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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2026-03-03 |
Spatially resolved airway niches: mapping epithelial-immune microenvironments in asthma
2026-Mar, Expert review of respiratory medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/17476348.2025.2582244
PMID:41146609
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综述 | 本文综述了空间组学技术在哮喘研究中的应用,揭示了气道壁中上皮-免疫微环境的分子特征及其在疾病异质性和治疗反应中的作用 | 整合了多种空间组学技术(如Visium-HD、Xenium、CosMx SMI等)的数据,首次系统性地绘制了哮喘气道中IL-13富集的杯状细胞中心、肥大细胞-平滑肌环路等特定微环境,并强调了这些空间信息在传统解离分析中被忽略 | 临床广泛应用仍需降低检测成本、减少RNA扩散、统一FFPE工作流程,并需要在全球队列中进行多组学整合以提高可重复性和临床可操作性 | 通过空间组学技术解析哮喘气道中上皮-免疫微环境的分子构成与空间分布,以推动精准医疗发展 | 人类气道活检样本、离体肺切片以及小鼠哮喘模型 | 空间转录组学 | 哮喘 | 空间转录组学、多重成像蛋白质组学、空间代谢组学 | NA | 空间组学数据(转录组、蛋白质组、代谢组) | NA | 10x Genomics, NanoString, Bruker, Fluidigm, Ionpath | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间代谢组学 | Visium-HD, Xenium, CosMx SMI, MERFISH, Imaging Mass Cytometry, MIBI, MALDI-MSI | Visium-HD(空间转录组学), Xenium(原位基因表达), CosMx SMI(单分子成像), MERFISH(多重误差鲁棒荧光原位杂交), Imaging Mass Cytometry(成像质谱流式), MIBI(多重离子束成像), 高分辨率MALDI-MSI(基质辅助激光解吸电离质谱成像) |
| 722 | 2026-03-03 |
Single cell RNA-seq characterization of non-fibrotic stromal wound repopulation in the rabbit
2026-Mar, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110816
PMID:41421445
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,在兔模型中探究了非纤维化角膜基质伤口愈合过程中的转录变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了角膜基质细胞在非纤维化伤口愈合中的异质性及从静止态到成纤维细胞的连续转录轨迹 | 研究仅基于兔模型,结果可能不完全适用于人类;且仅关注了特定时间点(第7天和第28天)的转录变化 | 探究非纤维化角膜伤口愈合的分子机制,以预防角膜手术或损伤后的瘢痕形成 | 兔角膜基质细胞(包括静止态角膜细胞和伤口愈合过程中的成纤维细胞) | 单细胞转录组学 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 兔角膜组织样本(包括对照组和损伤后第7天、第28天的时间点) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 723 | 2026-03-03 |
Synovial fibroblast responses to different types of injury resulting in cartilage repair or osteoarthritis
2026-Mar, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.12.023
PMID:41490604
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研究论文 | 本研究通过整合分析小鼠关节损伤模型的单细胞RNA测序数据,比较了滑膜成纤维细胞对不同类型和持续时间关节损伤的响应 | 揭示了滑膜成纤维细胞在关节表面损伤和创伤后骨关节炎模型中的异质性响应,包括谱系特异性转录因子的共表达特征 | 基于已发表的scRNA-seq数据,可能受原始实验设计和样本量的限制 | 比较不同关节损伤模型中滑膜成纤维细胞的响应机制,以指导关节修复和骨关节炎的未来研究 | 小鼠滑膜成纤维细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个小鼠关节损伤模型的数据集(JSI、DMM、ACLR模型,包含不同时间点) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 724 | 2026-03-03 |
Experimental study of tumor-associated macrophage-derived SPP1 inhibit CD8+ T cells to promote Colorectal cancer progression
2026-Mar, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101276
PMID:41633116
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了肿瘤相关巨噬细胞(TAM)来源的分泌磷蛋白1(SPP1)通过抑制CD8⁺ T细胞向Tc1细胞分化,从而促进结直肠癌进展的机制 | 首次在结直肠癌中鉴定出一个高表达SPP1的独特TAM亚群,并阐明了TAM来源的SPP1通过CD44介导的信号通路抑制CD8⁺ T细胞功能的具体分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,其在人类结直肠癌患者中的临床相关性及转化潜力仍需进一步验证 | 探究肿瘤相关巨噬细胞在结直肠癌免疫微环境中的调控作用及其分子机制 | 结直肠癌(CRC)肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞(TAM)和CD8⁺ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学分析,体外共培养实验 | 小鼠结直肠癌模型(MC38细胞) | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 725 | 2026-03-03 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics to dissect mast-cell heterogeneity and arginine-metabolism-associated markers in BRCA
2026-Mar, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101281
PMID:41655499
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据,揭示了乳腺癌中肥大细胞的异质性,并识别了与精氨酸代谢相关的标志物,特别是OAT基因在促进乳腺癌侵袭性中的作用 | 首次将精氨酸代谢与肥大细胞异质性及功能特化联系起来,并整合多组学数据识别了与预后相关的HAS和LAS亚群,以及关键基因OAT的功能验证 | 研究主要基于公共数据集和体外实验,缺乏体内模型验证,且样本来源可能受批次效应影响 | 解析乳腺癌中肥大细胞的异质性及其与精氨酸代谢相关的功能标志物 | 乳腺癌组织中的肥大细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | Seurat, Monocle2, CellChat, hdWGCNA, LASSO-Cox, MiloR | 基因表达数据 | 272,592个细胞(来自GSE161529数据集),以及TCGA和GSE42568的批量RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 726 | 2026-03-03 |
The Poly(rC) binding protein 2 is required for spermatogenesis by regulating alternative splicing and mRNA stability
2026-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150796
PMID:41655928
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研究论文 | 本研究揭示了RNA结合蛋白PCBP2通过调控关键转录本的mRNA稳定性和选择性剪接,在精子发生过程中发挥不可或缺的作用 | 首次在体内阐明了PCBP2在精子发生中的功能,并发现其通过招募hnRNPU和DDX5形成复合物来协调减数分裂和精子形成相关基因的mRNA命运 | 研究主要基于小鼠模型,其在人类中的确切功能机制和临床转化潜力仍需进一步验证 | 探究PCBP2在精子发生过程中的功能及其在非梗阻性无精子症中的作用机制 | 小鼠生殖细胞、人类睾丸组织(来自非梗阻性无精子症患者) | 生殖生物学 | 男性不育症(非梗阻性无精子症) | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq (scRNA-seq), IP-MS, RIP-Seq | NA | RNA序列数据、蛋白质质谱数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 727 | 2026-03-03 |
Tamoxifen promotes metastasis of breast cancer via reshaping lipid-driven fibrotic microenvironments in the lung
2026-Mar, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101286
PMID:41666535
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研究论文 | 本研究揭示了长期使用他莫昔芬可能通过重塑肺部脂质驱动的纤维化微环境,促进雌激素受体阳性乳腺癌的肺转移 | 首次揭示长期他莫昔芬治疗通过改变肺部脂质代谢和纤维化微环境来促进乳腺癌肺转移的新机制,并提出了靶向脂质代谢作为潜在治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型(PyMT和4T1同种移植模型),人类临床相关性有待进一步验证 | 探究长期他莫昔芬治疗对乳腺癌肺转移微环境形成的影响及其机制 | 雌激素受体阳性乳腺癌及其肺转移微环境 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫荧光、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞表型数据 | PyMT和4T1小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 728 | 2026-03-03 |
Revealing the function and mechanism of piRNA-related genes in bladder cancer through single-cell sequencing and methylation analyses and construction of prognostic features based on consensus clustering
2026-Mar, Current urology
IF:0.9Q4
DOI:10.1097/CU9.0000000000000306
PMID:41668898
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和甲基化分析揭示了piRNA相关基因在膀胱癌中的功能和机制,并基于共识聚类构建了预后特征 | 首次结合单细胞测序、甲基化分析和共识聚类技术,系统性地探索piRNA相关基因在膀胱癌中的功能、机制及预后价值,并构建了一个包含MAPK13、INHBA和LAMB2的三基因预后模型 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏大规模的前瞻性临床队列验证,且对piRNA相关基因的具体调控网络和体内功能机制仍需进一步深入探索 | 探索PIWI-interacting RNA相关基因在膀胱癌发生发展中的功能、潜在机制及其预后价值 | 膀胱癌细胞和组织,以及相关的PIWI-interacting RNA相关基因 | 生物信息学与计算生物学 | 膀胱癌 | 单细胞测序,甲基化测序,差异甲基化位点测序,定量聚合酶链反应,共识聚类,机器学习 | 共识聚类,逻辑回归 | 基因表达数据,甲基化数据,单细胞测序数据 | 基于The Cancer Genome Atlas-Urothelial Bladder Carcinoma数据集,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq,甲基化测序 | NA | NA |
| 729 | 2026-03-03 |
Single-cell transcriptome analysis reveals a cellular immune response in common carp (Cyprinus carpio) infected with Aeromonas hydrophila
2026-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150936
PMID:41692207
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,全面探究了鲤鱼在感染嗜水气单胞菌后,其关键免疫器官头肾中的细胞免疫应答机制,特别关注了巨噬细胞在细胞水平的异质性、分化及分子调控网络 | 首次在鲤鱼中应用单细胞RNA测序技术,系统揭示了感染嗜水气单胞菌后头肾中巨噬细胞的异质性、分化轨迹和分子调控网络,为理解鱼类细胞免疫应答提供了新的视角 | NA | 探究鲤鱼在感染嗜水气单胞菌后的细胞免疫应答机制 | 鲤鱼(Cyprinus carpio)的头肾组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 730 | 2026-03-03 |
Evolutionary convergence and divergence of hippocampal cytoarchitecture between rodents and primates revealed by single-cell spatial transcriptomics
2026-Mar, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwaf595
PMID:41768547
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研究论文 | 本研究通过单细胞空间转录组学分析,揭示了啮齿动物与灵长类海马体细胞结构的进化趋同与差异 | 首次利用单细胞空间转录组学技术,跨物种比较了猕猴、狨猴和小鼠海马体的转录组图谱,发现了灵长类特异性和层状特异性的谷氨酸能细胞类型,以及GABA能细胞的进化富集 | 研究主要基于转录组数据,功能验证相对有限;样本物种数量较少,可能未涵盖所有相关进化分支 | 探究海马体细胞类型和空间分布的跨物种进化模式,为理解海马体功能演化提供分子和细胞基础 | 猕猴、狨猴和小鼠的海马体组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞空间转录组学分析, 单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据, RNA-seq数据 | 多个物种(猕猴、狨猴、小鼠)的海马体样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞空间转录组学, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 731 | 2026-03-03 |
Single-cell advances in the investigation of the pathogenesis and treatment of brain metastasis
2026-Mar, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdaf108
PMID:41769415
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综述 | 本文综述了近年来应用单细胞RNA测序技术研究脑转移瘤的进展,重点关注肿瘤异质性、肿瘤微环境以及治疗反应 | 系统总结了单细胞RNA-seq技术在脑转移瘤研究中的应用,整合了多个研究对肿瘤细胞转录特征、免疫细胞变化及微环境组成的发现 | 作为综述文章,未提出新的实验数据或模型,主要依赖现有研究的整合与分析 | 总结单细胞技术如何增进对脑转移瘤发病机制的理解,并探讨其对未来治疗策略的启示 | 脑转移瘤及其微环境中的肿瘤细胞、免疫细胞、血管细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 脑转移瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 732 | 2026-03-03 |
Pitfalls in analysis and interpretation of single-cell RNA-seq data in cancer
2026-Mar, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdaf047
PMID:41769412
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综述 | 本文讨论了癌症研究中单细胞和单核RNA测序数据分析的常见陷阱及其克服方法 | 系统性地识别并总结了癌症sc/snRNA-seq分析中的常见错误,包括统计分析、染色体畸变推断、轨迹分析和基于特征的批量RNA-seq数据分析中的潜在问题 | 作为一篇综述,未提供新的实验数据或具体案例分析,主要基于现有文献和经验进行讨论 | 旨在帮助研究人员避免单细胞RNA测序数据分析中的常见错误,提高分析质量和结果解释的可靠性 | 癌症研究中的单细胞和单核RNA测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 733 | 2026-03-03 |
Redefining the immune microenvironment of gliomas in the era of single-cell genomics
2026-Mar, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdaf087
PMID:41769417
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综述 | 本文回顾了单细胞基因组学时代下对胶质瘤肿瘤免疫微环境(TIME)的重新定义,并探讨了其对开发有效免疫疗法的影响 | 利用单细胞RNA测序等单细胞技术,系统性地重新定义了胶质瘤的免疫微环境,强调了非恶性细胞及其与癌细胞相互作用的重要性 | 本文为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有研究进行总结和展望 | 总结单细胞基因组学对胶质瘤肿瘤免疫微环境(TIME)的研究进展,并探索其对免疫疗法开发的启示 | 胶质瘤的肿瘤免疫微环境(TIME),包括恶性细胞和非恶性细胞(如免疫细胞) | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 734 | 2026-03-03 |
Current landscape of single-cell genomics in meningioma
2026-Mar, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdaf133
PMID:41769414
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综述 | 本文综述了单细胞基因组学在脑膜瘤研究中的当前应用与未来机遇 | 整合了单细胞测序技术、空间分辨数据和功能基因组学方法,以单细胞分辨率全面研究脑膜瘤的转录组和表观基因组,揭示肿瘤内和肿瘤间的异质性 | NA | 探讨单细胞组学在脑膜瘤研究中的应用现状与未来发展方向 | 脑膜瘤 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据、表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 735 | 2026-03-03 |
Identification of GLDN+ odontogenic stem cells as crucial for human tooth development and regeneration
2026-Feb-28, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-025-00419-y
PMID:41760598
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序识别了人牙乳头中的GLDN+牙源性干细胞,并证实其在牙齿发育和再生中的关键作用 | 首次在人牙乳头中鉴定出GLDN+牙源性干细胞这一关键亚群,并揭示了其通过BMP5信号通路维持表型和功能的机制 | 研究主要基于体外和异位再生模型,在体功能验证和临床转化潜力仍需进一步探索 | 揭示人牙乳头细胞异质性,鉴定参与牙齿发育和再生的关键干细胞亚群 | 人牙乳头细胞 | 单细胞组学 | 牙科疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 736 | 2026-03-03 |
Mapping biology in space: from spatial transcriptomics platforms to analytical tools and databases
2026-Feb-28, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2026.01.034
PMID:41611568
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综述 | 本文系统总结了截至2025年9月的594个空间转录组学分析工具和77种相关技术,并开发了一个集成的数据库平台SpatialToolDB | 首次对空间转录组学领域的技术平台和分析工具进行了大规模系统性梳理和总结,并创建了一个持续更新的集成数据库平台SpatialToolDB,为技术选择和方法比较提供了数据驱动的基础 | 作为一篇综述文章,主要基于对现有文献和工具的总结,未提出新的实验方法或算法模型 | 总结空间转录组学领域的技术平台、分析工具和数据库,为研究人员选择合适的技术和分析策略提供指导 | 空间转录组学技术平台、分析工具和相关数据库 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 737 | 2026-03-03 |
Tumor-Educated Extracellular Vesicle-Derived LINC01116 Drives Non-Small Cell Lung Cancer Progression and Immunosuppression by Sponging miR-3614-5p to Upregulate ARHGAP1
2026-Feb-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116347
PMID:41764827
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研究论文 | 本研究探讨了细胞外囊泡来源的长链非编码RNA LINC01116通过海绵吸附miR-3614-5p上调ARHGAP1,从而促进非小细胞肺癌进展和免疫抑制的机制 | 首次揭示了肿瘤来源细胞外囊泡中的LINC01116通过ceRNA机制调控miR-3614-5p/ARHGAP1轴,影响肿瘤微环境中巨噬细胞极化,为NSCLC提供了新的预后标志物和治疗靶点 | 研究主要基于体外实验和动物模型,临床样本验证相对有限,且具体信号通路下游机制有待进一步阐明 | 探究细胞外囊泡来源lncRNA在非小细胞肺癌进展和肿瘤免疫微环境中的作用 | 非小细胞肺癌组织、患者血液来源细胞外囊泡、肺癌细胞系、巨噬细胞及小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 生物信息学分析、RNA pull-down、RIP、荧光素酶报告基因检测、单细胞RNA测序 | ceRNA网络模型 | 基因表达数据、RNA序列数据 | TCGA数据库数据及NSCLC患者血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 738 | 2026-03-03 |
Spatial transcriptomics and single-cell analysis reveal GSTO2-mediated protective networks in oral squamous cell carcinoma tumor microenvironment
2026-Feb-28, Oral oncology
IF:4.0Q2
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了GSTO2在口腔鳞状细胞癌肿瘤微环境中的保护性网络作用 | 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学,识别出GSTO2作为OSCC的遗传验证保护因子,并阐明了其通过代谢重编程和免疫细胞互作的空间组织机制 | 研究样本量相对有限,且主要基于观察性分析,功能验证实验可进一步扩展 | 探究口腔鳞状细胞癌的细胞异质性、代谢重编程及其与肿瘤进展和治疗反应的分子机制 | 口腔鳞状细胞癌样本 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, SMR分析, 功能富集, PPI网络分析, 分子对接, Co-IP | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据 | 50,667个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 739 | 2026-03-03 |
Identification of immune reconstitution and hematopoiesis restoration by scRNA-seq in bone marrow of multiple myeloma patients treated with high-dose melphalan following auto-HSCT
2026-Feb-27, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 740 | 2026-03-03 |
Step-by-Step Protocol for In Situ Profiling of RNA Subcellular Localization Using TATA-seq
2026-Feb-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5611
PMID:41769253
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TATA-seq的原位RNA亚细胞定位分析详细实验方案 | 开发了一种利用抗体靶向和T7启动子介导的线性扩增,对无膜细胞器内RNA进行原位、高灵敏度测序的新方法 | NA | 建立一种高效、直接的方法来检测和展示无膜细胞器内RNA的分布与多样性 | 无膜细胞器(如核斑、旁斑等)内的RNA | 空间转录组学 | NA | Target Transcript Amplification and Sequencing (TATA-seq) | NA | RNA测序数据 | 低输入样本(<10,000个细胞) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |