单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
721	2025-04-22	JAK3 A573V and JAK3 M511I mutations in peripheral T-cell lymphoma mediating resistance to anti-PD-1 therapy through the STAT3/PD-L1 pathway 2025-Apr-08, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2024-010783 PMID:40199606	research paper	该研究探讨了JAK3 A573V和JAK3 M511I突变通过STAT3/PD-L1通路介导外周T细胞淋巴瘤对抗PD-1治疗的耐药性	首次系统地描绘了r/r PTCL患者的全面突变谱，并揭示了JAK3突变通过STAT3/PD-L1通路导致抗PD-1治疗耐药的新机制	研究样本量相对有限（109例患者），且主要关注JAK3突变，可能忽略了其他潜在耐药机制	阐明外周T细胞淋巴瘤对抗PD-1治疗耐药的生物学决定因素	复发/难治性外周T细胞淋巴瘤（r/r PTCL）患者	肿瘤免疫学	外周T细胞淋巴瘤	靶向下一代测序（440个癌症相关基因）、单细胞转录组学、Western blotting、流式细胞术	JAK3突变模型（Jurkat和BA/F3细胞系）、JAK3突变同源小鼠模型	基因组数据、转录组数据、蛋白质表达数据	109例r/r PTCL患者
722	2025-04-22	Genome-coverage single-cell histone modifications for embryo lineage tracing 2025-Apr, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-08656-1 PMID:40011786	研究论文	本文开发了一种名为TACIT的方法，用于在小鼠早期胚胎中进行基因组覆盖的单细胞组蛋白修饰分析，并结合单细胞RNA测序数据绘制了单细胞分辨率的表观遗传景观	开发了TACIT方法，首次实现了基因组覆盖的单细胞七种组蛋白修饰分析，并结合机器学习鉴定了全能性基因调控网络	研究仅限于小鼠早期胚胎，尚未在人类或其他物种中验证	探索早期胚胎发育过程中的单细胞表观遗传重编程和细胞命运决定机制	小鼠早期胚胎	发育生物学	NA	TACIT（靶向染色质索引和标签化）、单细胞RNA测序、CRISPR激活	机器学习模型	表观遗传组数据、转录组数据	小鼠早期胚胎（具体数量未明确说明）
723	2025-04-22	RETRACTION: Exploring Wound Management in Dental Pulp: Utilizing Single-Cell RNA Sequencing for Global Transcriptomic Analysis in Healthy and Inflamed Pulpal Tissues 2025-Apr, International wound journal IF:2.6Q1 DOI:10.1111/iwj.70539 PMID:40251782	撤稿声明	该文章因同行评审过程存在问题而被撤稿	NA	同行评审过程被破坏，导致文章被撤稿	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
724	2025-04-22	Adhesion-Assisted Antioxidant-Engineered Mesenchymal Stromal Cells for Enhanced Cardiac Repair in Myocardial Infarction 2025-03-25, ACS nano IF:15.8Q1 DOI:10.1021/acsnano.5c00820 PMID:40073336	research paper	该研究通过化学修饰间充质基质细胞（MSC）增强其在心肌梗死（MI）治疗中的存活率和修复效果	使用抗VCAM1和多巴胺（PD）化学修饰MSC，显著提高细胞存活率并促进心脏修复	研究仅在大鼠模型中进行，尚未在人体中验证	提高MSC在心肌梗死治疗中的疗效	间充质基质细胞（MSC）和心肌梗死（MI）大鼠模型	细胞治疗	心肌梗死	化学修饰、单细胞RNA测序	NA	NA	大鼠模型
725	2025-04-22	Single-Cell Proteomic Characterization of Drug-Resistant Prostate Cancer Cells Reveals Molecular Signatures Associated with Morphological Changes 2025-Mar-14, Molecular & cellular proteomics : MCP IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.mcpro.2025.100949 PMID:40090465	研究论文	本研究通过单细胞蛋白质组学技术揭示了耐药前列腺癌细胞的蛋白质组特征及其与形态变化的关联	采用优化的高通量数据非依赖采集(DIA)方法进行单细胞蛋白质组分析，平均每个细胞鉴定超过1300种蛋白质，并发现与细胞大小变化密切相关的蛋白质亚群	NA	探索前列腺癌耐药细胞的分子特征及其生物学行为	前列腺癌耐药细胞(DRCs)和亲本PC3细胞	蛋白质组学	前列腺癌	单细胞蛋白质组学(SCP)、数据非依赖采集(DIA)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	蛋白质组数据、RNA测序数据	NA
726	2025-04-22	Resolving the spatial and cellular architecture of intra-tumor heterogeneity by multi-region dissection of lung adenocarcinoma 2025-Feb-22, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao DOI:10.1016/j.jgg.2025.02.006 PMID:39993622	research paper	通过多区域解剖肺腺癌，解析肿瘤内异质的空间和细胞结构	揭示了肺腺癌中两种癌细胞亚群（Cancer_c1和Cancer_c2）的空间分布及其与免疫细胞的相互作用机制	研究仅基于空间转录组学和单细胞RNA测序数据，未涉及其他分子层面的验证	解析肺腺癌肿瘤微环境的空间异质性及其对肿瘤进展和免疫逃逸的驱动机制	肺腺癌（LUAD）的多区域活检样本（肿瘤核心、肿瘤边缘和正常区域）	digital pathology	lung cancer	spatial transcriptomics (ST), single-cell RNA-sequencing (scRNA-seq)	NA	spatial transcriptomics data, single-cell RNA-seq data	多区域肺腺癌活检样本（具体数量未明确说明）
727	2025-04-22	Integrative machine learning approach for identification of new molecular scaffold and prediction of inhibition responses in cancer cells using multi-omics data 2025-Jan-15, Briefings in functional genomics IF:2.5Q3 DOI:10.1093/bfgp/elaf006 PMID:40251828	研究论文	本研究利用多组学数据和机器学习方法，识别新的分子支架并预测癌细胞中的抑制反应	结合机器学习和多组学数据（包括单细胞RNA-seq数据）来预测药物反应，并识别新的潜在先导化合物	研究为计算机模拟（in silico）工作，尚未进行临床验证	提高癌症治疗的个性化和有效性，设计新的靶向癌症治疗药物	癌细胞系（特别是对Idasanutlin有反应的细胞系）和ChEMBL数据库中的化合物	机器学习	癌症	多组学数据分析、单细胞RNA-seq、分子对接和动力学研究	机器学习模型（具体类型未明确说明）	多组学数据、单细胞RNA-seq数据	未明确说明具体样本数量，但涉及多个癌细胞系和ChEMBL数据库中的化合物
728	2025-04-22	Understanding developing kidneys and Wilms tumors one cell at a time 2025, Current topics in developmental biology DOI:10.1016/bs.ctdb.2024.11.005 PMID:40254343	review	本文综述了单细胞测序技术在正常肾脏发育和Wilms肿瘤研究中的应用及其技术选择	总结了当前可用的单细胞测序技术，并讨论了它们在肾脏发育和Wilms肿瘤研究中的应用及技术组合的潜力	未提及具体实验数据或样本量的限制	探讨单细胞测序技术在肾脏发育和Wilms肿瘤研究中的应用	正常肾脏发育和Wilms肿瘤	生物医学	Wilms肿瘤	单细胞测序	NA	单细胞数据	NA
729	2025-04-22	Nanoceria-Mediated Cyclosporin A Delivery for Dry Eye Disease Management through Modulating Immune-Epithelial Crosstalk 2024-04-30, ACS nano IF:15.8Q1 DOI:10.1021/acsnano.3c11514 PMID:38632691	research paper	该研究开发了一种基于纳米酶的滴眼液，用于通过调节免疫-上皮细胞间的相互作用来治疗干眼病	开发了具有长期抗氧化和抗炎能力的纳米酶滴眼液，通过再生活性氧清除能力和持续释放环孢素A来打破氧化应激-炎症的恶性循环	NA	开发一种新型干眼病治疗方法，通过调节角膜微环境中的免疫-上皮细胞相互作用	干眼病(DED)患者	纳米医学	干眼病	流式细胞术、单细胞测序	NA	实验数据	NA
730	2025-04-22	Interleukin-1β polarization in M1 macrophage mediates myocardial fibrosis in diabetes 2024-Apr-20, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.111858 PMID:38492336	研究论文	本研究探讨了M1巨噬细胞通过白细胞介素-1β（IL-1β）与成纤维细胞相互作用介导糖尿病心肌纤维化的机制	揭示了M1巨噬细胞通过IL-1β与成纤维细胞相互作用在糖尿病心肌纤维化中的关键作用	研究主要基于db/db小鼠模型，人类样本的验证尚未进行	探究巨噬细胞在糖尿病心肌纤维化中的机制	db/db小鼠的心脏组织、巨噬细胞、成纤维细胞和内皮细胞	糖尿病研究	糖尿病心肌病	超声心动图、Masson三色染色、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	db/db小鼠模型	基因表达数据、图像数据	db/db小鼠的心脏组织样本
731	2025-04-22	KRT19 is a Promising Prognostic Biomarker and Associates with Immune Infiltrates in Serous Ovarian Cystadenocarcinoma 2023, International journal of general medicine IF:2.1Q2 DOI:10.2147/IJGM.S419235 PMID:37916194	research paper	该研究通过生物信息学分析探讨了KRT19在浆液性卵巢囊腺癌中的预后价值和与免疫浸润的关联	首次揭示了KRT19作为浆液性卵巢囊腺癌预后生物标志物的潜力及其与肿瘤免疫细胞浸润的相关性	研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证	探索KRT19在卵巢癌中的生物学功能和临床意义	浆液性卵巢囊腺癌患者样本	digital pathology	ovarian cancer	生物信息学分析（TCGA、GTEx、GEO、HPA数据库）	NA	基因表达数据	多个公共数据库中的卵巢癌样本（具体数量未明确说明）
732	2025-04-21	Development and validation of a transcription factor regulatory network-based signature for individualized prognostic risk in lung adenocarcinoma 2025-Jun-15, International journal of cancer IF:5.7Q1 DOI:10.1002/ijc.35375 PMID:39960662	研究论文	本研究开发并验证了一个基于转录因子调控网络的签名（scGPS），用于肺腺癌（LUAD）患者的个体化预后风险评估	利用单细胞RNA测序数据构建了上皮细胞特异性转录因子调控网络，并从中提取了3521个基因对作为预后签名，相较于现有基因签名具有更优的预后分层能力	研究依赖于多个数据集的整合分析，可能存在批次效应或数据异质性问题	开发可靠的肺腺癌预后签名以实现风险分层	肺腺癌患者	数字病理	肺癌	scRNA-seq, bulk RNA-seq, 微阵列	scGPS（单细胞基因对签名）	基因表达数据	来自23个LUAD队列的2740名患者，包括1个scRNA-seq数据集、5个bulk RNA-seq数据集和17个微阵列数据集
733	2025-04-21	Propionate alleviates diabetes-induced cardiac fibrosis in mice via regulating Serpinf1 2025-May-05, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151641 PMID:40203653	研究论文	本研究探讨了丙酸盐对糖尿病小鼠心脏纤维化的治疗作用及其机制	发现丙酸盐通过上调Serpinf1基因表达，抑制Wnt信号通路的异常激活，从而改善糖尿病心脏纤维化	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床试验中验证	研究丙酸盐对糖尿病心脏纤维化的治疗作用及机制	糖尿病小鼠模型和原代小鼠心脏成纤维细胞	心血管疾病	糖尿病心肌病	单细胞RNA测序、shRNA敲除实验	小鼠模型	基因表达数据、组织学数据	未明确说明小鼠数量
734	2025-04-21	Single-cell RNA sequencing highlights the role of proinflammatory fibroblasts, vascular endothelial cells, and immune cells in the keloid immune microenvironment 2025-May, International journal of dermatology IF:3.5Q1 DOI:10.1111/ijd.17516 PMID:39450923	研究论文	通过单细胞RNA测序分析瘢痕疙瘩和健康皮肤组织，揭示了促炎性成纤维细胞、血管内皮细胞和免疫细胞在瘢痕疙瘩免疫微环境中的作用	首次揭示了促炎性成纤维细胞和血管内皮细胞在瘢痕疙瘩免疫微环境中的关键作用，并提供了潜在的治疗靶点	样本量较小（3个瘢痕疙瘩和2个健康皮肤样本），且依赖公共数据库数据进行外部验证	探索瘢痕疙瘩免疫微环境中细胞的功能状态及其在疾病发展中的作用	瘢痕疙瘩和健康皮肤组织中的细胞	数字病理	瘢痕疙瘩	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	3个瘢痕疙瘩和2个健康皮肤样本
735	2025-04-21	Skin organoid transplantation promotes tissue repair with scarless in frostbite 2025-Apr-18, Protein & cell IF:13.6Q1 DOI:10.1093/procel/pwae055 PMID:39363875	research paper	该研究探讨了皮肤类器官移植在促进冻伤无疤痕组织修复中的应用	首次构建了人诱导多能干细胞(hiPSC)来源的皮肤类器官结合明胶水凝胶用于冻伤治疗，并揭示了其通过调控整合素α5β1-FAK通路减少纤维化疤痕形成的机制	研究仅在鼠模型中进行，尚未进行人体临床试验	开发一种促进冻伤无疤痕愈合的新型治疗方法	冻伤小鼠模型和hiPSC来源的皮肤类器官	再生医学	冻伤	单细胞转录组学	鼠模型	基因表达数据	未明确说明具体样本数量
736	2025-04-21	Progesterone signaling in oviductal epithelial cells modulates the immune response to support preimplantation embryonic development 2025-Apr-18, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adt6113 PMID:40249812	研究论文	本研究探讨了孕酮信号在输卵管上皮细胞中对免疫反应的调节作用及其对胚胎植入前发育的影响	揭示了孕酮受体在输卵管上皮细胞中的表达对胚胎发育的重要性，并发现通过抑制炎症可以挽救胚胎发育延迟	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证	理解孕酮信号在早期妊娠中的作用，特别是对胚胎植入前发育的影响	输卵管上皮细胞和小鼠胚胎	生殖生物学	妊娠失败	单细胞RNA测序	小鼠模型	基因表达数据	未明确提及具体样本数量，但涉及小鼠输卵管上皮细胞和胚胎
737	2025-04-21	Single-cell RNA sequencing of human double-negative T cells reveals a favorable cellular signature for cancer therapy 2025-Apr-17, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2024-010684 PMID:40246580	研究论文	通过单细胞RNA测序和功能分析，揭示了人类双阴性T细胞在癌症治疗中的独特细胞特征	首次通过单细胞RNA测序比较了双阴性T细胞（DNTs）与常规Vδ2 T细胞的转录组和功能差异，揭示了DNTs独特的细胞组成和功能特征	研究仅针对健康供体的细胞进行分析，未涉及患者样本	探究双阴性T细胞（DNTs）在癌症治疗中的生物学特性和潜在优势	健康供体来源的双阴性T细胞（DNTs）和Vδ2 T细胞	免疫治疗	白血病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术，异种移植模型	NA	RNA测序数据，流式细胞数据	健康供体来源的细胞样本
738	2025-04-21	Hypoxia-induced Wnt5a-secreting fibroblasts promote colon cancer progression 2025-Apr-17, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-58748-9 PMID:40246836	研究论文	本研究揭示了Wnt5a在结肠癌进展中的作用机制，特别是其在低氧诱导的炎症性成纤维细胞中的表达及其对肿瘤微环境的影响	首次发现Wnt5a在低氧诱导的炎症性成纤维细胞中表达，并通过抑制血管生成维持低氧环境，进而促进结肠癌进展	研究主要基于小鼠模型和单细胞RNA-seq数据，人类样本的直接验证有限	探究Wnt5a在结肠癌进展中的作用及其机制	结肠癌及其微环境中的成纤维细胞和内皮细胞	癌症生物学	结肠癌	单细胞RNA-seq	小鼠结肠癌模型	RNA-seq数据	人类和小鼠结肠成纤维细胞的单细胞RNA-seq数据
739	2025-04-21	MIRO1 mutation leads to metabolic maladaptation resulting in Parkinson's disease-associated dopaminergic neuron loss 2025-Apr-17, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1 DOI:10.1038/s41540-025-00509-x PMID:40246848	研究论文	本文利用携带MIRO1 p.R272Q突变的患者特异性iPSC来源的中脑类器官，探讨了多巴胺能神经元退化的细胞和分子机制	揭示了MIRO1 p.R272Q突变通过影响多巴胺能神经元的发育路径和代谢缺陷，破坏神经元-星形胶质细胞代谢互作，从而导致其丢失的新机制	研究仅基于iPSC来源的类器官模型，未在动物模型或更多患者样本中验证	探究MIRO1突变导致帕金森病相关多巴胺能神经元丢失的分子机制	携带MIRO1 p.R272Q突变的iPSC来源中脑类器官	神经退行性疾病研究	帕金森病	单细胞RNA测序(scRNAseq)和代谢建模	iPSC来源的中脑类器官模型	基因表达数据和代谢数据	NA
740	2025-04-21	Single-cell sequencing systematically analyzed the mechanism of Emdogain on the restoration of delayed replantation periodontal membrane 2025-Apr-17, International journal of oral science IF:10.8Q1 DOI:10.1038/s41368-024-00345-5 PMID:40246878	研究论文	本研究通过单细胞测序技术系统分析了Emdogain（EMD）在延迟再植牙周膜修复中的作用机制	首次在单细胞分辨率下揭示了EMD促进牙周膜修复的细胞和分子机制，并发现了Vtn+成纤维细胞的关键作用	研究仅在大鼠模型中进行，尚未在人体验证	探究EMD在延迟再植牙周膜修复中的作用机制	大鼠延迟再植牙模型	数字病理学	牙周疾病	单细胞测序、Micro-CT、HE染色、TRAP染色、免疫荧光染色	动物模型	单细胞转录组数据、影像数据	大鼠延迟再植牙模型（具体数量未说明）