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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2026-05-30 |
CNS1-dependent regulatory T cells shape recovery from acute lung injury
2026-May-14, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkag119
PMID:42201839
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研究论文 | 研究CNS1依赖的调节性T细胞在急性肺损伤恢复中的作用 | 通过单细胞RNA测序揭示CNS1缺陷导致Treg细胞无法完全激活支持抑制和修复功能的转录程序,首次阐明外周诱导Treg在ALI严重程度中的关键作用 | 未明确说明 | 探究外周诱导的调节性T细胞在急性肺损伤恢复过程中的功能机制 | CNS1基因敲除小鼠的肺组织Treg细胞 | 机器学习 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型(CNS1缺陷与野生型对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 722 | 2026-05-30 |
Breast Cancer Milieu Maneuvers Cancer-Associated Macrophages to Synergize Neoplastic Repertoires
2026-May-14, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18101596
PMID:42192956
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综述 | 探讨乳腺癌微环境如何调控肿瘤相关巨噬细胞(TAM)以促进肿瘤发展,并重点分析M2型巨噬细胞的分子机制、异质性及临床转化挑战 | 系统整合了单细胞测序、空间转录组学和计算生物学的最新进展,揭示TAM异质性,并批判性评估了从基础研究到临床应用的转化障碍 | 临床转化受限于治疗特异性低、补偿性信号通路激活以及小鼠与人类巨噬细胞生物学差异 | 阐明乳腺癌中支持M2型巨噬细胞极化的分子信号,并探讨克服治疗局限性的策略 | 乳腺癌肿瘤相关巨噬细胞(TAMs),尤其是M2亚型及其相关信号通路(如CSF1/CSF1R、STAT3、IL-6等) | NA | 乳腺癌 | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 723 | 2026-05-30 |
Ligand-Receptor Interaction Combined with Histopathology Improves Glioma Prognostic Model
2026-May-14, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14051110
PMID:42193434
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研究论文 | 开发了一种整合配体-受体相互作用和深度学习的多模态框架,用于构建胶质母细胞瘤预后模型 | 首次将配体-受体相互作用组学与基于深度学习的病理组学结合,构建多模态预后模型,揭示了胶质瘤细胞间通讯的分子和空间景观 | NA | 通过整合配体-受体相互作用和病理学特征,改善胶质母细胞瘤的预后模型 | 胶质母细胞瘤患者转录组数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据及H&E染色组织切片 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 空间转录组学 | 深度学习模型, Logistic回归 | 转录组数据, 基因表达数据, 图像(H&E染色切片) | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 724 | 2026-05-30 |
Uncovering the Targets of Pueraria Associated with Programmed Cell Death and the Construction of a Diagnostic Model in Septic Cardiomyopathy
2026-May-14, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14051114
PMID:42193439
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研究论文 | 本研究旨在揭示葛根在脓毒症心肌病中调节程序性细胞死亡的靶点,并构建诊断模型 | 首次整合14种程序性细胞死亡模式和171种机器学习算法组合,构建了基于葛根核心靶点的脓毒症心肌病诊断模型,并通过单细胞RNA测序揭示心肌免疫微环境中的细胞类型特异性表达 | 结论基于公开转录组数据集和有限的实验验证样本,模型在更大临床队列中的泛化性能需进一步评估 | 识别葛根在脓毒症心肌病中调节程序性细胞死亡的靶点,并构建可验证的诊断模型 | 脓毒症心肌病患者的血液样本和脂多糖诱导的脓毒症小鼠心脏组织 | 机器学习 | 脓毒症心肌病 | RNA-seq | 机器学习集成模型(171种算法组合) | 转录组数据 | 7个GEO转录组数据集、脓毒症心肌病患者血液样本、脂多糖诱导的小鼠心脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 725 | 2026-05-30 |
Temporally Resolved Single-Cell RNA Sequencing Reveals Pathogenesis and Immune Responses in Intracerebral Bacille Calmette-Guérin (BCG) Infection
2026-May-14, Pathogens (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pathogens15050531
PMID:42198657
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研究论文 | 通过时间分辨的单细胞RNA测序揭示卡介苗颅内感染的发病机制和免疫反应 | 首次利用单细胞RNA测序技术时间分辨地解析了卡介苗颅内感染过程中细胞类型、通路和细胞间通讯的动态变化,并提出了血脑脊液屏障可能是分枝杆菌入侵的潜在途径 | 该研究仅在小鼠模型中进行,与人类颅内感染的相关性和差异尚需进一步验证 | 阐明卡介苗穿透中枢神经系统屏障的途径及感染过程中中枢神经系统免疫微环境的时间重塑模式 | 尾静脉注射卡介苗感染的小鼠脑组织 | 机器学习和单细胞组学 | 颅内感染性疾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠感染模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞测序平台用于全脑组织单细胞转录组分析 |
| 726 | 2026-05-30 |
6-Bromoindole-3-acetonitrile Attenuates DSS-Induced Colitis by Inhibiting Epithelial Cell Pyroptosis
2026-May-12, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15101697
PMID:42195900
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研究论文 | 通过分析公共单细胞RNA测序数据,发现6-溴吲哚-3-乙腈通过抑制上皮细胞焦亡缓解DSS诱导的小鼠结肠炎 | 首次从海洋来源溴代吲哚中筛选出焦亡抑制剂6-溴吲哚-3-乙腈,并揭示其通过结合髓过氧化物酶(MPO)发挥抗炎作用的分子机制 | 研究基于临床前动物模型,结果需在临床环境中进一步验证 | 探索治疗溃疡性结肠炎的新策略,重点抑制上皮细胞焦亡 | DSS诱导结肠炎小鼠模型及小鼠结肠上皮细胞 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 公开数据集中的DSS诱导结肠炎小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 公开单细胞RNA测序数据集 |
| 727 | 2026-05-30 |
Low-Strength Type I Interferon Signaling Promotes CAR T Cell Treatment Efficacy
2026-May-11, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0691
PMID:42112708
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析,发现低强度I型干扰素信号可增强CAR T细胞治疗B细胞淋巴瘤的效果 | 首次提出在体外制造过程中利用低强度I型干扰素信号增强CAR T细胞疗效,且不依赖共刺激分子,并避免体内干扰素毒性 | 样本量较小(仅8名患者),未涉及其他癌症类型或长期随访数据 | 提高CD19靶向CAR T细胞治疗弥漫大B细胞淋巴瘤的疗效 | 接受axicabtagene ciloleucel治疗的8名复发/难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者的输注产品 | 机器学习 | B细胞淋巴瘤, 白血病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8名患者输注产品 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 728 | 2026-05-30 |
Integrated Single-Cell and Spatial Transcriptomics Analyses Delineate a BAG3-Associated Macrophage Program with Microenvironmental and Prognostic Relevance in Hepatocellular Carcinoma
2026-May-11, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17050562
PMID:42195019
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学分析,描绘了BAG3相关巨噬细胞程序在肝细胞癌中的微环境和预后相关性 | 首次在肝细胞癌中识别出BAG3相关的肿瘤相关巨噬细胞亚群,并阐明其与应激适应、蛋白稳态和基质重塑相关的程序,同时结合空间转录组学揭示其空间分布和微环境相互作用 | 仅基于公共数据集分析,缺乏独立临床队列验证;样本量有限,特别是空间转录组学仅包含少量治疗暴露样本;BAG3 TAM程序的功能机制未进行实验验证 | 评估BAG3相关肿瘤相关巨噬细胞程序在肝细胞癌中的生物学和预后相关性 | 肝细胞癌肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 公共数据集包含多个肝细胞癌样本,但具体数量未提及;空间转录组学基于少量治疗暴露样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 729 | 2026-05-30 |
Shared and Divergent Transcriptional Programs of Oligodendrocyte Differentiation Across Vertebrate Species Revealed by scRNA-seq Analysis
2026-May-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27104283
PMID:42196265
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研究论文 | 通过跨物种单细胞转录组分析,揭示了脊椎动物少突胶质细胞分化的共享与分化转录程序 | 首次在五种脊椎动物(河豚、弹涂鱼、鸡、小鼠和人类)中系统比较少突胶质细胞分化轨迹,发现共享和物种特异的基因表达模块,并揭示羊膜动物在祖细胞阶段特异扩展的分化程序与陆地运动回路髓鞘形成需求相关 | 仅分析脊髓样本,未涵盖其他中枢神经系统区域;物种间细胞类型注释可能存在偏差;功能验证实验有限 | 解析少突胶质细胞分化程序在脊椎动物进化中的保守性和适应性变化 | 五种脊椎动物(河豚、弹涂鱼、鸡、小鼠和人类)脊髓中的少突胶质细胞谱系细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | CAME跨物种映射模型 | 单细胞转录组数据 | 五种脊椎动物脊髓样本(具体数量未在摘要中提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 730 | 2026-05-30 |
Multi-Omics Analysis and In Vitro Experimental Validation Identify Candidate Mechanisms of Baicalein Against Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2026-May-11, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31101610
PMID:42197164
|
研究论文 | 通过多组学分析与体外实验验证,揭示黄芩素抗慢性阻塞性肺疾病的潜在机制 | 整合多数据集转录组分析、单细胞转录组学、机器学习特征选择、孟德尔随机化、分子模拟和体外验证的假说生成策略,系统化地探索黄芩素对慢阻肺的免疫相关多靶点机制 | 预测的巨噬细胞中心机制仍需在免疫细胞和体内模型中进行专门验证 | 阐明黄芩素治疗慢性阻塞性肺疾病的分子机制 | 慢性阻塞性肺疾病患者样本数据及LPS刺激的BEAS-2B上皮细胞 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | 转录组分析, 单细胞转录组学, 孟德尔随机化, 分子模拟, 虚拟敲除分析, 体外验证 | LASSO回归, 随机森林, 支持向量机 | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, GWAS统计摘要 | 260个对照样本和250个COPD样本 | NA | NA | NA | NA |
| 731 | 2026-05-30 |
Molecular Mechanism of POSTN Mediating M2 Polarization of Kupffer Cells to Promote Hepatic Fibrosis
2026-May-11, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph19050752
PMID:42198426
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研究论文 | 探讨POSTN介导库普弗细胞M2极化促进肝纤维化的分子机制 | 首次揭示POSTN通过调控库普弗细胞M2极化重塑肝脏微环境,并筛选出POSTN靶向抑制剂Rhodiosin | 未提及具体限制 | 研究POSTN在肝纤维化中的作用机制及潜在治疗靶点 | 库普弗细胞、LX-2细胞、POSTN条件敲除小鼠 | 机器学习 | 肝纤维化 | 单细胞测序、CCK-8实验、虚拟药物筛选 | CellChat | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 732 | 2026-05-30 |
The Current Landscape of Metastatic Breast Cancer: A Pathology Guide on Emerging Biomarkers
2026-May-10, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18101544
PMID:42192904
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综述 | 本文综述了转移性乳腺癌生物标志物检测的当前景观,包括常规标志物和新兴标志物,以及液体活检等技术进展 | 本文全面整合了最新临床指南与文献,强调了液体活检(如ctDNA分析)在实时监测和耐药检测中的重要性,并展望了AI和空间转录组学将推动病理学从静态诊断向动态预测模型转变 | 作为综述,未提供原始实验数据;新兴生物标志物如AI和空间转录组学的临床应用仍处于早期阶段 | 全面合成转移性乳腺癌生物标志物检测的当前景观,详细说明哪些生物标志物需要检测及其临床依据 | 转移性乳腺癌(MBC)患者及相关生物标志物 | 数字病理学 | 乳腺癌 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 733 | 2026-05-30 |
The Role of Next-Generation Sequencing in Cardiovascular Disease: A New Era of Precision Cardiology
2026-May-10, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life16050796
PMID:42195352
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综述 | 本文综述了下一代测序(NGS)如何推动心血管疾病的精准医疗,包括分子诊断、风险预测和新兴治疗应用 | 系统总结了NGS从单基因分析向综合遗传变异评估的转变,并讨论了长读长测序和单细胞测序等新技术的前景 | 未提供具体临床试验数据,主要基于现有文献综述,缺乏实证验证 | 探讨NGS在心血管疾病精准诊疗中的应用现状与未来方向 | 心血管疾病相关遗传变异及临床应用 | 机器学习 | 心血管疾病 | NGS,长读长测序,单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 734 | 2026-05-30 |
Molecular Target Discovery and Systemic Mechanism Analysis of Teriflunomide for Dry Eye Disease
2026-May-09, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48050492
PMID:42193097
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research paper | 采用整合计算与转录组学框架,包括ADMET分析、多数据集转录组整合及单细胞RNA测序,鉴定特立氟胺治疗干眼病的多靶点机制 | 首次应用虚拟细胞模型AetherCell模拟靶点扰动与药物诱导反应的吻合度,揭示特立氟胺通过协调多靶点调控发挥治疗作用的新机制 | NA | 探究特立氟胺治疗干眼病的分子靶点及系统机制 | 干眼病相关上皮细胞和免疫细胞 | machine learning | 干眼病 | 单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟 | AetherCell虚拟细胞模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 735 | 2026-05-30 |
SIRT1 in Cardiac Diseases: Molecular Mechanisms, Therapeutic Potential, and Future Directions
2026-May-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27104216
PMID:42196199
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综述 | 本文综述了SIRT1在多种心脏疾病中的分子机制、治疗潜力和未来研究方向 | 系统总结了SIRT1在心脏疾病中的多面保护作用及其双重角色,并整合了多组学和单细胞转录组学的前沿方法 | SIRT1的过度表达可能有害,需精确调控;心脏特异性靶向、NAD可用性优化及临床转化仍面临挑战 | 探讨SIRT1在心脏疾病中作为治疗靶点和生物标志物的潜力 | SIRT1及其在心肌缺血/再灌注损伤、心力衰竭、糖尿病心肌病、心脏肥大、衰老相关心功能障碍和昼夜节律紊乱中的作用 | NA | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 736 | 2026-05-30 |
Unfolding Immune Dysregulation in COPD: Identification of a Three-Gene Signature and Functional Validation of TCF7 in Human Lung Tissue and T Lymphocytes
2026-May-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27104231
PMID:42196213
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研究论文 | 通过机器学习识别COPD免疫失调的三基因标志物,并在人体肺组织和T淋巴细胞中验证TCF7的功能 | 首次鉴定出TCF7、EGR1和NFKB1三种基因作为COPD免疫失调的标志物,并验证了TCF7在T细胞中的关键调控作用及其对caspase-8的影响 | 未提及具体限制 | 揭示COPD的免疫失调机制并识别潜在生物标志物和治疗靶点 | COPD患者和健康对照的肺组织、T淋巴细胞及巨噬细胞 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | qRT-PCR, ELISA, Western blotting, 免疫荧光 | 机器学习模型 | 转录组数据、单细胞RNA-seq数据 | 未明确提及样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 737 | 2026-05-30 |
BART-spatial unravels biologically significant transcriptional regulators from spatial omics data
2026-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.05.723027
PMID:42146333
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研究论文 | 开发了一种名为BART-spatial的计算方法,用于从空间组学数据中推断功能性的转录调控因子 | BART-spatial创新性地整合了空间变异性与伪时间信息,结合公开的转录调控因子结合谱数据,能够从空间转录组学和表观组学数据中识别低表达的转录调控因子,弥补了现有工具忽视空间异质性的不足 | 未提及 | 开发一种能够从空间组学数据中推断功能性转录调控因子的计算方法 | 空间组学数据中的转录调控因子 | 机器学习 | NA | 空间转录组学,空间表观组学 | BART-spatial | 空间组学数据 | 多个空间数据集,涵盖10X Visium、Visium HD、Atera和空间RNA-ATAC-seq等平台 | 10x Genomics, Atera | 空间转录组学,空间表观组学 | 10x Visium, Visium HD, Atera, 空间RNA-ATAC-seq | NA |
| 738 | 2026-05-30 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling Uncovers a Metastasis-Associated MUCL3+ Signet-Ring Cell Subpopulation in Gastric Cancer
2026-May-08, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15100857
PMID:42193868
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示胃癌中与转移相关的MUCL3阳性印戒细胞亚群 | 首次鉴定出MUCL3作为胃印戒细胞癌特异性标志物,并发现TFF1与胃癌细胞迁移相关 | 未明确说明局限性 | 比较胃印戒细胞癌与胃腺癌,寻找生物标志物并阐明印戒细胞癌侵袭行为的分子机制 | 胃印戒细胞癌和胃腺癌患者的手术切除原发胃癌组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 手术切除的原发胃癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 739 | 2026-05-30 |
Systematic clustering alignment and feature characterization for single-cell omics using ACE-OF-Clust
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.09.710668
PMID:41959377
|
研究论文 | ACE-OF-Clust实现单细胞组学数据的系统性聚类对齐与特征表征 | 引入直接比较聚类解决方案、评估与标注的一致性,并利用特征级聚类剖面优先区分细胞类型的基因,同时评估基因集对聚类模式的贡献 | NA | 解决单细胞聚类中的聚类对齐问题,提高聚类结果的可解释性、灵活性和鲁棒性 | 单细胞转录组数据(scRNA-seq)和空间转录组(ST)数据,包括PBMC scRNA-seq和乳腺癌ST数据,以及多组学单细胞数据 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学单细胞测序 | 混合成员聚类模型 | 基因表达数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、单细胞多组学 | NA | NA |
| 740 | 2026-05-30 |
Cellular Origins and Context-Dependent Prognostic Effects of Lactate Metabolism Genes Reveal Novel Molecular Subtypes in Gastric Cancer
2026-May-04, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48050477
PMID:42193082
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研究论文 | 通过乳酸代谢相关基因揭示胃癌新型分子亚型及其细胞起源和背景依赖性预后效应 | 首次通过单细胞RNA-seq整合分析,揭示乳酸代谢关键基因HK2和FABP4在不同细胞类型中的起源,并发现FABP4的预后效应具有背景依赖性,颠覆了传统预后模型固定效应的认知 | 跨平台预后模型验证失败,表明单队列来源的特征具有局限性;需要更多外部队列验证FABP4的细胞起源依赖性功能 | 解析胃癌异质性中乳酸代谢重编程的贡献,重点关注关键基因的细胞来源和背景特异性功能 | 胃癌患者肿瘤样本(TCGA队列375例)及单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 共识聚类 | 基因表达数据 | 375例胃癌患者样本(TCGA) | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |