单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 7521 - 7540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7521 | 2024-10-06 |
Integrated single-cell and bulk RNA-seq analysis identifies a prognostic T-cell signature in colorectal cancer
2024-08-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-70422-6
PMID:39215032
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，识别出结直肠癌中的预后T细胞特征 | 本研究创新性地利用单细胞测序数据，通过加权基因共表达网络分析、Lasso回归和StepCox分析，开发了一种基于六个T细胞相关基因的预后风险模型TRGS，相比现有免疫相关预后模型，具有更高的预测效能 | NA | 识别结直肠癌中的预后T细胞特征，优化患者对免疫治疗和化疗的反应 | 结直肠癌患者的T细胞特征及其预后影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序和批量RNA测序 | 加权基因共表达网络分析、Lasso回归和StepCox分析 | 基因表达数据 | NA |
| 7522 | 2024-10-06 |
Quantification of escape from X chromosome inactivation with single-cell omics data reveals heterogeneity across cell types and tissues
2024-Aug-14, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100625
PMID:39084228
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研究论文 | 开发了一种名为scLinaX的方法，用于量化单细胞组学数据中的X染色体失活逃逸现象，揭示了不同细胞类型和组织间的异质性 | 首次开发了scLinaX方法，用于直接量化单细胞RNA测序数据中的失活X染色体相对基因表达，并扩展到10x多组学数据集 | 需要进一步验证和扩展到更多类型的细胞和组织中 | 研究X染色体失活逃逸现象在不同细胞类型和组织中的差异 | X染色体失活逃逸现象及其在不同细胞类型和组织中的表现 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个器官的单细胞RNA测序数据集 |
| 7523 | 2024-10-06 |
A fibroblast-dependent TGF-β1/sFRP2 noncanonical Wnt signaling axis promotes epithelial metaplasia in idiopathic pulmonary fibrosis
2024-Jul-09, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI174598
PMID:38980870
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研究论文 | 研究了纤维母细胞依赖的TGF-β1/sFRP2非经典Wnt信号轴在特发性肺纤维化中促进上皮化生的机制 | 发现了TGF-β1信号通过sFRP2激活非经典Wnt信号轴，促进特发性肺纤维化中的上皮化生 | 研究仅限于细胞和组织水平，未涉及临床试验 | 探讨特发性肺纤维化中纤维母细胞与上皮细胞相互作用的机制 | 特发性肺纤维化患者的肺组织和纤维母细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自特发性肺纤维化患者和非疾病捐赠者的肺组织样本 |
| 7524 | 2024-10-06 |
Impending HCC diagnosis in patients with cirrhosis after HCV cure features a natural killer cell signature
2024-07-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000804
PMID:38381525
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研究论文 | 研究探讨了在HCV治愈后肝硬化患者中自然杀伤细胞（NK细胞）的特征，以预测肝细胞癌（HCC）的发展 | 首次揭示了HCV治愈后肝硬化患者中NK细胞的特征与HCC发展的关联，特别是TIM-3和CD38的高表达 | 研究样本量较小，仅涵盖8个队列，可能影响结果的普适性 | 探讨HCV治愈后肝硬化患者中NK细胞的特征，以预测HCC的发展 | HCV治愈后肝硬化患者的NK细胞特征及其与HCC发展的关联 | NA | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 8个队列，包括HCV治愈后肝硬化患者和健康对照 |
| 7525 | 2024-10-06 |
Oleic acid-PPARγ-FABP4 loop fuels cholangiocarcinoma colonization in lymph node metastases microenvironment
2024-07-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000784
PMID:38377465
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研究论文 | 研究探讨了油酸-PPARγ-FABP4循环在胆管癌淋巴结转移微环境中的作用 | 揭示了油酸-PPARγ-FABP4正反馈循环在胆管癌淋巴结转移中的关键作用，并提出了针对这一循环的潜在治疗策略 | NA | 探究胆管癌在淋巴结微环境中的定植机制，特别是代谢重编程的作用 | 胆管癌及其淋巴结转移 | NA | 胆管癌 | 单细胞RNA测序、代谢组学、CRISPR/Cas9筛选 | NA | RNA | 来自患者的原发肿瘤病灶和配对的淋巴结转移样本 |
| 7526 | 2024-10-06 |
Multiomics identifies metabolic subtypes based on fatty acid degradation allocating personalized treatment in hepatocellular carcinoma
2024-02-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000553
PMID:37540187
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研究论文 | 本文通过多组学分析，基于脂肪酸降解途径对肝细胞癌进行分子分类，并评估其指导个性化治疗的能力 | 本文首次基于脂肪酸降解途径对肝细胞癌进行分子分类，并发现不同亚型对特定治疗的响应差异 | 本文的样本量较小，且主要基于已有的公开数据集进行分析，需要进一步的临床验证 | 开发基于脂肪酸降解途径的肝细胞癌分子分类，并评估其指导个性化治疗的能力 | 肝细胞癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序、PCR阵列、脂质组学、代谢组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据 | 41名肝细胞癌患者，其中17名接受PD-1治疗 |
| 7527 | 2024-08-07 |
Pegylated interferon-α for chronic hepatitis B … not ready to be shelved yet! New insights on its role using single-cell transcriptomics
2024-01-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000560
PMID:37676248
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7528 | 2024-10-06 |
Enhanced mitophagy driven by ADAR1-GLI1 editing supports the self-renewal of cancer stem cells in HCC
2024-01-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000299
PMID:36683360
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研究论文 | 研究探讨了ADAR1通过编辑GLI1促进肝癌干细胞自我更新的机制 | 首次揭示了ADAR1通过编辑GLI1在肝癌干细胞中调控线粒体自噬的新机制 | NA | 探讨ADAR1编辑在肝癌干细胞生成和维持中的作用机制 | 肝癌干细胞和ADAR1编辑的GLI1 | 癌症研究 | 肝癌 | RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 7529 | 2024-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the immunoregulatory roles of PegIFN-α in patients with chronic hepatitis B
2024-01-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000524
PMID:37368993
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术揭示了PegIFN-α在慢性乙型肝炎患者中的免疫调节作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了慢性乙型肝炎患者在接受PegIFN-α治疗前后外周免疫细胞的转录组图谱，并发现了三种特定的细胞亚群及其在治疗前后的变化 | 研究仅限于慢性乙型肝炎患者，且样本量未明确提及，可能影响结果的普适性 | 探讨慢性乙型肝炎患者的免疫细胞特征及PegIFN-α治疗的免疫调节作用 | 慢性乙型肝炎患者的外周免疫细胞 | 数字病理学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7530 | 2024-10-06 |
Embryonic development grand challenge: crosslinking advances
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1467261
PMID:39364136
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评论 | 本文讨论了胚胎发育研究的新进展及其跨学科意义 | 本文介绍了基于干细胞的3D方法在胚胎发育研究中的最新进展 | 本文主要讨论了胚胎发育研究的挑战和潜力，未提供具体的研究数据或方法 | 探讨胚胎发育研究的跨学科意义及其在基础生物医学科学中的潜力 | 胚胎发育的生物机制及其在科学、社会和政治领域的复杂性 | NA | NA | 干细胞3D方法 | NA | NA | NA |
| 7531 | 2024-10-06 |
Multi-omics profiling and experimental verification of tertiary lymphoid structure-related genes: molecular subgroups, immune infiltration, and prognostic implications in lung adenocarcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1453220
PMID:39364403
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研究论文 | 研究了三级淋巴结构相关基因在肺腺癌中的功能，包括分子亚型、免疫浸润和预后意义 | 首次全面研究了三级淋巴结构相关基因在肺腺癌中的功能，并开发了精确的诺模图以增强其临床应用 | 研究依赖于公开数据，可能存在数据偏差；实验验证仅通过qRT-PCR进行，未涉及其他验证方法 | 探讨三级淋巴结构相关基因在肺腺癌中的作用及其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 肺腺癌患者及其三级淋巴结构相关基因 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 基于公开数据，具体样本数量未明确提及 |
| 7532 | 2024-10-06 |
Immune and inflammatory insights in atherosclerosis: development of a risk prediction model through single-cell and bulk transcriptomic analyses
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1448662
PMID:39364414
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研究论文 | 本文通过单细胞和批量转录组分析，开发了一种用于预测动脉粥样硬化风险的模型，揭示了免疫和炎症在动脉粥样硬化中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了动脉粥样硬化斑块中免疫细胞的异质性，并开发了一个基于机器学习的风险评分模型 | 需要进一步的临床验证和更大规模的样本以验证模型的普适性和准确性 | 研究动脉粥样硬化中的免疫异质性，并开发一种个性化免疫疗法的风险预测模型 | 动脉粥样硬化斑块中的免疫细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习 | 转录组数据 | NA |
| 7533 | 2024-10-06 |
Isolation of planarian viable cells using fluorescence-activated cell sorting for advancing single-cell transcriptome analysis
2023-Nov, Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms
IF:1.3Q4
DOI:10.1111/gtc.13068
PMID:37723830
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研究论文 | 本文开发了一种使用荧光激活细胞分选（FACS）从成体涡虫体内分离活细胞的方法，以推进单细胞转录组分析 | 本文创新性地使用紫外激光替代紫外激光来激发Hoechst 33342，减少了细胞损伤，并开发了一种无需染色的FACS策略，提高了单细胞RNA测序的质量 | 尽管成功获得了高质量的RNA测序数据，但非aPSCs细胞的RNA读取质量较低 | 开发一种有效的方法来分离活细胞，以进行高质量的单细胞RNA测序 | 成体涡虫的活细胞，包括成体多能干细胞（aPSCs）和分化/分化细胞 | 单细胞测序 | NA | 荧光激活细胞分选（FACS） | NA | RNA | 成体涡虫的多种细胞类型 |
| 7534 | 2024-10-06 |
simpleaf: A simple, flexible, and scalable framework for single-cell transcriptomics data processing using alevin-fry
2023-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.28.534653
PMID:37034702
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研究论文 | 介绍了一个名为simpleaf的框架，用于简化使用alevin-fry生态系统的单细胞转录组数据处理 | simpleaf简化了单细胞数据处理的复杂性，同时保留了alevin-fry工具的性能和灵活性，并增加了新的功能和能力 | NA | 简化单细胞转录组数据处理的复杂性，同时保留工具的性能和灵活性 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 7535 | 2024-10-06 |
SARS-CoV-2 cellular tropism and direct multiorgan failure in COVID-19 patients: Bioinformatic predictions, experimental observations, and open questions
2023-Feb, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.11928
PMID:36229927
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综述 | 本文综述了SARS-CoV-2病毒的细胞趋向性及其在COVID-19患者中引发多器官衰竭的可能机制 | 首次广泛使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）基因表达数据集来预测SARS-CoV-2的细胞趋向性 | 并非所有预测的易感细胞在COVID-19患者中都会被感染 | 探讨SARS-CoV-2病毒的传播途径及其在COVID-19患者中引发多器官衰竭的原因 | SARS-CoV-2病毒的细胞趋向性及其与早期感染和多器官衰竭的关联 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7536 | 2024-10-06 |
Human antibody BD-218 has broad neutralizing activity against concerning variants of SARS-CoV-2
2023-Feb-01, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2022.12.120
PMID:36528147
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研究论文 | 本文报道了一种名为BD-218的人类抗体，具有广泛的SARS-CoV-2变种中和活性 | BD-218抗体能够与SARS-CoV-2刺突蛋白的受体结合域上的新表位结合，显示出对多种变种（包括beta、delta和omicron变种）的广泛中和活性 | NA | 研究SARS-CoV-2变种的中和抗体，以提高现有抗COVID疗法的有效性 | BD-218抗体及其对SARS-CoV-2变种的中和活性 | NA | NA | 单细胞测序、生物化学方法、伪型病毒中和实验、冷冻电镜结构分析 | NA | 结构数据 | 从早期康复患者中筛选出的抗体 |
| 7537 | 2024-10-06 |
Epstein-Barr virus perpetuates B cell germinal center dynamics and generation of autoimmune-associated phenotypes in vitro
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1001145
PMID:36248899
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研究论文 | 研究EB病毒如何通过体外实验维持B细胞生发中心动态并产生与自身免疫相关表型 | 首次通过单细胞方法揭示EB病毒感染和LCLs中的B细胞异质性，并提出EB病毒持续驱动B细胞进入、通过和退出生发中心反应的模型 | 研究主要在体外进行，缺乏体内实验验证 | 探讨EB病毒如何影响B细胞的动态变化及其与自身免疫疾病的关系 | EB病毒感染的B细胞及其在生发中心中的动态变化 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 从LCLs中分离的多个亚群B细胞 |
| 7538 | 2024-10-06 |
Loss of OTUD6B Stimulates Angiogenesis and Promotes Diabetic Atherosclerosis
2022, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
DOI:10.2147/DMSO.S380986
PMID:36200061
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研究论文 | 研究OTUD6B在糖尿病性动脉粥样硬化斑块中对血管生成的影响 | 首次探讨OTUD6B在糖尿病性动脉粥样硬化斑块中对血管生成的调控作用 | 仅限于动物模型和人类样本的初步研究，需要进一步的临床验证 | 探讨OTUD6B在糖尿病性动脉粥样硬化中的作用机制 | OTUD6B在糖尿病性动脉粥样硬化斑块中的表达及其对血管生成的影响 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和RNA测序 (RNA-seq) | NA | RNA | 包括糖尿病截肢患者的人类前胫动脉样本和ApoE-/-小鼠模型 |
| 7539 | 2024-10-06 |
NGN2 induces diverse neuron types from human pluripotency
2021-09-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.07.006
PMID:34358451
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研究论文 | 研究通过神经生成素2（NGN2）过表达从人诱导多能干细胞（iPSCs）中诱导出多种神经元类型 | 使用单细胞转录组学分析了NGN2过表达过程中从多能性到神经元功能成熟的时间进程中的细胞状态，揭示了生成的神经元类型的分子异质性 | 神经元分化路径和异质性尚未完全探索 | 研究神经元分化机制和神经退行性疾病的建模 | 人诱导多能干细胞（iPSCs）和神经生成素2（NGN2）过表达诱导的神经元 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多个iPSC克隆和来自不同个体的细胞系 |
| 7540 | 2024-10-06 |
Assessing the replicability of spatial gene expression using atlas data from the adult mouse brain
2021-07, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001341
PMID:34280183
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研究论文 | 本文评估了成年小鼠大脑中空间基因表达数据的重复性，特别是通过比较Allen脑图谱和空间转录组学数据集 | 首次使用可行的空间技术对Allen脑图谱的全脑、全转录组空间表达数据进行基准测试，并与第二个独立数据集进行比较 | 模型在不同数据集之间的双向分类性能无法重现，表明跨平台分类不够稳健 | 评估成年小鼠大脑中空间基因表达数据的重复性 | 成年小鼠大脑的空间基因表达数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | LASSO回归、线性回归和基于相关性的特征选择 | 基因表达数据 | 成年小鼠大脑的全脑、全转录组数据 |