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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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7401 | 2025-10-06 |
Elucidating the tumor microenvironment interactions in breast, cervical, and ovarian cancer through single-cell RNA sequencing
2025-May-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-03017-4
PMID:40404741
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析乳腺癌、宫颈癌和卵巢癌中肿瘤微环境的细胞互作机制 | 首次在妇科肿瘤中系统鉴定四种癌症相关成纤维细胞亚型并揭示其功能差异,发现TAMs通过VEGFA_VEGFR2信号通路促进血管生成 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证和临床样本验证 | 阐明妇科肿瘤微环境中关键细胞类型及其相互作用机制 | 乳腺癌、宫颈癌和卵巢癌肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌,宫颈癌,卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | SingleR, CellChat | 单细胞转录组数据 | 来自GEO数据库的妇科肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7402 | 2025-10-06 |
Single cell analysis of diverse immune cell in pneumococcal meningitis
2025-May-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-02258-7
PMID:40404806
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肺炎链球菌脑膜炎患者的免疫细胞组成和功能变化 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘肺炎链球菌脑膜炎的免疫细胞转录组景观 | 样本量有限,仅分析外周血单个核细胞 | 解析肺炎链球菌脑膜炎中的免疫反应机制 | 肺炎链球菌脑膜炎患者和健康个体的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 脑膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | PM患者和健康个体(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7403 | 2025-10-06 |
Integrating Mendelian randomization and multi-transcriptomic analyses to unveil the genetic association risk of regulatory T cell-mediated free cholesterol and gastric cancer
2025-May-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02739-1
PMID:40405007
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研究论文 | 本研究整合孟德尔随机化和多转录组分析,揭示调节性T细胞介导的游离胆固醇与胃癌的遗传关联风险 | 首次结合孟德尔随机化和多组学方法系统分析游离胆固醇通过调节性T细胞影响胃癌的因果机制 | 依赖于公开数据库数据,需要进一步实验验证具体分子机制 | 探究游离胆固醇与胃癌的因果关系及调节性T细胞的中介作用 | 233种代谢物、731种免疫细胞与胃癌的关联 | 生物信息学 | 胃癌 | 孟德尔随机化, 转录组分析, 单细胞测序 | 两样本孟德尔随机化, 多变量孟德尔随机化 | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞测序数据 | GWAS数据库和TCGA数据库样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组关联分析 | NA | NA |
7404 | 2025-10-06 |
Identification of shared mechanisms between Alzheimer's disease and atherosclerosis by integrated bioinformatics analysis
2025-May-22, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-02642-z
PMID:40405226
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析识别阿尔茨海默病与动脉粥样硬化的共同机制 | 首次通过多方法整合分析发现WIPF3基因在两种疾病中的核心作用,并揭示炎症在疾病共发生中的关键机制 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 探索阿尔茨海默病与动脉粥样硬化的共同发病机制 | AD脑组织和动脉粥样硬化斑块的测序数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病,动脉粥样硬化 | bulk sequencing, 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析, Lasso Cox回归, 随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7405 | 2025-10-06 |
Identification of m5C RNA modification-related gene signature for predicting prognosis and immune microenvironment-related characteristics of heart failure
2025-May-22, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-025-00454-z
PMID:40405297
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法识别了m5C RNA修饰相关基因特征,用于预测心力衰竭预后和免疫微环境特征 | 首次系统研究m5C RNA修饰在心力衰竭中的作用及其与免疫微环境的关系,建立了基于4个m5C生物标志物的诊断模型 | 研究主要基于公共数据集,需要更多独立队列验证;动物实验样本量有限 | 探索m5C RNA修饰在心力衰竭中的作用机制及其临床意义 | 心力衰竭患者样本和心肌梗死后心力衰竭大鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR, western blot | 随机森林, LASSO逻辑回归, SVM-RFE, 共识聚类 | 基因表达数据 | 训练集:200例HF患者和166例对照;验证集:GSE183852单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
7406 | 2025-10-06 |
Unveiling the hidden dance: SPP1 + macrophages identified in ulcerative colitis reveal crosstalk with CHI3L1 + fibroblasts
2025-May-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06565-5
PMID:40399882
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了溃疡性结肠炎中SPP1+巨噬细胞和CHI3L1+成纤维细胞的关键作用及其相互作用机制 | 首次发现SPP1+巨噬细胞与CHI3L1+成纤维细胞在溃疡性结肠炎炎症部位的富集现象及其在疾病进展中的关键通讯作用 | 样本来源有限,主要基于公共数据库验证,需要更大规模样本验证研究结果 | 探索巨噬细胞和成纤维细胞在溃疡性结肠炎发病机制中的具体作用及其相互作用 | 溃疡性结肠炎患者的外周血和结肠活检样本中的巨噬细胞和成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术, 多重免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 流式细胞数据, 免疫组化数据 | UC患者的外周血和结肠活检样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
7407 | 2025-10-06 |
Long noncoding RNAs in familial hypercholesterolemia: biomarkers, therapeutics, and AI in precision medicine
2025-May-21, Lipids in health and disease
IF:3.9Q2
DOI:10.1186/s12944-025-02605-7
PMID:40399983
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综述 | 探讨长链非编码RNA在家族性高胆固醇血症中的作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 整合AI驱动的lncRNA发现与单细胞转录组学技术,提出lncRNA作为新型生物标志物和治疗靶点的创新应用 | 生物标志物验证、RNA递送效率和监管审批等临床转化挑战尚未解决 | 研究lncRNA在家族性高胆固醇血症精准医疗中的应用前景 | 家族性高胆固醇血症患者及相关lncRNA(LeXis、CHROME、H19) | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学,AI驱动的lncRNA发现 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7408 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics Uncovers Core Signature for Regulating Mitochondrial Homeostasis During Testicular Ageing
2025-May, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13797
PMID:39731228
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示果蝇睾丸衰老过程中线粒体稳态调控的核心特征 | 首次在果蝇睾丸衰老模型中系统揭示线粒体功能失调特征及关键调控基因 | 研究仅限于果蝇模型,未在哺乳动物中验证 | 探究睾丸衰老过程中线粒体稳态的调控机制 | 年轻和年老果蝇的睾丸组织 | 单细胞组学 | 生殖系统衰老 | 单细胞RNA测序 | 拟时序轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 年轻和年老果蝇睾丸样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7409 | 2025-05-11 |
Unraveling Tissue Complexity Through Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2025-May, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202500710
PMID:40342283
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
7410 | 2025-10-06 |
Optineurin Cooperates With NRF2 to Regulate Tooth Root Morphogenesis by Controlling Mitochondrial Dynamics and Apoptosis
2025-May, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13799
PMID:39762159
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研究论文 | 本研究揭示了Optineurin通过与NRF2协同调控线粒体动力学和细胞凋亡在牙齿根部形态发生中的关键作用 | 首次发现OPTN与NRF2协同调控线粒体分裂机制,通过DRP1磷酸化和BCL2转录影响牙根发育 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究OPTN在牙齿根部发育中的作用机制 | 小鼠牙齿(E16.5、P1、P7)及人类胚胎和成人牙齿样本,根尖乳头干细胞(SCAPs) | 发育生物学 | 牙齿发育异常 | 单细胞测序,RNA-seq分析,体外细胞培养,离体器官培养 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | 多个发育时间点的小鼠牙齿样本及人类牙齿样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7411 | 2025-10-06 |
[Public Database-based Study to Explore the Expression and Role of DDB1
in Lung Adenocarcinoma]
2025-Apr-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
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研究论文 | 本研究基于公共数据库探讨DDB1在肺腺癌中的表达及其作用 | 首次系统分析DDB1在肺腺癌中的表达特征、预后价值及其与免疫细胞浸润的关系 | 研究主要依赖公共数据库数据,需要进一步实验验证机制 | 探究DDB1在肺腺癌中的表达特征、临床意义及生物学功能 | 肺腺癌组织和细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | 生物信息学分析,单细胞测序,组织芯片 | NA | 基因表达数据,临床病理数据,单细胞测序数据 | 公共数据库中的肺腺癌样本和组织芯片样本 | NA | 单细胞RNA-seq,组织芯片 | NA | NA |
7412 | 2025-10-06 |
HMOX1-LDHB interaction promotes ferroptosis by inducing mitochondrial dysfunction in foamy macrophages during advanced atherosclerosis
2025-04-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.12.011
PMID:39731912
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研究论文 | 本研究揭示了HMOX1-LDHB相互作用通过诱导线粒体功能障碍促进晚期动脉粥样硬化中泡沫巨噬细胞铁死亡的新机制 | 首次发现HMOX1-LDHB相互作用通过LONP1介导的TFAM降解导致线粒体功能障碍,从而促进泡沫巨噬细胞铁死亡 | NA | 阐明晚期动脉粥样硬化中泡沫巨噬细胞死亡的分子机制 | 动脉粥样硬化中的泡沫巨噬细胞,特别是TREM2低表达的泡沫巨噬细胞亚群 | 分子生物学 | 心血管疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
7413 | 2025-10-06 |
Identification of prognostic biomarkers for endometrioid endometrial carcinoma based on the miRNA and mRNA co-expression network regulated by estradiol
2025, Clinics (Sao Paulo, Brazil)
DOI:10.1016/j.clinsp.2025.100672
PMID:40319860
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研究论文 | 基于雌二醇调控的miRNA和mRNA共表达网络识别子宫内膜样腺癌的预后生物标志物 | 首次构建雌二醇调控的miRNA-mRNA共表达网络,并识别出miR-142-5p-SACS和miR-30a-5p-GPR157作为EEC潜在预后生物标志物 | 样本量有限,特别是实验验证部分仅使用细胞系,需要更多临床样本验证 | 识别与雌二醇调控相关的子宫内膜样腺癌预后生物标志物 | 子宫内膜样腺癌患者和子宫内膜癌Ishikawa细胞系 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | RNA测序, 单细胞转录组测序, 生物信息学分析 | 共表达网络分析, 蛋白质-蛋白质相互作用网络 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | TCGA数据库408例EEC患者,实验组9个细胞样本(6个雌二醇处理,3个对照) | NA | RNA-seq, 单细胞转录组测序 | NA | NA |
7414 | 2025-10-06 |
Single cell RNA-sequencing identified CCR7+/RELB+/IRF1+ T cell responding for juvenile idiopathic arthritis pathogenesis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1528446
PMID:40406113
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析鉴定出CCR7+/RELB+/IRF1+三阳性T细胞在幼年特发性关节炎发病机制中的作用 | 首次在单细胞水平揭示HLA-B27阳性和阴性JIA患者的免疫细胞差异,并鉴定出CCR7+/RELB+/IRF1+三阳性T细胞这一新型致病T细胞亚群 | 样本来源仅限于外周血单核细胞,未涉及关节组织等病变部位 | 探索幼年特发性关节炎不同亚型的疾病异质性及其发病机制 | 幼年特发性关节炎患者的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 幼年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | JIA患者、pSS患者和SLE患者的外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7415 | 2025-10-06 |
Decoding multiple myeloma: single-cell insights into tumor heterogeneity, immune dynamics, and disease progression
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1584350
PMID:40406148
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤的肿瘤异质性、免疫动态和疾病进展机制 | 首次在单细胞水平揭示多发性骨髓瘤中神经免疫相互作用的机制,并识别出关键的未分化IGLC3+骨髓瘤细胞亚群 | 样本量有限,需要更大规模验证神经免疫轴在肿瘤进展中的具体作用机制 | 探索多发性骨髓瘤的肿瘤异质性、免疫动态和神经免疫调控机制 | 多发性骨髓瘤和高风险冒烟型多发性骨髓瘤患者样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | CytoTRACE, Monocle2, Slingshot | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7416 | 2025-10-06 |
Identification of common hub genes and construction of immune regulatory networks in aplastic anemia, myelodysplastic syndromes, and acute myeloid leukemia
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1547289
PMID:40406144
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,识别了再生障碍性贫血、骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病中的共同枢纽基因及其免疫调控网络 | 首次发现POLG和MAP2K7作为三种血液疾病的共同枢纽基因,并揭示其通过MIF介导的细胞通讯调控20多条免疫调控通路 | 枢纽基因对细胞增殖和迁移无显著影响,研究样本来源有限 | 识别再生障碍性贫血、骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病的共同枢纽基因,构建免疫调控网络,为预防疾病进展提供基础 | 再生障碍性贫血、骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病患者样本 | 生物信息学 | 血液系统疾病 | 基因表达差异分析、基因集富集分析、加权基因共表达网络分析、免疫浸润分析、单细胞测序、细胞通讯分析、孟德尔随机化、RT-qPCR、ELISA、细胞增殖实验 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | GEO数据库相关数据集 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
7417 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals adrb1 as a sympathetic nerve-regulated immune checkpoint driving T cell exhaustion and impacting immunotherapy in esophageal squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1520766
PMID:40406147
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现ADRB1是交感神经调节的免疫检查点,驱动T细胞耗竭并影响食管鳞状细胞癌的免疫治疗 | 首次通过单细胞RNA测序揭示ADRB1在食管鳞癌中的免疫调节作用,并建立基于肾上腺素能受体信号通路的预后模型 | 研究样本量有限,需要更大规模验证 | 探索肾上腺素能受体信号通路在食管鳞癌免疫治疗中的作用机制 | 食管鳞状细胞癌患者样本 | 单细胞测序分析 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA分析, 免疫荧光, 流式细胞术, 拷贝数变异分析 | 预后模型 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据, TCGA数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7418 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA-Seq Recognized Key Genes for Metastasis and Macrophage Infiltration in Colorectal Cancer
2025, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/9488531
PMID:40406545
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别结直肠癌转移和巨噬细胞浸润的关键基因ZFAND2A | 首次通过单细胞测序技术系统识别结直肠癌转移和巨噬细胞浸润的关键基因ZFAND2A,并验证其功能 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内实验验证 | 识别结直肠癌转移和巨噬细胞浸润的关键基因 | 结直肠癌细胞和巨噬细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, WB分析, CCK-8, transwell实验, ELISA, 流式细胞术 | lasso回归 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的GSE261012和GSE234804数据集,以及TCGA数据库数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7419 | 2025-10-06 |
CD9 expression rivals IDH mutation as a prognostic marker in glioma: a novel nomogram approach
2025, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2025.1507443
PMID:40406701
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研究论文 | 本研究评估了四跨膜蛋白CD9在胶质瘤中的预后意义和功能机制,开发了CD9整合的预后列线图模型 | 首次将CD9表达与IDH突变作为胶质瘤预后标志物进行比较,并通过孟德尔随机化验证了CD9与胶质瘤风险的因果关系 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,需要前瞻性研究进一步验证 | 评估CD9在胶质瘤中的预后价值和功能机制,开发精准预后模型 | 胶质瘤患者样本 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 多组学分析、单细胞RNA测序、孟德尔随机化、蛋白互作网络分析 | Cox回归、列线图 | 基因组数据、转录组数据、单细胞数据 | 1033个胶质瘤样本(来自TCGA和CGGA队列),20例胶质母细胞瘤单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
7420 | 2025-10-06 |
Cellular and Molecular Atlas of Peripheral Blood Mononuclear Cells from a Pregnant Woman After Recovery from COVID-19
2023-Apr, Maternal-fetal medicine (Wolters Kluwer Health, Inc.)
DOI:10.1097/FM9.0000000000000190
PMID:40406392
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究一名COVID-19康复孕妇外周血单个核细胞的免疫反应特征 | 首次在单细胞分辨率水平揭示COVID-19康复孕妇PBMCs中CD16单核细胞和MAIT细胞的免疫应答特征 | 仅研究单个病例样本,样本量有限 | 探究COVID-19康复孕妇的免疫反应机制 | 孕妇外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1名COVID-19康复孕妇,与已发表健康孕妇数据对比 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |