单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7421 - 7440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7421 | 2025-10-06 |
NR2F2 and its contribution to lymph node metastasis in oral squamous cell carcinoma
2025-Aug, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111814
PMID:40262715
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研究论文 | 本研究探讨了NR2F2在口腔鳞状细胞癌淋巴结转移中的作用及其与肿瘤干细胞特性的关联 | 首次在单细胞水平将口腔鳞癌干细胞分为五个亚群，并鉴定NR2F2为干细胞性最高亚群的关键基因，揭示了其在淋巴结转移中的新机制 | NA | 研究癌症干细胞在口腔鳞状细胞癌淋巴结转移中的作用，重点关注NR2F2的表达和生物学意义 | 口腔鳞状细胞癌患者样本、癌细胞系、淋巴结组织 | 单细胞测序分析 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、免疫荧光、Western blot、功能实验、体内实验、批量RNA测序、药物敏感性分析 | CytoTRACE算法、irGSEA、GSVA、GO分析、KEGG分析 | 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据、功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7422 | 2025-10-06 |
Atlas of temporal molecular pathological alterations after traumatic brain injury based on RNA-Seq
2025-Aug, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115270
PMID:40268159
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研究论文 | 基于RNA测序构建创伤性脑损伤后时间分子病理变化图谱 | 首次通过10个时间点的密集转录组分析系统揭示TBI进展中的动态分子病理变化，并聚焦焦亡在神经炎症中的关键作用 | 研究基于小鼠模型，结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 | 系统解析创伤性脑损伤后分子病理变化的时间动态特征 | C57/BL6小鼠脑组织 | 生物信息学 | 创伤性脑损伤 | RNA-seq, WGCNA, RT-qPCR, Western blot, 免疫荧光, 单细胞RNA测序 | WGCNA, Mfuzz | 基因表达数据 | 10个时间点(0h,1h,2h,3h,4h,6h,12h,1d,3d,7d)的小鼠脑组织样本 | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7423 | 2025-10-06 |
Unraveling the immune activation mechanisms of DAMPs in coronary artery disease through transcriptomic and single-cell analyses
2025-Jul, Cytokine
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cyto.2025.156952
PMID:40306092
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研究论文 | 通过转录组学和单细胞分析揭示DAMPs在冠状动脉疾病中触发免疫激活的机制 | 首次结合转录组学和单细胞分析系统研究DAMPs在CAD中的免疫激活机制，发现P2RY14和IFIH1基因的显著表达差异 | 研究基于公共数据库数据，缺乏实验验证；样本来源和数量有限 | 探究损伤相关分子模式在冠状动脉疾病中触发免疫激活的分子机制 | 冠状动脉疾病患者的转录组和单细胞数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 差异表达分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据 | 来自GSE202625、GSE242046和GSE159677数据集的样本 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7424 | 2025-10-06 |
Unveiling the spatiotemporal strategies of plants in response to biotic and abiotic stresses:A comprehensive review
2025-Jul, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109967
PMID:40315636
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综述 | 本文全面评述了单细胞RNA测序和空间转录组学技术在研究植物响应生物与非生物胁迫的细胞层面策略中的应用 | 首次系统性地探讨了单细胞和空间转录组技术在植物环境胁迫研究中的整合应用，填补了该领域综述的空白 | 植物组织解离的技术挑战限制了单细胞技术在植物研究中的广泛应用 | 深入分析单细胞和空间转录组技术的发展、优势与局限，探索其在植物胁迫响应研究中的应用前景 | 植物细胞类型及其在胁迫条件下的响应机制 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 空间转录组学(ST) | NA | 基因表达数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7425 | 2025-10-06 |
Apocrine Gland Damage and the Release of Specific Keratins in Early Stage Indicate the Crucial Involvement of Apocrine Glands in Hidradenitis Suppurativa
2025-Jun, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.09.021
PMID:39547394
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研究论文 | 本研究通过免疫组织化学和单细胞测序揭示了顶泌腺在化脓性汗腺炎早期病变中的关键作用 | 首次发现顶泌腺在HS早期即受损并释放特异性角蛋白，揭示了CXCL-CXCR和SAA1-FPR2通路介导的中性粒细胞招募机制 | 样本量较小（患者12例，对照8例），需要更大规模研究验证 | 探讨顶泌腺在化脓性汗腺炎发病机制中的潜在作用 | 化脓性汗腺炎患者和健康对照者的非病变皮肤和早期病变皮肤 | 数字病理学 | 化脓性汗腺炎 | 免疫组织化学，单细胞测序 | NA | 组织图像，单细胞测序数据 | 患者12例（组织），20例（血清），健康对照8例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7426 | 2025-10-06 |
Transcriptional reprogramming triggered by neonatal UV radiation or Lkb1 loss prevents BRAFV600E-induced growth arrest in melanocytes
2025-Jun, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03339-7
PMID:40057604
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研究论文 | 本研究揭示了新生儿UV辐射或Lkb1缺失通过触发转录重编程来阻止BRAFV600E诱导的生长停滞，从而促进黑色素瘤发生的机制 | 发现BRAF突变黑色素瘤可不依赖痣进展而独立发展，并鉴定出新的治疗靶点 | NA | 阐明UVB引发的、新生儿特异性BRAF相关黑色素瘤的机制，特别是其在生长停滞中的作用 | 黑色素细胞和黑色素瘤 | 肿瘤生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学、基因组分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7427 | 2025-05-25 |
Confronting the challenge of cell segmentation in spatial transcriptomics
2025-May-23, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02717-z
PMID:40410420
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7428 | 2025-10-06 |
Combining spatial transcriptomics and ECM imaging in 3D for mapping cellular interactions in the tumor microenvironment
2025-May-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101261
PMID:40220761
|
研究论文 | 本研究通过整合3D空间转录组学和ECM成像技术，系统性地绘制了肺癌肿瘤微环境中细胞间相互作用图谱 | 首次将3D空间转录组学与细胞外基质成像技术相结合，突破了传统2D组织切片的限制，能够同时分析细胞-细胞相互作用和ECM重塑 | 仅基于一例临床肺癌样本的概念验证研究，样本量有限 | 系统量化肿瘤微环境中分子状态、细胞间相互作用和细胞外基质重塑 | 临床肺癌样本中的恶性细胞、非恶性细胞和细胞外基质 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, ECM成像, 3D组织重建 | NA | 空间转录组数据, 图像数据 | 1例临床肺癌样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞空间转录组 | NA | NA |
| 7429 | 2025-10-06 |
Scalable image-based visualization and alignment of spatial transcriptomics datasets
2025-May-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101264
PMID:40267922
|
研究论文 | 提出基于图像的可视化计算框架STIM，用于空间转录组数据集的展示与对齐 | 首次将ImgLib2和BigDataViewer图像数据框架应用于空间转录组数据分析，支持不规则测量间距和任意空间分辨率的数据处理 | NA | 开发可扩展的空间转录组数据可视化与对齐方法 | 小鼠脑组织连续切片和人类转移性淋巴结切片的空间转录组数据 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组技术 | NA | 空间转录组测序数据 | 13个小鼠脑组织连续切片和19个人类转移性淋巴结切片 | NA | 空间转录组 | NA | NA |
| 7430 | 2025-10-06 |
Identification of cell specific biomarkers for intellectual disability via single cell RNA sequencing and transcriptomic bioinformatics approaches
2025-May-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85162-4
PMID:40399537
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和转录组生物信息学方法识别与智力障碍相关的T细胞特异性生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和转录组数据分析识别智力障碍中T细胞特异性生物标志物，发现6个核糖体蛋白作为枢纽基因 | 未提及样本量大小和研究人群特征，功能验证不足 | 寻找可用于智力障碍诊断和评估的T细胞相关生物标志物 | 智力障碍患者的T细胞（CD4和CD8） | 生物信息学 | 智力障碍 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 蛋白-蛋白相互作用网络分析 | 生物信息学分析流程 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7431 | 2025-10-06 |
Inflammatory metabolite 7α,25-OHC promotes TIMP1 expression in COVID-19 monocytes through synergy effect of SMARCC1/JUND/H3K27ac
2025-May-21, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05721-w
PMID:40399563
|
研究论文 | 本研究揭示炎症代谢物7α,25-OHC通过SMARCC1/JUND/H3K27ac协同作用促进COVID-19单核细胞中TIMP1表达的分子机制 | 首次发现7α,25-OHC通过增强SMARCC1-JUND相互作用调控TIMP1表达的新机制，并阐明其在COVID-19炎症反应中的关键作用 | 机制研究主要基于体外实验，需要更多体内实验验证 | 探究COVID-19患者单核细胞中染色质重塑因子调控炎症反应的分子机制 | COVID-19患者的单核细胞 | 表观遗传学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 共免疫沉淀, ChIP-qPCR | NA | 单细胞测序数据, 表观遗传数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 7432 | 2025-10-06 |
RNAcare: integrating clinical data with transcriptomic evidence using rheumatoid arthritis as a case study
2025-May-21, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-025-02162-z
PMID:40399884
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研究论文 | 开发了一个整合临床数据与转录组学证据的计算平台RNAcare，以类风湿关节炎为例进行验证 | 提供交互式、可重复的解决方案，能够直接整合基因表达数据与临床特征，支持患者特异性分析 | 作为概念验证仅以类风湿关节炎为例，平台在更广泛疾病中的应用仍需验证 | 开发一个便于临床医生使用的转录组数据分析工具，探索基因表达与临床结局的关系 | 类风湿关节炎患者样本及其临床数据 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 转录组分析，机器学习 | 机器学习 | 基因表达数据，临床数据 | NA | NA | RNA-seq | NA | NA |
| 7433 | 2025-10-06 |
Targeting CD74 in microglia to modulate experimental cerebral ischemia and reperfusion injury: insights from Single-Cell and bulk transcriptomics
2025-May-21, Molecular brain
IF:3.3Q2
DOI:10.1186/s13041-025-01197-8
PMID:40400029
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组学分析，探索CD74在小胶质细胞中对脑缺血再灌注损伤的调控作用 | 首次发现CD74在小胶质细胞中的上调与神经炎症相关，并通过基因敲除实验证实其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于动物模型，尚未在人类临床中得到验证 | 探索CD74在脑缺血再灌注损伤中的作用机制及治疗潜力 | 小鼠小胶质细胞及脑缺血再灌注损伤模型 | 神经科学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 基因敲除 | CX3CR1Cre/ERT2转基因小鼠模型 | 基因表达数据, 行为学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7434 | 2025-10-06 |
Spatially resolved mapping of cells associated with human complex traits
2025-May, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08757-x
PMID:40108460
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研究论文 | 开发了一种整合空间转录组数据和全基因组关联研究的方法，用于在空间分辨率下绘制与人类复杂性状相关的细胞分布 | 提出了首个将空间转录组数据与GWAS汇总统计数据整合的方法，实现了复杂性状相关细胞的空间定位 | 方法验证主要基于胚胎期数据集，在成人组织中的应用需要进一步验证 | 开发空间解析的性状相关细胞定位方法，增进对疾病病理的理解 | 人类复杂性状相关细胞，特别是精神分裂症和抑郁症相关的谷氨酸能神经元 | 空间转录组学 | 精神分裂症, 抑郁症 | 空间转录组学, 全基因组关联研究 | gsMap | 空间转录组数据, GWAS汇总统计数据 | 覆盖25个器官的胚胎空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7435 | 2025-10-06 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveals a Stereoscopic Response of Rice Leaf Cells to Magnaporthe oryzae Infection
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202416846
PMID:40123572
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示了水稻叶片细胞对稻瘟病菌感染的三维免疫响应机制 | 首次结合单细胞和空间转录组学技术构建水稻叶片细胞图谱，揭示了细胞特异性及多维度的免疫响应模式 | 研究主要聚焦转录组层面，对蛋白质水平和代谢物动态变化的验证仍需进一步研究 | 探究水稻叶片细胞对稻瘟病菌感染的免疫响应机制 | 水稻叶片细胞 | 植物生物学 | 植物真菌病害 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 236,708个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7436 | 2025-10-06 |
Halofuginone Disrupted Collagen Deposition via mTOR-eIF2α-ATF4 Axis to Enhance Chemosensitivity in Ovarian Cancer
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202416523
PMID:40126173
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现靶向胶原蛋白可重塑卵巢癌细胞外基质，并鉴定出卤夫酮通过mTOR-eIF2α-ATF4轴抑制COL1A1产生以增强化疗敏感性 | 首次建立22基因基质组特征预测卵巢癌化疗反应，发现卤夫酮通过调控mTOR-eIF2α-ATF4轴和巨噬细胞极化重塑肿瘤微环境 | NA | 探索靶向细胞外基质重塑增强卵巢癌化疗敏感性的策略 | 卵巢癌相关成纤维细胞、肿瘤相关巨噬细胞、CD8+ T细胞 | 肿瘤微环境研究 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7437 | 2025-10-06 |
PRMT1 Ablation in Endothelial Cells Causes Endothelial Dysfunction and Aggravates COPD Attributable to Dysregulated NF-κB Signaling
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411514
PMID:40135804
|
研究论文 | 本研究探讨PRMT1在内皮细胞中的功能及其在慢性阻塞性肺病发病机制中的作用 | 首次揭示PRMT1通过调控NF-κB信号通路防止内皮功能障碍和衰老的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明PRMT1在内皮细胞中的功能及其在COPD发病机制中的作用 | 内皮细胞、内皮特异性PRMT1敲除小鼠、COPD模型 | 分子生物学 | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 7438 | 2025-10-06 |
TcEVdb: a database for T-cell-derived small extracellular vesicles from single-cell transcriptomes
2025-Feb-28, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaf012
PMID:40036846
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研究论文 | 构建了一个基于单细胞转录组数据的T细胞来源小细胞外囊泡综合数据库TcEVdb | 首次系统性地整合多项目单细胞RNA测序数据，利用SEVtras方法分析T细胞来源细胞外囊泡的异质性和功能特征 | 依赖公共数据库数据的质量和完整性，分析结果需要进一步实验验证 | 探索T细胞来源细胞外囊泡的转录组特征和功能多样性 | T细胞来源的小细胞外囊泡 | 生物信息学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | SEVtras | 单细胞转录组数据 | 277,265个EV液滴，来自21个项目的221个样本，涵盖51种T细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7439 | 2025-10-06 |
Pro-Fibrotic Macrophage Subtypes: SPP1+ Macrophages as a Key Player and Therapeutic Target in Cardiac Fibrosis?
2025-02-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14050345
PMID:40072075
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综述 | 本文探讨SPP1+巨噬细胞在心脏纤维化中的关键作用及作为治疗靶点的潜力 | 首次系统阐述SPP1+巨噬细胞作为心脏纤维化关键介质和治疗靶点的作用机制 | 主要基于临床前研究数据，尚未在人体临床试验中得到验证 | 研究心脏纤维化的发病机制和潜在治疗策略 | SPP1+巨噬细胞及其与成纤维细胞、肌成纤维细胞的相互作用 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7440 | 2025-10-06 |
Distinct myeloid-derived suppressor cell populations in human glioblastoma
2025-Jan-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abm5214
PMID:39818911
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定人胶质母细胞瘤中两种不同的髓源性抑制细胞群体及其空间分布特征 | 首次在IDH野生型胶质母细胞瘤中发现两种功能不同的MDSC亚群，并揭示其与肿瘤干细胞的空间共定位和相互作用机制 | 样本量相对有限（33例胶质瘤），且主要关注IDH野生型肿瘤 | 阐明胶质瘤相关髓系细胞在肿瘤进展和免疫逃逸中的作用机制 | 人胶质瘤组织中的免疫细胞和肿瘤细胞 | 单细胞组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据，空间基因表达数据 | 33例人胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |