应 | 黑腿蜱胚胎细胞系ISE6及埃里希体病原体 | 单细胞组学 | 蜱传疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，基于ISE6细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 747 | 2026-03-28 |
Transcriptional landscape of CD4+ T cells in Systemic Sclerosis
2026-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.03.697349
PMID:41889800
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术深入表征了系统性硬化症患者中CD4+ T细胞的亚群，揭示了疾病相关的转录组特征和细胞状态变化 | 采用新颖的单细胞RNA测序方法，首次全面描绘了系统性硬化症中CD4+ T细胞的转录景观，并结合TCR库分析，提供了前所未有的疾病细胞和分子机制见解 | 样本量相对较小（8名患者和8名健康对照），可能限制结果的普适性；研究主要关注CD4+ T细胞，未涵盖其他免疫细胞类型 | 探究系统性硬化症中CD4+ T细胞的转录组特征和亚群变化，以揭示疾病的细胞和分子基础 | 系统性硬化症患者和健康对照者的CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 超过80,000个CD4+ T细胞，来自8名系统性硬化症患者和8名健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 748 | 2026-03-28 |
Patches: A Representation Learning Framework for Decoding Shared and Condition-Specific Transcriptional Programs in Wound Healing
2026-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.23.630186
PMID:41889850
|
研究论文 | 本文提出了一个名为Patches的表示学习框架，用于解码伤口愈合过程中共享和条件特异性的转录程序 | 开发了条件子空间学习方法，能够同时解析共享和条件特异性转录模式，特别适用于具有缺失数据、不匹配细胞群或复杂属性组合的实验设计 | 未明确说明框架的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性限制 | 解码伤口愈合过程中共享和条件特异性的转录程序 | 皮肤损伤模型中的单细胞转录组数据 | 计算生物学 | 伤口愈合 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 条件子空间学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 749 | 2026-03-28 |
Diverse high-fat diets drive multi-omic reprogramming that persists after dietary reversal
2026-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.708620
PMID:41889866
|
研究论文 | 本研究通过纵向多组学分析，揭示了不同高脂饮食对宿主生理和肠道微生物组的长期影响，以及饮食逆转后部分变化的持续性 | 首次系统比较了七种不同脂肪来源的高脂饮食的长期效应，并揭示了饮食逆转后微生物组和宿主基因表达的持久性变化（“微生物组记忆”效应） | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证；研究窗口期可能不足以观察所有变化的完全恢复 | 探究不同脂肪来源的高脂饮食对宿主-微生物组互作组的长期影响及饮食逆转后的恢复程度 | 小鼠（包括不同基线微生物组结构的队列） | 微生物组学 | 代谢性疾病 | 粪便宏基因组学、粪便代谢组学、血浆代谢组学、脂质组学、肠道单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据（基因组、代谢组、转录组） | 长期饲养一年的小鼠队列，包括对照组、七种高脂饮食组及饮食逆转组 | NA | 单细胞RNA测序, 宏基因组测序, 代谢组学, 脂质组学 | NA | NA |
| 750 | 2026-03-28 |
STiLE: Automated Tissue Microarray Dearraying for Spatial Transcriptomics
2026-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.712359
PMID:41890059
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为STiLE的工具，用于自动化组织微阵列（TMA）的去阵列化，该工具仅基于细胞质心坐标操作，无需依赖组织学图像 | STiLE是首个仅基于细胞质心坐标进行TMA去阵列化的工具，消除了对图像数据的依赖，从而对染色质量不均和光照不均等伪影具有鲁棒性 | NA | 开发一种自动化工具，用于空间转录组学中组织微阵列的去阵列化，以克服现有方法依赖图像数据且不支持坐标输出的瓶颈 | 组织微阵列（TMA）样本中的细胞质心坐标 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 基于连通性的组件检测、基于密度的聚类（HDBSCAN）、组件引导的聚类合并、可选的基于网格的峰值检测 | 细胞质心坐标 | 11个公共TMA样本（50-150个核心）和396个合成数据集 | Vizgen, 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学 | Vizgen MERSCOPE, 10x Xenium, NanoString CosMx | 支持多种空间转录组学平台，包括Vizgen MERSCOPE、10x Xenium和NanoString CosMx |
| 751 | 2026-03-28 |
Single-cell-based identification of drug synergy with immunotherapy via tumor microenvironment remodeling
2026-Mar-18, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014132
PMID:41850739
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和L1000平台筛选，建立了一个评估肿瘤微环境重塑的框架，并识别出增强免疫疗法疗效的药物组合 | 开发了一个基于单细胞RNA测序的免疫调节药物资源库和MP评分算法，首次系统性地量化肿瘤微环境对治疗干预的响应，并发现痛风药物别嘌醇能显著增强抗PD-1疗法的效果 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证；样本量相对有限，可能影响结果的普适性 | 识别在复杂肿瘤微环境中有效的治疗药物，特别是通过重塑肿瘤微环境来增强免疫疗法疗效的药物协同作用 | 肿瘤微环境中的细胞类型，包括髓源性抑制细胞等免疫细胞，以及739种免疫调节化合物 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，L1000平台筛选 | MP评分算法 | 单细胞RNA测序数据 | 涉及多种癌症的小鼠模型，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 752 | 2026-03-28 |
Spatial remodeling of the tumor immune microenvironment in hepatocellular carcinoma with cirrhosis driven by Treg-CD8⁺T cell crosstalk via the SPP1-ITGA4 axis
2026-Mar-18, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102734
PMID:41855857
|
研究论文 | 本研究系统比较了伴有肝硬化与不伴有肝硬化的肝细胞癌肿瘤免疫微环境的细胞组成、空间结构及免疫调节相互作用 | 揭示了肝硬化背景下肝细胞癌特有的免疫抑制微环境空间重构模式，首次提出Treg-CD8⁺T细胞通过SPP1-ITGA4信号轴进行空间交互的新机制 | 研究主要基于HBV阳性病例，结论在其他病因肝细胞癌中的普适性有待验证；空间分析样本量相对有限 | 阐明肝硬化背景如何重塑肝细胞癌肿瘤免疫微环境的空间结构和功能 | 肝细胞癌患者肿瘤组织（伴有肝硬化 vs 不伴有肝硬化） | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组分析，单细胞RNA测序 | 空间分析模型 | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 278例HBV阳性病例，共绘制2,837,999个细胞 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 753 | 2026-03-28 |
Subcellular transcriptome sequencing with single cell APEX-seq identifies regulators of cell-cell interactions
2026-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.712496
PMID:41889815
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为单细胞APEX-seq的新方法，用于在单细胞分辨率下绘制亚细胞转录组图谱，并应用于肿瘤-巨噬细胞和CAR T细胞共培养系统，以揭示细胞间相互作用的调控因子 | 开发了基于邻近标记的单细胞APEX-seq方法，首次实现了亚细胞转录组在单细胞水平的高通量映射，特别富集了传统scRNA-seq难以解析的细胞表面和分泌转录本 | 方法主要针对内质网相关转录本，可能未覆盖其他亚细胞区域的RNA；应用场景目前局限于共培养系统，在体内复杂组织中的验证尚需进一步研究 | 开发并应用一种新方法来研究亚细胞RNA定位及其在细胞间相互作用调控中的作用 | 肿瘤细胞、巨噬细胞、人类CAR T细胞及其共培养系统 | 单细胞组学 | 癌症 | 邻近标记、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 数千个单个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基于液滴的单细胞RNA测序平台 |
| 754 | 2026-03-28 |
A Rare T-Cell Factor 4 Lineage-negative Epithelial Stem Cell Supports Wound Repair and APC-deletion-induced Colon Tumorigenesis
2026-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.712502
PMID:41889847
|
研究论文 | 本研究通过小鼠谱系追踪、免疫组化和单细胞测序，鉴定出一种罕见的非CBC、Tcf4谱系阴性（Tcf4 Lin-）上皮干细胞群，该细胞群在伤口修复和APC缺失诱导的结肠肿瘤发生中发挥关键作用 | 首次发现并表征了一种罕见的Tcf4谱系阴性结肠上皮干细胞群，揭示了其在损伤修复和肿瘤发生中的独特功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类中的相关性尚需进一步验证 | 探索结肠上皮干细胞在组织稳态维持和肿瘤发生中的作用机制 | 小鼠结肠上皮细胞，特别是Tcf4 Lin-干细胞群 | 单细胞生物学 | 结肠肿瘤 | 谱系追踪，免疫组化，单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据，组织图像数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 755 | 2026-03-28 |
Binary-SPA: A Reference-Free Method for Cell Annotation in High-Resolution Spatial Transcriptomics
2026-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.712369
PMID:41889971
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Binary-SPA的计算框架，用于高分辨率空间转录组学数据的细胞类型注释，无需依赖外部参考数据集 | 开发了一种两阶段注释方法，结合二进制分类和基于锚点的标签转移，实现了无参考的高精度细胞注释 | 未明确提及方法在极低表达或高度异质性样本中的性能限制 | 解决高分辨率空间转录组学中细胞类型注释的挑战 | 高分辨率空间转录组学数据中的细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 二进制分类模型 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 756 | 2026-03-28 |
PalmaClust: A graph-fusion framework leveraging the Palma ratio for robust ultra-rare cell type detection in scRNA-seq data
2026-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.16.712161
PMID:41890078
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为PalmaClust的图融合聚类框架，用于在单细胞RNA测序数据中稳健地检测超罕见细胞类型 | PalmaClust创新性地将社会学中的尾敏感不平等度量指标Palma比率重新用于识别由极端稀疏性驱动的标记基因，并通过融合多个基于互补基因选择统计量构建的KNN图来提高检测性能 | NA | 开发一种可扩展且统计基础扎实的方法，以灵敏地检测罕见细胞群体，同时提供校准的置信度和可解释的分子特征 | 单细胞RNA测序数据中的罕见细胞群体，如瞬时祖细胞、耐药肿瘤亚克隆和抗原特异性淋巴细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 图融合聚类框架 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 757 | 2026-03-28 |
Tetrastigma hemsleyanum alleviates febrile seizures by inhibiting HSPB1/Akt/NF-κB signaling via small extracellular vesicle-mediated astrocyte-microglia crosstalk
2026-Mar-17, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158087
PMID:41886953
|
研究论文 | 本研究探讨了三叶崖爬藤总黄酮通过抑制HSPB1/Akt/NF-κB信号通路缓解热性惊厥的机制，涉及星形胶质细胞与小胶质细胞通过小细胞外囊泡的交互作用 | 首次揭示热性惊厥中星形胶质细胞通过释放小细胞外囊泡激活小胶质细胞HSPB1/Akt/NF-κB信号通路的机制，并鉴定儿茶素为三叶崖爬藤总黄酮的主要活性成分 | 研究主要基于大鼠模型和体外实验，人类临床验证尚未进行，且小细胞外囊泡的具体作用机制需进一步阐明 | 探究三叶崖爬藤总黄酮缓解热性惊厥的分子机制 | 热性惊厥大鼠模型、星形胶质细胞、小胶质细胞 | 神经科学 | 热性惊厥 | 单细胞RNA测序、小细胞外囊泡测序、Transwell共培养实验 | 动物模型（大鼠）、细胞共培养模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 未明确具体样本数量，但涉及大鼠模型和细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序、小细胞外囊泡测序 | NA | NA |
| 758 | 2026-03-28 |
Preferential formation of NUP98-KDM5A condensates at specific H3K4me3-rich loci drives leukemogenic gene expression
2026-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.16.712262
PMID:41889846
|
研究论文 | 本研究揭示了NUP98-KDM5A融合蛋白通过结合高密度H3K4me3区域形成凝胶状凝聚体，从而特异性驱动白血病基因表达的机制 | 首次阐明了染色质修饰（H3K4me3）与相分离凝聚体形成之间的定量靶向机制，解释了融合蛋白在广泛H3K4me3存在下仍能特异性靶向白血病基因簇的原理 | 研究主要基于NUP98-KDM5A模型，其他NUP98融合蛋白的机制可能不同；患者单细胞数据为相关性分析，因果机制需进一步验证 | 探究NUP98融合蛋白的基因靶向和凝聚体形成机制 | NUP98-KDM5A融合蛋白及其在白血病发生中的作用 | 表观遗传学 | 白血病 | 细胞成像、基因组分析、单细胞测序 | NA | 成像数据、基因组数据、单细胞测序数据 | 患者单细胞测序数据（未明确具体数量） | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 759 | 2026-03-28 |
Cell-type-specific transposon demethylation and TAD remodeling in aging mouse brain
2026-Mar-11, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2026.02.015
PMID:41819104
|
研究论文 | 本研究通过生成小鼠大脑衰老的单细胞表观基因组图谱，揭示了细胞类型特异的转座子去甲基化和染色质构象变化 | 整合了单细胞甲基组、染色质构象、转录组和染色质可及性数据，构建了跨模态细胞分类，并开发了基于深度学习模型预测衰老相关基因表达变化 | 使用2月龄小鼠作为基线，可能无法完全反映更早或更晚生命阶段的衰老过程 | 探究大脑衰老的表观遗传机制，特别是转座子甲基化和染色质构象变化 | 小鼠大脑多个区域的细胞 | 表观遗传学 | 神经退行性疾病 | 单细胞甲基组测序、染色质构象分析、空间转录组学 | 深度学习模型 | 甲基组数据、染色质构象数据、转录组数据、染色质可及性数据 | 132,551个单细胞甲基组和72,666个联合染色质构象-甲基组细胞核，以及895,296个细胞的空间转录组数据 | NA | 单细胞甲基组测序、染色质构象分析、空间转录组学 | NA | NA |
| 760 | 2026-03-28 |
SR2P: an efficient stacking method to predict protein abundance from gene expression in spatial transcriptomics data
2026-Mar-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.04.709692
PMID:41846960
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于堆叠的机器学习框架SR2P，用于从空间转录组学数据中的基因表达预测蛋白质丰度 | SR2P通过整合11种互补的预测模型，在多个空间多组学基准测试中持续优于现有方法，能够从仅含RNA的空间数据中推断蛋白质丰度 | 技术及成本限制仍是空间多组学分析的障碍，且蛋白质-RNA丰度在关键免疫细胞表面标记物中存在不一致性 | 预测空间转录组学数据中的蛋白质丰度，以扩展当前空间平台在肿瘤免疫学研究中的分析能力 | 头颈部鳞状细胞癌患者的空间转录组学数据 | 机器学习 | 头颈部鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | 堆叠机器学习框架 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |