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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2025-10-05 |
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveal Keratinocytes as Key Players in Vulvar Lichen Sclerosus Pathogenesis
2025-Aug-29, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.08.022
PMID:40886965
|
研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组学技术揭示角化细胞在外阴硬化性苔藓发病机制中的核心作用 | 首次整合空间和单细胞转录组学技术系统分析外阴硬化性苔藓,发现角化细胞在疾病中的双重作用机制 | 未明确说明样本规模和具体技术平台细节 | 阐明外阴硬化性苔藓的分子发病机制 | 病变、非病变和健康的外阴皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 722 | 2025-10-05 |
APOBEC3B Promotes SARS-CoV-2 Through Activation of PKR/eIF2⍺ and AMPD2 Dysregulation
2025-Aug-28, Viruses
DOI:10.3390/v17091176
PMID:41012606
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研究论文 | 本研究揭示APOBEC3B通过激活PKR/eIF2α通路和调控AMPD2表达促进SARS-CoV-2感染 | 首次发现A3B在严重COVID-19患者中过表达并通过双重机制促进病毒感染的机制 | 不同细胞系中机制存在差异,具体分子机制仍需进一步阐明 | 探究APOBEC3B在SARS-CoV-2感染中的作用机制 | 严重COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液细胞、Caco-2细胞、A549-ACE2细胞 | 生物医学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 基因敲低 | Transformer | 基因表达数据 | 严重与轻度COVID-19患者的BALF细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 723 | 2025-10-05 |
IL-6-Mediated Neurogenic Inflammation Regulated by the Dorsal Root Ganglion Macrophages Exacerbates Imiquimod-Induced Psoriasis-Like Skin Lesions in Mice
2025-Aug-08, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.07.018
PMID:40784595
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研究论文 | 本研究揭示了背根神经节神经元通过IL-6介导神经源性炎症加剧银屑病样皮肤病变的机制 | 首次发现外周神经系统是IL-6的重要来源,并阐明神经元与巨噬细胞通过IL-1β/MAPK信号通路相互调控的神经免疫机制 | 研究仅限于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究神经免疫相互作用在银屑病发病机制中的具体作用 | 小鼠背根神经节组织和银屑病样皮肤病变 | 神经免疫学 | 银屑病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠背根神经节组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 724 | 2025-10-05 |
Perturb-seq reveals distinct responses to pluripotency regulator dosages underlying the control of self-renewal and differentiation
2025-Aug-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.07.669196
PMID:41031011
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研究论文 | 本研究通过Perturb-seq技术揭示了多能性调控因子剂量对自我更新和分化控制的独特响应模式 | 首次系统性地定量研究关键转录因子剂量梯度对hESC表型的影响,发现谱系特异性基因的非单调响应模式 | 研究仅限于hESC模型,未验证其他细胞类型;CRISPRi可能产生脱靶效应 | 研究转录因子表达水平梯度如何影响细胞表型 | 人类胚胎干细胞(hESCs) | 单细胞基因组学 | NA | CRISPR干扰(CRISPRi), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 定量模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 725 | 2025-10-05 |
Spatial determinants of tumor cell dedifferentiation and plasticity in primary cutaneous melanoma
2025-Jun-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.21.660851
PMID:40667360
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研究论文 | 本研究通过整合多重循环免疫荧光成像、空间转录组学和传统组织学技术,探索早期皮肤黑色素瘤中肿瘤细胞去分化和空间异质性的决定因素 | 首次在早期黑色素瘤中系统揭示肿瘤可塑性和空间异质性的微环境决定因素,展示了从单个癌症到微区域再到单细胞水平的多尺度变异性 | 研究样本仅限于早期原发性皮肤黑色素瘤,对其他类型或晚期黑色素瘤的适用性有待验证 | 识别与早期黑色素瘤中肿瘤细胞去分化和真皮侵袭相关的空间决定因素 | 早期原发性皮肤黑色素瘤组织 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 循环免疫荧光成像, 空间转录组学, 传统组织学 | NA | 图像, 空间转录组数据, 组织学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 726 | 2025-10-05 |
Deep learning inference of cell type-specific gene expression from breast tumor histopathology
2025-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.04.652089
PMID:41030996
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研究论文 | 开发了一种从乳腺癌组织病理学全玻片图像直接预测细胞类型特异性基因表达的深度学习工具 | 首次实现直接从常规组织病理学图像预测细胞类型特异性基因表达,无需进行单细胞或批量RNA测序 | 在9种细胞类型中仅对癌症相关成纤维细胞、癌细胞和髓系细胞的预测效果最佳 | 开发低成本、快速的细胞类型特异性基因表达推断方法 | 乳腺癌组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 深度学习,单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 深度学习模型 | 全玻片图像,基因表达数据 | TCGA乳腺癌队列和160例独立队列 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 727 | 2025-10-05 |
Niche Macrophages Recycle Iron to Tumor Cells and Foster Erythroblast Mimicry to Promote Bone Metastasis and Anemia
2025-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.23.650120
PMID:41031013
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研究论文 | 本研究揭示了骨髓转移微环境中巨噬细胞通过铁循环促进肿瘤生长和贫血的新机制 | 发现VCAM1+CD163+CCR3+巨噬细胞在骨转移微环境中被肿瘤细胞劫持用于铁获取,并首次报道肿瘤细胞通过模仿红系细胞产生血红蛋白的适应性机制 | 人类样本验证仍需进一步扩展,具体分子调控通路需要更深入研究 | 探究骨转移与贫血之间的机制联系及肿瘤微环境中细胞互作 | 骨髓转移微环境中的巨噬细胞、肿瘤细胞和红系细胞 | 单细胞生物学 | 乳腺癌骨转移 | 单细胞RNA测序, 微环境标记 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 728 | 2025-10-05 |
The transcription factor HHEX maintains glucocorticoid levels and protects adrenals from androgen-induced lipid depletion
2025-Apr-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6248794/v1
PMID:40321776
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现HHEX转录因子在肾上腺糖皮质激素生成细胞中富集,并揭示其在维持糖皮质激素水平和保护肾上腺免受雄激素诱导脂质耗竭中的关键作用 | 首次鉴定HHEX为糖皮质激素生成细胞中最富集的转录因子,并阐明其作为雄激素受体靶基因在肾上腺性别二态性和脂质代谢中的新功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类肾上腺中的相关机制仍需进一步验证 | 探索维持肾上腺皮质糖皮质激素生成细胞分化响应能力的分子机制 | 小鼠肾上腺皮质类固醇生成谱系细胞 | 单细胞生物学 | 肾上腺功能障碍 | 单细胞RNA测序 | 遗传小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 729 | 2025-10-05 |
Chronic inflammation deters natural killer cell fitness and cytotoxicity in myeloid leukemia
2025-Feb-25, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024014592
PMID:39571169
|
研究论文 | 本研究探讨慢性炎症如何通过TNFα信号通路损害自然杀伤细胞功能,从而影响慢性髓系白血病的免疫监视 | 首次在CML模型中系统揭示TNFα诱导的炎症信号通过上调Cish等检查点基因抑制NK细胞功能的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限,需要进一步临床研究确认治疗潜力 | 阐明慢性髓系白血病微环境中NK细胞功能受损的分子机制 | 慢性髓系白血病小鼠模型、健康供体NK细胞、CML患者样本 | 免疫学 | 慢性髓系白血病 | 单细胞RNA测序、体外功能实验 | 嵌合BCR::ABL1+ CML小鼠模型 | 基因表达数据、功能实验数据 | CML小鼠模型、健康供体NK细胞、未治疗CML患者血浆样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 730 | 2025-10-05 |
Identifying differentiation markers between dermal fibroblasts and adipose-derived mesenchymal stromal cells (AD-MSCs) in human visceral and subcutaneous tissues using single-cell transcriptomics
2025-Feb-11, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04185-w
PMID:39934849
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研究论文 | 通过单细胞转录组学鉴定人内脏和皮下组织中真皮成纤维细胞与脂肪来源间充质基质细胞的区分标志物 | 首次使用单细胞RNA测序技术在同一供体的不同组织中系统比较AD-MSCs和成纤维细胞的转录组差异 | 样本来源相对有限,所有组织样本来自同一批供体 | 鉴定能够区分脂肪来源间充质基质细胞和成纤维细胞的分子标志物 | 人皮下和内脏脂肪组织中的AD-MSCs以及皮肤成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 定量PCR | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据, qPCR数据 | 来自同一供体的皮下脂肪组织、内脏脂肪组织和皮肤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 731 | 2025-10-05 |
Mechanism of enhancing chemotherapy efficacy in pancreatic ductal adenocarcinoma with paricalcitol and hydroxychloroquine
2025-Jan-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101881
PMID:39730001
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研究论文 | 本研究探讨帕立骨化醇和羟氯喹联合治疗增强胰腺导管腺癌化疗效果的分子机制 | 首次揭示帕立骨化醇和羟氯喹联合吉西他滨通过调节自噬和ER应激通路增强胰腺癌化疗敏感性的机制 | 研究样本量有限,需要更大规模的临床试验验证 | 阐明帕立骨化醇和羟氯喹联合治疗增强胰腺导管腺癌对吉西他滨化疗敏感性的分子机制 | 胰腺导管腺癌细胞、原位小鼠模型、患者来源异种移植模型和临床试验患者样本 | 肿瘤学研究 | 胰腺癌 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据、细胞表型数据 | 体外细胞模型、动物模型和临床试验配对活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 732 | 2025-10-05 |
Function value of basement membrane-related genes in odontogenic keratocyst by bioinformatics analysis
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1658125
PMID:41018070
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研究论文 | 通过生物信息学分析基底膜相关基因在牙源性角化囊肿中的功能价值 | 首次通过单细胞RNA测序定位SPARC基因在牙源性角化囊肿基质成纤维细胞中的特异性高表达,并揭示其与免疫微环境的相互作用 | 样本量较小(12例OKC和4例正常对照),需要更大规模研究验证 | 探讨基底膜相关基因在牙源性角化囊肿发病机制中的作用 | 牙源性角化囊肿组织和正常口腔黏膜组织 | 生物信息学 | 牙源性角化囊肿 | 转录组测序,单细胞RNA测序,免疫组织化学,免疫荧光 | 生物信息学分析 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 12例非综合征性牙源性角化囊肿和4例正常口腔黏膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 733 | 2025-10-05 |
GADD45G as a novel prognostic biomarker and therapeutic target in glioma: integrative analysis of bulk and single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1608710
PMID:41018072
|
研究论文 | 本研究通过整合分析bulk和单细胞RNA测序数据,探讨GADD45G在胶质瘤中的预后价值及其作为治疗靶点的潜力 | 首次系统性地整合多组学数据揭示GADD45G在胶质瘤中的预后价值,并通过单细胞分辨率分析其在胶质母细胞瘤细胞亚群中的表达模式 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证GADD45G的具体作用机制 | 探索GADD45G在胶质瘤中的预后意义和治疗潜力 | 胶质瘤患者样本和胶质瘤细胞系 | 生物信息学 | 胶质瘤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, Western blot | Cox回归模型, Kaplan-Meier生存分析, Spearman相关分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 来自TCGA、TARGET、GTEx、CGGA和GEO等多个数据库的胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 734 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA profiling of colorectal granular-type laterally spreading tumor uncovers progression trajectory toward carcinoma and transcriptional signatures favoring lateral morphogenesis
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1552841
PMID:41018078
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究结直肠颗粒型侧向发育型肿瘤的转录特征及其向癌变的进展轨迹 | 首次在单细胞水平揭示LST-Gs的化生分化特征及其与肿瘤进展的关联,发现Arp2/3复合物在高度分化细胞中的显著上调 | 样本量有限,研究主要关注转录组层面,缺乏功能性验证实验 | 阐明结直肠颗粒型侧向发育型肿瘤的形态发生机制和向癌发展的进化轨迹 | 结直肠颗粒型侧向发育型肿瘤、突起型腺瘤和正常黏膜组织 | 单细胞测序 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 735 | 2025-10-05 |
Predicting the prognosis of hepatocellular carcinoma based on genes related to polyamine metabolism
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19985
PMID:41018906
|
研究论文 | 基于多胺代谢相关基因构建肝细胞癌预后预测模型 | 首次基于多胺代谢相关基因对肝细胞癌进行分子分型并构建预后预测模型 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 开发肝细胞癌预后预测模型并探索潜在治疗靶点 | 肝细胞癌患者和HuH-7细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, CCK8实验, 伤口愈合实验, Transwell实验 | Cox回归, Lasso回归, 列线图 | 基因表达数据, 临床数据 | 公共数据库中的肝细胞癌样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 736 | 2025-10-05 |
Characterization of cancer-related fibroblasts in bladder cancer and construction of CAFs-based bladder cancer classification: insights from single-cell and multi-omics analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1580986
PMID:41019085
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研究论文 | 通过单细胞和多组学分析表征膀胱癌中癌症相关成纤维细胞并构建基于CAFs的膀胱癌分类 | 首次系统鉴定膀胱癌中10个不同的CAF亚群,并建立基于pCAFs的膀胱癌分子分型系统 | 样本量有限,需要进一步实验验证各亚型的临床适用性 | 探索膀胱癌中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用 | 膀胱癌组织和其中的癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习算法 | 机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 737 | 2025-10-05 |
PLK2 as a key regulator of glycolysis and immune dysregulation in polycystic ovary syndrome
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1610713
PMID:41019094
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析,发现PLK2是多囊卵巢综合征中糖酵解和免疫失调的关键调控因子 | 首次将PLK2确立为PCOS中内皮细胞糖酵解的核心调控基因,并揭示其通过NF-κB和IL-17信号通路促进慢性炎症和卵巢纤维化的机制 | 研究主要基于动物模型和生物信息学分析,需要进一步临床验证 | 阐明多囊卵巢综合征中卵巢基质细胞糖酵解失调的分子机制 | 多囊卵巢综合征患者和DHEA诱导的PCOS大鼠模型 | 生物信息学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫浸润分析, 功能富集分析 | Seurat, CellChat, CIBERSORT, ESTIMATE, ssGSEA | 基因表达数据 | 三个独立的批量RNA-seq数据集和DHEA诱导的PCOS大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 738 | 2025-10-05 |
A splicing-based multitissue association study of joint transcriptomes identified susceptibility genes for osteoarthritis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1590008
PMID:41019096
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研究论文 | 通过跨组织和单组织转录组关联分析结合单细胞测序技术,鉴定骨关节炎易感基因LTBP1及其在软骨细胞分化中的调控作用 | 首次整合跨组织/单组织TWAS分析与单细胞测序数据,系统揭示LTBP1基因通过TGF-β和Notch信号通路参与骨关节炎发病的新机制 | 未明确说明样本规模及具体测序平台技术细节 | 鉴定骨关节炎的易感基因并阐明其功能机制 | 骨关节炎相关遗传位点及LTBP1基因 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞测序, 转录组关联分析(TWAS), 全基因组关联研究(GWAS) | UTMOST, FUSION, MAGMA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 739 | 2025-10-05 |
Spatial and single-cell transcriptomics capture two distinct cell states in soybean defense response to Phakopsora pachyrhizi infection
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1637176
PMID:41019740
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研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组技术揭示大豆对亚洲大豆锈病病原体感染的两种不同细胞状态及其空间分布模式 | 首次结合空间转录组和单核转录组技术揭示植物免疫反应的空间协调性,发现感染区域与周边区域存在不同的防御反应状态 | 仅针对大豆-Phakopsora pachyrhizi互作系统,其他植物-病原体系统的普适性有待验证 | 解析植物对病原体感染的空间防御反应机制 | 大豆植株及其对Phakopsora pachyrhizi病原体感染的响应 | 植物生物学 | 植物病害 | 空间转录组学, 单核RNA测序, 基因共表达网络分析 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 740 | 2025-10-05 |
Dissecting and validation the biomarker of heart failure progression in patients with atherosclerosis by single-cell sequencing, bioinformatics, and machine learning
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1587274
PMID:41019764
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和转录组数据,结合机器学习方法鉴定动脉粥样硬化向心力衰竭进展的早期生物标志物 | 首次整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,结合三种机器学习算法鉴定CD48作为AS向HF进展的潜在生物标志物 | 研究基于公共数据库数据,需要实验验证;样本来源和数量有限 | 识别动脉粥样硬化向心力衰竭进展的早期生物标志物及潜在机制 | 动脉粥样硬化患者向心力衰竭进展的转录组数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 机器学习 | LASSO, Random Forest, SVM-RFE | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE28829, GSE57345等),包含2828个心脏相关基因 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 人类细胞图谱(HCL)平台 |