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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7341 - 7360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7341 | 2025-10-06 |
HiDDEN: a machine learning method for detection of disease-relevant populations in case-control single-cell transcriptomics data
2024-11-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53666-8
PMID:39487129
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研究论文 | 提出一种名为HiDDEN的机器学习方法，用于在病例对照单细胞转录组数据中检测疾病相关细胞群体 | 开发了能够细化病例对照标签以准确反映每个细胞扰动状态的计算方法，解决了标准分析方法在受影响细胞比例小或扰动强度弱时的局限性 | 方法验证主要基于模拟数据集和有限的实际应用案例，需要更多真实世界数据的进一步验证 | 检测病例对照单细胞转录组数据中细微的转录变化和疾病相关细胞群体 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤，脱髓鞘疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习方法 | 单细胞转录组数据 | 模拟数据集、人类多发性骨髓瘤前体条件数据集、小鼠脱髓鞘模型数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7342 | 2025-10-06 |
Prostaglandin E2-EP2/EP4 signaling induces immunosuppression in human cancer by impairing bioenergetics and ribosome biogenesis in immune cells
2024-11-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53706-3
PMID:39487111
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了前列腺素E2通过EP2/EP4受体信号通路损害肿瘤浸润免疫细胞的生物能量和核糖体生物合成，导致免疫抑制的机制 | 首次在人类癌症中系统阐明PGE2-EP2/EP4信号通路通过下调c-Myc和PGC-1，损害免疫细胞的氧化磷酸化、糖酵解和核糖体蛋白合成，从而抑制抗肿瘤免疫的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据，需要在更多人类癌症类型中验证；机制研究尚未完全揭示所有下游信号通路 | 探究前列腺素E2在肿瘤微环境中诱导免疫抑制的具体分子机制 | 人类癌症和雌性小鼠同系肿瘤中浸润的免疫细胞，包括CD8 T细胞和巨噬细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类癌症和雌性小鼠肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7343 | 2025-10-06 |
Synergistic effects of mTOR inhibitors with VEGFR3 inhibitors on the interaction between TSC2-mutated cells and lymphatic endothelial cells
2025-Jun, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2760-4
PMID:39862344
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研究论文 | 本研究探讨TSC2突变细胞与淋巴管内皮细胞的相互作用机制，以及mTOR抑制剂与VEGFR3抑制剂联合治疗的协同效应 | 首次揭示mTOR抑制剂与VEGFR3抑制剂联合使用对TSC2突变疾病治疗的协同作用 | 体外实验可能无法完全模拟体内复杂环境，需要进一步临床验证 | 探索淋巴管平滑肌瘤病（LAM）的新型治疗策略 | TSC2缺失细胞和淋巴管内皮细胞（LECs） | 分子生物学 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞测序，异种移植模型 | NA | 基因表达数据，细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7344 | 2025-10-06 |
Mechanistic insights into Hippo-YAP pathway activation for enhanced DFU healing
2025-Jun-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.01067.2024
PMID:40261295
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序揭示了TFAP2A-LIFR-Hippo-YAP信号轴在调控巨噬细胞M2极化及促进糖尿病足溃疡愈合中的新机制 | 首次发现TFAP2A通过调控LIFR表达和激活Hippo-YAP信号通路诱导巨噬细胞M2极化的免疫调节新功能 | NA | 探究TFAP2A-LIFR-Hippo-YAP信号轴在糖尿病足溃疡愈合中的作用机制 | 糖尿病足溃疡样本中的免疫细胞，特别是巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 体外实验, 小鼠模型 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7345 | 2025-10-06 |
Pathway Enrichment-Based Unsupervised Learning Identifies Novel Subtypes of Cancer-Associated Fibroblasts in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2025-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00705-7
PMID:40272703
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研究论文 | 提出基于通路富集的无监督学习方法识别胰腺导管腺癌中癌症相关成纤维细胞新亚型 | 开发了scPathClus方法，通过通路富集而非基因表达进行单细胞聚类，克服了scRNA-seq数据中dropout事件的影响 | 方法仅在胰腺导管腺癌数据中进行验证，尚未在其他癌症类型中测试 | 开发新的单细胞聚类方法并识别胰腺癌中癌症相关成纤维细胞的新亚型 | 胰腺导管腺癌中的癌症相关成纤维细胞 | 单细胞分析 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组分析，伪时间分析，批量转录组分析 | 社区检测，无监督学习 | 单细胞基因表达数据，空间转录组数据，批量转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7346 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals alterations to cellular dynamics and paracrine signaling in radiation-induced muscle pathology
2025-Jun-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00115.2025
PMID:40316295
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示辐射诱导肌肉病理中细胞动态变化和旁分泌信号传导的改变 | 首次使用单细胞RNA测序技术描述辐射暴露后骨骼肌微环境中的转录变化，揭示FAP细胞呈现促纤维化和衰老转录组特征 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究辐射治疗引起骨骼肌萎缩和纤维化的潜在机制 | 小鼠辐射模型中的骨骼肌细胞 | 单细胞转录组学 | 肌肉病理 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠辐射模型在照射后24小时和56天的时间点 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7347 | 2025-10-06 |
Stromal heterogeneity in the adult lung delineated by single-cell genomics
2025-Jun-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00285.2025
PMID:40353369
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综述 | 通过单细胞基因组学技术揭示成年肺间质细胞的异质性特征 | 整合多研究数据证明肺间质细胞异质性在不同研究中具有保守性，并通过空间分析确定各亚群在肺组织中的独特解剖位置 | NA | 概述单细胞RNA测序研究揭示的肺间质细胞异质性 | 成年肺组织中的间质细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7348 | 2025-10-06 |
Super-resolution imaging informed scRNA sequencing analysis reveals the critical role of GDF15 in rejuvenating aged hematopoietic stem cells
2025-Jun, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000236
PMID:40416726
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研究论文 | 本研究通过超分辨率成像与单细胞RNA测序相结合，揭示了GDF15在衰老造血干细胞线粒体形态调控中的关键作用 | 首次将活细胞超分辨率显微镜与单细胞RNA测序技术整合，发现了GDF15介导线粒体信号和形态影响造血干细胞命运的新机制 | 样本量相对较小（约200个HSCs） | 探索衰老造血干细胞中线粒体形态变化的分子和细胞机制 | 年轻和衰老小鼠的造血干细胞 | 单细胞分析 | 衰老相关疾病 | 超分辨率显微镜, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | 聚类分析 | 显微镜图像, 单细胞基因表达数据 | 约200个造血干细胞（来自年轻和衰老小鼠） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7349 | 2025-05-28 |
Author Correction: Left atrial single-cell transcriptomics reveals amphiregulin as a surrogate marker for atrial fibrillation
2025-May-26, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08195-5
PMID:40419725
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7350 | 2025-10-06 |
An inducible mouse model of osteogenesis imperfecta type V reveals aberrant osteogenesis caused by Ifitm5 c.-14C>T mutation
2025-May-24, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjaf022
PMID:39908237
|
研究论文 | 本研究通过构建可诱导的Ifitm5 c.-14C>T突变小鼠模型，揭示了V型成骨不全症的致病机制 | 首次开发了可诱导的Ifitm5 c.-14C>T突变小鼠模型，克服了以往模型胚胎致死的问题，并整合单细胞转录组分析 | 研究主要聚焦于小鼠模型，人类临床转化的适用性仍需进一步验证 | 探究V型成骨不全症中MALEP-IFITM5蛋白的致病机制 | Ifitm5 c.-14C>T突变小鼠模型 | 遗传学 | 成骨不全症 | 单细胞RNA测序，Cre-loxP诱导系统 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据，组织学数据 | 多种Cre品系的Ifitm5突变小鼠（Prx1-Cre、Col1a1-Cre、Ocn-Cre） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7351 | 2025-10-06 |
Unraveling the significance of cuproptosis in hepatocellular carcinoma heterogeneity and tumor microenvironment through integrated single-cell sequencing and machine learning approaches
2025-May-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02696-9
PMID:40411678
|
研究论文 | 通过整合单细胞测序和机器学习方法揭示铜死亡在肝细胞癌异质性和肿瘤微环境中的重要性 | 首次系统性地将铜死亡与HCC细胞亚群异质性联系起来，并构建了基于铜死亡相关基因的风险评分模型和预后列线图 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要进一步实验验证 | 探索铜死亡在肝细胞癌异质性和肿瘤微环境中的作用机制 | 肝细胞癌患者单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 | 生物信息学, 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习 | LASSO回归, Cox回归, WGCNA, 风险评分模型 | 基因表达数据, 临床数据 | 来自GEO、TCGA和ICGC数据库的多个队列样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7352 | 2025-10-06 |
Prognostic model identification of ribosome biogenesis-related genes in pancreatic cancer based on multiple machine learning analyses
2025-May-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02733-7
PMID:40411705
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研究论文 | 本研究通过多机器学习分析识别胰腺癌中核糖体生物合成相关基因的预后模型 | 首次系统筛选胰腺癌中核糖体生物合成相关预后基因并构建九基因风险模型，结合单细胞RNA测序验证关键基因表达模式 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证机制 | 探索核糖体生物合成在胰腺癌中的分子机制并开发预后预测模型 | 胰腺癌患者基因表达数据 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，机器学习算法 | Cox回归，机器学习算法 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的胰腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | GSE155698数据集 |
| 7353 | 2025-10-06 |
Compromised efferocytosis during aging is related to COVID-19 severity in mice
2025-May-24, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2025.05.008
PMID:40419113
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研究论文 | 本研究通过建立衰老小鼠COVID-19模型，揭示了衰老个体中胞葬作用受损与COVID-19严重程度的相关机制 | 首次在衰老小鼠模型中证明SARS-CoV-2感染导致胞葬作用受损，并阐明其与过度炎症反应的关联 | 研究基于小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究衰老个体中COVID-19病情加重的免疫机制 | 年轻和衰老小鼠的肺组织免疫细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻和衰老小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7354 | 2025-10-06 |
Controlling Human Stem Cell-Derived Islet Composition Using Magnetic Sorting
2025-May-21, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.29030
PMID:40400171
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研究论文 | 本研究开发了一种通过磁激活细胞分选技术富集干细胞衍生胰岛中功能性β细胞的方法 | 首次使用CD49a标记通过磁分选技术控制干细胞衍生胰岛的细胞组成，显著提高了β细胞比例和功能 | 研究主要关注CD49a标记的富集效果，对其他细胞类型的影响和长期安全性需要进一步验证 | 改善干细胞衍生胰岛的细胞组成和功能，提高其治疗1型糖尿病的疗效 | 人类多能干细胞衍生的胰岛细胞 | 细胞生物学 | 1型糖尿病 | 磁激活细胞分选，单细胞RNA测序，免疫染色 | NA | 基因表达数据，蛋白质表达数据 | 人类多能干细胞衍生的胰岛细胞，移植到糖尿病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7355 | 2025-10-06 |
AI-Driven Multiscale Study on the Mechanism of Polygonati Rhizoma in Regulating Immune Function in STAD
2025-May-20, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c00981
PMID:40415801
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研究论文 | 本研究通过AI驱动的多尺度分析方法揭示了黄精在胃腺癌中调节免疫功能的分子机制 | 首次结合AI驱动的网络药理学、生物信息学和单细胞RNA测序技术系统研究黄精在STAD中的多靶点免疫调节机制 | 研究主要基于计算预测和体外实验，需要进一步的体内实验和临床研究验证 | 探索黄精在胃腺癌中调节肿瘤免疫微环境的多靶点作用机制 | 黄精活性成分、胃腺癌细胞系HGC-27、消化系统肿瘤的单细胞数据 | 生物信息学 | 胃腺癌 | 单细胞RNA测序,网络药理学,分子对接,分子动力学模拟 | 机器学习算法 | 基因表达数据,单细胞数据 | 5589个免疫相关基因,18个重叠差异表达基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7356 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing in Incontinentia Pigmenti With Neonatal Encephalopathy Reveals Broad Immune Activation Moderated by Steroids
2025-May, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200358
PMID:40020213
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究色素失禁症伴新生儿脑病患者的免疫激活状态及类固醇治疗的影响 | 首次在单个色素失禁症新生儿患者中应用单细胞RNA测序技术，揭示类固醇治疗对免疫激活的调节作用 | 研究仅基于单个病例(n=1)，样本量有限 | 探究色素失禁症伴新生儿脑病的细胞特异性基因表达及类固醇治疗机制 | 色素失禁症新生儿患者与健康对照幼儿 | 单细胞测序 | 色素失禁症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 1例IP患者(治疗前后) + 1例健康对照，共20,411个细胞 | HIVE | 单细胞RNA-seq | HIVE单细胞系统 | HIVEsingle-cell system |
| 7357 | 2025-10-06 |
An integrated machine learning model of transcriptomic genes in multi-center chronic obstructive pulmonary disease reveals the causal role of TIMP4 in airway epithelial cell
2025-Apr-23, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03238-1
PMID:40269868
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研究论文 | 本研究通过整合多中心COPD转录组数据，开发了13基因模型并鉴定TIMP4为关键致病基因 | 首次通过多中心数据整合和机器学习方法识别出与COPD发病机制相关的核心基因集，并验证TIMP4在纤毛细胞中的致病作用 | 研究样本来源仅限于两个中心，功能验证仍处于初步阶段 | 识别COPD发病机制中独立于患者变异性的核心基因集 | COPD患者肺组织样本和原代人气道上皮细胞 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | 加权基因共表达网络分析，机器学习，孟德尔随机化，单细胞测序 | 基因表达模型 | 转录组测序数据 | 来自两个中心的COPD患者肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7358 | 2025-10-06 |
Piezo1-Mediated Calcium Flux Transfers Mechanosignal to Yes-Associated Protein to Stimulate Matrix Production in Keloid
2025-Apr-18, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.03.039
PMID:40254148
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研究论文 | 本研究揭示了Piezo1通过钙流调控YAP核转位促进瘢痕疙瘩基质产生的机械信号传导机制 | 首次发现Piezo1/钙流/YAP信号轴在瘢痕疙瘩机械信号传导中的关键作用，并验证其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未进行临床试验验证 | 探索机械力诱导瘢痕疙瘩形成的分子机制 | 人源瘢痕疙瘩成纤维细胞和患者来源的瘢痕疙瘩异种移植模型 | 分子生物学 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞转录组分析, 原子力显微镜, 钙离子荧光指示剂, 免疫荧光染色, 转录组学 | NA | 基因表达数据, 生物力学数据, 影像数据 | 人源瘢痕疙瘩成纤维细胞和正常皮肤成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 7359 | 2025-10-06 |
A single-cell RNA sequencing dataset of peripheral blood cells in long COVID patients on herbal therapy
2025-Jan-30, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-04510-1
PMID:39885244
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研究论文 | 本研究提供了一个关于长新冠患者在接受草药治疗后外周血细胞的单细胞RNA测序数据集 | 首次提供了针对长新冠患者草药治疗前后免疫细胞群体的单细胞转录组数据资源 | 对草药治疗长新冠的有效性和安全性理解仍然有限 | 深入理解草药在长新冠管理中的作用 | 长新冠患者的外周血细胞 | 单细胞转录组学 | 长新冠 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 181,205个通过质量控制的细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7360 | 2025-10-06 |
A quantitative prediction method utilizing whole omics data for biosensing
2025-01-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-84323-1
PMID:39870652
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研究论文 | 开发了一种利用全组学数据进行生物传感的定量预测方法OmicSense | 使用高斯混合模型作为概率分布，能够准确预测每个生物标志物的目标变量，对背景噪声具有鲁棒性且不会过拟合 | NA | 开发一种能够充分利用组学数据构建生物标志物的定量预测方法 | 转录组、代谢组和微生物组数据集 | 机器学习 | NA | 全组学数据分析 | 高斯混合模型 | 组学数据 | NA | NA | 单细胞转录组测序, 代谢组学, 微生物组学 | NA | NA |