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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 741 | 2026-06-05 |
Integrating multi-omics analysis identifies DNA damage-related gene CLSPN as a biomarker in gastric cancer
2026-Feb-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39387-6
PMID:41656416
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研究论文 | 通过多组学分析识别胃腺癌中DNA损伤相关基因CLSPN作为生物标志物 | 首次整合批量RNA测序、单细胞RNA测序和免疫组化实验,系统筛选并验证CLSPN在胃腺癌中的诊断潜力,突出其细胞类型特异性表达 | 仍需在临床评估中进一步验证其在胃腺癌管理策略中的实际价值 | 探索DNA损伤相关基因与胃腺癌的关联,为其分子机制和潜在生物标志物提供见解 | 胃腺癌患者样本 | 机器学习、数字病理学 | 胃腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 多种机器学习方法(未具体指定) | 基因表达数据,单细胞表达数据,免疫组化图像 | NA | NA | 批量RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 742 | 2026-06-05 |
Spatial transcriptomics identifies IL-32 as a lipid droplet-associated cytokine linked to tubular injury in human diabetic kidney disease
2026-Feb-07, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-026-02192-y
PMID:41653322
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研究论文 | 通过空间转录组学技术发现脂滴相关细胞因子IL-32与人糖尿病肾病肾小管损伤相关 | 首次将IL-32鉴定为脂滴相关细胞因子,并揭示其作为脂质代谢与炎症反应之间的分子桥梁在糖尿病肾病进展中的作用 | NA | 探究脂质积累与炎症信号在糖尿病肾病肾小管损伤中的分子联系 | 不同病理等级的糖尿病肾病患者肾活检样本 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 空间转录组学、数字空间分析、RNA scope、免疫荧光显微镜 | NA | 空间转录组数据、图像数据 | 14例不同病理等级的糖尿病肾病患者样本 | NA | 空间转录组学、单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 743 | 2026-06-05 |
Mitochondria-targeted nanozyme system for psoriasis treatment
2026-Feb-07, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04068-z
PMID:41652629
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研究论文 | 开发了一种多功能脂质体水凝胶纳米平台用于银屑病的靶向治疗,通过抗氧化和抗炎双重机制发挥作用 | 首次将线粒体靶向纳米酶与网络药理学、转录组学和单细胞测序技术相结合,揭示ROS/mTOR/HIF-1α轴在银屑病中性粒细胞调控中的关键作用 | 研究仅基于IMQ诱导的银屑病小鼠模型,尚需在人类临床样本中验证疗效 | 开发一种新型纳米治疗策略用于银屑病及相关慢性炎症性皮肤病的治疗 | 银屑病样皮肤炎症的机制及CMH@lip@Res-TCeO纳米平台的疗效 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 网络药理学, 转录组学 | NA | 转录组数据 | IMQ诱导的银屑病样小鼠模型(具体样本数量未提供) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 744 | 2026-06-05 |
Ex vivo long-term expansion of human hematopoietic stem and progenitor cells as a tool for modeling vector integration sites and clonality
2026-Feb-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07700-6
PMID:41654907
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研究论文 | 本研究利用小分子APU实现人类造血干祖细胞的离体长期扩增,以模拟载体整合位点及克隆性,用于基因治疗前的基因毒性评估 | 首次使用APU组合小分子实现人脐带血HSPCs的长期离体扩增和培养,结合整合位点分析动态追踪致突变性载体插入导致的克隆扩增,替代传统小鼠模型进行人类特异的基因毒性测试 | 离体模型与体内骨髓环境的克隆多样性尚有差异,且仅验证了脐带血来源的HSPCs,其他来源细胞(如骨髓或动员外周血)未提及 | 开发基于人类HSPCs的新型体外基因毒性检测方法,通过长期培养监测整合位点克隆性变化,预测插入突变风险 | 人脐带血来源的造血干祖细胞 | 数字病理学 | 遗传性疾病 | 慢病毒转导, 单细胞RNA测序, 整合位点分析, 异种移植 | NA | 基因表达数据, 整合位点序列数据 | 脐带血来源HSPCs(未明确定量),5周体外培养和1次异种移植(小鼠骨髓样本) | 10x Genomics, 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, 10x Chromium | 单细胞RNA测序采用10x Chromium平台进行文库构建 |
