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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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7541 | 2025-10-06 |
Synovial fibroblast gene expression is associated with sensory nerve growth and pain in rheumatoid arthritis
2024-04-10, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adk3506
PMID:38598614
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法识别与类风湿关节炎疼痛相关的滑膜成纤维细胞基因表达模块,并验证其促进疼痛感觉神经生长的机制 | 开发了基于图的基因表达模块识别方法,首次发现滑膜衬里层成纤维细胞基因表达与疼痛感觉神经生长的直接关联 | 研究样本主要来自炎症程度较低的类风湿关节炎患者,结果在高度炎症情况下的适用性需进一步验证 | 探究类风湿关节炎疼痛机制与滑膜成纤维细胞基因表达的关系 | 类风湿关节炎患者的滑膜活检样本、滑膜成纤维细胞、背根神经节神经元 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、机器学习、受体-配体相互作用分析 | GbGMI(基于图的基因表达模块识别) | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 两个独立队列的类风湿关节炎患者滑膜活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7542 | 2025-10-06 |
Multimodal Analytical Tools to Enhance Mechanistic Understanding of Aortic Valve Calcification
2024-04, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2023.06.017
PMID:37517686
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综述 | 本文综述了用于增强主动脉瓣钙化机制理解的多模态分析工具 | 整合转录组学、蛋白质组学和分子成像技术,构建研究钙化性主动脉瓣疾病(CAVD)的整体方法,具有识别新调控通路的潜力 | NA | 推进钙化性主动脉瓣疾病和药物靶点研究 | 钙化性主动脉瓣疾病(CAVD) | 生物医学研究 | 心血管疾病 | 转录组学, 蛋白质组学, 分子成像, 正电子发射断层扫描/计算机断层扫描 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 影像数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7543 | 2025-10-06 |
Endothelial cells drive organ fibrosis in mice by inducing expression of the transcription factor SOX9
2024-02-28, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abq4581
PMID:38416842
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研究论文 | 本研究揭示内皮细胞通过转录因子SOX9驱动多器官纤维化的机制 | 首次证实内皮细胞(而非仅成纤维细胞)通过SOX9表达直接促进器官纤维化,并发现CCN2是介导此过程的关键因子 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚不充分 | 探究内皮细胞在器官纤维化中的作用机制 | 小鼠模型及人类心力衰竭患者心脏组织 | 分子生物学 | 器官纤维化/心力衰竭 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 基因编辑 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据, 组织病理数据 | 多种小鼠纤维化模型(心脏、肺、肝)及人类心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
7544 | 2025-10-06 |
Lipocalin-2 expression identifies an intestinal regulatory neutrophil population during acute graft-versus-host disease
2024-02-21, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adi1501
PMID:38381845
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现表达脂质运载蛋白-2的肠道中性粒细胞群体,可减轻急性移植物抗宿主病的严重程度 | 首次发现LCN2表达的中性粒细胞群体通过调控巨噬细胞功能缓解aGVHD,并揭示LCN2/IGF-1R信号通路机制 | 未明确LCN2治疗对移植物抗白血病效应的影响,人类样本验证仍需扩大 | 探索急性移植物抗宿主病的肠道组织耐受机制和潜在治疗策略 | 小鼠模型和人类aGVHD患者肠道活检样本 | 单细胞生物学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个患者队列的肠道活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7545 | 2025-10-06 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics to characterize the molecular and cellular architecture of the ischemic mouse brain
2024-02-07, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg1323
PMID:38324639
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研究论文 | 本研究结合空间转录组学和单细胞转录组学技术,系统描绘了缺血性小鼠大脑的分子和细胞结构特征 | 首次整合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,揭示了缺血大脑中LGALS9-CD44信号通路的关键作用,并发现细胞外囊泡介导的Lgals9递送可改善功能恢复 | 研究仅基于小鼠模型,需要在其他物种中进一步验证;Lgals9的具体作用机制仍需深入探索 | 表征缺血性大脑的分子和细胞结构特征,探索神经炎症在脑缺血后的病理机制 | 缺血性中风小鼠模型中的脑组织细胞 | 空间转录组学 | 脑血管疾病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | 19,777个转录组位点 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7546 | 2025-10-06 |
CD23+IgG1+ memory B cells are poised to switch to pathogenic IgE production in food allergy
2024-02-07, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adi0673
PMID:38324641
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研究论文 | 本研究在儿童花生过敏中发现了一类CD23+IgG1+记忆B细胞,这些细胞在2型免疫反应中产生,含有高亲和力花生特异性克隆,并能被激活分化为产生IgE的细胞 | 首次描述了CD23+IgG1+记忆B细胞作为致病性IgE产生细胞前体在食物过敏中的关键作用,揭示了长期过敏持续性的潜在机制 | 研究主要聚焦于儿童花生过敏,样本来源相对局限,需要进一步验证在其他食物过敏中的普适性 | 探究食物过敏中持续性IgE反应的B细胞记忆机制 | 人类儿童花生过敏患者 | 免疫学 | 食物过敏 | 单细胞RNA测序,B细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据,血清学数据 | 儿童花生过敏患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7547 | 2025-10-06 |
Understanding the cell fate and behavior of progenitors at the origin of the mouse cardiac mitral valve
2024-02-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.12.006
PMID:38198889
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和克隆分析揭示了小鼠心脏二尖瓣发育过程中内皮祖细胞的命运决定机制 | 首次定义了二尖瓣祖细胞的代谢过程特征,并揭示了内皮细胞衍生克隆在瓣叶形成中的特异性生长模式 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类或其他物种中验证 | 探究心脏二尖瓣发育过程中内皮祖细胞的命运决定和行为机制 | 小鼠胚胎和出生后二尖瓣的内皮细胞和瓣膜细胞 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 回顾性多色克隆分析 | NA | 基因表达数据, 细胞谱系数据 | 基因标记的内皮细胞和显微解剖的小鼠胚胎及出生后二尖瓣样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7548 | 2025-10-06 |
YAP and TAZ couple osteoblast precursor mobilization to angiogenesis and mechanoregulation in murine bone development
2024-01-22, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.11.029
PMID:38141609
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研究论文 | 本研究揭示了YAP和TAZ在小鼠骨骼发育过程中协调成骨前体细胞动员与血管生成及力学调控的机制 | 首次发现YAP和TAZ在胚胎骨骼发育中空间耦合成骨前体细胞动员与血管生成,并调控血管形态发生和力学响应 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究胚胎骨骼发育过程中成骨前体细胞动员与血管生成协调作用的分子机制 | 小鼠胚胎骨骼发育过程中的成骨前体细胞和血管系统 | 发育生物学 | 骨骼发育疾病 | 单细胞RNA测序,3D细胞共培养 | NA | 基因表达数据,细胞成像数据 | 小鼠胚胎样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7549 | 2025-10-06 |
Insights into midgut cell types and their crucial role in antiviral immunity in the lepidopteran model Bombyx mori
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1349428
PMID:38420120
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综述 | 本文综述了鳞翅目模型家蚕中肠细胞类型及其在抗病毒免疫中的关键作用 | 利用前沿单细胞转录组学揭示昆虫中肠细胞中先前未被识别的亚群,并阐明昆虫与高等哺乳动物胃肠道之间的显著相似性 | NA | 探讨昆虫中肠细胞类型在免疫防御中的复杂作用机制 | 家蚕中肠细胞类型(柱状细胞、肠内分泌细胞、杯状细胞和再生细胞) | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
7550 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells from pregnant women with Systemic lupus erythematosus
2024, International reviews of immunology
IF:4.3Q2
DOI:10.1080/08830185.2024.2376649
PMID:39066603
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析妊娠期系统性红斑狼疮患者外周血单个核细胞的免疫细胞组成和基因表达特征 | 首次在单细胞水平比较妊娠期活动性与非活动性SLE患者的免疫细胞比例和转录模式差异 | 样本量较小(仅12例患者),且未包含健康孕妇对照组 | 阐明妊娠期SLE患者的免疫细胞特征和分子机制 | 系统性红斑狼疮孕妇的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12例SLE患者(包含活动性/非活动性、妊娠/非妊娠分组) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序技术 |
7551 | 2025-10-06 |
Immune cell profiling of preeclamptic pregnant and postpartum women by single-cell RNA sequencing
2024, International reviews of immunology
IF:4.3Q2
DOI:10.1080/08830185.2022.2144291
PMID:36369864
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析先兆子痫孕妇和产后妇女的免疫细胞特征 | 首次在单细胞水平系统描绘先兆子痫患者孕期和产后免疫细胞图谱,揭示免疫细胞亚群的异质性和动态变化 | 样本量较小(3例患者和2例对照),仅使用外周血单个核细胞进行研究 | 探究先兆子痫患者免疫系统在单细胞水平的特征和异质性 | 先兆子痫孕妇和健康对照的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例早发性先兆子痫孕妇和2例健康对照 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
7552 | 2025-10-06 |
Chemokine receptors in primary and secondary lymphoid tissues
2024, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2023.11.003
PMID:39260934
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综述 | 本文综述了趋化因子受体在初级和次级淋巴组织免疫细胞中的存在与功能 | 系统梳理了不同趋化因子受体在淋巴器官中的特异性功能,如CXCR4在骨髓中的作用和CCR7在胸腺及次级淋巴组织中的调控机制 | 主要关注常规趋化因子受体,对非典型受体覆盖有限,且为综述性内容缺乏原始实验数据 | 探讨趋化因子受体在淋巴组织免疫细胞中的分布和功能 | 骨髓、胸腺、脾脏、淋巴结和派尔集合淋巴结等淋巴组织中的免疫细胞 | 免疫学 | NA | 高维光谱流式细胞术、单细胞测序 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
7553 | 2025-10-06 |
YAP and TAZ couple osteoblast precursor mobilization to angiogenesis and mechanoregulated bone development
2023-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.20.524918
PMID:36711590
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研究论文 | 本研究揭示了YAP和TAZ信号在胚胎骨骼发育中协调成骨前体细胞动员与血管生成的新机制 | 首次发现YAP/TAZ信号通过调控趋化因子Cxcl12,将成骨前体细胞与血管空间偶联,并调节血管形态发生和机械传导 | 研究主要聚焦于胚胎发育阶段,成年骨骼稳态中的机制仍需进一步探索 | 探究YAP和TAZ在胚胎骨骼发育过程中协调成骨前体细胞动员与血管生成的分子机制 | 小鼠胚胎长骨中的成骨前体细胞、血管系统及人间充质基质细胞 | 发育生物学 | 骨骼发育疾病 | 单细胞RNA测序, 条件性基因敲除, 3D血管网络培养 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞成像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7554 | 2025-10-06 |
Single cell RNA-sequencing profiling to improve the translation between human IBD and in vivo models
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1291990
PMID:38179052
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综述 | 探讨单细胞RNA测序技术如何通过分析人类IBD与小鼠模型的异同来改善临床前研究的转化效果 | 首次系统总结单细胞转录组技术在IBD研究中的应用,强调通过比较人类与小鼠模型的细胞特征来提升临床转化效率 | 该技术尚未在IBD临床前模型中广泛应用,缺乏标准化比较框架 | 提高炎症性肠病临床前研究向临床治疗的转化成功率 | 人类IBD患者与实验小鼠模型的单细胞转录组数据 | 单细胞组学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7555 | 2025-10-06 |
Longitudinal Single-Cell Transcriptomics Reveals a Role for Serpina3n-Mediated Resolution of Inflammation in a Mouse Colitis Model
2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.04.004
PMID:33862275
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了小鼠结肠炎模型中炎症消退的细胞动态变化机制 | 首次在单细胞水平上系统描绘结肠炎炎症消退过程中的细胞动态变化,发现Serpina3n在基质细胞中的特异性表达及其促进炎症消退的新功能 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 阐明结肠炎炎症消退过程中的细胞类型变化和相互作用机制 | 化学诱导结肠炎小鼠模型 | 单细胞生物学 | 结肠炎 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7556 | 2025-10-06 |
Deciphering the Premetastatic Lymphatic Niche of Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Jun, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241307894
PMID:40082761
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了口腔鳞状细胞癌转移前淋巴结生态位的细胞结构,发现并验证了CD4+ Tex-pre细胞在塑造免疫抑制转移前环境中的作用 | 首次在口腔鳞癌转移前淋巴结中鉴定出具有前衰竭状态的CD4+ T细胞亚群,并证明其促进淋巴结转移的机制 | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本,需要更大规模临床验证 | 探索口腔鳞状细胞癌转移前淋巴结生态位的细胞组成和免疫抑制机制 | 口腔鳞状细胞癌患者的转移前肿瘤引流淋巴结和对侧淋巴结 | 单细胞组学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,RNAscope原位染色,计算机分析,体内实验 | NA | 单细胞RNA测序数据,bulk RNA测序数据,图像数据 | OSCC患者的淋巴结样本(包括转移前肿瘤引流淋巴结和配对对侧淋巴结) | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
7557 | 2025-10-06 |
Antioxidant interventions reduced cytokine-induced pyroptosis of peripheral MAIT cells in patients with HBV-related cirrhosis
2025-Jun-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000714
PMID:40377492
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研究论文 | 本研究探讨了HBV相关肝硬化患者外周血MAIT细胞减少的特征及机制,发现细胞焦亡是主要因素,抗氧化干预可减轻此过程 | 首次揭示细胞焦亡是HBV相关肝硬化中MAIT细胞减少的关键机制,并证明抗氧化剂可有效干预 | 样本量有限(60例),缺乏长期随访数据 | 探究HBV相关肝硬化患者MAIT细胞耗竭的特征和机制 | 20名健康对照者和40名HBV相关肝硬化患者(代偿期20例,失代偿期20例) | 免疫学 | 乙型肝炎肝硬化 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,多重免疫荧光,ELISA | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据,免疫荧光图像,蛋白浓度数据 | 60例样本(20健康对照+40患者) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7558 | 2025-10-06 |
Single-cell analyses unravel ecosystem dynamics and intercellular crosstalk during gallbladder cancer malignant transformation
2025-Jun-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000697
PMID:40377484
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示胆囊癌恶性转化过程中的生态系统动态和细胞间通讯 | 首次构建了从正常组织到高级别上皮内瘤变再到侵袭性胆囊癌的单细胞图谱,揭示了TOP2A+上皮细胞亚型与免疫抑制巨噬细胞的关键作用 | 样本量相对有限(10个样本),需要更大队列验证发现 | 探索胆囊癌恶性转化过程中的细胞和分子变化,识别早期生物标志物和治疗靶点 | 胆囊组织样本,包括正常邻近组织、高级别上皮内瘤变和胆囊癌组织 | 单细胞生物学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,多重免疫荧光染色 | 10种机器学习方法 | 单细胞转录组数据,bulk RNA-seq数据,图像数据 | 98,113个细胞,来自2个正常组织、2个HGIN和6个GBC样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
7559 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal single-cell analysis elucidates the cellular and molecular dynamics of human cornea aging
2025-May-19, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01475-z
PMID:40390022
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研究论文 | 通过单细胞时空分析揭示人类角膜衰老过程中的细胞和分子动态变化 | 首次构建人类角膜时空单细胞图谱,发现角膜上皮细胞的'时空向心迁移模式'新范式 | 样本量有限(8个供体),年龄跨度较大(33-88岁) | 阐明人类角膜衰老过程中的细胞和分子机制 | 人类角膜组织 | 单细胞组学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 免疫荧光染色, Western blotting | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 8个供体的角膜组织(年龄33-88岁) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | scStereo-seq | 单细胞空间增强分辨率组学测序 |
7560 | 2025-05-22 |
Corrigendum to "Deciphering the cell type-specific and zonal distribution of drug-metabolizing enzymes, transporters, and transcription factors in livers of mice using single-cell transcriptomics"
2025-May-19, Drug metabolism and disposition: the biological fate of chemicals
DOI:10.1016/j.dmd.2025.100088
PMID:40393347
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |