单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7521 - 7540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7521 | 2025-10-06 |
Brain-wide cell-type-specific transcriptomic signatures of healthy ageing in mice
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08350-8
PMID:39743592
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序系统描绘小鼠大脑在健康衰老过程中细胞类型特异性转录组变化 | 提供了首个涵盖全脑区域、包含约120万个高质量单细胞转录组的衰老数据集，识别了847个细胞簇和14个年龄偏向性胶质细胞簇 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本；主要关注转录组水平变化，缺乏功能验证 | 系统解析健康衰老过程中大脑细胞类型特异性转录组变化 | 年轻和年老雌雄小鼠的大脑细胞，涵盖前脑、中脑和后脑区域 | 单细胞转录组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约120万个高质量单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7522 | 2025-10-06 |
Single-cell analyses of intestinal epithelium reveal the dysregulation of gut immune microenvironment in systemic lupus erythematosus
2025-Jan-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06147-5
PMID:39871323
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示系统性红斑狼疮中肠道上皮免疫微环境的失调机制 | 首次在狼疮背景下构建肠道上皮的高分辨率单细胞图谱，发现CD8αα+ IELs减少、CD8αβ+ IELs增加以及γδT细胞减少与氧化应激和铁死亡的关联 | 研究主要基于MRL/Lpr小鼠模型，人类样本验证尚需进一步研究 | 探究系统性红斑狼疮中肠道免疫微环境的失调机制 | MRL/Lpr狼疮小鼠和MRL/Mpj对照小鼠的肠道上皮细胞 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序，qPCR，流式细胞术，体内实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 狼疮小鼠和对照小鼠的肠道上皮样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7523 | 2025-05-23 |
Author Correction: Uncovering functional lncRNAs by scRNA-seq with ELATUS
2025-Jan-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55730-9
PMID:39774948
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7524 | 2025-10-06 |
Self and parasite-derived peptides selected upon DERAA-bearing HLA-DRB1 alleles activate CD4+ T cells from Chagas cardiomyopathy patients and are associated with ventricular dysfunction
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1527115
PMID:40391216
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研究论文 | 本研究揭示了携带DERAA基序的HLA-DRB1等位基因在查加斯心肌病患者中通过呈递宿主和寄生虫来源的肽段激活CD4+ T细胞，并与心室功能障碍相关 | 首次发现特定HLA-DRB1等位基因通过交叉反应性肽段激活致病性CD4+ T细胞，并建立其与心肌纤维化和心室功能障碍的直接关联 | 样本量有限，需要更大规模研究验证；机制研究尚未完全阐明T细胞活化的具体信号通路 | 探究HLA-DRB1等位基因在查加斯心肌病发病机制中的作用 | 查加斯病患者（包括无症状期和心肌病期患者）的CD4+ T细胞和心脏组织 | 免疫学 | 查加斯心肌病 | 计算分析、体外功能实验、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、功能实验数据、临床数据 | 查加斯病患者（包括IND和CCC两组） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7525 | 2025-10-06 |
Comprehensive Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Cervical Cancer: Insights Into Tumor Microenvironment and Gene Expression Dynamics
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/5027347
PMID:40395456
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析宫颈癌的肿瘤微环境和基因表达动态 | 首次在宫颈癌中应用大规模单细胞RNA测序技术揭示细胞异质性和基因表达动态 | NA | 探索宫颈癌的肿瘤微环境特征和基因表达动态 | 宫颈癌样本 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | 细胞聚类分析、伪时间分析、基因共表达网络分析 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7526 | 2025-10-06 |
Pan-cancer analysis of phagocytosis regulators in female-specific cancers: a focus on HMGB2
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1565924
PMID:40396172
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研究论文 | 通过对女性特有癌症中吞噬作用调节因子的泛癌分析，重点关注HMGB2的功能机制 | 首次系统分析女性特有癌症中吞噬作用调节因子的表达特征，并验证HMGB2在调控肿瘤细胞增殖、迁移和巨噬细胞吞噬功能中的关键作用 | 基于公共数据库的分析可能存在数据异质性，体外实验需要进一步体内验证 | 探索吞噬作用调节因子在女性特有癌症中的分子机制和临床意义 | 女性特有癌症（乳腺癌、宫颈癌、卵巢癌、子宫内膜癌） | 生物信息学 | 女性特有癌症 | 单细胞测序、DNA甲基化分析、体外功能验证 | NA | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据 | 公共数据库中的多癌种样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7527 | 2025-10-06 |
Integrative single-cell and spatial transcriptomics analysis reveals MDK-NCL pathway's role in shaping the immunosuppressive environment of lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1546382
PMID:40396179
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学分析揭示MDK-NCL通路在肺腺癌免疫抑制微环境形成中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据，系统揭示了MDK-NCL信号轴在肺腺癌免疫抑制微环境形成中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证样本量有限，需要进一步的功能实验验证机制 | 研究肺腺癌肿瘤微环境的细胞组成及MDK-NCL信号通路的作用 | 肺腺癌组织样本及配对癌旁正常组织 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,实时PCR,Western blotting | Seurat,inferCNV,MCPcounter,Niches | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,批量转录组数据 | TCGA-LUAD队列和内部队列的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 7528 | 2025-10-06 |
Application of Cellular Indexing of Transcriptomes and Epitopes by Sequencing (CITE-Seq) to Precisely Dissect the Brain Tumor Immune Microenvironment
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4558-1_3
PMID:40402445
|
研究论文 | 应用CITE-Seq技术精确解析脑肿瘤免疫微环境 | 将CITE-Seq技术应用于脑肿瘤研究，同时获取单细胞转录组和表面蛋白信息 | NA | 精确解析脑肿瘤免疫微环境的细胞组成和功能 | 脑肿瘤微环境中的恶性细胞、免疫细胞、星形胶质细胞和其他基质细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | CITE-Seq, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表位数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 7529 | 2025-10-06 |
Immune Single-Cell Annotation by Molecular Signature-Based Deconvolution with MIXTURE
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4558-1_13
PMID:40402455
|
研究论文 | 提出基于MIXTURE算法的单细胞RNA测序注释协议，用于改善肿瘤免疫微环境中细胞类型的识别 | 使用v-SVR反卷积算法MIXTURE解决无监督注释方法的局限性，提供更精确的细胞类型注释和组成分析 | NA | 优化单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别，以解析肿瘤免疫微环境和改进免疫治疗策略 | 黑色素瘤单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | v-SVR反卷积算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7530 | 2025-10-06 |
The IL-1β inhibitor canakinumab in previously treated lower-risk myelodysplastic syndromes: a phase 2 clinical trial
2024-11-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54290-2
PMID:39537648
|
研究论文 | 评估IL-1β抑制剂canakinumab在既往治疗过的低危骨髓增生异常综合征患者中的安全性和疗效 | 首次在人体临床试验中证明IL-1β抑制剂canakinumab可通过抑制TNF介导的炎症信号通路影响造血分化 | 仅针对遗传复杂性较低的患者有效，样本量较小（25例患者） | 评估靶向IL-1β信号通路是否能挽救MDS患者的无效红细胞生成 | 25例既往治疗过的低危MDS患者（中位年龄74岁，60%男性） | 临床医学 | 骨髓增生异常综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据，基因表达数据 | 25例MDS患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7531 | 2025-10-06 |
Reconstructing the regulatory programs underlying the phenotypic plasticity of neural cancers
2024-11-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53954-3
PMID:39516198
|
研究论文 | 开发了一种名为scregclust的计算方法，用于从单细胞RNA测序数据重建细胞调控程序 | 提出单细胞调控驱动聚类方法，能高效划分基因模块并预测关键转录因子和激酶 | 对细胞状态调控机制的理解仍有限 | 研究神经系统癌症的表型可塑性调控程序 | 成人和儿童脑癌肿瘤样本及发育组织 | 生物信息学 | 神经系统癌症 | 单细胞RNA测序 | scregclust算法 | 单细胞RNA测序数据 | 15种肿瘤类型的数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7532 | 2025-10-06 |
Uncovering functional lncRNAs by scRNA-seq with ELATUS
2024-11-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54005-7
PMID:39521797
|
研究论文 | 开发名为ELATUS的计算框架，通过单细胞RNA测序数据增强功能性长链非编码RNA的检测能力 | 结合伪比对工具Kallisto和选择性功能过滤，创建专门针对lncRNAs的单细胞RNA测序分析流程，在参考注释不准确的情况下表现更优 | 未提及具体样本数量和研究规模，主要关注方法学比较 | 开发优化单细胞RNA测序数据分析方法，提高功能性长链非编码RNA的检测准确性 | 长链非编码RNA（lncRNAs）在单细胞水平的表达分析 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞多组学测序（single-cell multiome），ATAC-seq | 计算框架ELATUS，基于Kallisto伪比对工具 | 单细胞转录组数据，表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单细胞多组学测序 | NA | NA |
| 7533 | 2025-10-06 |
STimage-1K4M: A histopathology image-gene expression dataset for spatial transcriptomics
2024-Jun-20, ArXiv
PMID:38947920
|
研究论文 | 介绍了一个结合组织病理学图像和基因表达数据的空间转录组学数据集STimage-1K4M | 首次提供亚图块级别图像与高维基因表达数据的配对，填补了现有医学图像-文本数据集中缺乏局部区域详细描述的空白 | 数据集仅包含1,149张原始图像，可能覆盖的疾病类型和组织类型有限 | 开发用于计算病理学的多模态数据分析资源 | 空间转录组学数据中的组织病理学图像和基因表达信息 | 计算病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像, 基因表达数据 | 1,149张图像，4,293,195个亚图块-基因表达对 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7534 | 2025-10-06 |
Bioengineered vascular grafts with a pathogenic TGFBR1 variant model aneurysm formation in vivo and reveal underlying collagen defects
2024-05-08, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg6298
PMID:38718134
|
研究论文 | 本研究通过结合hiPSC、生物工程血管移植物和基因编辑技术，在动物体内建立了功能性人类胸主动脉瘤模型 | 首次将hiPSC来源的血管平滑肌细胞与基因编辑技术结合，在动物体内构建了模拟人类胸主动脉瘤形成的生物工程血管移植物模型 | 研究样本量有限，仅针对特定TGFBR1变异，需要在更大多样性样本中验证 | 建立更好的人类胸主动脉瘤疾病模型并研究其发病机制 | 人类诱导多能干细胞来源的血管平滑肌细胞和生物工程血管移植物 | 组织工程 | 胸主动脉瘤 | 基因编辑，空间转录组学，组织学分析，蛋白质测定 | 生物工程血管移植物模型 | 转录组数据，组织学图像，蛋白质数据 | 使用isogenic对照hiPSC、基因编辑突变细胞和LDS患者来源细胞构建的多种生物工程血管移植物 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7535 | 2025-10-06 |
Synovial fibroblast gene expression is associated with sensory nerve growth and pain in rheumatoid arthritis
2024-04-10, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adk3506
PMID:38598614
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法识别与类风湿关节炎疼痛相关的滑膜成纤维细胞基因表达模块，并验证其促进疼痛感觉神经生长的机制 | 开发了基于图的基因表达模块识别方法，首次发现滑膜衬里层成纤维细胞基因表达与疼痛感觉神经生长的直接关联 | 研究样本主要来自炎症程度较低的类风湿关节炎患者，结果在高度炎症情况下的适用性需进一步验证 | 探究类风湿关节炎疼痛机制与滑膜成纤维细胞基因表达的关系 | 类风湿关节炎患者的滑膜活检样本、滑膜成纤维细胞、背根神经节神经元 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、机器学习、受体-配体相互作用分析 | GbGMI（基于图的基因表达模块识别） | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 两个独立队列的类风湿关节炎患者滑膜活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7536 | 2025-10-06 |
Multimodal Analytical Tools to Enhance Mechanistic Understanding of Aortic Valve Calcification
2024-04, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2023.06.017
PMID:37517686
|
综述 | 本文综述了用于增强主动脉瓣钙化机制理解的多模态分析工具 | 整合转录组学、蛋白质组学和分子成像技术，构建研究钙化性主动脉瓣疾病(CAVD)的整体方法，具有识别新调控通路的潜力 | NA | 推进钙化性主动脉瓣疾病和药物靶点研究 | 钙化性主动脉瓣疾病(CAVD) | 生物医学研究 | 心血管疾病 | 转录组学, 蛋白质组学, 分子成像, 正电子发射断层扫描/计算机断层扫描 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 影像数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7537 | 2025-10-06 |
Endothelial cells drive organ fibrosis in mice by inducing expression of the transcription factor SOX9
2024-02-28, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abq4581
PMID:38416842
|
研究论文 | 本研究揭示内皮细胞通过转录因子SOX9驱动多器官纤维化的机制 | 首次证实内皮细胞（而非仅成纤维细胞）通过SOX9表达直接促进器官纤维化，并发现CCN2是介导此过程的关键因子 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚不充分 | 探究内皮细胞在器官纤维化中的作用机制 | 小鼠模型及人类心力衰竭患者心脏组织 | 分子生物学 | 器官纤维化/心力衰竭 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 基因编辑 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据, 组织病理数据 | 多种小鼠纤维化模型（心脏、肺、肝）及人类心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7538 | 2025-10-06 |
Lipocalin-2 expression identifies an intestinal regulatory neutrophil population during acute graft-versus-host disease
2024-02-21, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adi1501
PMID:38381845
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现表达脂质运载蛋白-2的肠道中性粒细胞群体，可减轻急性移植物抗宿主病的严重程度 | 首次发现LCN2表达的中性粒细胞群体通过调控巨噬细胞功能缓解aGVHD，并揭示LCN2/IGF-1R信号通路机制 | 未明确LCN2治疗对移植物抗白血病效应的影响，人类样本验证仍需扩大 | 探索急性移植物抗宿主病的肠道组织耐受机制和潜在治疗策略 | 小鼠模型和人类aGVHD患者肠道活检样本 | 单细胞生物学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个患者队列的肠道活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7539 | 2025-10-06 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics to characterize the molecular and cellular architecture of the ischemic mouse brain
2024-02-07, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg1323
PMID:38324639
|
研究论文 | 本研究结合空间转录组学和单细胞转录组学技术，系统描绘了缺血性小鼠大脑的分子和细胞结构特征 | 首次整合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了缺血大脑中LGALS9-CD44信号通路的关键作用，并发现细胞外囊泡介导的Lgals9递送可改善功能恢复 | 研究仅基于小鼠模型，需要在其他物种中进一步验证；Lgals9的具体作用机制仍需深入探索 | 表征缺血性大脑的分子和细胞结构特征，探索神经炎症在脑缺血后的病理机制 | 缺血性中风小鼠模型中的脑组织细胞 | 空间转录组学 | 脑血管疾病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | 19,777个转录组位点 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7540 | 2025-10-06 |
CD23+IgG1+ memory B cells are poised to switch to pathogenic IgE production in food allergy
2024-02-07, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adi0673
PMID:38324641
|
研究论文 | 本研究在儿童花生过敏中发现了一类CD23+IgG1+记忆B细胞，这些细胞在2型免疫反应中产生，含有高亲和力花生特异性克隆，并能被激活分化为产生IgE的细胞 | 首次描述了CD23+IgG1+记忆B细胞作为致病性IgE产生细胞前体在食物过敏中的关键作用，揭示了长期过敏持续性的潜在机制 | 研究主要聚焦于儿童花生过敏，样本来源相对局限，需要进一步验证在其他食物过敏中的普适性 | 探究食物过敏中持续性IgE反应的B细胞记忆机制 | 人类儿童花生过敏患者 | 免疫学 | 食物过敏 | 单细胞RNA测序，B细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据，血清学数据 | 儿童花生过敏患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |