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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7381 | 2026-02-14 |
Applications of spatial transcriptomics and artificial intelligence to develop integrated management of pancreatic cancer
2024, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2024.06.007
PMID:39271261
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综述 | 本文综述了空间转录组学和人工智能在胰腺癌综合管理中的应用 | 整合空间转录组学和人工智能工具,以更精确地分析肿瘤微环境中的细胞间通讯,并识别新的生物标志物和治疗靶点 | NA | 探索空间转录组学和人工智能在胰腺癌早期诊断和个性化治疗中的应用 | 胰腺癌 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序, seqFISH | NA | 测序数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7382 | 2026-02-14 |
Crosstalk between tumor and microenvironment: Insights from spatial transcriptomics
2024, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2024.06.009
PMID:39271263
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综述 | 本文综述了肿瘤与微环境之间的相互作用,重点关注空间转录组学技术在解析肿瘤异质性、进化及克隆状态中的应用 | 整合空间转录组学技术视角,系统阐述肿瘤异质性驱动因素及肿瘤-微环境动态互作机制 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有文献总结 | 探讨肿瘤异质性、进化及克隆状态的驱动因素,并分析肿瘤与微环境的相互作用 | 肿瘤组织及其微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7383 | 2026-02-14 |
Deep learning-based multimodal spatial transcriptomics analysis for cancer
2024, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2024.08.001
PMID:39271260
|
书本章节 | 本章探讨了深度学习与多模态空间转录组学在癌症研究中的整合应用 | 将深度学习与多模态空间转录组学结合,为癌症诊断和治疗提供全面且可操作的见解,代表了肿瘤学向更精准和个性化方向的范式转变 | NA | 推进癌症诊断、治疗规划和精准医学 | 癌症生物学,包括肿瘤异质性、微环境相互作用和治疗反应 | 机器学习 | 癌症 | 空间转录组学,多模态数据分析 | 卷积神经网络 | 多模态数据(包括基因组、蛋白质组、影像和临床数据) | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7384 | 2026-02-14 |
Current computational methods for spatial transcriptomics in cancer biology
2024, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2024.06.006
PMID:39271268
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综述 | 本文综述了当前在癌症生物学中用于空间转录组学的计算方法 | NA | NA | 回顾和总结空间转录组学在癌症生物学中的计算分析方法 | 空间转录组学数据及其在癌症研究中的应用 | 计算生物学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7385 | 2026-02-14 |
Data enhancement in the age of spatial biology
2024, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2024.06.008
PMID:39271267
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综述 | 本文综述了空间转录组学与其他数据类型(如单细胞转录组学和详细组织染色图像)整合的计算方法,旨在克服当前空间转录组学技术在分辨率或同时分析基因数量方面的限制 | 深入探讨了整合空间转录组学与互补数据源的计算方法,以克服现有技术在分辨率或基因分析数量上的局限,并强调了这些方法在癌症生物学理解中的革命性潜力 | 作为综述文章,未涉及具体实验数据或新算法开发,主要聚焦于现有挑战和解决方案的概述 | 旨在通过整合空间转录组学与其他数据类型,提升对细胞异质性和微环境的理解,特别是在癌症等复杂疾病中 | 空间转录组学数据、单细胞转录组学数据、详细组织染色图像 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学、单细胞转录组学、组织染色 | NA | 空间转录组学数据、单细胞转录组学数据、图像数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7386 | 2026-02-14 |
Integrated multi-omics single cell atlas of the human retina
2023-Nov-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3471275/v1
PMID:38014002
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研究论文 | 本文构建了一个综合多模态的人类视网膜细胞图谱,整合了转录组和染色质可及性数据 | 首次整合了大规模多模态单细胞数据,揭示了超过110种细胞类型,并精细映射了GWAS和eQTL变异 | NA | 创建全面的人类视网膜细胞图谱以促进对视网膜功能和病理的理解 | 人类视网膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组和染色质可及性数据 | 约240万个细胞,来自55名捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 7387 | 2026-02-13 |
Bufei formula attenuates airway mucus hypersecretion in COPD through inhibition of TRIM56-mediated ITGB4 ubiquitination
2026-Apr-24, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121215
PMID:41580166
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研究论文 | 本研究探讨了补肺方通过抑制TRIM56介导的ITGB4泛素化来减轻慢性阻塞性肺疾病气道黏液高分泌的机制 | 首次揭示了补肺方活性组分BFF-4通过靶向TRIM56并抑制其介导的ITGB4泛素化,从而调控MUC5AC表达的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,临床转化效果有待进一步验证;分子对接预测的小分子相互作用需要实验证实 | 阐明传统中药补肺方治疗慢性阻塞性肺疾病气道黏液高分泌的具体分子机制 | 香烟烟雾诱导的COPD小鼠模型、香烟烟雾提取物诱导的气道上皮细胞 | 基础医学研究 | 慢性阻塞性肺疾病 | DARTS技术、Co-IP-MS、单细胞测序、分子对接 | 动物疾病模型、细胞模型 | 蛋白质组学数据、单细胞测序数据、分子对接数据 | 未明确说明具体样本数量,但包含小鼠模型和细胞实验 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 7388 | 2026-02-13 |
Temporal transcriptomic profiling of bone autograft healing reveals dynamic immune, vascular, and osteogenic programs
2026-Apr, Bone
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.bone.2025.117771
PMID:41478392
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研究论文 | 本研究通过时序转录组分析揭示了骨自体移植愈合过程中动态的免疫、血管和成骨程序 | 首次结合bulk和单细胞RNA测序技术,在小鼠骨膜介导的自体移植模型中系统描绘了14天内移植相关组织的分子和细胞程序动态变化,并发现了供体来源细胞稀少而宿主来源细胞类型转换的现象,提示了愈合过程中活跃的神经血管互作 | 研究基于小鼠模型,结果在人体中的适用性有待验证;观察时间限于14天内,长期愈合过程未涵盖 | 阐明驱动早期骨自体移植整合的分子和细胞程序 | 小鼠骨膜介导的自体移植模型中的移植相关组织 | 数字病理 | 骨科疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7389 | 2026-02-13 |
The role of insulin-like growth factor binding proteins in TGF-β1-induced fibroblast-myofibroblast transition during endometriosis fibrosis
2026-Apr, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112362
PMID:41520746
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研究论文 | 本研究探讨了胰岛素样生长因子结合蛋白(IGFBPs)在子宫内膜异位症纤维化过程中TGF-β1诱导的成纤维细胞-肌成纤维细胞转化(FMT)中的作用 | 首次定义了IGFBPs在子宫内膜异位症纤维化中的作用,并发现IGFBP6是一种潜在的抗纤维化因子和治疗靶点 | NA | 研究IGFBPs在子宫内膜异位症相关纤维化中TGF-β1诱导的FMT过程中的作用 | 子宫内膜异位症患者的异位子宫内膜组织及异位子宫内膜基质细胞(EcESCs) | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7390 | 2026-02-13 |
Integrated methylome and hydroxymethylome analysis identifies CAMK2G, NFATC4, and SFRP2 as TET1-regulated drivers of odontoblastic differentiation in human dental pulp cells
2026-Apr, Bone
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.bone.2026.117775
PMID:41534676
|
研究论文 | 本研究通过整合甲基组和羟甲基组分析,揭示了TET1调控的CAMK2G、NFATC4和SFRP2作为人牙髓细胞成牙本质分化的关键驱动因子 | 首次在全基因组水平描绘了人牙髓细胞成牙本质分化过程中的DNA甲基化动态,并识别出TET1通过5hmC修饰调控的新表观遗传驱动因子 | 研究主要基于体外细胞模型,未在体内验证这些驱动因子的功能 | 阐明人牙髓细胞成牙本质分化过程中的DNA甲基化动态及TET1介导的调控机制 | 人牙髓细胞 | 表观遗传学 | 牙科疾病 | 微阵列、hMeDIP-seq、scRNA-seq | NA | 基因组DNA甲基化数据、羟甲基化数据、单细胞RNA-seq数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7391 | 2026-02-13 |
Zebrafish neural regeneration: mechanistic insights into human nervous system repair
2026-Mar-05, Neuroscience
IF:2.9Q2
|
综述 | 本文综述了斑马鱼在神经再生研究中的关键发现,强调了其在模拟人类神经退行性疾病和指导治疗策略中的转化意义 | 整合了斑马鱼在视网膜、脊髓和大脑中神经再生的多系统机制,并引入了单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9等先进技术来解析再生过程中的细胞状态和调控网络 | 作为一篇综述文章,未涉及原始实验数据,且斑马鱼与人类在生理和病理上存在差异,其发现直接转化至临床应用仍需进一步验证 | 解码脊椎动物中枢神经系统的再生机制,以指导人类神经修复的治疗策略 | 斑马鱼(Danio rerio)作为研究模型,聚焦于其视网膜、脊髓和大脑的神经再生过程 | 再生医学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9, 谱系追踪, 多组学分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7392 | 2026-02-13 |
[Impact of bone metastasis on the prognosis of lung adenocarcinoma patients treated with third-generation EGFR-TKIs and the underlying mechanisms]
2026-Feb-12, Zhonghua yi xue za zhi
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研究论文 | 本研究评估了骨转移对接受一线第三代EGFR-TKI治疗的肺腺癌患者预后的影响,并通过单细胞RNA测序探索了骨转移导致EGFR-TKI耐药的潜在机制 | 首次结合大规模临床回顾性分析与单细胞RNA测序技术,系统揭示了骨转移肺腺癌患者对第三代EGFR-TKI预后不佳的免疫微环境机制,并构建了基于免疫调控基因的预后评分模型 | 研究为回顾性分析,存在选择偏倚;单细胞测序样本量较小(n=4);验证队列样本量有限 | 评估骨转移对第三代EGFR-TKI治疗肺腺癌患者预后的影响,并探索其耐药机制 | EGFR突变晚期肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO-Cox回归模型 | 临床数据,单细胞转录组数据 | 临床队列370例患者(161例有骨转移,209例无骨转移);单细胞测序4个样本(2个原发肺肿瘤,2个骨转移灶);TCGA训练队列41例;亚洲验证队列93例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7393 | 2026-02-13 |
Diagnostic model and identification of IGFBP2 as an aging-related biomarker and therapeutic target for systemic sclerosis-associated interstitial lung disease through integrated bioinformatics and machine learning approaches
2026-Feb-12, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004351
PMID:41677271
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和机器学习方法,识别了IGFBP2作为系统性硬化症相关间质性肺病(SSc-ILD)的衰老相关生物标志物和治疗靶点 | 结合临床数据、基因表达分析和机器学习算法,首次将IGFBP2鉴定为SSc-ILD的关键衰老相关基因,并构建了诊断模型 | 研究样本量有限(106例患者),且主要依赖公共数据库数据,需要进一步实验验证和更大规模临床研究 | 识别SSc-ILD的临床特征和衰老相关遗传标志物,验证IGFBP2在基底细胞衰老和纤维化进展中的作用 | 系统性硬化症患者(SSc-ILD和SSc-NILD组)、小鼠模型、基因表达数据集 | 机器学习 | 系统性硬化症相关间质性肺病 | 基因表达分析、免疫荧光、定量PCR、Western blotting、单细胞RNA测序 | LASSO、随机森林、支持向量机-递归特征消除 | 基因表达数据、临床数据 | 106例患者(73例SSc-ILD,33例SSc-NILD)、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7394 | 2026-02-13 |
Single-cell resolution of splicing regulation in peripheral blood mononuclear cells uncovers heterogeneity-driven mechanisms underlying human complex traits
2026-Feb-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69325-z
PMID:41672992
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据,在欧洲人群的外周血单个核细胞中,系统性地研究了遗传变异对选择性剪接的调控及其与复杂性状的关联机制 | 首次在单细胞分辨率下,系统性地揭示了遗传变异对选择性剪接的细胞类型特异性调控,并阐明了剪接调控作为复杂性状易感位点作用机制的重要性 | 研究仅针对欧洲血统人群,结果可能无法直接推广到其他人群;样本量相对有限(980人) | 探究遗传变异在免疫细胞类型和人口统计学层次上对选择性剪接的调控机制,及其与复杂性状的关联 | 欧洲血统人群的外周血单个核细胞(PBMCs) | 单细胞组学 | 复杂性状(多基因性状) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),基因分型 | NA | 单细胞RNA测序数据,基因型数据 | 980名欧洲血统个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7395 | 2026-02-13 |
B-Cell Landscape in Inflamed Dental Pulp Reveals Potential Autoimmune Involvement
2026-Feb-11, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251415328
PMID:41673562
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和组织病理学分析,揭示了牙髓炎中B细胞的动态变化及其潜在的自身免疫参与机制 | 首次从B细胞角度全面解析牙髓炎,发现B细胞在炎症中的促炎作用及自身反应性倾向,为牙髓炎发病机制提供了新视角 | 研究主要基于小鼠模型和有限的组织样本,人类样本的验证及长期临床意义需进一步探索 | 探究牙髓炎中B细胞的角色及其在局部病理和全身免疫特征中的潜在贡献 | 健康和炎症状态下的牙髓组织,包括人类和小鼠样本 | 数字病理学 | 牙髓炎 | 单细胞RNA测序,组织病理学分析,多重免疫荧光,流式细胞术,孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,组织图像,血清学数据 | 未明确指定样本数量,但包括健康和炎症牙髓组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7396 | 2026-02-13 |
Integrated analysis of spatial and single-cell profiles reveals cell type-specific regulation of synaptic plasticity in human brain aging
2026-Feb-10, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf202
PMID:41495924
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组学数据,揭示了人类前额叶皮层衰老过程中细胞类型特异性和空间调控的分子机制 | 首次整合单细胞多组学(scRNA-seq和scATAC-seq)与空间转录组学技术,系统解析了人脑衰老过程中兴奋性神经元的表观遗传和转录调控变化,并识别出EGR1作为突触可塑性的关键潜在调控因子 | 研究样本量相对有限(51例),且为横断面研究,无法确定因果关系;主要关注前额叶皮层,其他脑区的衰老机制可能不同 | 揭示人类前额叶皮层衰老过程中细胞类型特异性和空间调控的分子机制,寻找与认知衰退相关的生物标志物和治疗靶点 | 51例健康人类前额叶皮层样本,分为青年、中年和老年组 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 空间基因表达数据 | 51例人类前额叶皮层样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7397 | 2026-02-13 |
Appearance of Amyloid-β Early in Life Initiates Neuronal Hyper-excitability, Mitochondrial Decay, and Loss of Dendritic Complexity in the Hippocampal CA1 Region of 5xFAD Mice
2026-Feb-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.04.703883
PMID:41676529
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研究论文 | 本研究在5xFAD小鼠模型中,揭示了在淀粉样斑块显著沉积之前,海马CA1区神经元就出现突触过度兴奋、线粒体功能衰退和树突复杂性丧失的早期细胞事件 | 首次在5xFAD小鼠模型中系统定义了淀粉样斑块沉积前的早期时间窗,并整合了电生理、线粒体功能、形态学和空间转录组学数据,揭示了海马亚区(特别是CA1区)在疾病早期的选择性易损性 | 研究基于转基因小鼠模型(5xFAD),其结果向人类阿尔茨海默病的直接转化性尚需验证;且主要关注海马区,其他脑区的早期变化未涉及 | 探究阿尔茨海默病(AD)在显著斑块沉积和可测量行为障碍出现之前的最早细胞事件,特别是突触过度兴奋和亚细胞代谢功能障碍是否在早期出现并导致区域特异性神经元易损性 | 5xFAD杂合子小鼠模型的海马组织,重点关注CA1、CA3和齿状回等海马亚区 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 离体电生理学、线粒体结构与功能评估、形态学分析(树突结构)、空间转录组学 | 5xFAD转基因小鼠模型 | 电生理信号、线粒体功能数据、形态学图像数据、空间转录组数据 | 5xFAD小鼠模型(具体数量未在摘要中明确说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7398 | 2026-02-13 |
Querying functional drivers in primary murine naïve and memory T cells using RNP-mediated CRISPR-Cas9 Gene Deletion
2026-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.05.704062
PMID:41676462
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研究论文 | 本文提出了一种基于RNP介导的CRISPR-Cas9基因删除技术,用于在原发性小鼠幼稚和记忆T细胞中快速评估候选基因的功能作用 | 开发了一种无需生殖系基因敲除小鼠的快速CRISPR-Cas9协议,可直接在激活效应、静止幼稚和记忆CD8 T细胞中进行基因删除,适用于急性和慢性感染模型 | 未明确提及样本量或技术验证的局限性,可能依赖于体外模型 | 研究CD8 T细胞在感染和癌症中的功能驱动基因,以加速免疫疗法和疫苗设计 | 原发性小鼠CD8 T细胞,包括幼稚、记忆和效应亚群 | 免疫学 | 癌症 | CRISPR-Cas9基因编辑,微阵列,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7399 | 2026-02-13 |
Exacerbated salmonellosis in poly(ADP-ribose) polymerase 14-deficient mice
2026-Feb-03, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02971-25
PMID:41468544
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研究论文 | 本研究探讨了PARP14蛋白在小鼠沙门氏菌感染模型中的作用,发现PARP14缺失会加剧肠道炎症和组织损伤 | 首次揭示了PARP14在沙门氏菌感染中作为多细胞类型多效性调节因子的作用,特别是在Th17反应和上皮细胞转录组特征中的关键功能 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证;PARP14的具体作用机制仍需进一步探究 | 探究PARP14蛋白在沙门氏菌感染引起的黏膜炎症中的功能 | 小鼠模型中的沙门氏菌感染及PARP14缺失小鼠 | 分子生物学与免疫学 | 感染性疾病(沙门氏菌感染) | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, TaqMan qPCR, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 未明确指定样本数量,但涉及PARP14缺失小鼠和对照小鼠的组织分析 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7400 | 2026-02-13 |
RNA Quality Control Enables Antibiotic Tolerance
2026-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.02.703294
PMID:41676483
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研究论文 | 本研究通过实验进化方法探索了细菌在抗生素和免疫压力下的适应机制,揭示了RNA质量控制如何驱动抗生素耐受性 | 首次发现RNA降解酶RNase Y的突变通过bet-hedging策略调控RNA周转,作为可调的主调节器来应对抗生素和免疫的联合压力 | 研究主要基于实验进化模型,可能未完全反映真实宿主环境中的复杂相互作用 | 探究细菌在抗生素和免疫压力下的适应机制及RNA质量控制的作用 | 细菌种群 | 微生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |