单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 38047 篇文献，本页显示第 7421 - 7440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7421 | 2025-11-22 |
Molecular signals associated with intraperitoneal chemotherapy resistance in gastric cancer with peritoneal metastasis through PIPS GC trial integrated translational research
2025-Oct-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-19515-4
PMID:41083688
|
研究论文 | 通过PIPS-GC临床试验的整合转化研究，识别胃癌腹膜转移患者对腹腔内紫杉醇联合系统化疗反应的生物标志物 | 首次通过整合全外显子组测序、转录组测序和空间转录组学分析，发现THSD4作为预测胃癌腹膜转移化疗反应的潜在生物标志物 | 样本量较小（仅9例患者），需要进一步研究验证THSD4的临床实用性 | 识别能够预测胃癌腹膜转移患者对腹腔内紫杉醇联合系统化疗反应的生物标志物 | 胃癌腹膜转移患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 全外显子组测序,转录组测序,单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因组数据,转录组数据,空间转录组数据 | 9例胃癌患者（6例反应组，3例无反应组） | NA | 全外显子组测序,转录组测序,单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 7422 | 2025-11-22 |
Single-Cell RNA-Seq Dissects Specific Marker in Glioblastoma Based on Gene Regulatory Networks
2025-Oct, Iranian journal of biotechnology
IF:1.6Q4
DOI:10.30498/ijb.2025.528387.4159
PMID:41255833
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据构建基因调控网络，解析胶质母细胞瘤的分子亚型特异性标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和基因调控网络分析胶质母细胞瘤亚型特异性调控机制，发现GATA3作为新型预后标志物 | 样本量有限，需要更大规模验证；分析方法依赖于计算推断的拷贝数变异和转录因子结合基序 | 识别胶质母细胞瘤的关键调控因子和亚型特异性标志物，改善患者分层和治疗效果 | 胶质母细胞瘤恶性细胞及其分子亚型（前神经型、经典型、间充质型） | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，基因调控网络分析，差异基因表达分析，配体-受体相互作用分析 | 共识聚类，基因调控网络模型 | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7423 | 2025-11-22 |
Epigenetic Adaptation Drives Monocyte Differentiation into Microglia-Like Cells Upon Engraftment into the Central Nervous System
2025-Jul-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.09.612126
PMID:39314467
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示单核细胞在进入中枢神经系统后通过表观遗传重编程获得小胶质细胞特异性标记物表达的能力 | 挑战了传统认为单核细胞与驻留小胶质细胞可通过特定标记物区分的范式，首次证明单核细胞能在中枢神经系统中通过表观遗传适应转化为小胶质细胞样细胞 | NA | 探究单核细胞在中枢神经系统中的表观遗传适应机制及其对小胶质细胞标记物特异性的影响 | 骨髓嵌合体模型中的单核细胞和小胶质细胞 | 表观遗传学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 流式细胞术, 免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 流式细胞数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 7424 | 2025-11-22 |
Comprehensive profiling of migratory primordial germ cells reveals niche-specific differences in non-canonical Wnt and Nodal-Lefty signaling in anterior vs posterior migrants
2025-Jun-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.29.610420
PMID:39257761
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠迁移过程中原始生殖细胞及其周围体细胞生态位的转录异质性 | 首次揭示了前后位置迁移PGCs在非经典Wnt和Nodal-Lefty信号通路的生态位特异性差异，并验证了人类中的保守性 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证依赖于重新分析已发表数据集 | 阐明迁移过程中原始生殖细胞与不同体细胞生态位相互作用的分子机制 | 小鼠原始生殖细胞和周围体细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，全胚胎免疫荧光染色 | 轨迹推断方法 | 单细胞转录组数据，免疫荧光图像数据 | 13,262个小鼠PGCs和7,868个周围体细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7425 | 2025-11-22 |
White and Brown Adipose Tissue Share a Common Fibro-Adipogenic Progenitor Population
2025-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656577
PMID:40501707
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现白色和棕色脂肪组织共享共同的纤维-脂肪生成祖细胞群 | 首次在棕色脂肪组织中鉴定出纤维-脂肪生成祖细胞样细胞，扩展了脂肪祖细胞群的认识 | 使用体外培养的原代前脂肪细胞，可能无法完全反映体内情况 | 研究脂肪组织异质性及其祖细胞身份 | 培养的原代白色和棕色前脂肪细胞 | 单细胞生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析、调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7426 | 2025-11-22 |
Delineation of signaling routes that underlie differences in macrophage phenotypic states
2025-Apr, NAR molecular medicine
DOI:10.1093/narmme/ugaf013
PMID:41255709
|
研究论文 | 通过质谱蛋白质组学分析揭示人类巨噬细胞不同功能状态下的信号通路差异 | 首次通过磷酸化蛋白质组学结合转录组数据系统识别免疫抑制性巨噬细胞的关键激酶和转录调控因子 | 研究主要基于体外培养的原代巨噬细胞，临床验证仍需进一步深入 | 阐明巨噬细胞表型状态差异背后的信号通路机制 | 人类原代巨噬细胞和肿瘤患者的单细胞测序数据 | 蛋白质组学 | 癌症 | 质谱蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、单细胞测序、转录组分析 | NA | 蛋白质组数据、磷酸化蛋白质组数据、转录组数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 质谱蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7427 | 2025-11-22 |
Prognostic and Immunological Implications of Telomere Maintenance-Related Genes in Breast Cancer: A Mechanistic Exploration
2025, Breast cancer (Dove Medical Press)
DOI:10.2147/BCTT.S545745
PMID:41255412
|
研究论文 | 本研究通过分析乳腺癌中端粒维持相关基因构建风险模型，用于预后预测和治疗评估 | 首次系统构建基于端粒维持相关基因的乳腺癌风险预测模型，并结合单细胞RNA测序验证关键基因表达 | 研究基于回顾性数据集，需要前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 探讨端粒维持相关基因在乳腺癌中的预后价值和免疫学意义 | 乳腺癌患者及其基因表达数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, Cox回归分析, LASSO回归, 孟德尔随机化分析 | 风险预测模型 | 基因表达数据 | 多个乳腺癌数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7428 | 2025-11-22 |
The Intestinal Immune Network for IgA Production is Involved in the Development and Progression of Sepsis: A Multi-Omics Study
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S548786
PMID:41255589
|
研究论文 | 通过多组学方法研究肠道IgA生成免疫网络在脓毒症发生发展中的作用 | 首次整合bulk RNA测序、单细胞RNA测序、临床试验、动物研究和孟德尔随机化分析，系统揭示肠道IgA免疫网络在脓毒症中的作用机制 | NA | 阐明肠道IgA生成免疫网络在脓毒症发生发展中的作用机制 | 脓毒症患者、动物模型、免疫细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | bulk RNA测序,单细胞RNA测序,孟德尔随机化分析,机器学习 | LASSO,Cox回归,诺莫图模型 | 基因表达数据,临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 7429 | 2025-11-22 |
Integrative pharmacovigilance and AI-based framework uncovers potential drug triggers in juvenile idiopathic arthritis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653003
PMID:41256847
|
研究论文 | 本研究开发了一个结合药物警戒和人工智能的框架，用于识别可能引发或加重幼年特发性关节炎的药物 | 首次整合了四种不相称性算法、三种机器学习模型和毒理基因组学分析，并通过新生成的转录组数据进行多层级验证 | 研究主要依赖于回顾性数据库分析，样本量相对有限，需要进一步的前瞻性研究验证 | 识别可能触发或加重幼年特发性关节炎的药物安全信号 | 幼年特发性关节炎患者和药物安全报告数据 | 自然语言处理 | 幼年特发性关节炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 机器学习 | DMPNN, GCN, SVM | 文本报告, 分子描述符, 化学指纹, 结构图, 转录组数据 | FAERS数据库10,012,438份报告，47个个体（39名JIA患者和8名对照）的bulk RNA-seq数据，30个单细胞RNA-seq样本（21个内部PBMC样本和9个公共sJIA样本） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7430 | 2025-11-22 |
Immune snapshots along the inflammation-to-cancer road in bladder urothelium
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1685237
PMID:41256858
|
综述 | 本文综述了膀胱尿路上皮从炎症到癌症过程中免疫微环境的动态演变过程 | 整合了空间转录组学、单细胞技术和尿液外泌体分析等新技术，提供了炎症-癌症连续过程中的精确免疫快照 | 作为小型综述，可能未涵盖该领域所有最新研究进展 | 阐明膀胱尿路上皮从炎症到癌症过程中的免疫学转变机制 | 膀胱尿路上皮的免疫微环境 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 空间转录组学,单细胞技术,尿液外泌体分析 | NA | 转录组数据,单细胞数据,外泌体数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7431 | 2025-11-22 |
Machine learning-driven exploration of therapeutic targets for atrial fibrillation-joint analysis of single-cell and bulk transcriptomes and experimental validation
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1652467
PMID:41257259
|
研究论文 | 通过机器学习分析心房颤动患者的转录组数据，探索新的治疗靶点和分子机制 | 结合单细胞和批量转录组数据的联合分析，应用三种机器学习算法筛选关键基因，并通过实验验证 | 样本来源仅限于GEO数据库和右心耳组织，需要进一步扩大样本验证 | 探索心房颤动的治疗靶点和诊断生物标志物 | 心房颤动患者的转录组数据和右心耳组织样本 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, RT-qPCR, western blot | LASSO, SVM-RFE, 随机森林, 列线图模型 | 转录组数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 7432 | 2025-11-22 |
The analysis reveals novel hub genes and pathways associated with Tetralogy of Fallot
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1604939
PMID:41257258
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA-seq数据，识别了法洛四联症相关的核心基因和通路 | 首次在单细胞分辨率下验证法洛四联症中脂肪酸代谢通路在心肌细胞中的特异性富集 | 样本量有限，仅使用了两个数据集进行验证 | 探索法洛四联症的核心基因和通路，为疾病预防和干预提供潜在靶点 | 法洛四联症患者的心脏组织 | 生物信息学 | 先天性心脏病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, 功能富集分析 | NA | 基因表达数据 | 基于两个数据集GSE146220和GSE217772 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7433 | 2025-11-22 |
Identification of tumor immunophenotypes associated with immunotherapy response in bladder cancer
2023-12, International journal of urology : official journal of the Japanese Urological Association
IF:1.8Q3
DOI:10.1111/iju.15276
PMID:37602677
|
研究论文 | 本研究通过分析膀胱癌免疫表型，开发了与免疫治疗反应相关的基因特征，并验证了SRRM4、NPHS1和TMEM72作为预测生物标志物的潜力 | 首次基于肿瘤免疫细胞评分系统性地定义了膀胱癌的炎症型和免疫排斥型免疫表型，并建立了可预测免疫检查点抑制剂治疗反应的基因特征模型 | 研究主要基于公共数据集进行回顾性分析，缺乏前瞻性临床验证 | 揭示与膀胱癌免疫治疗反应相关的免疫表型特征，为改善免疫治疗效果提供新的分子靶点 | 膀胱癌患者 | 生物信息学 | 膀胱癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | 风险评分模型 | 基因表达数据，蛋白质表达数据，临床预后数据 | 多个膀胱癌队列数据集（GSE32894、Imvigor210、GSE145140） | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7434 | 2025-11-22 |
Leveraging diverse cell-death patterns to predict the prognosis and drug sensitivity of triple-negative breast cancer patients after surgery
2022-Nov, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1016/j.ijsu.2022.106936
PMID:36341760
|
研究论文 | 通过分析12种细胞死亡模式建立细胞死亡指数模型，用于预测三阴性乳腺癌患者术后预后和药物敏感性 | 首次综合12种程序性细胞死亡模式建立预测模型，并识别出两种具有不同生物学过程的三阴性乳腺癌分子亚型 | 研究基于回顾性队列数据，需要前瞻性研究进一步验证 | 预测三阴性乳腺癌患者术后预后和化疗敏感性 | 三阴性乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 机器学习算法，转录组分析 | 无监督聚类模型，nomogram模型 | 转录组数据，基因组数据，临床信息 | 来自TCGA-BRCA、METABRIC、GSE58812、GSE21653、GSE176078、GSE75688和KM-plotter等多个队列的数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7435 | 2025-11-21 |
Decoding bioprocesses with transcriptomics: current status and future potential
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108736
PMID:41092969
|
综述 | 本文总结了转录组学在生物过程工程中的应用现状并展望其未来潜力 | 系统梳理了从RT-qPCR到RNA-seq等转录组学技术在生物过程工程中的应用，并前瞻性地提出单细胞分析（scRNA-seq）和转录历史记录（Record-Seq）技术将推动对种群时空多样性的理解 | NA | 总结转录组学技术在生物过程工程领域的应用现状并展望未来发展 | 原核和真核细胞系统在生物过程中的基因表达谱 | 生物信息学 | NA | RT-qPCR, 微阵列, RNA-seq, scRNA-seq, Record-Seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 7436 | 2025-11-21 |
High-resolution spatial transcriptomics uncover epidermal-dermal divergences in Merkel cell carcinoma: spatial context reshapes the gene expression landscape
2025-Dec, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03608-5
PMID:41131107
|
研究论文 | 本研究利用高分辨率空间转录组学技术揭示了默克尔细胞癌中表皮和真皮区域的基因表达差异 | 首次在空间分辨率下展示了表皮性默克尔细胞癌的转录组特征，发现其具有角质形成细胞分化特征 | 样本数量有限，且主要关注表皮性肿瘤区域 | 探索表皮微环境对默克尔细胞癌肿瘤细胞行为的调控作用 | 默克尔细胞癌肿瘤细胞，特别是表皮性和真皮性肿瘤细胞 | 空间转录组学 | 默克尔细胞癌 | 高分辨率空间转录组学，单细胞转录组学 | NA | 空间转录组数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7437 | 2025-11-21 |
Macrophage Phospholipase D3 promotes atherosclerosis via exacerbating foam cell formation and inducing inflammatory responses
2025-Dec, International journal of cardiology. Heart & vasculature
DOI:10.1016/j.ijcha.2025.101834
PMID:41245776
|
研究论文 | 本研究探讨巨噬细胞磷脂酶D3通过加剧泡沫细胞形成和诱导炎症反应促进动脉粥样硬化的机制 | 首次系统阐明PLD3在动脉粥样硬化中的功能作用及分子机制，发现其通过CD36介导的脂质积累和NF-κB驱动的炎症反应促进疾病进展 | 研究主要基于小鼠模型和THP-1细胞系，人类样本验证相对有限 | 探究PLD3在动脉粥样硬化发生发展中的作用机制 | 人类动脉粥样硬化组织、ApoE^-/-小鼠模型、THP-1源性巨噬细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、qRT-PCR、western blotting、慢病毒介导的基因敲降、RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、图像数据 | 人类动脉粥样硬化组织、ApoE^-/-小鼠、THP-1细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7438 | 2025-11-21 |
YAP/TAZ deletion in vascular smooth muscle cells mirrors atherosclerosis-associated transcriptional programs
2025-Dec, Journal of molecular and cellular cardiology plus
DOI:10.1016/j.jmccpl.2025.100487
PMID:41246212
|
研究论文 | 本研究通过血管平滑肌细胞特异性缺失YAP/TAZ，揭示其转录程序与动脉粥样硬化发展的相似性 | 首次证明YAP/TAZ缺失诱导的VSMC转录变化能重现动脉粥样硬化关键特征，并鉴定出19个保守的YAP-TEAD靶基因 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究YAP/TAZ缺失对血管平滑肌细胞表型的影响及其在动脉粥样硬化中的作用 | 血管平滑肌细胞(VSMC) | 转录组学 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, ChIP-seq, 启动子基序分析 | NA | 转录组数据, 表观遗传数据 | 小鼠VSMC样本（2周和8周YAP/TAZ缺失时间点） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7439 | 2025-11-21 |
CD9 antibody enhances the anti-leukemia efficacy of γδT cells in adult B cell acute lymphoblastic leukemia
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113752
PMID:41244573
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定B细胞急性淋巴细胞白血病中的侵袭性preB_CD9+亚群，并证明抗CD9抗体可增强γδT细胞的抗白血病疗效 | 首次发现CD9在B-ALL复发患者中高表达，并证明抗CD9抗体可增强γδT细胞对CD9高表达白血病细胞的杀伤作用 | 样本量较小（10个样本），需要更大规模研究验证 | 探索B细胞急性淋巴细胞白血病的肿瘤微环境特征及免疫治疗新策略 | B细胞急性淋巴细胞白血病患者样本和健康志愿者样本 | 单细胞测序分析 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 10个样本（3例复发患者，3例新诊断患者，4例健康志愿者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7440 | 2025-11-21 |
An easy and reproducible method for rapid tissue macroarray block construction
2025-Nov-20, Virchows Archiv : an international journal of pathology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s00428-025-04326-9
PMID:41261245
|
研究论文 | 提出一种快速构建组织大阵列块的新方法，确保精确的组织定向且无需专用仪器 | 开发了使用海绵作为支架的快速组织大阵列构建技术，将处理时间减少10倍并解决组织定向难题 | 未提及方法验证的样本规模或与其他方法的直接比较数据 | 改进组织大阵列构建技术，提高病理诊断和研究效率 | 石蜡包埋组织样本 | 数字病理学 | NA | 组织大阵列构建技术 | NA | 组织样本 | 每个大阵列包含9-48个组织核心 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |