单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 741 - 760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 741 | 2025-04-21 |
PRC1 as an independent adverse prognostic factor in Wilms tumor via integrated bioinformatics and experimental validation
2025-Apr-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-98030-y
PMID:40247060
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学和实验验证方法，探讨了PRC1在Wilms肿瘤中的关键预后因素作用及其机制 | 首次将PRC1确定为Wilms肿瘤的独立不良预后因素，并通过多组学分析揭示了其在肿瘤进展中的多重作用机制 | 研究主要基于体外细胞实验和生物信息学分析，缺乏体内动物模型验证 | 探索PRC1在Wilms肿瘤中的预后价值和分子机制 | Wilms肿瘤患者样本和WIT-49细胞系 | 肿瘤生物学 | Wilms肿瘤 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、功能富集分析(GO/KEGG/GSEA)、免疫分析、体外敲低实验 | NA | 基因表达数据、单细胞数据、基因组数据 | 来自TARGET数据库的批量RNA-seq数据和GSE200256单细胞数据集 |
| 742 | 2025-04-21 |
Dynamic evolution and antitumor mechanisms of CXCR6+CD8+ T cells in small cell lung cancer treated with low-dose radiotherapy and immunotherapy
2025-Apr-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06450-1
PMID:40247265
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research paper | 本研究探讨了低剂量放疗联合免疫治疗对小细胞肺癌中CXCR6+CD8+ T细胞的动态演变及抗肿瘤机制的影响 | 揭示了干细胞样T细胞从肿瘤引流淋巴结迁移至肿瘤部位并分化为效应表型的过程，以及树突状细胞在T细胞分化中的关键作用 | 研究结果仍需通过更大规模的临床队列验证，且具体分子机制有待进一步阐明 | 阐明低剂量放疗联合免疫治疗促进CD8+ T细胞肿瘤内浸润及其细胞毒功能增强的机制 | 小细胞肺癌患者及Kaede荷瘤小鼠 | 肿瘤免疫学 | 小细胞肺癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、免疫荧光 | Kaede荷瘤小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、临床队列数据 | 未明确说明患者数量，使用Kaede荷瘤小鼠模型 |
| 743 | 2025-04-21 |
High-fat diet alters retinal lipid composition and gene expression networks in mice
2025-Apr-17, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02212-z
PMID:40247316
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了高脂饮食（HFD）如何通过改变视网膜脂质组成和基因表达网络影响视网膜疾病的发展 | 首次在高脂饮食模型中，通过单细胞转录组测序在单细胞分辨率上研究了HFD对视网膜不同细胞类型的影响，并揭示了胆汁酸合成途径的异常激活在视网膜脂质代谢中的关键作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，结果是否适用于人类仍需进一步验证 | 探究高脂饮食对视网膜脂质代谢和基因表达网络的影响及其与视网膜疾病的关联 | 高脂饮食喂养的小鼠视网膜组织 | 生物医学 | 视网膜疾病（包括年龄相关性黄斑变性、青光眼和糖尿病视网膜病变） | 单细胞转录组测序、脂质组学、蛋白质组学 | 小鼠高脂饮食模型 | 脂质组数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | 高脂饮食喂养6个月的小鼠视网膜组织 |
| 744 | 2025-04-21 |
Bulk RNA-seq conjoined with ScRNA-seq analysis reveals the molecular characteristics of nucleus pulposus cell ferroptosis in rat aging intervertebral discs
2025-Apr-17, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-025-03550-7
PMID:40247370
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research paper | 该研究通过批量RNA-seq和单细胞RNA-seq分析，揭示了大鼠衰老椎间盘中髓核细胞铁死亡的分子特征 | 首次定义了铁死亡的关键驱动因素和铁死亡髓核细胞亚群的特征，并发现ATF3是铁死亡的关键驱动因子，Rps6 +/Cxcl1-是铁死亡髓核细胞亚群的共同分子特征 | 研究仅在大鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证 | 探究髓核细胞铁死亡在椎间盘退变(IDD)中的分子特征和机制 | 大鼠尾椎间盘的髓核细胞 | 分子生物学 | 椎间盘退变 | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq (ScRNA-seq), Prussian blue染色, C11-BODIPY荧光探针, 4-HNE染色 | NA | RNA-seq数据 | 10个月和20个月大的大鼠髓核组织 |
| 745 | 2025-04-21 |
High-throughput drug screening identifies SMAC mimetics as enhancers of NK-cell cytotoxicity in chronic myeloid leukemia
2025-Apr-10, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024025286
PMID:39792962
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研究论文 | 通过高通量药物筛选发现SMAC模拟物能增强NK细胞在慢性髓性白血病中的细胞毒性 | 首次系统性评估了500多种小分子化合物对NK细胞功能的影响，并发现SMAC模拟物能显著增强NK细胞对CML细胞的杀伤作用 | 研究主要基于体外实验，需要进一步的体内实验验证 | 探索增强NK细胞免疫疗法效果的药物 | NK细胞和慢性髓性白血病细胞 | 免疫治疗 | 慢性髓性白血病 | 高通量药物筛选、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 细胞系和原代患者样本 |
| 746 | 2025-04-21 |
Elevated Serum and Urinary Secreted Protein Acidic and Rich in Cysteine Levels are Novel Biomarkers of Kidney Fibrosis Severity
2025-Apr, Archives of medical research
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.arcmed.2024.103125
PMID:39612526
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research paper | 该研究探讨了血清和尿液中SPARC水平作为肾脏纤维化严重程度的新型生物标志物的诊断价值 | 首次发现血清和尿液中的SPARC水平与肾脏纤维化严重程度相关，并验证了其作为非侵入性诊断标志物的潜力 | 研究样本仅包括CKD患者，未在其他肾脏疾病中验证SPARC的诊断价值 | 探索SPARC在肾脏纤维化中的诊断价值 | 674名接受肾活检的CKD患者及肾脏纤维化的体内外模型 | 生物标志物研究 | 慢性肾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 血清和尿液样本数据 | 674名CKD患者（训练队列322人，验证队列352人） |
| 747 | 2025-04-21 |
Immune pathogenic response landscape of acute posterior multifocal placoid pigment epitheliopathy revealed by scRNA sequencing
2025-Apr, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-024-00316-0
PMID:39774261
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示急性后部多灶性鳞状色素上皮病变（APMPPE）的免疫致病反应图谱 | 首次使用单细胞RNA测序技术对APMPPE患者的外周血单核细胞（PBMCs）进行综合分析，揭示了单核细胞的转录变化及其亚群，并识别出IFITM3在APMPPE发病机制中的关键作用 | 研究仅基于一名APMPPE患者的数据，样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探究APMPPE的免疫致病机制 | APMPPE患者的外周血单核细胞（PBMCs） | 生物医学研究 | 急性后部多灶性鳞状色素上皮病变（APMPPE） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 1名APMPPE患者 |
| 748 | 2025-04-21 |
Asherman syndrome at single-cell resolution
2025-Apr, American journal of obstetrics and gynecology
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.ajog.2024.12.023
PMID:40253078
|
综述 | 本文全面回顾了Asherman综合征的历史背景、临床表现、分类、产科挑战及当前治疗方法 | 探讨了单细胞RNA测序技术在揭示Asherman综合征分子机制中的潜力 | 现有治疗方法如宫腔镜粘连松解术仍面临粘连复发和产科并发症的挑战 | 深入了解Asherman综合征的病理机制并探索创新治疗策略 | Asherman综合征患者及其相关治疗方法 | 生殖医学 | Asherman综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 749 | 2025-04-21 |
Uterine fibroids at single-cell resolution: unveiling cellular heterogeneity to improve understanding of pathogenesis and guide future therapies
2025-Apr, American journal of obstetrics and gynecology
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.ajog.2024.08.037
PMID:40253076
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综述 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了子宫肌瘤的细胞异质性，以增进对其发病机制的理解并指导未来治疗 | 利用单细胞RNA测序技术首次详细描述了子宫肌瘤中平滑肌细胞和成纤维细胞的异质性，并发现了MED12突变肌瘤可能非单克隆性质的新证据 | 主要基于MED12突变型肌瘤的研究，对其他遗传突变型肌瘤的细胞异质性研究较少 | 深入理解子宫肌瘤的细胞和分子机制，为开发更有效的非侵入性治疗方案提供依据 | 子宫肌瘤组织和平滑肌组织 | 数字病理学 | 子宫肌瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫染色、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及MED12突变型肌瘤和正常肌层组织的比较研究 |
| 750 | 2025-04-21 |
"Thin endometrium" at single-cell resolution
2025-Apr, American journal of obstetrics and gynecology
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.ajog.2024.10.002
PMID:40253077
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综述 | 本文综述了薄型子宫内膜在单细胞分辨率下的研究进展，探讨了其细胞群、信号通路和细胞间通讯的关键变化 | 利用单细胞测序技术揭示了薄型子宫内膜在细胞水平上的加速衰老过程及其对子宫内膜容受性的影响 | 目前的研究仍处于基础研究阶段，尚未提出具体的临床治疗方案 | 探索薄型子宫内膜的潜在机制，为开发新的治疗方法提供理论基础 | 薄型子宫内膜与正常子宫内膜在晚增殖期的比较 | 生殖医学 | 不孕症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 751 | 2025-04-21 |
Single-cell omics technologies - Fundamentals on how to create single-cell looking glasses for reproductive health
2025-Apr, American journal of obstetrics and gynecology
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.ajog.2024.08.041
PMID:40253074
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综述 | 本文综述了单细胞组学技术在生殖健康研究中的最新应用及其潜力 | 探讨了单细胞技术在生殖医学中的创新应用，包括空间转录组学和高维蛋白质组成像 | 讨论了单细胞技术在数据分析方面的统计限制和计算挑战 | 提高对女性健康和生殖障碍的基本理解，并改变临床实践和患者预后 | 生殖道组织、妊娠及妊娠障碍、妇科恶性肿瘤、子宫和卵巢生理及衰老 | 单细胞组学 | 妇科疾病 | 单细胞测序、蛋白质组学、空间转录组学、高维蛋白质组成像 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | NA |
| 752 | 2025-04-21 |
Single-cell technology: the key to an improved understanding of the human endometrium in health and disease
2025-Apr, American journal of obstetrics and gynecology
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.ajog.2024.08.042
PMID:40253082
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综述 | 本文总结了利用单细胞RNA测序技术研究子宫内膜在月经周期中单细胞分辨率下的变化及其在健康和疾病中的作用 | 利用单细胞RNA测序技术揭示子宫内膜不同细胞类型在月经周期中的基因表达谱及细胞间复杂协作 | NA | 深入理解子宫内膜在月经周期中的细胞水平变化及其在病理条件下的差异 | 子宫内膜中的上皮细胞、基质细胞、内皮细胞和免疫细胞 | 单细胞测序 | 子宫内膜异位症、子宫内膜癌、Asherman综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 753 | 2025-04-21 |
TrimNN: Characterizing cellular community motifs for studying multicellular topological organization in complex tissues
2025-Jan-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5584635/v1
PMID:39877090
|
研究论文 | 介绍了一种名为TrimNN的图深度学习框架，用于识别和分析空间转录组学和蛋白质组学中的细胞群落基序 | 提出了一种自下而上的方法，通过可计数的拓扑块来区分细胞生态位，具有可解释性和普适性 | NA | 研究复杂组织中多细胞拓扑组织的协调规则 | 空间转录组学和蛋白质组学数据中的细胞群落基序 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学、蛋白质组学 | 图深度学习框架 | 空间组学数据 | NA |
| 754 | 2025-04-21 |
Interferon-γ Signaling in Eosinophilic Esophagitis Affects Epithelial Barrier Function and Programmed Cell Death
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101466
PMID:39884574
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了嗜酸性食管炎(EoE)中干扰素信号对上皮屏障功能和程序性细胞死亡的影响 | 首次在单细胞水平揭示了EoE患者上皮细胞中干扰素反应特征基因的差异表达，并明确了IFN-γ对上皮屏障功能的显著影响 | 研究主要基于体外器官模型，需要进一步在体实验验证 | 阐明干扰素信号在EoE发病机制中的作用 | 嗜酸性食管炎患者的上皮细胞和器官模型 | 单细胞组学 | 嗜酸性食管炎 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | 器官模型 | RNA测序数据 | 未明确说明样本数量 |
| 755 | 2025-04-20 |
Role of PRC2 in the stochastic expression of Aire target genes and development of mimetic cells in the thymus
2025-Jul-07, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20240817
PMID:40244172
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研究论文 | 本文通过多组学单细胞方法和深度单细胞RNA测序，研究了Aire如何控制多种基因在少量Aire表达细胞中的转录，并揭示了PRC2在Aire介导的随机基因表达和模拟细胞发育中的关键作用 | 揭示了PRC2在Aire介导的随机基因表达和模拟细胞发育中的独立且关键的作用 | 研究主要基于单细胞测序技术，可能未涵盖所有相关细胞类型或基因 | 理解Aire在胸腺上皮细胞中的耐受性功能及其基因表达调控机制 | 胸腺髓质上皮细胞（mTECs）和Aire靶基因 | 分子生物学 | NA | 多组学单细胞方法、深度单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量，但涉及少量Aire表达细胞 |
| 756 | 2025-04-20 |
Fast analysis of Spatial Transcriptomics (FaST): an ultra lightweight and fast pipeline for the analysis of high resolution spatial transcriptomics
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf044
PMID:40248491
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为FaST的超轻量快速分析管道，用于处理高分辨率空间转录组数据 | FaST管道能够在标准多核工作站上快速处理大量测序数据，且无需依赖H&E染色或其他成像程序指导细胞分割 | 尽管可以与成像引导的细胞分割软件集成，但当前版本主要依赖spateo-release包进行RNA分割 | 开发高效分析高分辨率空间转录组数据的计算工具 | 空间转录组数据集 | 生物信息学 | NA | 空间转录组测序 | NA | 测序数据 | 超过5亿条reads的数据集 |
| 757 | 2025-04-20 |
SciGeneX: enhancing transcriptional analysis through gene module detection in single-cell and spatial transcriptomics data
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf043
PMID:40248490
|
research paper | 介绍了一个名为SciGeneX的R包，用于通过基因模块检测增强单细胞和空间转录组数据的转录分析 | 提出了一种基于邻域分析和图分割方法生成共表达基因模块的新方法，能够揭示罕见和新颖的细胞群体 | NA | 增强单细胞和空间转录组数据的转录分析，以更准确地理解细胞异质性 | 单细胞RNA测序和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 图分割方法 | 转录组数据 | 人工和实验数据集，包括人类胸腺空间转录组数据 |
| 758 | 2025-04-20 |
Heterogeneity of the tumor immune cell microenvironment revealed by single-cell sequencing in head and neck cancer
2025-May, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.104677
PMID:40023465
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research paper | 该研究通过单细胞测序技术揭示头颈癌肿瘤免疫微环境中细胞的异质性 | 利用单细胞测序技术深入分析头颈癌肿瘤免疫微环境的异质性，为治疗靶点和预后因素提供新见解 | 未提及具体样本量或实验设计的详细限制 | 探讨头颈癌肿瘤免疫微环境异质性及其对疾病发生发展的影响 | 头颈癌患者的肿瘤免疫微环境细胞 | digital pathology | head and neck cancer | single-cell sequencing (SCS) | NA | gene expression data | NA |
| 759 | 2025-04-20 |
Comprehensive characterization of T cell subtypes in lung adenocarcinoma: Prognostic, predictive, and therapeutic implications
2025-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102332
PMID:40184717
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和机器学习算法，开发了一个与T细胞相关的预后标志物，用于预测肺腺癌患者的临床结果和免疫治疗反应 | 利用单细胞RNA测序和10种机器学习算法整合多个数据集，开发了一个新的预后标志物，并发现了CPA3基因在CD4+ T细胞中的重要作用 | 研究主要基于公共数据集，缺乏独立的前瞻性队列验证 | 开发肺腺癌的预后标志物并探索T细胞亚型在肿瘤免疫中的作用 | 肺腺癌患者和T细胞亚型 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习 | Lasso + PLSRcox | RNA测序数据 | 来自TCGA、GSE31210、GSE50081和GSE68465数据集的肺腺癌样本 |
| 760 | 2025-04-19 |
Single-Cell Transcriptomics Revealed E-Cigarettes-Induced Vascular Remodeling by Enhancing Tcf21 Expression
2025-May, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70183
PMID:40248042
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |