单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7481 - 7500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7481 | 2025-10-06 |
Spatially Resolved Panoramic in vivo CRISPR Screen via Perturb-DBiT
2025-May-08, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6481967/v1
PMID:40386382
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研究论文 | 开发了一种名为Perturb-DBiT的空间分辨CRISPR筛选方法，能够在同一组织切片上同时测序空间总RNA全转录组和单导向RNA | 首次实现空间总RNA全转录组与sgRNA的同步共测序，能够无偏发现遗传扰动对RNA调控、细胞动力学和组织结构的影响 | NA | 研究遗传扰动在原生组织环境中对基因表达的影响 | 人类癌症转移定植模型和免疫活性同系小鼠模型 | 空间转录组学 | 癌症 | CRISPR筛选, 空间转录组学, 全转录组测序 | NA | 空间RNA测序数据, sgRNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞多组学 | Perturb-DBiT | 能够在同一组织切片上同时进行空间总RNA全转录组和单导向RNA的base-by-base测序 |
| 7482 | 2025-10-06 |
OLS4: a new Ontology Lookup Service for a growing interdisciplinary knowledge ecosystem
2025-May-06, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf279
PMID:40323307
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研究论文 | 本文介绍了OLS4，一个用于生物信息学和化学领域本体搜索的新版本服务 | 实现完整的OWL2规范，支持多语言国际化，提供新的用户界面和外部数据库链接功能 | NA | 开发支持日益增长的本体生态系统的新一代本体查找服务 | 生物信息学和化学领域的本体和注释数据 | 生物信息学 | NA | 本体搜索技术 | NA | 本体数据 | NA | EMBL-EBI | 本体搜索服务 | OLS4 | 开源本体查找服务，支持OWL2规范和多语言界面 |
| 7483 | 2025-10-06 |
Fate mapping in mouse demonstrates early secretory differentiation directly from Lgr5+ intestinal stem cells
2025-05-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.12.023
PMID:39793582
|
研究论文 | 本研究通过整合定量命运图谱、数学建模和单细胞RNA测序，揭示了小鼠肠道隐窝维持的细胞机制 | 首次证明分泌系分化直接从Lgr5+肠道干细胞发生，而非传统认为的经过TA细胞阶段 | 研究仅限于小鼠模型，人类肠道上皮可能存在差异 | 解析肠道上皮稳态维持的细胞水平调控机制 | 小鼠肠道上皮干细胞和祖细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 命运图谱, 数学建模 | NA | 基因表达数据, 细胞命运追踪数据 | 三种互补的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7484 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq identifies protracted mouse germline X chromosome reactivation dynamics directed by a PRC2-dependent mechanism
2025-05-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.12.028
PMID:39798575
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究小鼠雌性原始生殖细胞中X染色体再激活的动态过程及其调控机制 | 首次在单细胞水平精确描绘X染色体再激活的动力学过程，揭示PRC2依赖的表观遗传机制在调控该过程中的关键作用 | 研究仅针对小鼠模型，人类生殖细胞中X染色体再激活机制可能有所不同 | 阐明雌性原始生殖细胞中X染色体再激活的分子机制和动力学特征 | 小鼠胚胎生殖细胞（从迁移期原始生殖细胞到性腺生殖细胞） | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 染色质分析 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据 | 小鼠胚胎发育不同阶段（E9.5至E16.5）的雌性生殖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7485 | 2025-10-06 |
Stemness in flux: Dissecting intestinal crypt organization with multimodal approaches
2025-05-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.04.003
PMID:40328226
|
研究论文 | 通过整合谱系追踪、单细胞RNA测序和数学模型，揭示隐窝底部干细胞在分泌和吸收谱系分化决策中的核心作用 | 首次结合多模态方法系统解析肠道隐窝组织机制，阐明Lgr5细胞在维持肠道上皮稳态中的关键功能 | NA | 探究肠道隐窝组织中干细胞谱系分化的调控机制 | 肠道隐窝干细胞 | 发育生物学 | NA | 谱系追踪, 单细胞RNA测序, 数学建模 | 数学模型 | 基因表达数据, 谱系追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7486 | 2025-10-06 |
KLRG1 identifies regulatory T cells with mitochondrial alterations that accumulate with aging
2025-May, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00855-9
PMID:40307497
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了随衰老积累的KLRG1+调节性T细胞亚群，并揭示了其线粒体改变和功能特征 | 首次发现表达KLRG1的调节性T细胞亚群随衰老积累，并揭示其具有线粒体改变和促炎表型的功能特征 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 鉴定与衰老相关的T细胞亚群及其功能特征 | CD4 T细胞，特别是调节性T细胞 | 免疫学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 基因表达数据，蛋白质表达数据 | 小鼠和人类样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7487 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA and Transcriptome Sequencing to Analyze the Role of Lactate Metabolism in Traumatic Brain Injury Astrocytes
2025-May, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.70428
PMID:40395067
|
研究论文 | 通过单细胞RNA和转录组测序分析乳酸代谢在创伤性脑损伤星形胶质细胞中的作用 | 首次在单细胞分辨率下揭示创伤性脑损伤后星形胶质细胞中乳酸代谢的关键作用，并鉴定出Ndufb9和Cox8a作为关键代谢基因 | 研究仅使用小鼠模型，样本量有限，且仅观察了急性和亚急性两个时间点 | 探索创伤性脑损伤后乳酸代谢在脑细胞中的作用机制 | 10周龄雄性C57BL/6J小鼠的额叶皮层组织 | 单细胞测序分析 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序，转录组测序，UMAP降维，差异表达基因分析，GO和KEGG富集分析 | 小鼠创伤性脑损伤模型 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确样本数量，使用小鼠额叶皮层组织在损伤后24小时和7天两个时间点 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7488 | 2025-10-06 |
An integrated analysis of scRNA-seq and RNA-seq data revealed metastasis-related regulators as prognostic indicators in lung adenocarcinoma
2025-Apr-30, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-2025-482
PMID:40400936
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，开发了肺腺癌预后预测模型 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据识别转移相关调控因子作为肺腺癌预后指标 | NA | 开发预测肺腺癌患者预后的列线图模型 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 加权基因共表达网络分析 | 预后模型, 列线图 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7489 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis and machine learning-based integration develop an immune-responsive signature of antigen-presenting cancer-associated fibroblasts in lung adenocarcinoma
2025-Apr-30, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-2024-2015
PMID:40400942
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析和机器学习整合开发了肺腺癌中抗原呈递癌症相关成纤维细胞的免疫反应特征 | 发现具有巨噬细胞样特征的新型抗原呈递CAF亚群，该亚群与免疫检查点抑制剂良好反应相关 | apCAF丰度在个体间存在差异，样本量可能有限 | 识别与肺腺癌免疫检查点抑制剂疗效相关的CAF亚群 | 肺腺癌样本中的癌症相关成纤维细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | 机器学习 | RNA测序数据 | 多个数据集的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7490 | 2025-10-06 |
Unlocking plant regeneration: The role for glutathione
2025-04-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.03.012
PMID:40262524
|
研究论文 | 本研究揭示了谷胱甘肽在植物再生过程中的关键作用机制 | 首次发现组织损伤释放的谷胱甘肽通过加速细胞周期G1期进程促进植物器官再生 | NA | 探究谷胱甘肽在植物再生过程中的分子机制 | 植物再生过程 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,活体成像 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7491 | 2025-10-06 |
Evaluating genetic-ancestry inference from single-cell RNA-seq data
2025-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.25.645175
PMID:40196550
|
研究论文 | 提出评估从单细胞RNA测序数据推断遗传祖先方法的框架 | 首次系统评估从scRNA-seq数据推断遗传祖先的方法有效性 | 仅基于四个数据集进行评估，样本多样性有限 | 评估从单细胞RNA测序数据推断遗传祖先的准确性 | 196名来自人类细胞图谱的捐赠者 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | ADMIXTURE等群体遗传学工具 | 单细胞RNA测序数据 | 196名捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7492 | 2025-10-06 |
TcEVdb: a database for T-cell-derived small extracellular vesicles from single-cell transcriptomes
2025-Feb-28, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaf012
PMID:40402791
|
研究论文 | 构建了一个名为TcEVdb的综合性数据库，用于探索T细胞来源的小细胞外囊泡的表达和聚类 | 首次通过SEVtras方法从T细胞单细胞RNA测序数据构建了全面的TcEV数据库，揭示了TcEV的异质性 | 基于计算推断而非直接实验验证的EV数据，可能存在技术局限性 | 探索T细胞来源的细胞外囊泡的转录组特征和功能 | T细胞来源的小细胞外囊泡 | 生物信息学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | SEVtras方法 | 单细胞转录组数据 | 277,265个EV液滴，来自21个项目中的221个样本，涵盖51种T细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7493 | 2025-10-06 |
CAF-macrophage crosstalk in tumour microenvironments governs the response to immune checkpoint blockade in gastric cancer peritoneal metastases
2025-Feb-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333617
PMID:39537239
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了胃癌腹膜转移中基质-髓系生态位通过C3-C3AR1轴介导免疫检查点抑制剂耐药的机制 | 首次发现胃癌腹膜转移中THBS2+基质癌相关成纤维细胞通过C3-C3AR1轴招募并转化巨噬细胞形成免疫抑制微环境 | 样本量有限，需更大规模研究验证 | 阐明胃癌腹膜转移对免疫检查点抑制剂耐药的机制 | 胃癌腹膜转移患者样本（原发肿瘤、腹膜转移灶和外周血） | 单细胞生物学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | II期临床试验患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7494 | 2025-10-06 |
TLR7 responses in glomerular macrophages accelerate the progression of glomerulonephritis in NZBWF1 mice
2025-Jan-27, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxaf005
PMID:39868591
|
研究论文 | 本研究通过TLR7缺陷小鼠模型揭示肾小球巨噬细胞中TLR7信号通过促进单核细胞迁移和炎症因子表达加速狼疮性肾炎进展 | 首次阐明肾小球巨噬细胞特异性TLR7信号在狼疮性肾炎中的致病机制，发现其通过CD31介导的单核细胞迁移和补体因子B表达促进疾病发展 | 研究局限于NZBWF1小鼠模型，尚未在人类患者中验证；血清补体因子B水平未升高与局部表达的关联机制需进一步探讨 | 探究巨噬细胞TLR7信号在狼疮性肾炎发病机制中的具体作用 | NZBWF1小鼠模型及其肾小球巨噬细胞 | 免疫学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序，基因敲除模型，免疫荧光 | Tlr7基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，蛋白质表达数据，组织病理数据 | NZBWF1小鼠及Tlr7-/- NZBWF1小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7495 | 2025-10-06 |
Plasticity in metastatic colorectal cancer
2025-01-20, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.12.018
PMID:39837278
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序研究结直肠癌进展过程中癌细胞状态的变化 | 使用单细胞转录组测序技术绘制结直肠癌进展过程中癌细胞状态变化的图谱 | NA | 探索结直肠癌转移和治疗抵抗的机制 | 结直肠癌细胞 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7496 | 2025-10-06 |
Comprehensive analysis of autophagy-related prognostic genes in breast cancer using bulk and single-cell RNA sequencing
2025, American journal of clinical and experimental immunology
IF:1.4Q4
DOI:10.62347/XPCM9169
PMID:40401006
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析乳腺癌中的自噬相关基因，构建了一个3基因预后模型 | 首次结合单细胞和批量RNA测序技术系统分析乳腺癌自噬景观，并开发了基于FEZ1、STX11和ADAMTSL1的新型预后特征 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 阐明乳腺癌自噬景观并开发预后模型 | 乳腺癌患者和细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, Cox回归分析 | Cox比例风险模型, 预后风险模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA、GSE75688、GSE20685和GSE48390数据集的多个样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7497 | 2025-10-06 |
Erratum: Integrated Analysis of Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Combined with Multiple Machine Learning Identified a Novel Immune Signature in Diabetic Nephropathy [Corrigendum]
2025, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
DOI:10.2147/DMSO.S540734
PMID:40406633
|
更正 | 对一篇关于糖尿病肾病免疫特征的论文进行勘误 | NA | NA | NA | NA | NA | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 多种机器学习 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7498 | 2025-10-06 |
SPI1+CD68+ macrophages as a biomarker for gastric cancer metastasis: a rationale for combined antiangiogenic and immunotherapy strategies
2024-Oct-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009983
PMID:39455096
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研究论文 | 本研究揭示了SPI1+CD68+肿瘤相关巨噬细胞作为胃癌转移生物标志物的重要作用 | 首次发现SPI1+CD68+巨噬细胞亚群在胃癌转移中的关键作用及其作为联合治疗策略的生物标志物 | 研究主要基于实验模型，需要进一步临床验证 | 评估SPI1+CD68+肿瘤相关巨噬细胞在胃癌中的作用机制 | 胃癌组织和相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 单细胞转录组分析,免疫组织化学,免疫荧光,流式细胞术,染色质免疫沉淀 | 小鼠腹膜转移模型 | 基因表达数据,组织图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7499 | 2025-10-06 |
A phase 2 randomized trial with autologous polyclonal expanded regulatory T cells in children with new-onset type 1 diabetes
2024-05-08, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adn2404
PMID:38718135
|
研究论文 | 评估自体多克隆扩增调节性T细胞在新发1型糖尿病儿童中的疗效和安全性的随机二期临床试验 | 首次在儿童新发1型糖尿病患者中开展自体多克隆扩增调节性T细胞的随机二期临床试验 | 单次剂量治疗未能阻止β细胞功能衰退，样本量有限（110例） | 评估自体多克隆扩增调节性T细胞在1型糖尿病儿童中的治疗效果 | 新发1型糖尿病的儿童和青少年患者 | 临床医学 | 1型糖尿病 | 流式细胞术，bulk RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 临床数据，基因表达数据 | 110例新发1型糖尿病儿童和青少年 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 7500 | 2025-10-06 |
Library-based single-cell analysis of CAR signaling reveals drivers of in vivo persistence
2024-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.29.591541
PMID:38746119
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研究论文 | 通过单细胞测序分析CAR信号传导，揭示驱动体内持久性的关键因素 | 首次使用单细胞测序系统性地将不同胞内信号域结构与转录输出关联，发现特定结构具有独特的强直信号特征 | 研究中发现的强直信号特征仅在液体肿瘤中驱动持久疗效，在实体瘤中无效 | 解码CAR信号传导设计原则，指导下一代胞内信号域结构的合理设计 | 表达嵌合抗原受体(CARs)的工程化T细胞 | 单细胞分析 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |