单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 7501 - 7520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7501 | 2024-10-07 |
Probabilistic harmonization and annotation of single-cell transcriptomics data with deep generative models
2021-01, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20209620
PMID:33491336
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研究论文 | 本文介绍了一种基于深度生成模型的单细胞转录组数据概率调和与注释方法 | 提出了scANVI，一种半监督变分推断方法，用于利用现有细胞状态注释进行单细胞注释，并展示了scVI和scANVI在数据整合和细胞状态注释方面的优越性 | 未提及 | 旨在解决单细胞转录组数据整合和细胞类型注释的挑战 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成模型 | 基因表达数据 | 未提及 |
| 7502 | 2024-10-07 |
The Gustatory Sensory G-Protein GNAT3 Suppresses Pancreatic Cancer Progression in Mice
2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2020.08.011
PMID:32882403
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研究论文 | 研究了味觉信号传导蛋白GNAT3在胰腺癌进展中的免疫调节作用 | 首次探讨了味觉信号传导蛋白GNAT3在胰腺癌进展中的免疫调节作用，并发现其缺失会增强CXCL1/2-CXCR2轴，促进肿瘤进展 | NA | 探讨味觉信号传导蛋白GNAT3在胰腺癌进展中的免疫调节作用 | 胰腺导管腺癌（PDA）进展中的免疫抑制性炎症反应 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了Gnat3-null (Gnat3-/-)小鼠和携带Cre-inducible KrasLSL-G12D/+等位基因的小鼠进行交叉繁殖 |
| 7503 | 2024-10-06 |
Immune escape between endoplasmic reticulum stress-related cancer cells and exhausted CD8+T cells leads to neoadjuvant chemotherapy resistance in ovarian cancer
2024-Nov-12, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.150686
PMID:39278093
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研究论文 | 研究探讨了新辅助化疗对高级别浆液性卵巢癌患者肿瘤细胞和免疫细胞的影响 | 揭示了新辅助化疗抵抗的机制，并提出了针对ERS标记HSP90B1和免疫逃逸标记MDK的治疗策略 | 研究样本量较小，仅涉及11名患者 | 探索新辅助化疗对高级别浆液性卵巢癌患者肿瘤微环境中肿瘤细胞和免疫细胞的影响 | 高级别浆液性卵巢癌患者的肿瘤细胞和CD8+T细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11名高级别浆液性卵巢癌患者 |
| 7504 | 2024-10-06 |
CALB2 drives pancreatic cancer metastasis through inflammatory reprogramming of the tumor microenvironment
2024-Oct-03, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03201-w
PMID:39358777
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研究论文 | 研究探讨了CALB2在胰腺癌转移中的作用及其通过炎症重编程肿瘤微环境的机制 | 首次揭示了CALB2作为炎症重编程的关键调节因子，促进胰腺癌转移的机制，并提出了αCXCL14单克隆抗体与吉西他滨联合治疗的新策略 | NA | 探讨CALB2在胰腺癌转移中的作用及其通过炎症重编程肿瘤微环境的机制，并开发针对性的治疗策略 | 胰腺导管腺癌（PDAC）及其相关成纤维细胞（CAFs）和患者来源的类器官（PDOs） | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、多色免疫荧光、CUT&RUN测定、荧光素酶报告基因测定、RNA测序、功能获得或丧失测定 | NA | 基因表达数据 | 涉及人类PDAC样本、CAFs和PDOs的体外和体内共培养系统，以及免疫活性KPC类器官异种移植模型 |
| 7505 | 2024-10-06 |
Exploring the prognostic value of BRMS1 + microglia based on single-cell anoikis regulator patterns in the immunologic microenvironment of GBM
2024-Oct, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-024-04781-5
PMID:39143438
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和非负矩阵分解技术，探讨了胶质母细胞瘤（GBM）中BRMS1+小胶质细胞在免疫微环境中的预后价值 | 首次揭示了BRMS1+小胶质细胞在GBM免疫微环境中的重要作用，并提出其可能成为未来治疗的潜在靶点 | NA | 探讨BRMS1+小胶质细胞在GBM免疫微环境中的预后价值及其对免疫治疗的影响 | 胶质母细胞瘤（GBM）中的BRMS1+小胶质细胞及其在免疫微环境中的作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组RNA测序（stRNA-seq）、非负矩阵分解（NMF） | NA | 基因表达数据 | 使用了TCGA和CGGA数据集，具体样本数量未在摘要中提及 |
| 7506 | 2024-10-06 |
Iron-laden macrophage-mediated paracrine profibrotic signaling induces lung fibroblast activation
2024-Oct-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00675.2023
PMID:39183565
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研究论文 | 研究探讨了铁在肺纤维化中的作用，特别是巨噬细胞介导的机制 | 揭示了铁在巨噬细胞中积累引发脂质过氧化，从而放大TGF-β1产生，并通过旁分泌信号激活成纤维细胞的新机制 | NA | 研究铁代谢在肺纤维化中的作用及其机制 | 肺纤维化中的巨噬细胞和成纤维细胞 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用小鼠模型，包括博来霉素和胺碘酮诱导的肺纤维化模型 |
| 7507 | 2024-10-06 |
Single-cell analysis revealing the metabolic landscape of prostate cancer
2024-Sep-01, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.4103/aja20243
PMID:38657119
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了前列腺癌的代谢景观 | 首次通过单细胞RNA测序技术展示了前列腺癌中上皮细胞和基质细胞的代谢活性差异，并识别了神经内分泌细胞的高代谢率 | 研究主要集中在前列腺癌的代谢特征，未涉及其他癌症类型的比较 | 揭示前列腺癌的代谢重编程机制及其在治疗中的应用潜力 | 前列腺癌中的上皮细胞、基质细胞和神经内分泌细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 |
| 7508 | 2024-10-06 |
Integrated single-cell and bulk RNA-seq analysis identifies a prognostic T-cell signature in colorectal cancer
2024-08-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-70422-6
PMID:39215032
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，识别出结直肠癌中的预后T细胞特征 | 本研究创新性地利用单细胞测序数据，通过加权基因共表达网络分析、Lasso回归和StepCox分析，开发了一种基于六个T细胞相关基因的预后风险模型TRGS，相比现有免疫相关预后模型，具有更高的预测效能 | NA | 识别结直肠癌中的预后T细胞特征，优化患者对免疫治疗和化疗的反应 | 结直肠癌患者的T细胞特征及其预后影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序和批量RNA测序 | 加权基因共表达网络分析、Lasso回归和StepCox分析 | 基因表达数据 | NA |
| 7509 | 2024-10-06 |
Quantification of escape from X chromosome inactivation with single-cell omics data reveals heterogeneity across cell types and tissues
2024-Aug-14, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100625
PMID:39084228
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研究论文 | 开发了一种名为scLinaX的方法，用于量化单细胞组学数据中的X染色体失活逃逸现象，揭示了不同细胞类型和组织间的异质性 | 首次开发了scLinaX方法，用于直接量化单细胞RNA测序数据中的失活X染色体相对基因表达，并扩展到10x多组学数据集 | 需要进一步验证和扩展到更多类型的细胞和组织中 | 研究X染色体失活逃逸现象在不同细胞类型和组织中的差异 | X染色体失活逃逸现象及其在不同细胞类型和组织中的表现 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个器官的单细胞RNA测序数据集 |
| 7510 | 2024-10-06 |
A fibroblast-dependent TGF-β1/sFRP2 noncanonical Wnt signaling axis promotes epithelial metaplasia in idiopathic pulmonary fibrosis
2024-Jul-09, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI174598
PMID:38980870
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研究论文 | 研究了纤维母细胞依赖的TGF-β1/sFRP2非经典Wnt信号轴在特发性肺纤维化中促进上皮化生的机制 | 发现了TGF-β1信号通过sFRP2激活非经典Wnt信号轴，促进特发性肺纤维化中的上皮化生 | 研究仅限于细胞和组织水平，未涉及临床试验 | 探讨特发性肺纤维化中纤维母细胞与上皮细胞相互作用的机制 | 特发性肺纤维化患者的肺组织和纤维母细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自特发性肺纤维化患者和非疾病捐赠者的肺组织样本 |
| 7511 | 2024-10-06 |
Impending HCC diagnosis in patients with cirrhosis after HCV cure features a natural killer cell signature
2024-07-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000804
PMID:38381525
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研究论文 | 研究探讨了在HCV治愈后肝硬化患者中自然杀伤细胞（NK细胞）的特征，以预测肝细胞癌（HCC）的发展 | 首次揭示了HCV治愈后肝硬化患者中NK细胞的特征与HCC发展的关联，特别是TIM-3和CD38的高表达 | 研究样本量较小，仅涵盖8个队列，可能影响结果的普适性 | 探讨HCV治愈后肝硬化患者中NK细胞的特征，以预测HCC的发展 | HCV治愈后肝硬化患者的NK细胞特征及其与HCC发展的关联 | NA | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 8个队列，包括HCV治愈后肝硬化患者和健康对照 |
| 7512 | 2024-10-06 |
Oleic acid-PPARγ-FABP4 loop fuels cholangiocarcinoma colonization in lymph node metastases microenvironment
2024-07-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000784
PMID:38377465
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研究论文 | 研究探讨了油酸-PPARγ-FABP4循环在胆管癌淋巴结转移微环境中的作用 | 揭示了油酸-PPARγ-FABP4正反馈循环在胆管癌淋巴结转移中的关键作用，并提出了针对这一循环的潜在治疗策略 | NA | 探究胆管癌在淋巴结微环境中的定植机制，特别是代谢重编程的作用 | 胆管癌及其淋巴结转移 | NA | 胆管癌 | 单细胞RNA测序、代谢组学、CRISPR/Cas9筛选 | NA | RNA | 来自患者的原发肿瘤病灶和配对的淋巴结转移样本 |
| 7513 | 2024-10-06 |
Multiomics identifies metabolic subtypes based on fatty acid degradation allocating personalized treatment in hepatocellular carcinoma
2024-02-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000553
PMID:37540187
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研究论文 | 本文通过多组学分析，基于脂肪酸降解途径对肝细胞癌进行分子分类，并评估其指导个性化治疗的能力 | 本文首次基于脂肪酸降解途径对肝细胞癌进行分子分类，并发现不同亚型对特定治疗的响应差异 | 本文的样本量较小，且主要基于已有的公开数据集进行分析，需要进一步的临床验证 | 开发基于脂肪酸降解途径的肝细胞癌分子分类，并评估其指导个性化治疗的能力 | 肝细胞癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序、PCR阵列、脂质组学、代谢组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据 | 41名肝细胞癌患者，其中17名接受PD-1治疗 |
| 7514 | 2024-08-07 |
Pegylated interferon-α for chronic hepatitis B … not ready to be shelved yet! New insights on its role using single-cell transcriptomics
2024-01-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000560
PMID:37676248
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7515 | 2024-10-06 |
Enhanced mitophagy driven by ADAR1-GLI1 editing supports the self-renewal of cancer stem cells in HCC
2024-01-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000299
PMID:36683360
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研究论文 | 研究探讨了ADAR1通过编辑GLI1促进肝癌干细胞自我更新的机制 | 首次揭示了ADAR1通过编辑GLI1在肝癌干细胞中调控线粒体自噬的新机制 | NA | 探讨ADAR1编辑在肝癌干细胞生成和维持中的作用机制 | 肝癌干细胞和ADAR1编辑的GLI1 | 癌症研究 | 肝癌 | RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 7516 | 2024-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the immunoregulatory roles of PegIFN-α in patients with chronic hepatitis B
2024-01-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000524
PMID:37368993
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术揭示了PegIFN-α在慢性乙型肝炎患者中的免疫调节作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了慢性乙型肝炎患者在接受PegIFN-α治疗前后外周免疫细胞的转录组图谱，并发现了三种特定的细胞亚群及其在治疗前后的变化 | 研究仅限于慢性乙型肝炎患者，且样本量未明确提及，可能影响结果的普适性 | 探讨慢性乙型肝炎患者的免疫细胞特征及PegIFN-α治疗的免疫调节作用 | 慢性乙型肝炎患者的外周免疫细胞 | 数字病理学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7517 | 2024-10-06 |
Embryonic development grand challenge: crosslinking advances
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1467261
PMID:39364136
|
评论 | 本文讨论了胚胎发育研究的新进展及其跨学科意义 | 本文介绍了基于干细胞的3D方法在胚胎发育研究中的最新进展 | 本文主要讨论了胚胎发育研究的挑战和潜力，未提供具体的研究数据或方法 | 探讨胚胎发育研究的跨学科意义及其在基础生物医学科学中的潜力 | 胚胎发育的生物机制及其在科学、社会和政治领域的复杂性 | NA | NA | 干细胞3D方法 | NA | NA | NA |
| 7518 | 2024-10-06 |
Multi-omics profiling and experimental verification of tertiary lymphoid structure-related genes: molecular subgroups, immune infiltration, and prognostic implications in lung adenocarcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1453220
PMID:39364403
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研究论文 | 研究了三级淋巴结构相关基因在肺腺癌中的功能，包括分子亚型、免疫浸润和预后意义 | 首次全面研究了三级淋巴结构相关基因在肺腺癌中的功能，并开发了精确的诺模图以增强其临床应用 | 研究依赖于公开数据，可能存在数据偏差；实验验证仅通过qRT-PCR进行，未涉及其他验证方法 | 探讨三级淋巴结构相关基因在肺腺癌中的作用及其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 肺腺癌患者及其三级淋巴结构相关基因 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 基于公开数据，具体样本数量未明确提及 |
| 7519 | 2024-10-06 |
Immune and inflammatory insights in atherosclerosis: development of a risk prediction model through single-cell and bulk transcriptomic analyses
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1448662
PMID:39364414
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研究论文 | 本文通过单细胞和批量转录组分析，开发了一种用于预测动脉粥样硬化风险的模型，揭示了免疫和炎症在动脉粥样硬化中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了动脉粥样硬化斑块中免疫细胞的异质性，并开发了一个基于机器学习的风险评分模型 | 需要进一步的临床验证和更大规模的样本以验证模型的普适性和准确性 | 研究动脉粥样硬化中的免疫异质性，并开发一种个性化免疫疗法的风险预测模型 | 动脉粥样硬化斑块中的免疫细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习 | 转录组数据 | NA |
| 7520 | 2024-10-06 |
Isolation of planarian viable cells using fluorescence-activated cell sorting for advancing single-cell transcriptome analysis
2023-Nov, Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms
IF:1.3Q4
DOI:10.1111/gtc.13068
PMID:37723830
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研究论文 | 本文开发了一种使用荧光激活细胞分选（FACS）从成体涡虫体内分离活细胞的方法，以推进单细胞转录组分析 | 本文创新性地使用紫外激光替代紫外激光来激发Hoechst 33342，减少了细胞损伤，并开发了一种无需染色的FACS策略，提高了单细胞RNA测序的质量 | 尽管成功获得了高质量的RNA测序数据，但非aPSCs细胞的RNA读取质量较低 | 开发一种有效的方法来分离活细胞，以进行高质量的单细胞RNA测序 | 成体涡虫的活细胞，包括成体多能干细胞（aPSCs）和分化/分化细胞 | 单细胞测序 | NA | 荧光激活细胞分选（FACS） | NA | RNA | 成体涡虫的多种细胞类型 |