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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
741 2025-12-24
Hepatocyte cuproptosis promotes the progression of hepatic fibrosis: Emerging a potential therapeutic target
2025-Dec-21, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究揭示了肝细胞铜死亡在肝纤维化进展中的关键驱动作用,并发现单宁酸通过抑制铜死亡可改善肝纤维化 首次在单细胞水平阐明肝细胞是纤维化肝脏中铜死亡的主要靶细胞,并验证了抑制铜死亡作为肝纤维化治疗新靶点的潜力 研究主要基于小鼠模型和有限临床样本,需进一步在更大规模人群中验证 探究铜死亡在肝纤维化进展中的作用机制及治疗潜力 小鼠肝纤维化模型及肝纤维化患者的临床样本 单细胞组学 肝纤维化 单细胞RNA测序,蛋白质组学分析 NA 单细胞转录组数据,蛋白质组数据 小鼠模型及肝纤维化患者临床样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
742 2025-12-24
Differential Gene Expression Across Species Following Spinal Cord Injury: A Systematic Review and Meta-Analysis
2025-Dec-20, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
系统综述与荟萃分析 本文通过系统综述和荟萃分析,比较了不同物种在脊髓损伤后基因表达的差异,旨在揭示影响神经再生能力的分子机制 首次跨物种整合基因组范围的脊髓基因表达数据,通过荟萃分析识别了再生与非再生物种间共享的差异表达基因,并利用蛋白互作网络分析鉴定了关键枢纽基因 纳入研究的异质性较高,物种和损伤模型多样,且部分研究样本量较小,可能影响结果的普适性 探究脊髓损伤后不同物种的基因表达差异,以理解神经再生的分子基础 多物种的脊髓组织,包括再生能力强的非哺乳动物(如硬骨鱼、蝾螈)和再生能力有限的哺乳动物(如大鼠、小鼠) 生物信息学 脊髓损伤 微阵列,RNA测序,单细胞RNA测序,单核RNA测序 NA 基因表达数据 来自42项研究的多个物种样本,其中约43%使用褐家鼠 NA 微阵列,bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq,单核RNA-seq NA NA
743 2025-12-24
Spatial Transcriptomics Analysis of Macrophage-to-Myofibroblast Transition in Bronchiolitis Obliterans Following Hematopoietic Stem Cell Transplantation
2025-Dec-20, Transplantation and cellular therapy IF:3.6Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学分析造血干细胞移植后闭塞性细支气管炎中巨噬细胞向肌成纤维细胞转化的作用 首次在BO中应用空间转录组学技术揭示MMT的贡献,并识别了疾病进展中从炎症到纤维化的基因表达转变 样本量较小(仅3例BO患者和2例对照),且为回顾性研究,可能限制结果的普遍性 探究巨噬细胞向肌成纤维细胞转化是否参与造血干细胞移植后闭塞性细支气管炎的纤维化发展 造血干细胞移植后发生闭塞性细支气管炎患者的肺组织样本,以及肺癌患者的对照组织 数字病理学 肺疾病 空间转录组学,免疫荧光染色 无监督聚类 空间基因表达数据,图像数据 3例BO患者的肺组织样本,2例肺癌患者的对照组织 NA 空间转录组学 NA NA
744 2025-12-24
ASPEN: Robust detection of allelic dynamics in single cell RNA-seq
2025-Dec-19, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本文介绍了一种名为ASPEN的统计方法,用于在F1杂交单细胞转录组数据中建模等位基因均值和方差,以提高等位基因动态检测的敏感性 ASPEN结合了敏感映射流程和自适应收缩技术,能区分单细胞中的等位基因失衡和等位基因方差,相比现有方法在敏感性上提高了30% NA 开发一种统计方法以更准确地检测单细胞RNA-seq数据中的等位基因动态 F1杂交小鼠脑类器官和T细胞的单细胞RNA-seq数据 自然语言处理 NA 单细胞RNA-seq 统计模型 RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
745 2025-12-24
Multistep genomics on single cells and live cultures in subnanoliter capsules
2025-Dec-18, Science (New York, N.Y.)
研究论文 本文开发了一种名为CAGEs的亚纳升胶囊技术,用于实现单细胞的高通量多步基因组学分析,包括活细胞培养与全基因组读数的结合 创新点在于利用具有两亲性凝胶外壳的胶囊,选择性保留细胞和大分析物,同时允许培养基、酶和试剂自由进入,从而首次实现了高通量多步活细胞分析与基因组读数的整合 未明确提及具体限制,但可能涉及胶囊技术的优化、应用范围的扩展或与其他单细胞技术的兼容性 研究目标是开发一种新平台,以克服现有单细胞测序方法在活细胞多步分析中的高通量限制 研究对象为单细胞,特别是用于活细胞培养和基因组学分析的细胞群体 单细胞基因组学 NA 单细胞测序、活细胞分析、高通量多步基因组学 NA 基因组数据、转录组数据 数万个扩展克隆的转录组数据 NA 单细胞RNA-seq、高通量多步基因组学 CAGEs(胶囊技术) 具有两亲性凝胶外壳的亚纳升胶囊,用于选择性保留细胞和大分析物,支持活细胞培养和多种酶反应
746 2025-12-24
SpaceBar enables single-cell-resolution clone tracing with imaging-based spatial transcriptomics
2025-Dec-18, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 SpaceBar是一种新方法,能够在标准成像空间转录组学流程中实现单细胞分辨率的克隆追踪和空间基因表达谱分析 开发了SpaceBar方法,通过96个合成条形码序列的组合标记,首次在成像空间转录组学中实现克隆追踪,解决了传统方法不兼容的问题 仅使用96个条形码序列,可能限制大规模克隆追踪的应用;未在多种组织类型中验证 开发一种同时进行克隆追踪和空间基因表达分析的方法,以区分克隆动态和环境驱动的转录调控 复杂组织中的细胞 空间转录组学 NA 成像空间转录组学 NA 空间基因表达数据 NA NA 成像空间转录组学 NA 标准成像空间转录组学流程
747 2025-12-24
Infusible Extracellular Matrix Biomaterial Enhances Cell-Specific Pro-Repair Responses Following Acute Myocardial Infarction
2025-Dec-18, Advanced healthcare materials IF:10.0Q1
研究论文 本研究开发了一种可血管内注射的脱细胞细胞外基质生物材料(iECM),并通过单细胞核RNA测序和空间转录组学技术,揭示了其在急性心肌梗死后促进心脏修复的细胞与分子机制 首次利用单细胞核RNA测序技术,在急性时间点(1、3、7天)系统解析了iECM介导心脏修复过程中不同细胞类型的促修复反应,并通过空间转录组学验证了发现 研究依赖于动物模型,其结论向人类临床转化的有效性仍需进一步验证;研究时间点仅限于急性期(7天内),长期效应未知 探究可血管内注射的脱细胞细胞外基质生物材料(iECM)在急性心肌梗死后促进心脏修复的细胞与分子机制 急性心肌梗死模型中的心脏组织与细胞 单细胞组学 心血管疾病 单细胞核RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞核RNA测序数据,空间转录组学数据 在急性心肌梗死后1、3、7天多个时间点采集的样本 NA 单细胞核RNA测序,空间转录组学 NA NA
748 2025-12-24
Epithelial HO-1 regulates iron availability and promotes colonic tumorigenesis in a context-dependent manner
2025-Dec-17, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨了结肠上皮血红素加氧酶-1(HO-1)在结肠炎相关肿瘤发生中的双重作用,揭示了其在急性毒性保护与慢性炎症促进肿瘤中的机制 首次在结肠炎相关肿瘤模型中系统评估上皮HO-1的上下文依赖性功能,结合单细胞RNA测序揭示其调控肿瘤细胞增殖与应激适应程序的转换 研究主要基于小鼠模型和类器官,人类临床样本验证有限,且未深入探讨HO-1与其他铁代谢通路的具体交互机制 阐明结肠上皮HO-1在炎症相关肿瘤发生中的分子机制及其对铁可用性和氧化应激的调控作用 小鼠结肠炎相关肿瘤模型、小鼠及人类结肠上皮类器官、肿瘤上皮细胞 分子病理学 结肠癌 单细胞RNA测序、类器官培养、铁水平检测、脂质过氧化分析 基因敲除小鼠模型 基因表达数据、组织病理学图像、生化检测数据 未明确样本数量,但涉及小鼠模型、人类类器官及肿瘤组织分析 NA 单细胞RNA测序 NA NA
749 2025-12-24
HLA-DQB1*03:01 strongly affects age of onset of type 1 narcolepsy independently of DQA1 and ethnicity
2025-Dec-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过跨种族全基因组关联分析,首次发现HLA-DQB1*03:01是独立于DQA1和种族、显著影响1型发作性睡病发病年龄的主要遗传因素 首次进行跨种族GWAS研究,明确HLA-DQB1*03:01对发病年龄的独立影响,并发现其通过改变T细胞受体库发挥作用 未直接鉴定出致病的T细胞,病理生理机制的具体联系尚待进一步阐明 探究1型发作性睡病发病年龄的遗传决定因素 1型发作性睡病患者 遗传学 发作性睡病 全基因组关联研究(GWAS)、RNA测序 NA 基因组数据、RNA测序数据 5,339例来自中国、欧洲、韩国、日本和美国的病例 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
750 2025-12-24
GDF3 promotes adipose tissue macrophage-mediated inflammation via altered chromatin accessibility during aging
2025-Dec-15, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 本研究揭示了GDF3通过自分泌信号通路维持巨噬细胞炎症表型并加剧内毒素血症的机制 首次发现GDF3-SMAD2/3轴通过改变染色质可及性驱动衰老相关炎症,并验证其在人类样本中的相关性 主要基于小鼠模型,人类样本验证需进一步扩展 探究衰老过程中脂肪组织巨噬细胞炎症表型的调控机制 衰老小鼠脂肪组织巨噬细胞、人类脂肪组织样本及ARIC研究参与者 单细胞组学 衰老相关炎症 单细胞RNA测序、ATAC-seq NA 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 11,084名ARIC研究参与者及小鼠模型样本 NA 单细胞RNA-seq、ATAC-seq NA NA
751 2025-12-24
Multi-omics atlas of ovarian cellular and molecular responses to diabetes
2025-Dec-13, Molecular metabolism IF:7.0Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、DNA甲基化分析和代谢组学,全面描述了糖尿病雌性小鼠卵巢的细胞景观、表观遗传改变和代谢重编程 首次在糖尿病背景下,通过多组学方法系统揭示了卵巢功能障碍的分子机制,特别是颗粒细胞中关键基因的表达降低与DNA甲基化增加之间的关联 研究仅基于小鼠模型,结果可能无法直接外推至人类;且未深入探讨糖尿病类型或治疗干预的影响 阐明糖尿病对卵巢功能的细胞和分子影响机制 糖尿病雌性小鼠的卵巢组织 数字病理学 糖尿病 单细胞RNA测序, DNA甲基化分析, 代谢组学 NA RNA序列数据, 甲基化数据, 代谢物数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 代谢组学 NA NA
752 2025-12-24
Hic-5 drives epithelial mechanotransduction promoting a feed-forward cycle of bronchoconstriction
2025-Dec-12, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了Hic-5作为上皮细胞机械转导的关键调节因子,在哮喘中通过促进支气管收缩的正反馈循环驱动疾病进展 首次将Hic-5确定为气道基底细胞中机械转导的核心调节因子,并阐明其通过ET-1分泌介导支气管收缩正反馈循环的新机制 研究主要基于体外细胞模型和已有单细胞RNA-seq数据再分析,缺乏直接体内验证 探究哮喘中支气管收缩引起的机械力如何通过上皮细胞机械转导驱动疾病进展 人气道上皮细胞(包括基底细胞)及哮喘患者样本 NA 哮喘 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
753 2025-12-24
Single-cell eQTL mapping reveals cell-type-specific genetic regulation in lung cancer
2025-Dec-11, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本研究通过构建最大规模的人类肺组织单细胞eQTL图谱,揭示了细胞类型特异性遗传调控在肺癌中的作用 首次大规模应用单细胞RNA测序技术于eQTL分析,识别出超过60%的sc-eQTLs具有细胞类型特异性,并发现47%的已知NSCLC易感位点存在细胞类型特异性多效性遗传调控 研究样本量相对有限(222名捐赠者),且未涵盖所有肺细胞类型或肺癌亚型 阐明肺癌遗传易感性的细胞类型特异性机制 人类肺组织中的17种细胞类型 单细胞组学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) eQTL分析 单细胞转录组数据 222名捐赠者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
754 2025-12-24
From chronic gastritis to gastric cancer: Mendelian randomisation and multi-omics interrogation of leukaemia inhibitory factor receptor (LIFR), hepatocyte growth factor (HGF), serine protease inhibitor E1 (SERPINE1) and interleukin-10 receptor subunit beta (IL10RB)
2025-Dec-09, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究通过孟德尔随机化和多组学分析,识别了从慢性胃炎进展至胃癌的关键炎症因子和免疫细胞特征 结合孟德尔随机化与多组学数据(转录组、蛋白质组、单细胞RNA测序),系统性鉴定出LIFR、HGF、SERPINE1和IL10RB作为胃炎至胃癌进展的核心大分子介质,并利用虚拟筛选发现潜在靶向化合物 研究主要基于公共数据集和体外验证,缺乏大规模临床队列验证;虚拟筛选的化合物需进一步实验确认其疗效和安全性 阐明慢性胃炎向胃癌进展的因果性炎症因子和分子机制,并探索潜在治疗靶点 慢性胃炎和胃癌患者的多组学数据(基因组、转录组、蛋白质组、单细胞RNA测序数据) 生物信息学与多组学整合分析 胃癌 孟德尔随机化、全基因组关联研究、转录组测序、蛋白质组学、单细胞RNA测序、定量逆转录PCR、Western印迹、免疫组化、虚拟筛选、分子对接 孟德尔随机化模型(逆方差加权法为主)、多组学整合分析模型 基因组关联数据、转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 基于公共数据库(如TCGA、GEO)及独立队列,具体样本量未明确说明 NA 单细胞RNA测序、转录组测序、蛋白质组学 NA NA
755 2025-12-24
[Analyzing the impact of chemotherapy on cellular heterogeneity and identifying potential therapeutic targets in breast cancer patients via single-cell RNA sequencing]
2025-Dec-06, Zhonghua yu fang yi xue za zhi [Chinese journal of preventive medicine]
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了一名乳腺癌患者化疗前后肿瘤组织的细胞异质性,旨在描绘细胞进化轨迹并识别潜在的治疗靶点 在单细胞分辨率下,对同一患者化疗前后的肿瘤微环境进行纵向比较,描绘了细胞组成和发育轨迹的动态变化,并预测了APOD、ELN和F2R等基因在疾病进展中的关键作用 研究仅基于单一样本(一名患者),样本量小,限制了结果的普遍性和统计效力 分析化疗对乳腺癌肿瘤细胞异质性的影响,并识别潜在的治疗干预靶点 一名乳腺癌女性患者的化疗前活检组织和化疗后手术切除组织 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 1名患者,2个时间点(化疗前和化疗后)的肿瘤组织样本,共分析了8,599个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
756 2025-12-24
[Single-cell transcriptomic analysis of the impact of circadian rhythm disruption on immune function in zebrafish]
2025-Dec-06, Zhonghua yu fang yi xue za zhi [Chinese journal of preventive medicine]
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序,揭示了昼夜节律紊乱对斑马鱼免疫系统结构和功能的影响 首次在单细胞水平上系统解析了昼夜节律紊乱如何重塑斑马鱼免疫细胞组成、比例变化及发育轨迹,并识别了关键的免疫激活标记基因变化 研究基于斑马鱼幼虫模型,结果向高等脊椎动物或人类的直接外推需谨慎;且仅分析了短期(三天)恒定光照干扰,未探讨长期或不同模式节律紊乱的影响 探究昼夜节律紊乱在单细胞水平上调控免疫系统结构与功能的精确机制 斑马鱼幼虫的免疫细胞 单细胞转录组学 睡眠相关疾病 单细胞RNA测序 UMAP聚类、Monocle伪时间轨迹分析 单细胞转录组数据 对照组与昼夜节律紊乱组斑马鱼幼虫的免疫细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
757 2025-12-24
DAP12 deletion reduces neuronal SLIT2 and demyelination and enhances brain resilience in female tauopathy mice
2025-Dec-02, Molecular neurodegeneration IF:14.9Q1
研究论文 本研究探讨了在小鼠tau蛋白病模型中,删除DAP12基因如何通过影响神经元SLIT2信号和髓鞘形成,增强大脑对tau病理的耐受性 首次揭示了DAP12缺失通过抑制兴奋性神经元中SLIT2的上调,减轻tau蛋白病中的脱髓鞘,从而增强大脑耐受性的新机制 研究主要基于转基因小鼠模型,在人类中的直接相关性仍需进一步验证;性别差异的机制尚不完全清楚 探究DAP12在tau蛋白病中介导大脑耐受性的分子机制,为阿尔茨海默病提供新的治疗策略 携带人类Tau P301S突变的转基因小鼠模型,以及人类阿尔茨海默病脑组织 神经科学,单细胞组学 阿尔茨海默病,tau蛋白病 单核RNA测序,空间转录组学,细胞通讯分析 转基因小鼠模型 单细胞转录组数据,空间转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及转基因小鼠和人类脑组织 NA 单核RNA测序,空间转录组学 NA NA
758 2025-12-24
Identification and validation of tricarboxylic acid cycle-related diagnostic biomarkers for diabetic nephropathy via weighted gene co-expression network analysis and single-cell transcriptome analysis
2025-Dec, Acta diabetologica IF:3.1Q2
研究论文 本研究通过加权基因共表达网络分析和单细胞转录组分析,识别并验证了与三羧酸循环相关的糖尿病肾病诊断生物标志物 首次结合单细胞转录组数据和机器学习方法,从三羧酸循环相关基因中筛选出HPGD和G6PC作为糖尿病肾病的新型诊断标志物 研究主要基于公开数据集,缺乏独立的前瞻性临床队列验证 开发糖尿病肾病的早期诊断生物标志物 糖尿病肾病患者的肾脏组织样本 生物信息学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),加权基因共表达网络分析(WGCNA),单样本基因集富集分析(ssGSEA) 机器学习模型(未指定具体类型) 基因表达数据 基于GSE131882和GSE30122数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
759 2025-12-24
Glucokinase activators contribute to gastrointestinal disease risks through metabolic-immune interplay in the gut-liver axis: insights from a multi-omics study
2025-Dec, Acta diabetologica IF:3.1Q2
研究论文 本研究通过多组学分析探讨了葡萄糖激酶激活剂(GKAs)通过代谢-免疫相互作用对胃肠道疾病风险的长期影响 首次利用孟德尔随机化和多组学方法系统比较了直接GK激活与GK-GKRP解离两种机制对胃肠道疾病的因果效应,并揭示了代谢-免疫串扰在其中的关键作用 研究主要基于遗传变异作为代理,可能无法完全反映药物干预的复杂生物学效应,且样本来源和疾病模型的局限性需进一步验证 探究GKAs通过代谢-免疫相互作用对胃肠道疾病风险的长期影响机制 葡萄糖激酶激活剂(GKAs)的两种作用机制(直接GK激活与GK-GKRP解离)及其与胃肠道疾病的关联 多组学研究 胃肠道疾病 孟德尔随机化、meta分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、蛋白质-蛋白质相互作用网络、功能富集分析 NA 遗传变异数据、脂质性状数据、炎症蛋白数据、单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
760 2025-12-24
A clinically relevant pan-cancer prognostic signature derived from T-cell activation immune genes: Experimental validation across malignancies with emphasis on breast cancer
2025-Dec, Pharmacological research IF:9.1Q1
研究论文 本研究基于T细胞活化相关免疫反应基因构建了一个泛癌预后模型,并重点在乳腺癌中验证了模型内关键基因PTGER4的免疫调节功能 首次系统性地利用T细胞活化相关免疫基因构建泛癌预后特征,并通过单细胞测序和动物模型揭示了PTGER4在免疫检查点阻断治疗中的增效机制 研究主要基于公共数据库的转录组数据,实验验证集中在乳腺癌模型,其他癌种的机制验证尚不充分 建立基于T细胞活化免疫基因的泛癌预后模型,并探究其在肿瘤免疫微环境中的临床意义 泛癌转录组数据、乳腺癌组织单细胞数据、小鼠肿瘤模型 生物信息学 乳腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序 LASSO Cox回归模型 转录组数据、单细胞数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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