单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7441 - 7460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 7441 | 2025-10-06 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveals a Stereoscopic Response of Rice Leaf Cells to Magnaporthe oryzae Infection
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202416846
PMID:40123572
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示了水稻叶片细胞对稻瘟病菌感染的三维免疫响应机制 | 首次结合单细胞和空间转录组学技术构建水稻叶片细胞图谱，揭示了细胞特异性及多维度的免疫响应模式 | 研究主要聚焦转录组层面，对蛋白质水平和代谢物动态变化的验证仍需进一步研究 | 探究水稻叶片细胞对稻瘟病菌感染的免疫响应机制 | 水稻叶片细胞 | 植物生物学 | 植物真菌病害 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 236,708个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7442 | 2025-10-06 |
Halofuginone Disrupted Collagen Deposition via mTOR-eIF2α-ATF4 Axis to Enhance Chemosensitivity in Ovarian Cancer
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202416523
PMID:40126173
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现靶向胶原蛋白可重塑卵巢癌细胞外基质，并鉴定出卤夫酮通过mTOR-eIF2α-ATF4轴抑制COL1A1产生以增强化疗敏感性 | 首次建立22基因基质组特征预测卵巢癌化疗反应，发现卤夫酮通过调控mTOR-eIF2α-ATF4轴和巨噬细胞极化重塑肿瘤微环境 | NA | 探索靶向细胞外基质重塑增强卵巢癌化疗敏感性的策略 | 卵巢癌相关成纤维细胞、肿瘤相关巨噬细胞、CD8+ T细胞 | 肿瘤微环境研究 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7443 | 2025-10-06 |
PRMT1 Ablation in Endothelial Cells Causes Endothelial Dysfunction and Aggravates COPD Attributable to Dysregulated NF-κB Signaling
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411514
PMID:40135804
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研究论文 | 本研究探讨PRMT1在内皮细胞中的功能及其在慢性阻塞性肺病发病机制中的作用 | 首次揭示PRMT1通过调控NF-κB信号通路防止内皮功能障碍和衰老的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明PRMT1在内皮细胞中的功能及其在COPD发病机制中的作用 | 内皮细胞、内皮特异性PRMT1敲除小鼠、COPD模型 | 分子生物学 | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 7444 | 2025-10-06 |
TcEVdb: a database for T-cell-derived small extracellular vesicles from single-cell transcriptomes
2025-Feb-28, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaf012
PMID:40036846
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研究论文 | 构建了一个基于单细胞转录组数据的T细胞来源小细胞外囊泡综合数据库TcEVdb | 首次系统性地整合多项目单细胞RNA测序数据，利用SEVtras方法分析T细胞来源细胞外囊泡的异质性和功能特征 | 依赖公共数据库数据的质量和完整性，分析结果需要进一步实验验证 | 探索T细胞来源细胞外囊泡的转录组特征和功能多样性 | T细胞来源的小细胞外囊泡 | 生物信息学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | SEVtras | 单细胞转录组数据 | 277,265个EV液滴，来自21个项目的221个样本，涵盖51种T细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7445 | 2025-10-06 |
Pro-Fibrotic Macrophage Subtypes: SPP1+ Macrophages as a Key Player and Therapeutic Target in Cardiac Fibrosis?
2025-02-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14050345
PMID:40072075
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综述 | 本文探讨SPP1+巨噬细胞在心脏纤维化中的关键作用及作为治疗靶点的潜力 | 首次系统阐述SPP1+巨噬细胞作为心脏纤维化关键介质和治疗靶点的作用机制 | 主要基于临床前研究数据，尚未在人体临床试验中得到验证 | 研究心脏纤维化的发病机制和潜在治疗策略 | SPP1+巨噬细胞及其与成纤维细胞、肌成纤维细胞的相互作用 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7446 | 2025-10-06 |
Distinct myeloid-derived suppressor cell populations in human glioblastoma
2025-Jan-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abm5214
PMID:39818911
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定人胶质母细胞瘤中两种不同的髓源性抑制细胞群体及其空间分布特征 | 首次在IDH野生型胶质母细胞瘤中发现两种功能不同的MDSC亚群，并揭示其与肿瘤干细胞的空间共定位和相互作用机制 | 样本量相对有限（33例胶质瘤），且主要关注IDH野生型肿瘤 | 阐明胶质瘤相关髓系细胞在肿瘤进展和免疫逃逸中的作用机制 | 人胶质瘤组织中的免疫细胞和肿瘤细胞 | 单细胞组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据，空间基因表达数据 | 33例人胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 7447 | 2025-10-06 |
Isolation and Preparation of Embryonic Zebrafish Retinal Cells for Single-Cell RNA Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4087-6_6
PMID:39240518
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研究论文 | 本文描述了从斑马鱼胚胎眼睛中制备高质量单细胞悬液用于单细胞RNA测序的方法 | 开发了可重复生成高质量斑马鱼胚胎眼睛单细胞悬液的方法，并建立了定量评估细胞产量和活力的质量控制参数 | 该方法主要针对斑马鱼胚胎眼睛，在其他组织或模型系统中的适用性需要进一步验证 | 建立斑马鱼胚胎视网膜细胞单细胞RNA测序的样品制备和质量控制方法 | 斑马鱼胚胎眼睛的视网膜细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10× Genomics v3.1系统 | 10× Genomics v3.1单细胞测序系统 |
| 7448 | 2025-10-06 |
Insights into early acne pathogenesis: Exploring intercellular dynamics and key dysregulated genes
2025, Cell signaling
DOI:10.46439/signaling.3.053
PMID:40401196
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评论 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学数据探讨早期痤疮发病机制中的细胞间通讯和关键失调基因 | 首次在早期痤疮研究中整合单细胞RNA测序与空间转录组学数据，揭示主要皮肤细胞类型中与炎症反应和角化过度相关的关键失调基因 | NA | 探索早期痤疮发病机制中的细胞间动态和关键失调基因 | 痤疮患者的皮肤组织样本，包括内皮细胞、成纤维细胞、淋巴细胞、髓样细胞、角质形成细胞和平滑肌细胞 | 数字病理学 | 痤疮 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7449 | 2025-10-06 |
Huntington's disease cellular phenotypes are rescued non-cell autonomously by healthy cells in mosaic telencephalic organoids
2024-Aug-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50877-x
PMID:39095390
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研究论文 | 本研究通过构建亨廷顿病镶嵌型端脑类器官，揭示了健康细胞通过非细胞自主机制挽救疾病细胞表型的能力 | 首次在镶嵌型端脑类器官中证明健康细胞可通过细胞间接触恢复亨廷顿病细胞的神经元特性、发育轨迹和突触功能 | 研究主要关注发育阶段，对成熟神经元退行性病变的长期影响仍需进一步验证 | 探究亨廷顿病中不同基因型细胞间的非细胞自主相互作用机制 | 健康与亨廷顿病基因型的端脑类器官 | 神经科学 | 亨廷顿病 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7450 | 2025-10-06 |
Response of astrocytes and their interaction with surrounding brain cells after acute ischemia-reperfusion analyzed by single-cell transcriptome sequencing
2025-Jun-15, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析急性缺血再灌注后星形胶质细胞的反应及其与周围脑细胞的相互作用 | 首次系统揭示缺血再灌注12小时后星形胶质细胞亚群的异质性特征及其与周围脑细胞的通讯网络，识别出9个潜在治疗靶点基因 | 研究仅关注缺血再灌注后12小时的时间点，未分析其他时间点的动态变化 | 探究星形胶质细胞在缺血性脑卒中中的异质性反应机制 | 小鼠脑缺血再灌注模型中的星形胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA测序, 逆转录聚合酶链反应 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠脑缺血再灌注模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7451 | 2025-10-06 |
The janus face of astrocytes in multiple sclerosis: Balancing protection and pathology
2025-Jun-15, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
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综述 | 本文综述了星形胶质细胞在多发性硬化症中的双重作用及其治疗潜力 | 突破了传统的A1/A2二分法范式，揭示了人类星形胶质细胞存在连续状态谱系，并强调了空间多组学技术在该领域的新发现 | 将小鼠A1/A2概念转化到人类多发性硬化症存在挑战，人类星形胶质细胞表现出异质性和环境依赖性反应 | 探讨星形胶质细胞在多发性硬化症中的双重角色及靶向治疗策略 | 多发性硬化症中的星形胶质细胞 | 神经科学 | 多发性硬化症 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 空间多组学 | NA | 转录组数据, 空间组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7452 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis reveals fibroblast heterogeneity and myofibroblast conversion in ligamentum flavum hypertrophy
2025-Jun, The spine journal : official journal of the North American Spine Society
DOI:10.1016/j.spinee.2024.12.001
PMID:39653186
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示黄韧带肥厚中成纤维细胞异质性及肌成纤维细胞转化过程 | 首次在黄韧带肥厚中发现成纤维细胞向肌成纤维细胞的转分化过程，并识别出新型信号通路GAS和GRN | 仅纳入3例患者样本，样本量较小 | 研究肥厚黄韧带的细胞组成和信号通路 | 接受腰椎减压手术的LSCS患者黄韧带组织 | 单细胞组学 | 腰椎管狭窄症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例患者黄韧带组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7453 | 2025-10-06 |
Characterization of ROMK cellular heterogeneity along the mouse kidney thick ascending limb
2025-Jun, Pflugers Archiv : European journal of physiology
DOI:10.1007/s00424-025-03086-4
PMID:40358700
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研究论文 | 本研究通过多模态技术揭示了小鼠肾脏厚壁升支中ROMK通道的细胞异质性分布模式 | 首次发现ROMK蛋白顶端分布与分子特征不同的TAL细胞类型相对应，揭示了尽管ROMK mRNA普遍表达，但蛋白定位存在明显功能异质性 | 研究仅限于小鼠模型，人类肾脏中是否存在类似异质性尚需验证 | 阐明肾脏厚壁升支中ROMK通道的细胞分布异质性及其功能意义 | 小鼠肾脏厚壁升支细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序,RNAscope原位杂交,迭代间接免疫荧光成像 | 机器学习 | 图像,转录组数据 | 小鼠肾脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 7454 | 2025-10-06 |
GCNLA: Inferring Cell-Cell Interactions From Spatial Transcriptomics With Long Short-Term Memory and Graph Convolutional Networks
2025-May-22, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3572383
PMID:40402695
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研究论文 | 提出一种基于图卷积网络和长短期记忆注意力模块的网络架构GCNLA，用于从空间转录组数据推断细胞间相互作用 | 结合图卷积层、长短期记忆网络、注意力模块和残差连接，不仅学习细胞空间结构，还能捕获远端细胞间的相互作用信息 | NA | 从空间转录组数据推断细胞间相互作用 | 细胞间相互作用 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图卷积网络(GCN), 长短期记忆网络(LSTM) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | seqFISH, MERFISH | NA |
| 7455 | 2025-10-06 |
High-Sensitivity PD-L1 Staining Using Clone 73-10 Antibody and Spatial Transcriptomics for Precise Expression Analysis in Non-Tumorous, Intraepithelial Neoplasia, and Squamous Cell Carcinoma of Head and Neck
2025-May-20, Head and neck pathology
DOI:10.1007/s12105-025-01798-8
PMID:40392349
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研究论文 | 本研究使用高灵敏度克隆73-10抗体和空间转录组学技术评估头颈部鳞状细胞癌中PD-L1表达 | 首次结合高灵敏度克隆73-10抗体和空间转录组学技术系统分析头颈部鳞状细胞癌中PD-L1表达模式 | 样本量相对有限，空间转录组学分析仅包含6对样本 | 评估PD-L1在头颈部鳞状细胞癌中的表达模式，探索其与免疫治疗资格的相关性 | 头颈部鳞状细胞癌患者组织样本，包括癌组织、相邻鳞状上皮内瘤变和正常口腔黏膜 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 免疫组织化学染色，空间转录组学，通路分析 | NA | 组织切片图像，基因表达数据 | 94例头颈部鳞状细胞癌临床样本，包含配对的相邻鳞状上皮内瘤变和正常口腔黏膜样本，其中6对样本进行空间转录组学分析 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7456 | 2025-10-06 |
Neuron-like macrophage differentiation via the APOE-TREM2 axis contributes to chronic pain in nasopharyngeal carcinoma
2025-May-20, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-025-10035-5
PMID:40392335
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研究论文 | 本研究揭示了鼻咽癌中APOE-TREM2轴通过促进巨噬细胞向神经元样分化导致慢性疼痛的新机制 | 首次发现肿瘤相关巨噬细胞通过APOE-TREM2轴发生神经元样分化并参与鼻咽癌慢性疼痛的形成 | 动物模型与人类疾病存在差异，临床转化需要进一步验证 | 阐明APOE-TREM2轴在鼻咽癌慢性疼痛中的作用机制 | 鼻咽癌组织、巨噬细胞、小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，体外共培养，基因敲除 | 动物疾病模型 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | TCGA鼻咽癌数据集和单细胞测序样本 | NA | 单细胞RNA测序，转录组测序 | NA | NA |
| 7457 | 2025-10-06 |
ACSS2 mediates an epigenetic pathway to regulate β-cell adaptation during gestation in mice
2025-May-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58322-3
PMID:40393969
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了小鼠妊娠期β细胞适应的表观遗传调控机制 | 首次在单细胞水平发现ACSS2介导的乙酰-CoA生物合成和组蛋白乙酰化在β细胞妊娠适应中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探索妊娠期胰腺β细胞适应性变化的分子机制 | 小鼠胰腺β细胞 | 单细胞生物学 | 妊娠期糖尿病 | 单细胞转录组测序，遗传分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7458 | 2025-10-06 |
CellFM: a large-scale foundation model pre-trained on transcriptomics of 100 million human cells
2025-May-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59926-5
PMID:40393991
|
研究论文 | 本研究开发了一个基于1亿个人类细胞转录组数据预训练的大规模基础模型CellFM | 使用1亿个细胞的大规模数据集训练包含8亿参数的细胞基础模型，在模型规模和训练数据量上超越现有模型 | NA | 开发能够统一表示细胞状态的单细胞基础模型 | 人类单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | RetNet | 基因表达数据 | 1亿个人类细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7459 | 2025-10-06 |
TGF-β signaling redirects Sox11 gene regulatory activity to promote partial EMT and collective invasion of oncogenically transformed intestinal organoids
2025-May-20, Oncogenesis
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s41389-025-00560-7
PMID:40393982
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研究论文 | 本研究利用结直肠癌驱动突变肠道类器官模型，揭示TGF-β信号通过重编程Sox11基因调控活性促进部分上皮间质转化和集体侵袭的机制 | 首次发现Sox11作为关键转录因子在TGF-β1诱导的部分上皮间质转化和集体侵袭中的必要性作用，并揭示其在正常肠道功能和肿瘤抑制中的双重功能 | Sox11对于TGF-β1诱导的表型是必要但不充分的，其具体作用机制仍需进一步研究 | 探究TGF-β1诱导的部分上皮间质转化和集体侵袭的调控机制 | 携带结直肠癌驱动突变的肠道类器官 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 功能丧失和过表达实验 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 肠道类器官模型和人类结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7460 | 2025-10-06 |
The unique hypertrophic and fibrotic features of neonatal right ventricle in response to pressure overload
2025-May-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-01427-y
PMID:40394014
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研究论文 | 本研究建立了新生大鼠/小鼠右心室压力超负荷模型，揭示了新生儿右心室对压力超负荷反应的独特肥大和纤维化特征 | 首次建立了新生儿右心室压力超负荷模型，并通过单细胞RNA测序揭示了与成人不同的分子特征 | 研究仅针对新生儿期右心室反应，未涉及其他发育阶段或左心室变化 | 研究儿科心力衰竭的发病机制，特别是右心室压力超负荷引起的病理变化 | 新生大鼠和小鼠的右心室组织及心肌细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 组织染色 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 新生大鼠和小鼠右心室组织 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |