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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7461 - 7480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7461 | 2025-10-06 |
Sphingolipid metabolism-related genes as diagnostic markers in pneumonia-induced sepsis: the AUG model
2025-May-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-01150-8
PMID:40394027
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研究论文 | 本研究识别了与鞘脂代谢相关的ACER3、UGCG和GBA基因作为肺炎诱导脓毒症的诊断标志物，并构建了AUG预测模型 | 首次发现鞘脂代谢相关基因ACER3、UGCG和GBA组成的AUG模型在肺炎诱导脓毒症中的诊断价值，并揭示了其通过免疫细胞死亡途径和MIF信号参与疾病进程的机制 | 样本量相对有限（临床队列仅62例），需要更大规模的多中心研究验证 | 识别肺炎诱导脓毒症的生物标志物和治疗靶点 | 肺炎诱导脓毒症患者、肺炎患者和健康对照者 | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序、单细胞转录组测序 | 基因特征模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 训练集GSE65682、验证集E-MTAB-1548和E-MTAB-5273、临床队列62例（20例PIS、31例肺炎、11例健康对照） | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7462 | 2025-10-06 |
Decoding the impact of MMP1+ malignant subsets on tumor-immune interactions: insights from single-cell and spatial transcriptomics
2025-May-20, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02503-y
PMID:40394037
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学解析MMP1+恶性细胞亚群对肿瘤-免疫相互作用的影响 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学揭示MMP1+恶性细胞通过CXCL16-CXCR6和ANXA1-FPR3信号轴调控肿瘤免疫微环境的机制 | 未明确说明研究涉及的具体肿瘤类型和样本数量 | 探究MMP1在肿瘤进展和免疫调节中的作用机制 | MMP1+恶性细胞及其与免疫细胞（巨噬细胞和CD8+ T细胞）的相互作用 | 单细胞组学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7463 | 2025-10-06 |
Multimodal spatial proteomic profiling in acute myeloid leukemia
2025-May-20, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00897-7
PMID:40394148
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研究论文 | 本研究通过开发多模态空间蛋白质组学方法，揭示了急性髓系白血病骨髓微环境中的三级淋巴样结构及其临床意义 | 开发了基于组织微阵列的高通量空间免疫荧光和质谱流式成像技术，首次在骨髓中发现并验证了三级淋巴样结构的存在 | 骨髓脱钙和自发荧光可能对成像质量产生影响，方法在其他骨髓疾病中的适用性需要进一步验证 | 解析急性髓系白血病骨髓微环境中白血病细胞与免疫细胞的相互作用机制 | 急性髓系白血病患者的骨髓微环境 | 空间蛋白质组学 | 急性髓系白血病 | 空间免疫荧光成像, 质谱流式成像, 空间转录组学 | 无偏聚类分析, 空间K函数分析 | 蛋白质组数据, 转录组数据, 影像数据 | 480例患者转录组数据集 | NA | 空间蛋白质组学, 空间转录组学 | NA | 组织微阵列基础上的高通量空间成像平台 |
| 7464 | 2025-10-06 |
HSD17B1-mediated trophoblast differentiation lowers estrogen levels in early-onset preeclampsia
2025-May-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-02490-1
PMID:40394177
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现HSD17B1是早发性子痫前期发病机制中的核心失调节点 | 首次揭示HSD17B1作为滋养细胞-内分泌串扰的主协调因子在EOPE发病机制中的关键作用 | 研究样本量有限，需要更大规模验证；机制研究主要基于体外细胞模型 | 探究早发性子痫前期伴胎儿生长受限的发病机制 | 胎盘滋养细胞亚型、临床胎盘样本、BeWo滋养细胞模型 | 单细胞测序分析 | 子痫前期 | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 蛋白质印迹, 基因敲低 | 多模态计算分析 | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | EOPE-FGR和正常妊娠的胎盘样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7465 | 2025-10-06 |
Pyroptosis drives tumor progression and immune evasion in Hepatocellular Carcinoma: a single-cell and spatial transcriptomic study
2025-May-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02421-6
PMID:40394449
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析揭示CHMP4B作为肝细胞癌中焦亡关键基因，促进肿瘤进展和免疫逃逸 | 首次在肝细胞癌中整合单细胞RNA测序和空间转录组数据，鉴定CHMP4B作为焦亡关键调控基因及其在肿瘤免疫微环境中的作用机制 | 样本量有限（10例HCC患者），需要更大数据集和多组学方法进一步验证 | 研究焦亡相关基因在肝细胞癌中的表达及其对预后和肿瘤微环境的影响 | 肝细胞癌患者组织样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | LASSO回归, 机器学习 | 基因表达数据 | 10例HCC患者单细胞数据，TCGA批量RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7466 | 2025-10-06 |
Scmaskgan: masked multi-scale CNN and attention-enhanced GAN for scRNA-seq dropout imputation
2025-May-20, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06138-9
PMID:40394489
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研究论文 | 提出scMASKGAN方法，通过将矩阵填补转化为像素修复任务来解决scRNA-seq数据中的dropout事件 | 整合掩码机制、多尺度CNN、注意力机制和残差网络，结合细胞类型标签约束，将矩阵填补转化为像素修复任务 | NA | 改进单细胞RNA测序数据中dropout事件的填补效果 | 单细胞RNA测序数据和神经母细胞瘤样本 | 机器学习 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | CNN, GAN, 注意力机制, ResNet | 基因表达数据 | 10个神经母细胞瘤样本和7种不同数据类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7467 | 2025-10-06 |
A novel NFKB1 agonist remodels tumor microenvironment and activates dendritic cells to promote anti-tumor immunity in colorectal cancer
2025-May-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06576-2
PMID:40394677
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研究论文 | 本研究鉴定了一种新型NFKB1激动剂F1929-1458，通过重塑肿瘤微环境和激活树突状细胞促进抗肿瘤免疫 | 首次发现NFKB1激动剂可通过诱导肿瘤细胞释放DAMPs激活树突状细胞的cGAS-STING和NLRP3炎症小体通路 | 研究主要基于小鼠结直肠癌模型，人体应用效果需进一步验证 | 开发能够同时靶向癌症干细胞和肿瘤微环境的治疗策略 | 结直肠癌肿瘤微环境、树突状细胞、T细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞测序、小分子pull-down质谱、细胞热位移分析、分子对接 | NA | 单细胞测序数据、质谱数据 | 果蝇干细胞肿瘤模型、小鼠结直肠癌移植瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7468 | 2025-10-06 |
Non-variable RNA deletion using the CRISPR-Cas9 technique demonstrated improved outcomes in human intestine single-cell RNA sequencing data, even at half sequencing depths
2025-May-20, Genomics & informatics
DOI:10.1186/s44342-025-00043-6
PMID:40394729
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研究论文 | 本研究开发了一种基于CRISPR-Cas9的方法，用于在单细胞RNA测序中特异性去除非可变RNA，从而改善数据质量并降低测序成本 | 首次将CRISPR-Cas9技术应用于单细胞RNA测序中非可变RNA的靶向删除，相比计算方法能更有效地减少非可变基因表达 | 研究仅针对人类肠道组织，未验证在其他组织类型中的适用性；样本量相对有限 | 开发一种物理方法改善单细胞RNA测序数据质量，减少非可变RNA的影响 | 人类肠道组织的单细胞RNA测序数据 | 单细胞测序 | NA | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 17名患者的肠道组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7469 | 2025-10-06 |
Neoadjuvant with low-dose radiotherapy, tislelizumab, albumin-bound paclitaxel, and cisplatin for resectable locally advanced head and neck squamous cell carcinoma: phase II single-arm trial
2025-May-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59865-1
PMID:40382318
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研究论文 | 本研究评估低剂量放疗联合替雷利珠单抗、白蛋白结合型紫杉醇和顺铂新辅助治疗可切除局部晚期头颈部鳞状细胞癌的疗效和安全性 | 首次将低剂量放疗与PD-1抑制剂替雷利珠单抗及化疗联合用于HNSCC新辅助治疗，并利用单细胞RNA测序分析肿瘤微环境重塑 | 单臂II期试验设计，样本量较小（28例患者），缺乏对照组比较 | 评估新辅助低剂量放疗联合免疫化疗方案在局部晚期头颈部鳞癌中的病理完全缓解率和安全性 | 未经治疗的III-IVB期头颈部鳞状细胞癌患者 | 临床肿瘤学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据，基因表达数据 | 28例患者（23例接受手术） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7470 | 2025-10-06 |
Integrating HiTOP and RDoC frameworks part II: shared and distinct biological mechanisms of externalizing and internalizing psychopathology
2025-May-09, Psychological medicine
IF:5.9Q1
DOI:10.1017/S0033291725000819
PMID:40340892
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法探索HiTOP框架中外化与内化精神病理学的共享和独特生物学机制 | 首次将HiTOP和RDoC框架整合，通过多组学方法系统分析外化与内化精神病理学的生物学机制 | 研究依赖于已有的全基因组关联研究数据，未进行新的实验验证 | 探索精神病理学的外化与内化维度在RDoC分析单元中的生物学基础 | 精神病理学的外化(EXT)、内化(INT)及其共享(EXT+INT)维度 | 精神疾病生物学机制研究 | 精神病理学 | 多组学分析、全基因组关联研究、单细胞RNA测序、磁共振成像 | 因果推断分析 | 基因组数据、基因表达数据、脑影像数据 | 基于同伴文章Part I的全基因组关联研究数据 | NA | 单细胞RNA测序、磁共振成像 | NA | NA |
| 7471 | 2025-10-06 |
T cell-mediated SIV dissemination into the CNS: a single-cell transcriptomic analysis
2025-May-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6537361/v1
PMID:40386405
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示CD4+细胞毒性样T细胞在SIV向中枢神经系统传播中的关键作用 | 首次在急性SIV感染中识别出同时表达髓系和淋巴系基因的脑细胞簇，并发现CD4+细胞毒性样T细胞是病毒进入大脑的关键淋巴细胞亚群 | 研究仅基于三只急性SIV感染的恒河猴样本，样本量较小 | 表征急性感染期间脑淋巴细胞的作用及将SIV传播至中枢神经系统的CD4+T细胞表型 | 急性SIV感染的恒河猴脑部和血液细胞 | 单细胞转录组学 | HIV/SIV感染 | scRNA-seq, 生物信息学分析, 体外共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 3只急性SIV感染的恒河猴 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7472 | 2025-10-06 |
Spatially Resolved Panoramic in vivo CRISPR Screen via Perturb-DBiT
2025-May-08, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6481967/v1
PMID:40386382
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研究论文 | 开发了一种名为Perturb-DBiT的空间分辨CRISPR筛选方法，能够在同一组织切片上同时测序空间总RNA全转录组和单导向RNA | 首次实现空间总RNA全转录组与sgRNA的同步共测序，能够无偏发现遗传扰动对RNA调控、细胞动力学和组织结构的影响 | NA | 研究遗传扰动在原生组织环境中对基因表达的影响 | 人类癌症转移定植模型和免疫活性同系小鼠模型 | 空间转录组学 | 癌症 | CRISPR筛选, 空间转录组学, 全转录组测序 | NA | 空间RNA测序数据, sgRNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞多组学 | Perturb-DBiT | 能够在同一组织切片上同时进行空间总RNA全转录组和单导向RNA的base-by-base测序 |
| 7473 | 2025-10-06 |
OLS4: a new Ontology Lookup Service for a growing interdisciplinary knowledge ecosystem
2025-May-06, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf279
PMID:40323307
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研究论文 | 本文介绍了OLS4，一个用于生物信息学和化学领域本体搜索的新版本服务 | 实现完整的OWL2规范，支持多语言国际化，提供新的用户界面和外部数据库链接功能 | NA | 开发支持日益增长的本体生态系统的新一代本体查找服务 | 生物信息学和化学领域的本体和注释数据 | 生物信息学 | NA | 本体搜索技术 | NA | 本体数据 | NA | EMBL-EBI | 本体搜索服务 | OLS4 | 开源本体查找服务，支持OWL2规范和多语言界面 |
| 7474 | 2025-10-06 |
Fate mapping in mouse demonstrates early secretory differentiation directly from Lgr5+ intestinal stem cells
2025-05-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.12.023
PMID:39793582
|
研究论文 | 本研究通过整合定量命运图谱、数学建模和单细胞RNA测序，揭示了小鼠肠道隐窝维持的细胞机制 | 首次证明分泌系分化直接从Lgr5+肠道干细胞发生，而非传统认为的经过TA细胞阶段 | 研究仅限于小鼠模型，人类肠道上皮可能存在差异 | 解析肠道上皮稳态维持的细胞水平调控机制 | 小鼠肠道上皮干细胞和祖细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 命运图谱, 数学建模 | NA | 基因表达数据, 细胞命运追踪数据 | 三种互补的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7475 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq identifies protracted mouse germline X chromosome reactivation dynamics directed by a PRC2-dependent mechanism
2025-05-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.12.028
PMID:39798575
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究小鼠雌性原始生殖细胞中X染色体再激活的动态过程及其调控机制 | 首次在单细胞水平精确描绘X染色体再激活的动力学过程，揭示PRC2依赖的表观遗传机制在调控该过程中的关键作用 | 研究仅针对小鼠模型，人类生殖细胞中X染色体再激活机制可能有所不同 | 阐明雌性原始生殖细胞中X染色体再激活的分子机制和动力学特征 | 小鼠胚胎生殖细胞（从迁移期原始生殖细胞到性腺生殖细胞） | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 染色质分析 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据 | 小鼠胚胎发育不同阶段（E9.5至E16.5）的雌性生殖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7476 | 2025-10-06 |
Stemness in flux: Dissecting intestinal crypt organization with multimodal approaches
2025-05-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.04.003
PMID:40328226
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研究论文 | 通过整合谱系追踪、单细胞RNA测序和数学模型，揭示隐窝底部干细胞在分泌和吸收谱系分化决策中的核心作用 | 首次结合多模态方法系统解析肠道隐窝组织机制，阐明Lgr5细胞在维持肠道上皮稳态中的关键功能 | NA | 探究肠道隐窝组织中干细胞谱系分化的调控机制 | 肠道隐窝干细胞 | 发育生物学 | NA | 谱系追踪, 单细胞RNA测序, 数学建模 | 数学模型 | 基因表达数据, 谱系追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7477 | 2025-10-06 |
KLRG1 identifies regulatory T cells with mitochondrial alterations that accumulate with aging
2025-May, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00855-9
PMID:40307497
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了随衰老积累的KLRG1+调节性T细胞亚群，并揭示了其线粒体改变和功能特征 | 首次发现表达KLRG1的调节性T细胞亚群随衰老积累，并揭示其具有线粒体改变和促炎表型的功能特征 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 鉴定与衰老相关的T细胞亚群及其功能特征 | CD4 T细胞，特别是调节性T细胞 | 免疫学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 基因表达数据，蛋白质表达数据 | 小鼠和人类样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7478 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA and Transcriptome Sequencing to Analyze the Role of Lactate Metabolism in Traumatic Brain Injury Astrocytes
2025-May, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.70428
PMID:40395067
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研究论文 | 通过单细胞RNA和转录组测序分析乳酸代谢在创伤性脑损伤星形胶质细胞中的作用 | 首次在单细胞分辨率下揭示创伤性脑损伤后星形胶质细胞中乳酸代谢的关键作用，并鉴定出Ndufb9和Cox8a作为关键代谢基因 | 研究仅使用小鼠模型，样本量有限，且仅观察了急性和亚急性两个时间点 | 探索创伤性脑损伤后乳酸代谢在脑细胞中的作用机制 | 10周龄雄性C57BL/6J小鼠的额叶皮层组织 | 单细胞测序分析 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序，转录组测序，UMAP降维，差异表达基因分析，GO和KEGG富集分析 | 小鼠创伤性脑损伤模型 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确样本数量，使用小鼠额叶皮层组织在损伤后24小时和7天两个时间点 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7479 | 2025-10-06 |
An integrated analysis of scRNA-seq and RNA-seq data revealed metastasis-related regulators as prognostic indicators in lung adenocarcinoma
2025-Apr-30, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-2025-482
PMID:40400936
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，开发了肺腺癌预后预测模型 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据识别转移相关调控因子作为肺腺癌预后指标 | NA | 开发预测肺腺癌患者预后的列线图模型 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 加权基因共表达网络分析 | 预后模型, 列线图 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7480 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis and machine learning-based integration develop an immune-responsive signature of antigen-presenting cancer-associated fibroblasts in lung adenocarcinoma
2025-Apr-30, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-2024-2015
PMID:40400942
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析和机器学习整合开发了肺腺癌中抗原呈递癌症相关成纤维细胞的免疫反应特征 | 发现具有巨噬细胞样特征的新型抗原呈递CAF亚群，该亚群与免疫检查点抑制剂良好反应相关 | apCAF丰度在个体间存在差异，样本量可能有限 | 识别与肺腺癌免疫检查点抑制剂疗效相关的CAF亚群 | 肺腺癌样本中的癌症相关成纤维细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | 机器学习 | RNA测序数据 | 多个数据集的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |