单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 7481 - 7500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7481 | 2024-10-08 |
Deciphering cellular heterogeneity in Spodoptera frugiperda midgut cell line through single cell RNA sequencing
2024-Sep, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110898
PMID:39047877
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了秋粘虫中肠细胞系的细胞异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了秋粘虫中肠细胞系的细胞异质性，并鉴定了多种细胞类型及其特异性标记基因 | NA | 揭示秋粘虫中肠细胞系的细胞异质性，并研究呼吸和肠道膜杀虫剂靶标基因的表达 | 秋粘虫中肠细胞系SfMG-0617的细胞异质性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 18,794个细胞 |
| 7482 | 2024-10-08 |
Molecular profiling of core immune-escape genes highlights TNFAIP3 as an immune-related prognostic biomarker in neuroblastoma
2024-Sep, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01914-4
PMID:39028490
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研究论文 | 本文通过转录组表达谱分析，鉴定出TNFAIP3作为神经母细胞瘤中与免疫逃逸相关的关键基因，并探讨了其在免疫治疗中的潜在作用 | 首次将TNFAIP3鉴定为神经母细胞瘤中与免疫逃逸相关的关键基因，并验证了其在免疫治疗中的潜在作用 | 初步实验验证了TNFAIP3在TAMs中的生物学功能，但仍需进一步的临床试验验证其作为治疗靶点的有效性 | 鉴定神经母细胞瘤中与免疫逃逸相关的关键基因，并探讨其在免疫治疗中的潜在作用 | 神经母细胞瘤中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）及其相关基因 | 生物信息学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 17个临床神经母细胞瘤样本 |
| 7483 | 2024-10-08 |
Genetic structure analysis of yak breeds and their response to adaptive evolution
2024-Sep, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110933
PMID:39218165
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研究论文 | 研究了牦牛品种的遗传结构及其对适应性进化的响应 | 首次系统地分析了牦牛的细胞水平适应性特征，并结合scRNA-seq方法构建了牦牛肺组织和皮肤组织的转录图谱 | 研究主要集中在牦牛的遗传结构和适应性基因上，未涉及其他可能影响适应性的因素 | 探讨牦牛品种的遗传结构及其对高海拔环境的适应性进化 | 牦牛的遗传多样性和适应性相关基因 | 遗传学 | NA | WGRS, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及八个牦牛群体的基因数据和牦牛肺组织及皮肤组织的单细胞RNA测序数据 |
| 7484 | 2024-10-08 |
Multi-omics analysis reveals a pericyte-associated gene expression signature for predicting prognosis and therapeutic responses in solid cancers
2024-Sep, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110942
PMID:39326641
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研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了与周细胞相关的基因表达特征，用于预测实体癌的预后和治疗反应 | 首次通过整合转录组和蛋白质组数据，识别出肿瘤来源周细胞中的51个差异表达基因，并构建了预测肝癌和肺癌预后及治疗反应的风险模型 | 研究主要集中在肝癌和肺癌，未涵盖其他类型的实体癌 | 探讨周细胞在肿瘤微环境中的作用，并开发预测实体癌预后和治疗反应的基因表达特征 | 肿瘤来源周细胞及其相关基因 | 数字病理学 | NA | 转录组分析、蛋白质组分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 涉及TCGA数据库和GEO数据库中的多个样本 |
| 7485 | 2024-10-08 |
Integrated spatial and multimodal single-cell transcriptomics reveal patient-dependent cell heterogeneity in splenic marginal zone lymphoma
2024-08, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6296
PMID:38828498
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研究论文 | 本文通过多模态单细胞分析技术，深入研究了脾边缘区淋巴瘤（SMZL）的生物学特征 | 首次在转录组和蛋白质水平上全面描述了SMZL的生物学标志，并揭示了患者间和患者内的异质性 | NA | 深入描述脾边缘区淋巴瘤（SMZL）的生物学特征 | 脾边缘区淋巴瘤（SMZL）的细胞异质性 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序、细胞索引转录组和表位测序、V(D)J单细胞RNA测序、空间转录组学、成像质谱流式技术 | NA | 转录组数据、蛋白质数据 | 配对的血液/脾脏样本 |
| 7486 | 2024-10-08 |
Single-cell transcriptomic-informed deconvolution of bulk data identifies immune checkpoint blockade resistance in urothelial cancer
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109928
PMID:38812546
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ProM的方法，通过单细胞转录组数据和批量RNA测序数据的计算反卷积，揭示了尿路上皮癌中免疫检查点抑制剂抵抗的细胞特征 | 提出了ProM方法，通过结合单细胞和批量RNA测序数据，能够更好地分析肿瘤微环境中的细胞类型，并揭示了与免疫检查点抑制剂抵抗相关的预处理细胞特征 | NA | 研究肿瘤微环境中的细胞相互作用及其对治疗反应的影响，特别是免疫检查点抑制剂抵抗的机制 | 尿路上皮癌样本中的单细胞和批量RNA测序数据 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 人类尿路上皮癌样本 |
| 7487 | 2024-10-08 |
UPK3A+ umbrella cell damage mediated by TLR3-NR2F6 triggers programmed destruction of urothelium in Hunner-type interstitial cystitis/painful bladder syndrome
2024-06, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6275
PMID:38551071
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了Hunner型间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征中尿路上皮细胞的异质性和发育轨迹，并提出了针对UPK3A伞细胞损伤的关键信号通路的治疗策略 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了Hunner型间质性膀胱炎中尿路上皮细胞的异质性和发育轨迹，并确定了TLR3-NR2F6轴作为潜在的治疗靶点 | 治疗效果有限，缺乏对特定细胞类型和分子靶点的充分理解 | 揭示Hunner型间质性膀胱炎中尿路上皮细胞的异质性和发育轨迹，并寻找潜在的治疗靶点 | Hunner型间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征中的尿路上皮细胞 | NA | 膀胱疼痛综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | HIC膀胱中的尿路上皮细胞 |
| 7488 | 2024-10-08 |
The interplay of Cxcl10+/Mmp14+ monocytes and Ccl3+ neutrophils proactively mediates silica-induced pulmonary fibrosis
2024-04-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.133713
PMID:38335607
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研究论文 | 研究揭示了Cxcl10+/Mmp14+单核细胞和Ccl3+中性粒细胞在硅肺纤维化中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序识别出与硅肺纤维化相关的Cxcl10+/Mmp14+单核细胞和Ccl3+中性粒细胞，并提出抗受体-配体对治疗策略 | NA | 探讨硅肺纤维化的分子机制并寻找潜在的治疗策略 | Cxcl10+/Mmp14+单核细胞和Ccl3+中性粒细胞在硅肺纤维化中的作用 | 数字病理学 | 职业病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 硅肺小鼠的肺组织样本和硅肺患者的血清及肺组织切片 |
| 7489 | 2024-10-08 |
A TGF-β-dominant chemoresistant phenotype of hepatoblastoma associated with aflatoxin exposure in children
2024-03-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000534
PMID:37459556
|
研究论文 | 本文研究了儿童肝母细胞瘤（HB）中与黄曲霉素暴露相关的TGF-β主导的化疗耐药表型 | 首次定义了HB的四种转录亚型，并发现S2A亚型是一种新的化疗耐药亚型，与TGF-β上调和黄曲霉素暴露相关 | NA | 探讨黄曲霉素与肝母细胞瘤化疗耐药性的关系 | 肝母细胞瘤（HB）样本及其化疗耐药性 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、全外显子测序、批量RNA测序 | NA | RNA | 180个HB样本 |
| 7490 | 2024-10-08 |
Single-cell immune profiling of mouse liver aging reveals Cxcl2+ macrophages recruit neutrophils to aggravate liver injury
2024-03-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000590
PMID:37695548
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析不同年龄小鼠肝脏免疫细胞，揭示Cxcl2+巨噬细胞招募中性粒细胞加剧肝脏损伤的机制 | 首次揭示Cxcl2+巨噬细胞通过CXCL2-CXCR2轴招募中性粒细胞，加剧老年小鼠肝脏损伤 | 研究主要基于小鼠模型，需进一步验证在人类中的适用性 | 探究年龄相关肝脏损伤中局部免疫微环境的动态变化及其机制 | 不同年龄小鼠肝脏中的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 89,542个免疫细胞 |
| 7491 | 2024-10-08 |
An IL-4 signalling axis in bone marrow drives pro-tumorigenic myelopoiesis
2024-Jan, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06797-9
PMID:38057662
|
研究论文 | 研究揭示了IL-4信号轴在骨髓中驱动肿瘤促进性髓系生成的作用 | 首次发现IL-4在骨髓中通过调节粒细胞-单核细胞前体细胞的转录程序，促进免疫抑制性肿瘤促进髓系细胞的生成 | 研究主要基于小鼠模型和临床试验的初步结果，需要更多临床数据验证 | 探讨IL-4信号轴在肿瘤免疫抑制中的作用及其潜在治疗策略 | 非小细胞肺癌中的髓系细胞和IL-4信号通路 | NA | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及人类和小鼠的非小细胞肺癌样本 |
| 7492 | 2024-10-08 |
Population-level integration of single-cell datasets enables multi-scale analysis across samples
2023-Nov, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-02035-2
PMID:37813989
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scPoli的开源学习器，用于整合异质性单细胞数据集，并应用于肺和外周血单核细胞的群体水平图谱分析 | scPoli通过生成模型学习样本和细胞表示，实现了数据整合、标签传递和参考映射，并展示了其在解释样本层面生物和技术变异方面的能力 | NA | 开发一种工具，用于整合群体水平的单细胞数据集，促进多尺度分析 | 肺和外周血单核细胞的单细胞数据集 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序 | 生成模型 | 单细胞数据 | 2,375个样本，共780万个细胞 |
| 7493 | 2024-10-08 |
Inference of differential key regulatory networks and mechanistic drug repurposing candidates from scRNA-seq data with SCANet
2023-11-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad644
PMID:37862243
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SCANet的工具，用于从单细胞RNA测序数据中推断差异关键调控网络和机制性药物再利用候选者 | 开发了SCANet，一个集成的单细胞分析工具，涵盖了从基因共表达模块推断、驱动基因检测、转录调控网络重建到机制性药物再利用候选者预测的整个流程 | NA | 解决从单细胞RNA测序数据中重建细胞（亚）类型发育差异的关键调控网络的计算问题 | 急性呼吸疾病患者中的细胞因子风暴机制和肥胖小鼠肠道干细胞中的细胞驱动机制 | 生物信息学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及两个研究的数据，包括急性呼吸疾病患者和肥胖小鼠的肠道干细胞 |
| 7494 | 2024-10-08 |
Chromatin accessibility profiling of targeted cell populations with laser capture microdissection coupled to ATAC-seq
2023-10-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100598
PMID:37776856
|
研究论文 | 本研究报告了激光捕获显微切割与ATAC-seq结合（LCM-ATAC-seq）用于新鲜冷冻样本的空间染色质可及性特征分析 | 首次将激光捕获显微切割与ATAC-seq结合，用于空间染色质可及性分析 | 研究仅限于新鲜冷冻样本，未涉及其他类型的样本 | 探索空间表观基因组学领域，提供基因调控的进一步见解 | 染色质可及性在健康和疾病中的作用 | 表观基因组学 | NA | 激光捕获显微切割（LCM），ATAC-seq | NA | 染色质可及性数据 | 新鲜冷冻样本 |
| 7495 | 2024-10-08 |
Diverse clonal fates emerge upon drug treatment of homogeneous cancer cells
2023-Aug, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06342-8
PMID:37468627
|
研究论文 | 本文开发并应用了FateMap框架，结合DNA条形码和单细胞RNA测序，揭示了数以十万计的克隆在接受抗癌治疗后的命运 | 本文首次展示了单细胞来源的癌症细胞在接受治疗后产生的分子、形态和功能上不同的抗性类型，并发现这些抗性类型主要由药物添加前的细胞分子差异决定，而非外在因素 | 本文主要集中在实验室环境下的研究，尚未充分探讨这些抗性类型在临床环境中的实际应用和影响 | 揭示抗癌治疗后癌症细胞的抗性多样性及其分子机制 | 单细胞来源的癌症细胞及其在接受不同抗癌药物治疗后的抗性类型 | NA | NA | DNA条形码和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数以十万计的克隆 |
| 7496 | 2024-10-08 |
Harmonized cross-species cell atlases of trigeminal and dorsal root ganglia
2023-Jul-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.04.547740
PMID:37461736
|
研究论文 | 构建跨物种的DRG和TG细胞图谱，描述了6个物种和19项研究中的18种神经元和11种非神经元细胞类型 | 首次构建了跨物种的DRG和TG细胞图谱，并展示了其在注释新测序的DRG细胞中的应用 | 跨物种的转录组定义细胞类型比较仍然具有挑战性 | 研究外周感觉神经元的多样性及其在不同物种中的转录组特征 | 背根神经节（DRG）和三叉神经节（TG）中的感觉神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及6个物种和19项研究的细胞样本 |
| 7497 | 2024-10-08 |
Studying stochastic systems biology of the cell with single-cell genomics data
2023-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.17.541250
PMID:37292934
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综述 | 本文综述了单细胞基因组学数据在细胞系统生物学中的应用，并提出了一种统一的数学框架来处理单分子生物随机性和基因组学技术变异 | 提出了一个统一的数学框架，通过生成函数的方法整合单细胞RNA测序中的各种现象 | NA | 探讨单细胞基因组学数据在系统生物学中的应用，并提出一个数学框架来处理生物随机性和技术变异 | 单细胞RNA测序中的RNA转录过程和微流控技术中的封装和文库构建步骤 | 系统生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成函数 | 基因组数据 | NA |
| 7498 | 2024-10-08 |
Spatial genomic, biochemical, and cellular mechanisms drive meningioma heterogeneity and evolution
2023-May-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2921804/v1
PMID:37292686
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研究论文 | 本文整合了空间转录组学和空间蛋白质组学方法，研究了高级别脑膜瘤的基因组、生化和细胞机制，揭示了肿瘤内异质性与分子、时间和空间演化的关系 | 通过空间转录组学和蛋白质组学方法，揭示了高级别脑膜瘤的基因和蛋白质表达差异，并发现了治疗抵抗性的空间扩展亚克隆拷贝数变异 | NA | 研究脑膜瘤的肿瘤内异质性和演化机制，为个性化医疗治疗提供基础 | 高级别脑膜瘤 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 空间转录组学、空间蛋白质组学、多重顺序免疫荧光（seqIF）、空间解卷积 | NA | 基因组数据、蛋白质数据、单细胞RNA测序数据 | NA |
| 7499 | 2024-10-07 |
Serial single-cell RNA sequencing unveils drug resistance and metastatic traits in stage IV breast cancer
2024-Oct-03, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00723-6
PMID:39363009
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了IV期乳腺癌患者的肿瘤细胞在化疗抵抗和转移过程中的转录组、基因组和表观基因组变化 | 首次在单个患者样本中系统分析了化疗抵抗和转移前细胞的特征，揭示了化疗抵抗细胞的克隆扩增和转移前细胞的表达谱变化 | 研究仅基于单个患者样本，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨IV期乳腺癌患者肿瘤细胞在化疗抵抗和转移过程中的分子机制 | IV期乳腺癌患者的原发肿瘤和远处转移瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单个IV期乳腺癌患者样本 |
| 7500 | 2024-10-07 |
Multi-scale transcriptomics reveals that specific tumor cells promote lung adenocarcinoma metastasis through crosstalk with the microenvironment
2024-Oct-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01306-4
PMID:39363121
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研究论文 | 研究通过整合单细胞RNA测序、空间RNA测序和批量RNA测序，揭示了特定肿瘤细胞通过与微环境的相互作用促进肺腺癌转移的机制 | 建立了肺腺癌转移风险评分模型（LMRS），并识别出42个转移驱动基因和两种肿瘤上皮细胞亚型 | NA | 揭示肺腺癌转移的机制 | 肺腺癌的转移驱动基因、细胞间相互作用和细胞与配体-受体对的共定位关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间RNA测序（stRNA-seq）和批量RNA测序 | NA | RNA | NA |