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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 741 | 2026-06-06 |
Benzene-induced myelosuppression confers a survival advantage to hematopoietic progenitors: Single-cell analysis of malignant transformation dynamics in a murine model
2026-07-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.142337
PMID:42139775
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析苯诱导小鼠骨髓抑制向恶性转化的动态过程 | 首次通过单细胞分析揭示苯诱导骨髓抑制向白血病转化的关键时间窗及S100a8/S100a9相关转录程序作为早期分子特征 | 未在文献中明确提及 | 解析苯诱导骨髓抑制向快速恶性转化的演变机制 | Mll-Af9嵌合体小鼠模型及苯暴露后的造血干细胞/祖细胞 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Mll-Af9嵌合体小鼠经慢性苯吸入暴露,具体样本量未详述 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 742 | 2026-06-06 |
Integrating Single-Cell Sequencing and Proteomics to Unravel Stem Cell Heterogeneity: Implications for Precision Regenerative Medicine
2026-Jul, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-026-11116-6
PMID:41951880
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 743 | 2026-06-06 |
Machine Learning-Based Identification of Molecular Signatures in PTOA Cell Subtypes via Single-Cell Transcriptomics in a Mouse Model
2026-Jul, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-026-11121-9
PMID:41979832
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 744 | 2026-06-06 |
Hypoplastic Left Heart Syndrome Cardiomyocytes Exhibit Intrinsic Stress Vulnerabilities and Augmented Stress Responses in vitro
2026-Jul, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-026-11127-3
PMID:42089915
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研究论文 | 该论文研究了左心发育不全综合征(HLHS)心肌细胞在体外表现出的内在应激脆弱性和增强的应激反应 | 首次通过单细胞RNA测序和功能分析,揭示HLHS患者诱导多能干细胞来源的心肌细胞在转录水平上的内在脆弱性和对特定应激源的敏感性增强,为理解基因-环境相互作用在HLHS发病机制中的角色提供了新见解 | 研究仅基于体外模型(hiPSC-CMs),可能无法完全复制体内复杂的微环境;且样本量有限,可能限制结果的普遍性 | 识别HLHS患者与健康对照者心肌细胞之间的分子和功能差异,以揭示可能导致HLHS表型的潜在脆弱性 | 来自HLHS患者和健康对照者的诱导多能干细胞来源的心肌细胞(hiPSC-CMs) | 数字病理学 | 先天性心脏病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | HLHS患者和健康对照者的诱导多能干细胞来源的心肌细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 745 | 2026-06-06 |
TREM1+ Neutrophils Determine Immunosuppressive Microenvironment and Immunotherapy Response in Hepatocellular Carcinoma
2026-Jul, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.70726
PMID:42244441
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和质谱流式技术,揭示TREM1+中性粒细胞在肝细胞癌中驱动免疫抑制微环境并影响免疫治疗反应 | 首次确定TREM1+中性粒细胞亚群在肝细胞癌中作为关键免疫抑制细胞,通过CyTOF全面表征其功能表型,并证明靶向TREM1可增强抗PD-1抗体疗效 | 未在更大样本量或不同种族人群中验证,且TREM1抑制剂VJDT的具体作用机制需进一步阐明 | 识别驱动肝细胞癌进展的关键中性粒细胞亚群并探索其免疫治疗潜力 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的中性粒细胞亚群,特别是TREM1+中性粒细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 质谱流式技术 | NA | 单细胞基因表达数据, 蛋白质组学数据 | 肝细胞癌患者队列(具体数量未在摘要中提及) | Fluidigm, 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 质谱流式技术 | 10x Chromium, CyTOF | 10x Chromium用于scRNA-seq, CyTOF用于质谱流式分析 |
| 746 | 2026-06-06 |
Integrative transcriptomics and single-cell analysis unravel the senescence-reversing mechanism of quercetin in osteoarthritic chondrocytes
2026-06-25, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153831
PMID:42030882
|
研究论文 | 整合转录组学和单细胞分析揭示槲皮素在骨关节炎软骨细胞中逆转衰老的机制 | 首次整合转录组学和单细胞测序,分析p53介导的细胞周期阻滞和SASP驱动的炎症在骨关节炎软骨细胞衰老中的核心作用,并揭示槲皮素通过靶向p53信号通路调节氧化应激/炎症微环境从而发挥抗衰老效果 | 缺乏体内实验验证,尚不能断言槲皮素能延缓软骨退化或进行临床应用 | 研究槲皮素逆转骨关节炎软骨细胞衰老的机制 | 骨关节炎软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 转录组学, 单细胞测序, 分子对接 | NA | 基因表达数据 | GSE98918和GSE117999数据集中的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 747 | 2026-06-06 |
The exploration to identify key molecules in the interaction between endothelial cells and mono-macrophages in atherosclerosis based on the single cell transcriptome
2026-Jun-05, BMC cardiovascular disorders
IF:2.0Q3
DOI:10.1186/s12872-026-06031-0
PMID:42243679
|
研究论文 | 基于单细胞转录组数据探究动脉粥样硬化中内皮细胞与单核巨噬细胞相互作用的关键分子 | 通过单细胞RNA测序分析钙化动脉粥样硬化核心斑块与邻近正常组织,识别出MK、GALECTIN和SPP1等信号通路在动脉粥样硬化中显著改变,其中MDK-NCL配体-受体对在疾病相关细胞亚群中上调,并通过体外共培养实验验证 | 初步验证仅使用体外Transwell共培养实验,缺乏体内动物实验或临床样本验证 | 识别动脉粥样硬化中内皮细胞与单核巨噬细胞相互作用的关键信号通路和分子,为冠心病防治提供候选靶点 | 钙化动脉粥样硬化核心斑块和患者匹配的近端相邻颈动脉组织中的内皮细胞和单核巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 动脉粥样硬化、冠心病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 已发表的钙化动脉粥样硬化核心斑块和邻近颈动脉组织数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 748 | 2026-06-06 |
Well-ST-seq: Cost-Effective and Near-Cellular Spatial Transcriptomics Using Deterministic Barcoded Bead Arrays
2026-Jun-05, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.6c01070
PMID:42246548
|
研究论文 | 提出Well-ST-seq,一种利用确定性条形码微珠阵列实现近细胞分辨率且成本效益高的空间转录组学方法 | 通过微孔组装水凝胶微珠载体与组合微流控索引生成预定义空间条形码阵列,在简化工作流程中实现快速、低成本的确定性空间转录组学玻片制备 | 未提及明显局限性,但可能受限于微珠阵列的规模化和对不同组织类型的通用性 | 开发一种成本低廉、分辨率接近单细胞水平且捕获灵敏度高的确定性空间转录组学平台 | 小鼠海马体和发育中的小鼠胚胎大脑组织切片 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学,微流控索引,确定性条形码阵列 | NA | 空间基因表达数据 | 小鼠海马体组织切片(10 μm点阵)和连续发育中小鼠胚胎脑切片 | NA | 空间转录组学 | Well-ST-seq平台 | 利用微孔组合水凝胶微珠载体和正交微通道进行坐标索引,创建确定性空间条形码捕获阵列,点阵尺寸从10 μm到30 μm |
| 749 | 2026-06-06 |
Pan-cancer single-cell and spatial transcriptomics analyses delineate response-associated heterogeneity and therapeutic targets of tumor-infiltrating B cells following immune checkpoint blockade
2026-Jun-05, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04449-1
PMID:42247075
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研究论文 | 建立了泛癌种免疫检查点阻断反应B细胞图谱,揭示了肿瘤浸润B细胞的异质性和治疗靶点 | 首次构建了泛癌种免疫检查点阻断反应B细胞图谱,覆盖24种癌症类型,识别24个B细胞亚群并揭示其比例动态和转录组特征 | 未在摘要中明确提及具体局限性 | 探究肿瘤浸润B细胞在不同癌症类型中的生物学功能、空间微环境及其与免疫检查点阻断反应的关系 | 肿瘤浸润B细胞及其亚群 | 数字病理学 | 泛癌种 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | Geneformer模型 | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 688个单细胞转录组(241,645个细胞,来自24种癌症类型) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 750 | 2026-06-06 |
Human PSC-derived sinoatrial node-cardiac plexus assembloids model innervation-associated maturation of pacemaker systems
2026-Jun-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.04.018
PMID:42143017
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研究论文 | 通过整合人类多能干细胞来源的窦房结类器官与心脏神经节丛类器官,构建SAN-plexus组装体模型,研究起搏器系统的神经支配相关成熟过程 | 首次构建人类SAN-plexus组装体模型,整合空间转录组学与功能性分析,发现prosaposin-GPR37信号通路促进起搏器成熟 | NA | 建立体外模拟神经-窦房结相互作用的平台,研究起搏器发育和疾病的神经调控机制 | 人类多能干细胞衍生的窦房结类器官和心脏神经节丛类器官 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | 类器官组装体 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 751 | 2026-06-06 |
3D chromatin architecture-related genes orchestrate LUAD evolution and therapy resistance: insights from integrative machine learning and spatial single-cell mapping
2026-Jun-04, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01914-z
PMID:42240917
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研究论文 | 整合机器学习和空间单细胞测序揭示3D染色质结构相关基因在肺腺癌进展和治疗耐药中的调控作用 | 首次系统鉴定并验证5个3D染色质结构相关基因(SMC3、RAD21、FOXM1、MYBL2和MTA3)在肺腺癌术后复发、索拉非尼治疗反应及肿瘤进展中的关键调控作用,并利用空间转录组学和虚拟单基因扰动分析揭示其在肿瘤增殖细胞中的功能机制 | 研究主要基于公开数据集和生物信息学分析,缺乏临床样本的独立大规模验证,且未深入探讨这些基因在染色质三维结构中的具体调控机制 | 探索3D染色质结构相关基因在肺腺癌术后复发、索拉非尼治疗反应、肿瘤进展及肿瘤微环境调控中的作用 | 肺腺癌(LUAD)患者肿瘤组织及周边正常组织 | 机器学习 | 肺腺癌(lung cancer) | 转录组测序(RNA-seq)、空间转录组测序、单细胞测序、集成机器学习 | 集成机器学习模型 | 基因表达数据(转录组)、单细胞数据、空间转录组数据 | TCGA-LUAD队列及7个GEO数据集(GSE31210、GSE30219、GSE33072、GSE27389、GSE115002、GSE83836、GSE31428),含独立验证队列 | NA | 单细胞转录组测序(single-cell RNA-seq)、空间转录组测序(spatial transcriptomics) | 10x Chromium、10x Visium(推断,基于单细胞和空间测序常用平台) | NA |
| 752 | 2026-06-06 |
A progenitor cell population contributes to prenatal injury repair and neonatal antimicrobial defense in the small intestine
2026-Jun-04, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117503
PMID:42241283
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序与小鼠及类器官模型的功能研究,鉴定了胚胎和新生小鼠小肠中由溶菌酶1标记的前体细胞群(SISPCs),并揭示了其在产前损伤修复和新生儿抗菌防御中的作用 | 首次鉴定出胚胎和新生小鼠小肠中由Lyz1标记的前体细胞群(SISPCs),并发现其具有动态时空分布和干性特征,且不同于Lyz1潘氏细胞 | NA | 阐明胚胎小肠中上皮细胞的类型和功能,特别是前体细胞在肠道发育和损伤修复中的作用 | 小鼠小肠上皮细胞,特别是胚胎和新生阶段的Lyz1阳性前体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠小肠组织样本(具体数量未在摘要中说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 753 | 2026-06-06 |
Nerve-proximal tertiary lymphoid structures predict chemotherapy sensitivity in pancreatic cancer
2026-Jun-04, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117496
PMID:42241282
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研究论文 | 研究发现了在胰腺导管腺癌中,化疗促进神经重塑与三级淋巴结构(TLS)的相互作用,并鉴定出神经近端TLS可作为化疗敏感性的潜在生物标志物 | 首次揭示化疗诱导的施万细胞转录重编程与三级淋巴结构成熟之间的空间关联,提出神经-免疫轴在肿瘤微环境中的作用新机制 | 样本量有限(86例初治和49例新辅助化疗患者),且缺乏功能验证实验 | 探究胰腺导管腺癌中神经重塑对三级淋巴结构及化疗疗效的影响 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | NA | 组织切片 | 86例初治和49例新辅助化疗患者的组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台用于神经区域分析 |
| 754 | 2026-06-06 |
Circuit organization and transcriptomic heterogeneity of sympathetic circuits innervating cranial structures
2026-Jun-04, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117446
PMID:42241285
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研究论文 | 通过神经元追踪结合单细胞和空间转录组学,解析支配颅面部结构交感神经回路的组织结构和转录组异质性 | 首次结合神经元追踪、单细胞和空间转录组学技术,揭示了颈上神经节(SCG)神经元与其支配效应器官之间的精确投射关系,并发现SCG神经元转录组类型与轴突投射类型之间不存在严格的一对一对应关系 | NA | 阐明支配颅面部结构的交感神经回路的组织结构和细胞异质性 | 支配颅面部结构的小鼠交感神经回路及颈上神经节(SCG)神经元 | 机器学习 | NA | 神经元追踪、单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据、空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序,10x Visium空间转录组学 |
| 755 | 2026-06-06 |
Culture-specific transcriptional drifts limit the fidelity of organoid infection models
2026-Jun-04, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1014321
PMID:42241455
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研究论文 | 通过时间序列转录组分析揭示培养诱导的转录漂移影响了患者源回肠类器官在分枝杆菌感染模型中的保真度 | 首次使用人类肠道类器官模拟副结核分枝杆菌感染并表征上皮转录组反应,发现培养相关转录漂移是基因表达变化的主要驱动因素,并通过空间转录组学揭示感染可选择性抵消培养诱导的基因表达变化 | 培养诱导的转录漂移和福斯克林处理均对类器官感染模型产生显著干扰,可能掩盖病原体特异性响应 | 探究培养诱导的人工产物对肠道类器官感染模型的影响 | 患者源回肠类器官 | 数字病理学 | 克罗恩病 | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 患者源回肠类器官,包含MAP感染、FSK处理和未处理对照组的48小时时间序列样本 | NA | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 756 | 2026-06-06 |
DEHP-induced male reproductive toxicity: Evidence from population studies, animal experiments, and multi-omics profiling
2026-Jun-04, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120320
PMID:42241798
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研究论文 | 通过人群研究、动物实验和多组学分析评估DEHP暴露与男性生殖毒性的关联 | 采用多层次整合策略,结合NHANES人群数据、大鼠实验、转录组机器学习和单细胞RNA-seq网络推断,系统揭示DEHP生殖毒性机制并预测候选化合物 | 熊果酸的验证仅基于计算模拟,缺乏实验验证 | 探究DEHP暴露与男性睾酮缺乏的关联及分子机制 | 成年男性(NHANES 2013-2016)和雄性SD大鼠 | 机器学习 | 男性生殖毒性 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接, 分子动力学模拟 | 逻辑回归, 集成机器学习 | 文本, 基因表达数据 | NHANES 2013-2016成年男性(具体数量未提及);Sprague-Dawley大鼠(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 757 | 2026-06-06 |
Rheumatoid arthritis synovial fibroblasts promote the glycolysis of myeloid-derived suppressor cells via TREM1/mTOR axis
2026-Jun-04, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116961
PMID:42242136
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序、空间转录组学和流式细胞术,发现类风湿关节炎滑膜成纤维细胞通过TREM1/mTOR轴促进髓系抑制性细胞的糖酵解重编程,从而加剧炎症表型 | 首次揭示TREM1信号在类风湿关节炎中介导滑膜成纤维细胞与髓系抑制性细胞之间的代谢串扰,并证明TREM1是恢复MDSC代谢稳态的潜在治疗靶点 | 未提及具体局限性 | 研究类风湿关节炎中髓系抑制性细胞的代谢重编程机制及其与滑膜成纤维细胞的相互作用 | 类风湿关节炎患者的髓系抑制性细胞、成纤维样滑膜细胞MH7a细胞系 | 数字病理学 | 自身免疫性关节炎 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、空间转录组学、糖酵解检测 | NA | 基因表达数据、图像 | 未具体说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium | 用于单细胞RNA测序和空间转录组学分析 |
| 758 | 2026-06-06 |
scTACL: A multitask topology-aware contrastive learning approach for single-cell transcriptomics analysis
2026-Jun-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag361
PMID:42242168
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研究论文 | 提出scTACL方法,通过多任务拓扑感知对比学习分析单细胞转录组数据,以处理噪声和缺失事件 | 创新性地使用细胞相似性图与细胞嵌入相似性图之间的对比学习,并采用零膨胀负二项分布建模重建数据,无需空间信息即可区分空间转录组中的区域 | 未明确提及局限性,但可能依赖于数据质量和模型参数选择 | 开发新方法改善单细胞转录组数据分析,包括数据填充、聚类、批次效应校正和细胞间相互作用 | 单细胞转录组数据及空间转录组数据 | 机器学习 | 肺癌(肺腺癌)、肝癌 | scRNA-seq | 对比学习 | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 759 | 2026-06-06 |
Widespread transcriptional memory shapes heritable states and functional heterogeneity in cancer and stem cells
2026-Jun-04, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101621
PMID:42242211
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研究论文 | 通过谱系解析的单细胞转录组学揭示癌症和干细胞中广泛的转录记忆塑造可遗传状态和功能异质性 | 首次利用谱系追踪的单细胞转录组学区分可遗传细胞状态与瞬时波动,将转录记忆定义为可遗传异质性的新基础,并揭示聚类状态和潜在状态两类可遗传状态 | 转录记忆的跨细胞类型保守性仅部分观察到,且其维持机制尚未完全阐明,对潜在状态基因的功能优势解释有限 | 解析非遗传异质性的机制,特别是通过可遗传状态促进癌症进化和发育轨迹的分子基础 | 癌症细胞和干细胞中的可遗传细胞状态及其转录记忆 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞转录组学, 谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 谱系解析的单细胞转录组学 |
| 760 | 2026-06-06 |
Agility training enhances motor temporal precision by reweighting spinal phase-locked commissural inhibition
2026-Jun-04, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2026.05.013
PMID:42242212
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研究论文 | 本研究揭示了敏捷训练通过增强脊髓相位锁定交叉抑制来重塑慢速运动神经元活动,从而提升运动时间精确性的机制 | 首次发现敏捷训练通过增强交叉抑制而非均匀增强兴奋来选择性压缩慢速运动神经元活动,并阐明其分子基础为甘氨酸受体表达上调 | 未说明 | 探究敏捷训练改善运动时间精确性的神经回路和分子机制 | 成年斑马鱼的脊髓运动回路 | 计算神经科学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |