单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
7561	2024-10-05	Spatial Transcriptomics Analysis: Maternal Obesity Impairs Myogenic Cell Migration and Differentiation during Embryonic Limb Development 2024-Aug-31, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms25179488 PMID:39273445	研究论文	研究母体肥胖对胚胎肢体发育过程中肌细胞迁移和分化的影响	首次探讨了母体肥胖对肌细胞迁移相关生物过程的抑制作用	仅使用了C57BL/6小鼠模型，样本量较小	探讨母体肥胖对胚胎肢体发育过程中肌细胞迁移和分化的影响	C57BL/6小鼠胚胎的肌细胞迁移和分化	数字病理学	肥胖症	GeoMx DSP平台	NA	基因表达数据	C57BL/6小鼠胚胎，E13.5期，样本量未明确提及
7562	2024-10-05	Role of Neutrophils in the Development of Steatotic Liver Disease 2024-Aug, Seminars in liver disease IF:4.3Q1 DOI:10.1055/s-0044-1789207 PMID:39117322	综述	本文综述了中性粒细胞在脂肪肝疾病发展中的生物学作用及其作为治疗靶点的潜力	本文介绍了中性粒细胞在无菌性炎症中的作用，这是脂肪肝疾病发病机制的关键组成部分	尽管技术进步如单细胞RNA测序揭示了中性粒细胞亚群的存在，但这些不同亚群如何不同地参与脂肪肝疾病的发展仍不清楚	探讨中性粒细胞在脂肪肝疾病发展中的作用及其作为治疗靶点的潜力	中性粒细胞及其在脂肪肝疾病中的作用	NA	脂肪肝疾病	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
7563	2024-10-05	The dynamic behavior of chromatophores marks the transition from bands to spots in leopard geckos 2024-Jul-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2400486121 PMID:38976731	研究论文	研究豹纹守宫皮肤颜色从带状到斑点的转变过程	首次揭示了豹纹守宫皮肤颜色从带状到斑点的转变机制，并通过遗传分析和单细胞转录组学分析确定了关键基因的作用	研究主要集中在豹纹守宫的特定基因型，可能不适用于其他物种或基因型	探讨爬行动物皮肤颜色形成的发育过程和分子信号通路	豹纹守宫的带状和斑点皮肤模式	NA	NA	单细胞转录组学分析	NA	基因序列	豹纹守宫的胚胎皮肤样本
7564	2024-10-05	Single-cell analysis reveals an antiviral network that controls Zika virus infection in human dendritic cells 2024-May-14, Journal of virology IF:4.0Q2 DOI:10.1128/jvi.00194-24 PMID:38567950	研究论文	本文利用单细胞RNA测序技术研究了人类树突状细胞对寨卡病毒感染的抗病毒反应	首次在单细胞水平上揭示了寨卡病毒感染时抗病毒网络的组成和功能	研究仅限于人类树突状细胞，未涉及其他细胞类型	深入理解宿主对寨卡病毒感染的反应机制	人类树突状细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	一批人类单核细胞衍生的树突状细胞
7565	2024-10-05	Stimulation of fracture mineralization by salt-inducible kinase inhibitors 2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2 DOI:10.3389/fbioe.2024.1450611 PMID:39359266	研究论文	研究盐诱导激酶抑制剂对骨折矿化的刺激作用	首次测试了盐诱导激酶抑制剂YKL-05-099对骨折愈合的加速作用，并开发了基于水凝胶的siRNA递送系统	NA	研究盐诱导激酶抑制剂对骨折愈合的影响	骨折愈合过程中的矿化和组织结构	NA	NA	RT-qPCR, 单细胞RNA测序, μCT成像	NA	RNA, 图像	126只雌性小鼠
7566	2024-10-05	Recent progress and applications of single-cell sequencing technology in breast cancer 2024, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2024.1417415 PMID:39359479	综述	本文综述了单细胞测序技术在乳腺癌研究中的最新进展和应用	单细胞RNA测序和单细胞DNA测序技术结合多组学技术，显著增强了我们对肿瘤微环境中细胞多样性的理解	NA	探讨单细胞测序技术在乳腺癌研究中的潜力，特别是其在解码驱动疾病进展、治疗抵抗和转移的复杂基因组景观中的作用	乳腺癌及其肿瘤微环境	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞DNA测序	NA	基因组数据	NA
7567	2024-10-05	Food antigens suppress small intestinal tumorigenesis 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1373766 PMID:39359724	研究论文	研究食物抗原在小肠肿瘤发生中的抑制作用	首次报道食物抗原通过Peyer's patches（PPs）在小肠肿瘤发生中起到抑制作用	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证	探讨食物抗原在小肠肿瘤发生中的作用	小肠肿瘤、Peyer's patches（PPs）、食物抗原	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	小鼠模型中的免疫细胞
7568	2024-10-05	Single-cell RNA sequencing data locate ALDH1A2-mediated retinoic acid synthetic pathway to glomerular parietal epithelial cells 2024, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.) DOI:10.3389/ebm.2024.10167 PMID:39360029	review	本文通过挖掘单细胞和单核RNA测序数据库，发现肾小球壁上皮细胞中存在完整的视黄酸合成途径	首次在肾小球壁上皮细胞中发现ALDH1A2介导的视黄酸合成途径，并探讨了其在肾脏生理和病理中的潜在作用	需要进一步的实验验证和临床研究来证实ALDH1A2在肾脏中的具体作用	探讨ALDH1A2在肾脏生理和病理中的作用	肾小球壁上皮细胞	digital pathology	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	包括小鼠和人类肾脏的单细胞和单核RNA测序数据
7569	2024-10-05	Discovery of GJC1 as a prognostic biomarker in glioma cells: insights into its cell-cycle relationship and differential expression in non-neuronal cells 2024, Frontiers in cellular neuroscience IF:4.2Q2 DOI:10.3389/fncel.2024.1440409 PMID:39360264	研究论文	本研究探讨了GJC1作为胶质瘤细胞中的预后生物标志物的潜力及其与细胞周期的关系	发现GJC1在胶质瘤中具有独立的预后价值，并揭示了其在非神经细胞中的差异表达	研究主要基于回顾性分析，未来需要进一步的实验验证	研究GJC1在胶质瘤中的预后价值及其与细胞周期的关系	胶质瘤细胞及其与GJC1表达的关系	数字病理学	脑肿瘤	RNA-seq, 单细胞测序	NA	基因表达数据	使用了中国胶质瘤基因组图谱(CGGA)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库的数据
7570	2024-10-05	Cellular Heterogeneity of Activated Primary Human Macrophages and Associated Drug-Gene Networks: From Biology to Precision Therapeutics 2023-11-07, Circulation IF:35.5Q1 DOI:10.1161/CIRCULATIONAHA.123.064794 PMID:37850387	研究论文	研究了干扰素-γ激活的人类原代巨噬细胞的细胞异质性及其相关的药物-基因网络，旨在从生物学到精准治疗	通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析，鉴定了两种主要的巨噬细胞亚群，并结合细胞签名药物库识别了一种新型化合物，该化合物能够靶向治疗动脉粥样硬化	NA	探索巨噬细胞亚群在动脉粥样硬化中的作用，并开发新的免疫治疗方法	干扰素-γ激活的人类原代巨噬细胞及其在动脉粥样硬化中的作用	NA	心血管疾病	单细胞RNA测序、蛋白质组学、代谢物消耗分析、免疫测定、功能测试	NA	RNA序列数据	人类原代巨噬细胞、人类颈动脉粥样硬化斑块、小鼠动脉粥样硬化模型
7571	2024-10-05	Adrenomedullin has a pivotal role in trophoblast differentiation: A promising nanotechnology-based therapeutic target for early-onset preeclampsia 2023-11-03, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adi4777 PMID:37922358	研究论文	研究探讨了肾上腺髓质素（ADM）在滋养层细胞分化中的关键作用，并提出了一种基于纳米技术的早期子痫前期的潜在治疗靶点	首次揭示了ADM在滋养层细胞分化中的重要作用，并提出了一种基于纳米技术的治疗策略	研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体中进行验证	探讨ADM在早期子痫前期中的作用及其作为治疗靶点的潜力	滋养层细胞、早期子痫前期患者、妊娠小鼠	生物医学	妊娠相关疾病	单细胞测序、空间转录组学	NA	基因表达数据	人类绒毛膜滋养层细胞、滋养层干细胞、滋养层类器官、妊娠小鼠
7572	2024-10-05	Multi-scale characterisation of homologous recombination deficiency in breast cancer 2023-11-02, Genome medicine IF:10.4Q1 DOI:10.1186/s13073-023-01239-7 PMID:37919776	研究论文	本文研究了乳腺癌中同源重组缺陷的多尺度特征，开发了基于插入缺失事件的分类方法和转录组特征，以提高同源重组缺陷的分类准确性	本文创新性地利用插入缺失事件和转录组特征来提高同源重组缺陷的分类准确性，并展示了其在单细胞转录组数据中的应用	本文未详细讨论所开发方法在其他癌症类型中的适用性	研究乳腺癌中同源重组缺陷的多尺度特征，并开发新的分类方法	乳腺癌中的同源重组缺陷及其与BRCA1/2缺陷状态的关系	数字病理学	乳腺癌	外显子测序、单细胞RNA测序	多重弹性网络回归模型	基因表达数据	涉及多个乳腺癌样本，包括单细胞RNA测序数据
7573	2024-10-05	Neutrophils resist ferroptosis and promote breast cancer metastasis through aconitate decarboxylase 1 2023-10-03, Cell metabolism IF:27.7Q1 DOI:10.1016/j.cmet.2023.09.004 PMID:37793345	研究论文	研究揭示了中性粒细胞通过aconitate脱羧酶1（Acod1）抵抗铁死亡并促进乳腺癌转移的机制	首次发现Acod1在中性粒细胞中的高表达及其在抵抗铁死亡和促进乳腺癌转移中的关键作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行大规模验证	探讨中性粒细胞在乳腺癌转移中的作用及其潜在治疗靶点	肿瘤浸润中性粒细胞（TINs）和循环中性粒细胞	癌症研究	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	小鼠乳腺肿瘤模型中的TINs和循环中性粒细胞
7574	2024-10-05	Single-cell transcriptomic profiling of human pancreatic islets reveals genes responsive to glucose exposure over 24 hours 2023-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.06.06.543931 PMID:37333221	研究论文	研究探讨了高血糖对人类胰腺胰岛基因表达的影响	首次使用单细胞RNA测序技术分析了不同葡萄糖浓度下人类胰腺胰岛基因表达的动态变化	样本量较小，仅来自两个捐赠者	探索高血糖对人类胰腺胰岛基因表达的影响及其与2型糖尿病的关系	人类胰腺胰岛细胞	基因组学	2型糖尿病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	两个捐赠者的胰腺胰岛细胞
7575	2024-10-05	NOTCH3 drives meningioma tumorigenesis and resistance to radiotherapy 2023-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.07.10.548456 PMID:37503127	研究论文	研究报告NOTCH3在驱动脑膜瘤肿瘤发生和放射治疗抵抗中的作用	发现NOTCH3+脑膜瘤壁细胞在人类、狗和鼠中保守，并揭示了NOTCH3在肿瘤起始、细胞增殖、血管生成和放射治疗抵抗中的作用	研究主要基于小鼠遗传和异种移植模型，需要在临床试验中进一步验证	探讨NOTCH3在脑膜瘤肿瘤发生和放射治疗抵抗中的作用及其潜在治疗价值	脑膜瘤及其对放射治疗的抵抗性	数字病理学	脑膜瘤	单细胞转录组学、谱系追踪和成像技术	NA	单细胞转录组数据	涉及人类、狗和鼠的脑膜瘤样本
7576	2024-10-05	Spatiotemporal single-cell transcriptomic profiling reveals inflammatory cell states in a mouse model of diffuse alveolar damage 2023-Jun, Exploration (Beijing, China) DOI:10.1002/EXP.20220171 PMID:37933384	研究论文	本文通过结合单细胞和空间转录组学技术，系统分析了在小鼠弥漫性肺泡损伤模型中，由蓖麻毒素气溶胶吸入引起的嗜中性粒细胞炎症的细胞状态	本文揭示了稳态下的成纤维细胞向超炎症状态的转变，并发现激活的成纤维细胞与嗜中性粒细胞之间的CXCL1-CXCR2趋化因子轴在进一步招募嗜中性粒细胞中的作用	NA	研究弥漫性肺泡损伤过程中炎症细胞状态的变化	小鼠弥漫性肺泡损伤模型中的炎症细胞状态	数字病理学	肺部疾病	单细胞和空间转录组学	NA	转录组数据	小鼠模型
7577	2024-10-05	Repurposable drugs for SARS-CoV-2 and influenza sepsis with scRNA-seq data targeting post-transcription modifications 2021-Dec, Precision clinical medicine IF:5.1Q1 DOI:10.1093/pcmedi/pbab022 PMID:34993416	研究论文	本文通过整合基因表达扰动数据和单细胞RNA测序数据，识别出可重新用于治疗SARS-CoV-2和流感脓毒症的药物	本文采用系统生物学方法，结合FDA批准药物和临床前小分子化合物的基因表达扰动数据，以及COVID-19患者的单细胞RNA测序数据，识别出281种可能有效对抗SARS-CoV-2感染的药物，并实验验证了其中两种药物对流感病毒复制和宿主细胞细胞因子及其调节因子转录和翻译的抑制作用	本文主要基于现有数据和已批准药物进行筛选，未涉及新药开发	识别可重新用于治疗SARS-CoV-2和流感脓毒症的药物	SARS-CoV-2和流感病毒感染及其并发症	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	轻度和重度COVID-19患者的数据（GEO: GSE145926）
7578	2024-10-04	Implications of accumulation of clonally expanded and senescent CD4+GNLY+ T cells in immunological non-responders of HIV-1 infection 2024-Dec, Emerging microbes & infections IF:8.4Q1 DOI:10.1080/22221751.2024.2396868 PMID:39239709	研究论文	研究探讨了HIV-1感染免疫无应答者中CD4+GNLY+ T细胞的积累及其与免疫重建的关系	首次揭示了CD4GNLY T细胞在HIV-1感染免疫无应答者中的高克隆扩增和衰老特征，并探讨了其与免疫重建的关系	研究样本量较小，可能影响结果的普适性	阐明CD4GNLY T细胞的特征及其与HIV-1感染免疫无应答者免疫重建的关系	HIV-1感染免疫无应答者中的CD4GNLY T细胞	免疫学	HIV感染	单细胞RNA测序、单细胞TCR测序、流式细胞术、酶联免疫吸附试验	NA	单细胞RNA数据、TCR数据、流式细胞数据、血浆细胞因子数据	HIV-1感染免疫无应答者的血液样本
7579	2024-10-04	Integrating cellular experiments, single-cell sequencing, and machine learning to identify endoplasmic reticulum stress biomarkers in idiopathic pulmonary fibrosis 2024-Dec, Annals of medicine IF:4.9Q1 DOI:10.1080/07853890.2024.2409352 PMID:39340293	研究论文	本研究整合细胞实验、单细胞测序和机器学习技术，识别特发性肺纤维化中的内质网应激相关生物标志物	首次将内质网应激与特发性肺纤维化的生物标志物识别相结合，并开发了具有强预测能力的诊断和预后模型	NA	揭示特发性肺纤维化中的内质网应激相关生物标志物	特发性肺纤维化患者肺组织中的内质网应激相关基因和细胞类型	机器学习	特发性肺纤维化	单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、蛋白质-蛋白质相互作用分析	机器学习算法	基因表达数据	多个数据集和体外实验样本
7580	2024-10-04	The concept of onychodermis containing onychofibroblasts has histological (microanatomical), immunohistochemical as well as molecular basis 2024-Nov, Journal of cutaneous pathology IF:1.6Q3 DOI:10.1111/cup.14696 PMID:39044464	研究论文	本文探讨了包含onychofibroblasts的onychodermis的概念，并提供了其组织学、免疫组织化学和分子基础的证据	首次通过单细胞RNA测序和原位杂交技术，揭示了onychofibroblasts在onychodermis中表达的关键基因，这些基因与指甲形成和相关疾病有关	NA	研究onychodermis和onychofibroblasts在指甲发育和病理中的作用	onychodermis和onychofibroblasts的组织学、免疫组织化学和分子特征	NA	NA	单细胞RNA测序、原位杂交	NA	基因表达数据	NA