单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 7441 - 7460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7441 | 2024-10-09 |
Pain sensitivity genes as therapeutic targets in knee osteoarthritis: A comprehensive analysis
2024 Jan-Dec, Molecular pain
IF:2.8Q2
DOI:10.1177/17448069241289961
PMID:39313491
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研究论文 | 本研究系统分析了疼痛敏感基因在膝骨关节炎中的作用，并探讨了其作为治疗靶点的潜力 | 通过综合分析RNA-seq数据和单细胞RNA-seq数据，识别出关键的疼痛敏感基因，并验证了其在膝骨关节炎中的重要作用 | NA | 探讨疼痛敏感基因在膝骨关节炎中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 疼痛敏感基因在膝骨关节炎患者中的表达和作用 | 生物信息学 | 骨关节炎 | RNA-seq | LASSO, SVM, 随机森林 | RNA-seq数据 | 涉及GSE114007、GSE169077、GSE152805、GSE133449和GSE104782等多个数据集 |
| 7442 | 2024-10-09 |
The single-cell transcriptome of mTECs and CD4+ thymocytes under adhesion revealed heterogeneity of mTECs and a network controlled by Aire and lncRNAs
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1376655
PMID:39328409
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研究论文 | 研究了在粘附过程中，自身免疫调节因子（Aire）基因缺陷对胸腺髓质上皮细胞（mTECs）和CD4+胸腺细胞单细胞转录组的影响 | 揭示了mTECs在转录组水平上的异质性，并发现Aire和长链非编码RNAs（lncRNAs）在调控mTECs和胸腺细胞网络中的作用 | NA | 探讨Aire基因缺陷对胸腺髓质上皮细胞和胸腺细胞在粘附过程中的影响 | 胸腺髓质上皮细胞（mTECs）和CD4+胸腺细胞 | 基因表达 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 野生型（WT）和Aire缺陷型（Aire-deficient）mTECs与WT单阳性（SP）CD4胸腺细胞共培养的单细胞库 |
| 7443 | 2024-10-09 |
The Role of Polycystic Kidney Disease-Like Homologs in Planarian Nervous System Regeneration and Function
2024, Integrative organismal biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/iob/obae035
PMID:39364443
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研究论文 | 研究了多囊肾病样同源基因在涡虫神经系统再生和功能中的作用 | 首次全面研究了涡虫基因组中所有基因在感觉神经元中的表达和功能，并开发了用于机械感觉刺激的自动化设置 | 对数十种神经元亚型的功能了解仍然有限 | 探讨多囊肾病样同源基因在涡虫神经系统再生和功能中的作用 | 涡虫的感觉神经元及其在机械刺激和食物检测中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涡虫的无性和雌雄同体品系 |
| 7444 | 2024-10-09 |
Altered immune cell in human severe acute pancreatitis revealed by single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1354926
PMID:39372399
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了严重急性胰腺炎患者中免疫细胞的变化 | 首次构建了严重急性胰腺炎患者外周血单细胞图谱，并发现了一种表达高水平PPBP和PF4的新型单核细胞亚群 | 样本量较小，仅包括7名未治疗的严重急性胰腺炎患者 | 研究严重急性胰腺炎中特定免疫细胞亚型的变化及其机制，并识别预测急性胰腺炎严重程度的潜在生物标志物 | 严重急性胰腺炎患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7名未治疗的严重急性胰腺炎患者和6名健康对照 |
| 7445 | 2024-10-09 |
Prognosis of colorectal cancer, prognostic index of immunogenic cell death associated genes in response to immunotherapy, and potential therapeutic effects of ferroptosis inducers
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1458270
PMID:39372411
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研究论文 | 本研究利用生物信息学和医学大数据整合了来自Gene Expression Omnibus (GEO)和The Cancer Genome Atlas (TCGA)的数据集，全面概述了免疫原性细胞死亡(ICD)相关基因在结直肠癌(CRC)中的表达 | 研究揭示了ICD相关基因在CRC中的分子通路和基因网络，并探讨了细胞死亡诱导剂（包括铁死亡诱导剂）的治疗潜力及其在精准医学中的应用 | NA | 阐明ICD在结直肠癌中的分子机制及其在治疗中的潜在应用 | 结直肠癌(CRC)中的免疫原性细胞死亡(ICD)相关基因 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 差异表达分析、共识聚类、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA的多个结直肠癌样本 |
| 7446 | 2024-10-09 |
Comprehensive Analysis of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Reveals Transcriptional Signatures of Macrophages in Intrahepatic Cholestasis of Pregnancy
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S471374
PMID:39372590
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析了妊娠期肝内胆汁淤积症中巨噬细胞的转录特征 | 首次揭示了妊娠期肝内胆汁淤积症中巨噬细胞的转录特征，并发现了炎症状态的倾向 | NA | 探究妊娠期肝内胆汁淤积症中免疫细胞和免疫基因的调控机制 | 妊娠期肝内胆汁淤积症中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 妊娠期肝内胆汁淤积症 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 7447 | 2024-10-09 |
Dynamics of alternative polyadenylation in single root cells of Arabidopsis thaliana
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1437118
PMID:39372861
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研究论文 | 研究了拟南芥根细胞中单细胞RNA测序数据中的选择性多聚腺苷酸化（APA）动态 | 开发了一种新的流程来识别和整合来自不同单细胞RNA测序数据的APA位点，并分析单细胞中的APA动态 | NA | 揭示选择性多聚腺苷酸化在拟南芥根细胞发育中的动态变化 | 拟南芥根细胞中的选择性多聚腺苷酸化位点及其动态变化 | 基因表达调控 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 超过150,000个细胞，涵盖四个主要组织分支、十二种细胞类型和三个发育阶段 |
| 7448 | 2024-10-09 |
scResolve: Recovering single cell expression profiles from multi-cellular spatial transcriptomics
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.18.572269
PMID:38187629
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scResolve的方法，用于从多细胞空间转录组学测量中恢复单细胞表达谱 | scResolve能够准确恢复单细胞在其位置上的表达谱，这是细胞类型反卷积无法实现的 | NA | 开发一种方法来恢复多细胞空间转录组学测量中的单细胞表达谱 | 人类乳腺癌数据和人类肺部疾病数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 人类乳腺癌和肺部疾病数据 |
| 7449 | 2024-10-09 |
A review of the current state of single-cell proteomics and future perspective
2023-Nov, Analytical and bioanalytical chemistry
IF:3.8Q1
DOI:10.1007/s00216-023-04759-8
PMID:37285026
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综述 | 本文综述了单细胞蛋白质组学的当前状态，包括工作流程、样本制备技术、仪器和生物应用，并展望了其未来发展 | 单细胞蛋白质组学作为单细胞转录组学的补充，为生物研究提供了新的视角 | 目前存在样本体积小和数据解释需要稳健统计方法的挑战 | 评估单细胞蛋白质组学的当前技术状态，并展望其在生物研究中的未来应用 | 单细胞蛋白质组学的工作流程、样本制备技术、仪器和生物应用 | NA | NA | 单细胞蛋白质组学 | NA | NA | NA |
| 7450 | 2024-10-09 |
Integration of scHi-C and scRNA-seq data defines distinct 3D-regulated and biological-context dependent cell subpopulations
2023-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.29.560193
PMID:37873257
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研究论文 | 开发了一种多组学数据整合算法（MUDI），结合scHi-C和scRNA-seq数据，定义了3D调控和生物学上下文依赖的细胞亚群 | 首次在单细胞分辨率下整合3D染色质结构和基因表达数据，定义了拓扑结构整合的亚群（TISPs），并揭示了其在乳腺癌细胞中的应用 | NA | 研究3D染色质结构和基因表达在单细胞分辨率下的整合及其在癌症细胞中的应用 | 乳腺癌细胞的3D染色质结构和基因表达 | 生物信息学 | 乳腺癌 | scHi-C, scRNA-seq | 多组学数据整合算法（MUDI） | 基因表达数据, 染色质结构数据 | NA |
| 7451 | 2024-10-09 |
Cross-Dataset Single-Cell Analysis Identifies Temporal Alterations in Cell Populations of Primary Pancreatic Tumor and Liver Metastasis
2023-Apr-21, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15082396
PMID:37190324
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研究论文 | 本研究通过跨数据集的单细胞RNA测序分析，揭示了原发性胰腺肿瘤和肝转移瘤中细胞群落的时空变化 | 首次系统比较了原发性胰腺癌和肝转移瘤的细胞群落组成和基因组特征，并识别出肝转移瘤中独特的癌细胞亚群和标记物 | NA | 探讨胰腺导管腺癌（PDAC）原发肿瘤和肝转移瘤中细胞群落的组成和基因组特征的差异 | 胰腺导管腺癌（PDAC）的原发肿瘤和肝转移瘤 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据 | 使用了转基因KPC小鼠模型及其自发PDAC和匹配的肝转移瘤的scRNA-seq数据集 |
| 7452 | 2024-10-09 |
Human B Cells Mediate Innate Anti-Cancer Cytotoxicity Through Concurrent Engagement of Multiple TNF Superfamily Ligands
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.837842
PMID:35392082
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研究论文 | 本文报道了人类B细胞通过同时激活多个TNF超家族配体介导固有的抗癌细胞毒性 | 首次发现B细胞也具有固有的抗癌免疫机制，并展示了其在不同肿瘤细胞类型中的细胞毒性 | 研究主要集中在B细胞的细胞毒性机制上，未深入探讨其在临床治疗中的应用潜力 | 探讨B细胞在固有免疫中的抗癌机制 | 人类B细胞及其在不同肿瘤细胞类型中的细胞毒性 | NA | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序分析和流式细胞术 | NA | RNA | 从健康个体和头颈部鳞状细胞癌患者中分离的B细胞 |
| 7453 | 2024-10-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Intratumoral Heterogeneity in ccRCC, which Results in Different Clinical Outcomes
2020-07-08, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2020.04.023
PMID:32396851
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组分析揭示了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的肿瘤内异质性，并探讨了其对临床结果的影响 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析了ccRCC的肿瘤内异质性，并发现了T细胞耗竭是导致ccRCC组织免疫抑制特性的关键因素 | 研究样本量有限，且主要基于TCGA数据集，可能存在数据偏倚 | 探讨透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的肿瘤内异质性及其对临床结果的影响 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的肿瘤内异质性及其与免疫抑制和预后的关系 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 533名患者 |
| 7454 | 2024-10-08 |
The heterogeneity of breast cancer metastasis: a bioinformatics analysis utilizing single-cell RNA sequencing data
2024-Nov, Breast cancer research and treatment
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10549-024-07428-1
PMID:38992286
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据分析了乳腺癌转移的异质性 | 利用单细胞RNA测序技术区分转移的分子特征并识别患者预后的预测基因 | 没有单一基因或通路能完全解释肿瘤转移的机制 | 探索乳腺癌原发肿瘤组织与淋巴结和肝脏转移细胞之间的基因表达差异 | 乳腺癌原发肿瘤组织与淋巴结和肝脏转移细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7455 | 2024-10-08 |
Concerted transcriptional regulation of the morphogenesis of hypothalamic neurons by ONECUT3
2024-Oct-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52762-z
PMID:39366958
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研究论文 | 研究探讨了ONECUT3转录因子在调节下丘脑神经元形态发生中的作用 | 发现ONECUT3通过调节神经导航蛋白2（NAV2）影响下丘脑GABA衍生的多巴胺和促甲状腺激素释放激素（TRH）谷氨酸神经元的极化和形态发生 | NA | 研究ONECUT3在神经元分化和形态发生中的调控作用 | 下丘脑神经元 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及新生小鼠和秀丽隐杆线虫的神经元样本 |
| 7456 | 2024-10-08 |
Identification of KLHL17 as a prognostic marker for prostate cancer based on single-cell sequencing and in vitro/in vivo experiments
2024-Oct-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01406-1
PMID:39365488
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据识别前列腺癌中的恶性上皮细胞亚群及其分子特征，并构建了预测患者预后的风险评分模型 | 首次通过单细胞RNA测序和体内外实验验证KLHL17作为前列腺癌的预后标志物 | NA | 深入理解前列腺癌的异质性并识别潜在的治疗靶点 | 前列腺癌中的恶性上皮细胞及其分子特征 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 风险评分模型 | RNA测序数据 | NA |
| 7457 | 2024-10-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals peripheral immunological features in Parkinson's Disease
2024-Oct-04, NPJ Parkinson's disease
DOI:10.1038/s41531-024-00790-3
PMID:39366969
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了帕金森病患者和健康对照者的外周血单个核细胞中的免疫特征 | 首次揭示了NK细胞在帕金森病进展中的关键作用及其与疾病严重程度的正相关性 | 研究样本量有限，需要进一步验证和扩大样本以确认结果的普遍性 | 探讨帕金森病患者外周免疫反应与疾病严重程度之间的关系 | 帕金森病患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括早期和晚期帕金森病患者及健康对照者的外周血单个核细胞样本 |
| 7458 | 2024-10-08 |
Exploring the prognostic and diagnostic value of lactylation-related genes in sepsis
2024-10-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-74040-0
PMID:39367086
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研究论文 | 本研究探讨了乳酸化相关基因在脓毒症中的预后和诊断价值 | 首次识别出与脓毒症相关的55个乳酸化基因，并通过多种分析方法验证了这些基因的预后和诊断价值 | 样本量较小，且仅限于中国西南医科大学附属医院的患者 | 研究乳酸化相关基因在脓毒症中的预后和诊断作用 | 脓毒症患者和健康个体的血液样本 | NA | 脓毒症 | RNA测序、单细胞RNA测序、基因本体论分析、京都基因与基因组百科全书分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | NA | RNA序列数据 | 20名脓毒症患者和10名健康个体的血液样本，以及5个外周血样本用于单细胞RNA测序 |
| 7459 | 2024-10-08 |
Leveraging explainable deep learning methodologies to elucidate the biological underpinnings of Huntington's disease using single-cell RNA sequencing data
2024-Oct-04, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10855-5
PMID:39367331
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研究论文 | 利用可解释深度学习方法阐明亨廷顿病生物学基础的研究 | 使用单细胞RNA测序数据和残差神经网络（ResNet）模型，结合SHapley Additive exPlanations（SHAP）算法，揭示了影响亨廷顿病预测的基因及其在病理生物学中的作用 | 尽管模型在测试集上的F1分数达到96.53%，但仍存在一定的局限性 | 阐明亨廷顿病病理学的潜在机制 | 亨廷顿病细胞与健康细胞的差异基因表达模式 | 数字病理学 | 亨廷顿病 | 单细胞RNA测序 | 残差神经网络（ResNet） | 基因表达数据 | NA |
| 7460 | 2024-10-08 |
Deep learning to estimate response of concurrent chemoradiotherapy in non-small-cell lung carcinoma
2024-Oct-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05708-4
PMID:39367461
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研究论文 | 本文构建了一个深度学习模型，用于预测非小细胞肺癌患者在接受同步放化疗后的反应，并探索了相关的生物信号通路 | 首次使用深度学习模型预测非小细胞肺癌患者在接受同步放化疗后的反应 | NA | 开发和验证一个深度学习模型，用于预测非小细胞肺癌患者在接受同步放化疗后的反应 | 非小细胞肺癌患者在接受同步放化疗后的反应 | 机器学习 | 肺癌 | 深度学习 | ResNet50 | 图像 | 229名非小细胞肺癌患者 |