| 745 | 2026-06-05 |
Azoospermia phenotype and scRNA-seq reveal hnRNPK as a factor essential for male germ cell development in mice
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag108
PMID:41665013
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研究论文 | 通过生精细胞特异性Hnrnpk敲除小鼠模型结合多组学分析,发现hnRNPK是维持分化精原细胞正常发育的关键因子,揭示其在转录后水平调控雄性生殖细胞发育的机制 | 首次阐明hnRNPK在分化精原细胞中通过细胞质(与DAZL互作调控翻译起始)和细胞核(参与剪接)双重机制调控生殖细胞发育,填补了转录后调控在精子发生中的认识空白 | 当前信息未提及具体局限性,但基于模型可能包括:仅在小鼠模型验证、未探究人类患者中hnRNPK突变、多组学整合深度有限等 | 研究hnRNPK在雄性生殖细胞发育中的功能及分子机制 | 生精细胞特异性Hnrnpk敲除小鼠模型的分化精原细胞 | 机器学习 | 无精症 | scRNA-seq, 多组学分析, 基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据, 翻译效率数据, 剪接数据 | 成年生精细胞特异性Hnrnpk敲除小鼠与对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 746 | 2026-06-05 |
Intranasal Human NSC-Derived EVs Therapy Can Restrain Inflammatory Microglial Transcriptome, and NLRP3 and cGAS-STING Signalling, in Aged Hippocampus
2026-Feb, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70232
PMID:41656949
|
研究论文 | 该研究探讨了鼻内给予人类诱导多能干细胞衍生的神经干细胞胞外囊泡对老年小鼠海马神经炎症的影响 | 首次证明鼻内给予hiPSC-NSC-EVs可通过miRNA抑制NLRP3和cGAS-STING信号通路,减轻老年海马神经炎症并改善认知功能 | NA | 评估鼻内给予hiPSC-NSC-EVs对中年晚期小鼠海马神经炎症的治疗效果及其机制 | 18月龄C57BL6/J小鼠(雄性和雌性) | 神经科学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序、胞外囊泡治疗 | NA | 基因表达数据 | 18月龄小鼠,接受两次鼻内给药后于20.5月龄分析 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序7天后进行转录组分析 |
| 747 | 2026-06-05 |
Integrative cross-tissue and spatially resolved single-cell profiling uncovers tumour-educated inflammatory remodelling of tissue-resident macrophage ecosystem with immunotherapeutic prognostic significance in pan-cancer
2026-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70608
PMID:41655028
|
研究论文 | 通过整合跨组织和空间分辨的单细胞图谱,揭示泛癌组织中组织驻留巨噬细胞受肿瘤教育后的炎症重塑及免疫治疗预后意义 | 首次构建跨组织单细胞图谱揭示组织驻留巨噬细胞在泛癌中的保守炎症表型,发现组织驻留巨噬细胞和单核细胞来源巨噬细胞在肿瘤微环境中趋同分化形成炎症表型,并开发具有临床转化潜力的预后生物标志物 | 未提及具体局限性,但研究主要依赖公共数据库,且验证样本类型有限 | 阐明组织驻留巨噬细胞在肿瘤微环境中的功能重编程机制及其对免疫治疗预后的影响 | 从五种恶性肿瘤中收集的139万单细胞转录组数据和2318个批量RNA-seq样本 | 机器学习 | 泛癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、批量RNA-seq数据 | 139万单细胞和2318个批量RNA-seq样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 748 | 2026-06-05 |
Regnase-1-mediated regulation of neutrophils modulates SARS-CoV-2 pneumonia
2026-Feb, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013969
PMID:41662396
|
研究论文 | 本研究揭示了Regnase-1通过调控中性粒细胞功能影响SARS-CoV-2 MA10株感染抵抗力的机制 | 首次发现Regnase-1通过抑制Tsc22d3表达促进中性粒细胞干扰素反应,从而减弱对SARS-CoV-2感染抵抗力 | 基于小鼠模型,可能不完全代表人类SARS-CoV-2感染情况 | 探究Regnase-1在SARS-CoV-2感染中调节先天免疫反应的机制 | Regnase-1+/-杂合小鼠及其中性粒细胞 | 机器学习 | SARS-CoV-2肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Regnase-1+/-小鼠和野生型小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 749 | 2026-06-05 |
Single-cell pseudotime and cell communication analysis of pancreatic cancer
2026-Feb, Advances in clinical and experimental medicine : official organ Wroclaw Medical University
IF:2.1Q3
DOI:10.17219/acem/203156
PMID:41662508
|
研究论文 | 通过单细胞伪时间轨迹和细胞通讯分析,揭示胰腺癌进展中的细胞和分子机制 | 首次整合单细胞伪时间轨迹和细胞间通讯分析,深入剖析胰腺癌肿瘤微环境中的细胞多样性及相互作用 | 未提及具体限制 | 阐明胰腺癌进展的细胞和分子调控机制 | 胰腺癌组织中的癌细胞、基质成纤维细胞及多种免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 750 | 2026-06-05 |
SpaLSTF: Diffusion-based generative model with BiLSTM and XCA-Transformer for spatial transcriptomics imputation
2026-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013954
PMID:41666195
|
研究论文 | 提出SpaLSTF方法,利用条件扩散模型结合BiLSTM和XCA-Transformer来增强空间转录组数据中的基因表达 | 首次将双马尔可夫过程与BiLSTM和交叉协方差注意力Transformer结合,用于空间转录组数据的基因表达推断,并通过变分下界和KL散度正则化提升噪声生成的准确性 | 未涉及在实际生物样本中的验证;仅基于现有数据集进行性能比较,缺乏对模型泛化性的深入探讨 | 开发一种新方法以解决空间转录组数据稀疏性和表达覆盖不完整的问题 | 空间转录组数据中的细胞和基因表达模式 | 机器学习 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 条件扩散模型、双向长短期记忆网络(BiLSTM)、交叉协方差注意力Transformer(XCA-Transformer) | 基因表达数据(空间转录组和scRNA-seq) | 12个跨平台数据集,涵盖多种组织和器官 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 751 | 2026-06-05 |
Environmental bisphenols hijack the Hmox1 and Cdh1 to trigger premature ovarian insufficiency: A multi-omics investigation
2026-Feb, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.119789
PMID:41666766
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示环境双酚类化合物通过劫持Hmox1和Cdh1基因引发早发性卵巢功能不全的分子机制 | 首次整合机器学习与单细胞RNA测序解析双酚类化合物致POI关键靶点Hmox1和Cdh1 | 未提供具体样本量及临床验证数据 | 鉴定双酚类化合物诱发早发性卵巢功能不全的关键分子靶点与信号通路 | 双酚A、双酚F、双酚S暴露与早发性卵巢功能不全的分子关联 | 机器学习 | 早发性卵巢功能不全 | 多组学分析、单细胞RNA测序、分子对接 | 三重算法机器学习模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | ['10x Genomics'] | ['单细胞RNA测序'] | ['10x Chromium'] | 基于GSE200612数据集的10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 752 | 2026-06-05 |
A comparative study of statistical methods for identifying differentially expressed genes in spatial transcriptomics
2026-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013956
PMID:41671295
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研究论文 | 对空间转录组学中差异表达基因识别的统计方法进行比较研究,提出基于广义估计方程(GEE)的鲁棒方法 | 提出将广义估计方程框架用于空间转录组学差异表达分析,通过纳入空间相关性有效控制假阳性率 | 未明确提及具体局限性 | 开发并验证一种更稳健的统计方法,以替代忽略空间相关性的Wilcoxon秩和检验,提高差异基因鉴定的准确性 | 空间转录组学数据中的基因表达模式,特别是乳腺癌和前列腺癌组织样本 | 机器学习 | 乳腺癌, 前列腺癌 | 空间转录组学技术 | 广义估计方程(GEE) | 空间转录组学数据 | 来自乳腺癌和前列腺癌的空间转录组学数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 753 | 2026-06-05 |
Environmental flame retardant EHDPP stabilizes EGFR to accelerate lung cancer progression: Integrated network toxicology, bioinformatics, and in vitro evidence
2026-Feb, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.119854
PMID:41671956
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研究论文 | 整合网络毒理学、生物信息学和体外实验,揭示环境阻燃剂EHDPP通过稳定EGFR加速肺癌进展的分子机制 | 首次在分子层面阐明EHDPP通过结合EGFR并抑制其泛素化降解,稳定EGFR蛋白并激活PI3K-AKT信号通路,从而促进肺癌进展的致癌机制 | 研究主要基于体外细胞模型和计算预测,缺乏体内动物实验和人群流行病学证据的验证 | 阐明有机磷酸酯阻燃剂EHDPP通过吸入暴露促进肺癌进展的分子机制 | EHDPP诱导肺癌的潜在分子靶点及信号通路 | 生物信息学, 毒理学 | 肺癌 | 网络毒理学, 分子对接, scRNA-seq分析, 细胞实验 | NA | 基因表达数据, scRNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 754 | 2026-06-05 |
[The consensus of genetic detection in multiple myeloma in China (2026)]
2026-Jan-14, Zhonghua xue ye xue za zhi = Zhonghua xueyexue zazhi
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共识 | 本文提出了中国多发性骨髓瘤遗传检测的2026年共识,旨在标准化检测流程、优化高风险遗传异常的解读与报告,并更新风险分层框架 | 基于最新证据对2019年共识进行修订,纳入了全基因组测序和单细胞测序等新技术,并考虑了联合治疗方案对遗传病灶预后影响的改变 | 未明确说明 | 标准化中国多发性骨髓瘤遗传检测,提升高风险患者的识别和管理 | 多发性骨髓瘤的遗传异常 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 细胞遗传学核型分析、荧光原位杂交、下一代测序、全基因组测序、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 755 | 2026-06-05 |
CeLLTra: aligning cell names with gene expression via a pathway-informed transformer
2026-Jan-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf655
PMID:41652996
|
research paper | 提出了一种名为CeLLTra的对比学习框架,利用基于Transformer的模型整合生物通路信息,将基因分组为超级标记,从而从单细胞RNA测序数据中捕捉全面的基因表达 | 创新性地将通路信息整合到Transformer模型中,结合预训练领域特定语言模型,实现了细胞类型注释与基因表达谱的精准对齐 | 未在文中明确提及局限性 | 开发一种新的细胞类型注释方法,以解决传统方法因数据质量低和参考数据集不完整带来的挑战 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | natural language processing | non-small cell lung cancer | scRNA-Seq | Transformer | gene expression data | 大规模人类scRNA-Seq数据集(具体数量未提及) | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 756 | 2026-06-05 |
Integration of single-cell sequencing, transcriptome sequencing, and machine learning for constructing and validating histone acetylation-related prognostic risk models in hepatocellular carcinoma
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1624883
PMID:41659855
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研究论文 | 通过整合单细胞测序、转录组测序和机器学习,构建并验证了肝细胞癌中组蛋白乙酰化相关的预后风险模型 | 首次利用101种机器学习算法组合构建基于组蛋白乙酰化相关基因的肝细胞癌风险预测模型,并综合分析了免疫学、化疗敏感性、铁死亡和m6A甲基化等多个维度 | 研究基于公共数据库数据,可能需要更多独立外部验证;NEU1的具体机制仍需进一步体内实验验证 | 构建基于组蛋白乙酰化的肝细胞癌预后风险模型并验证其临床价值 | 肝细胞癌(LIHC)患者 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞测序, RNA-seq, 定量实时PCR, 蛋白质印迹 | 机器学习组合算法(101种组合) | 单细胞测序数据, 转录组数据, 临床样本数据 | 多份训练和验证队列,包括10种LIHC亚型样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 757 | 2026-06-05 |
Epithelial Cell-Specific Prognostic Signature (FTH1, RIT1, WASL, NDRG2, KIFC3) Stratifies Cervical Cancer Patients and Correlates With Immune Infiltration
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/4109928
PMID:41660555
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序数据构建宫颈癌上皮细胞特异性预后基因签名(FTH1、RIT1、WASL、NDRG2、KIFC3),并分析其与免疫浸润及药物敏感性的关联 | 首次从单细胞层面聚焦宫颈癌上皮细胞异质性,通过hdWGCNA鉴定上皮细胞亚群特异性基因模块,构建五基因预后模型,并验证了FTH1在宫颈癌细胞中的功能 | 研究依赖于公开数据集GSE208653,样本量和数据来源有限;预后模型的临床适用性需更大规模前瞻性队列验证;具体基因功能机制未深入探索 | 开发宫颈癌上皮细胞特异性风险模型,改善临床预后评估并揭示肿瘤免疫微环境变化 | 宫颈癌患者的单细胞RNA测序数据、TCGA-CESC和GSE52903队列的转录组数据及临床信息 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO-Cox回归风险模型 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | GSE208653数据集包含40457个细胞,TCGA-CESC和GSE52903队列的批量转录组样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 758 | 2026-06-05 |
Integrated multi-omics, spatial profiling and organoid modeling drive transformative advances in chronic liver disease and hepatocellular carcinoma immunomicroenvironment research
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1743439
PMID:41668742
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综述 | 系统总结了单细胞测序、空间转录组学和类器官模型在慢性肝病及肝细胞癌免疫微环境研究中的突破性应用,强调多组学整合、空间分析和类器官建模的协同作用推动了从静态描述到时空机制解码的范式转变 | 首次系统性整合单细胞测序、空间转录组学和类器官模型三大前沿技术,揭示其在解析肝免疫微环境时空动态、免疫逃逸机制及个体化治疗方面的协同创新 | 未提及具体技术的局限性,如单细胞测序的覆盖深度、空间转录组学的分辨率限制或类器官模型对体内微环境模拟的不足 | 阐述多组学整合、空间分析和类器官建模在慢性肝病免疫学研究中推动从静态细胞描述到时空机制解码及个体化治疗的范式转变 | 慢性肝病和肝细胞癌的免疫微环境,包括免疫细胞异质性、免疫-基质相互作用、纤维化、脂肪性肝炎及肿瘤免疫逃逸机制 | 数字病理学 | 肝癌 | NGS,RNA-seq,甲基化测序 | 类器官模型 | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 759 | 2026-06-05 |
Molecular crosstalk between MASLD and IVDD revealed through integrated biomarker discovery analysis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1703972
PMID:41668749
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研究论文 | 通过整合生物标志物发现分析揭示了代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)与椎间盘退变(IVDD)之间的分子交互作用 | 首次通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据集,系统揭示MASLD与IVDD之间的共享分子机制和生物标志物 | 研究仅基于有限样本验证,尚未在更大规模队列中进行确认;共病患者的分子变化机制需要进一步功能实验验证 | 探究MASLD与IVDD之间潜在的分子交互作用及共享致病机制 | MASLD患者、IVDD患者及共病患者 | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病, 椎间盘退变 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析, LASSO回归 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 10,388个NAFLD细胞和35,846个IVDD细胞 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 760 | 2026-06-05 |
Single cell atlas of the comorbidity mechanism between chronic obstructive pulmonary disease and lung adenocarcinoma: a study of multi-omics combined analysis
2026, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.20672
PMID:41669548
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研究论文 | 通过多组学联合分析揭示慢性阻塞性肺疾病与肺腺癌共病机制的单细胞图谱 | 首次结合孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序和多组学方法,系统揭示COPD与LUAD共享的关键基因(FCRLA、GREM1、MMP9)及其在免疫调节和细胞外基质重塑中的协同作用 | 未明确指出研究的具体局限性,如样本量大小或验证范围的限制 | 阐明慢性阻塞性肺疾病与肺腺癌共病的共享分子机制,识别潜在生物标志物和治疗靶点 | 慢性阻塞性肺疾病和肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 全基因组关联研究, 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序, 实时定量PCR | LASSO回归 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 血液样本 | 患者血液样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |