单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7321 - 7340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7321 | 2025-10-06 |
Interactions between cancer cells and immune cells drive transitions to mesenchymal-like states in glioblastoma
2021-06-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2021.05.002
PMID:34087162
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验揭示了巨噬细胞通过分泌oncostatin M诱导胶质母细胞瘤细胞向间充质样状态转变的机制 | 首次系统阐明巨噬细胞通过OSM-STAT3信号通路驱动胶质母细胞瘤细胞向间充质亚型转变的细胞间相互作用机制 | 研究主要关注巨噬细胞与肿瘤细胞的相互作用，对其他免疫细胞类型的影响可能未完全阐明 | 解析胶质母细胞瘤中间充质亚型的形成机制及其与肿瘤微环境的相互作用 | 人类胶质母细胞瘤肿瘤样本和模型系统中的癌细胞与免疫细胞 | 单细胞测序分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 体外和体内功能实验 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7322 | 2025-10-06 |
Genomic sequencing of single microbial cells from environmental samples
2008-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2008.05.006
PMID:18550420
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综述 | 本文综述了环境样本中单微生物细胞基因组测序的研究策略与实验方法 | 无需培养即可直接从单个微生物细胞进行基因组测序，突破了传统微生物研究的限制 | 多重置换扩增可能无法完整回收细菌单拷贝基因组，且在DNA扩增过程中可能发生序列重排 | 开发和应用单细胞基因组测序技术以研究环境样本中的微生物 | 环境样本中的单个微生物细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞基因组测序，多重置换扩增 | NA | 基因组DNA序列 | 多个大型测序中心的数据，单细胞基因组回收率通常>70% | NA | 单细胞基因组测序 | NA | NA |
| 7323 | 2025-10-06 |
Decellularised Amniotic Membrane for the Neurogenic Expression of Human Mesenchymal Stem Cells
2025-Jun, Journal of biomedical materials research. Part B, Applied biomaterials
DOI:10.1002/jbm.b.35588
PMID:40424302
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研究论文 | 本研究探讨脱细胞羊膜促进人间充质干细胞神经源性分化的能力及其在周围神经病变修复中的应用 | 首次结合空间转录组学与网络药理学分析脱细胞羊膜对干细胞神经分化的诱导机制 | 未明确说明样本数量及动物模型的具体细节 | 研究脱细胞羊膜诱导干细胞神经分化以促进神经再生的能力 | 人间充质干细胞和脱细胞羊膜 | 组织工程与再生医学 | 周围神经病变 | 免疫荧光染色、细胞粘附实验、活/死细胞染色、空间转录组测序、网络药理学分析 | NA | 基因表达数据、图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7324 | 2025-10-06 |
Targeting Ferroptosis Alleviates Pulmonary Arterial Hypertension, Insights from Transcriptomic and Experimental Analyses
2025-May-28, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202500001
PMID:40432432
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研究论文 | 本研究通过转录组学和实验分析探讨铁死亡在肺动脉高压发病机制中的作用 | 首次揭示铁死亡是肺动脉高压内皮细胞损伤的关键机制，并发现HIF1α信号在铁死亡诱导中的重要作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类患者中验证 | 研究铁死亡在肺动脉高压发展中的作用及其分子机制 | 肺动脉高压患者和小鼠模型 | 生物医学 | 肺动脉高压 | 转录组测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,组织学数据 | PAH患者和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7325 | 2025-10-06 |
Single-cell targeted transcriptomics reveals subset-specific immune signatures differentiating asymptomatic and cardiac patients with chronic Chagas disease
2025-May-28, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf269
PMID:40434116
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研究论文 | 通过单细胞靶向转录组学揭示慢性恰加斯病患者不同临床亚型的免疫特征差异 | 首次应用免疫基因靶向单细胞RNA测序技术比较无症状和心脏型慢性恰加斯病患者的免疫细胞特征 | 研究样本量有限，仅分析外周血单个核细胞 | 揭示慢性恰加斯病不同临床形式的免疫机制和疾病标志物 | 无症状(IND)和心脏型(CCC)慢性恰加斯病患者的免疫细胞 | 单细胞组学 | 恰加斯病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | IND和CCC患者的外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 免疫基因靶向单细胞RNA测序 |
| 7326 | 2025-05-29 |
Author Correction: Single-cell transcriptomics analysis reveals dynamic changes and prognostic signature in tumor microenvironment of PDAC
2025-May-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-02747-9
PMID:40425739
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7327 | 2025-10-06 |
[New technologies serve as accelerators for breakthroughs in modern acupuncture research]
2025-May-25, Zhen ci yan jiu = Acupuncture research
DOI:10.13702/j.1000-0607.20250380
PMID:40390610
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综述 | 系统回顾现代针灸研究发展历程，探讨不同时期技术对针灸研究的推动作用 | 强调新兴技术（单细胞测序、空间转录组学、神经影像、人工智能等）在未来针灸研究中的重要作用 | NA | 探讨技术发展对现代针灸研究的推动作用 | 针灸研究发展历程与技术应用 | NA | NA | 电生理技术、生化技术、单细胞测序、空间转录组学、神经影像、人工智能 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 7328 | 2025-10-06 |
A regulatory variant rs9379874 in T1D risk region 6p22.2 affects BTN3A1 expression regulating T cell function
2025-May, Acta diabetologica
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s00592-024-02389-9
PMID:39417845
|
研究论文 | 本研究通过功能基因组学方法鉴定了6p22.2区域中影响BTN3A1表达的功能性变异rs9379874及其在1型糖尿病发病机制中的作用 | 首次在6p22.2风险区域鉴定出功能性变异rs9379874，揭示其通过结合FOXA1调控BTN3A1表达影响T细胞功能的机制 | rs4320356变异与胰岛功能或自身免疫无显著关联，研究未完全阐明所有临床特征的遗传基础 | 揭示6p22.2风险区域与1型糖尿病亚群及相关临床特征的关联，鉴定该区域的致病变异和靶基因 | 2608例1型糖尿病患者和4814例健康对照，来自中国东部、中部和南部地区 | 功能基因组学 | 1型糖尿病 | GWAS, 生物信息学分析, 双荧光素酶报告基因检测, eQTL分析, 单细胞RNA测序分析 | NA | 基因分型数据, 表达数据, 表观遗传数据 | 7422个样本（2608例患者+4814例对照） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7329 | 2025-10-06 |
Immune-featured stromal niches associate with response to neoadjuvant immunotherapy in oral squamous cell carcinoma
2025-Mar-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102024
PMID:40107247
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学分析口腔鳞状细胞癌患者对免疫治疗的应答机制 | 首次在口腔鳞癌中揭示免疫特征性基质微环境与免疫治疗应答的关联，发现SELP高内皮微静脉和APOD肌成纤维细胞在免疫化疗应答者中特异性上调 | 样本量较小（22例患者），且为单中心研究 | 探究肿瘤基质细胞在口腔鳞癌免疫治疗应答中的作用机制 | 22例口腔鳞状细胞癌患者的配对肿瘤标本 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 22例患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7330 | 2025-10-06 |
Neuroinflammatory pathways and potential therapeutic targets in neonatal post-hemorrhagic hydrocephalus
2025-Mar, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-024-03733-z
PMID:39725707
|
综述 | 本文综述了新生儿出血后脑积水的神经炎症通路分子机制及潜在治疗靶点 | 系统整合了神经炎症通路、免疫介质和表观遗传机制在PHH中的作用，并评估了基于干细胞的创新疗法 | 新型疗法在新生儿群体中的安全性及其对大脑发育的潜在影响尚未完全明确 | 探讨PHH的病理生理机制并评估新兴治疗方法 | 早产儿出血后脑积水及其分子机制 | NA | 新生儿脑积水 | 全基因组/外显子组测序, 蛋白质组学, 表观遗传学, 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 7331 | 2025-10-06 |
Tissue-resident memory CD8 T cell diversity is spatiotemporally imprinted
2025-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08466-x
PMID:39843748
|
研究论文 | 本研究揭示了小肠组织中驻留记忆CD8 T细胞多样性的空间印记机制 | 开发了计算方法来捕获细胞沿小肠三个解剖轴的位置，并可视化细胞类型和基因表达的时空分布 | NA | 探索组织驻留记忆CD8 T细胞多样性的起源和空间分布机制 | 人类样本和小鼠急性系统性病毒感染模型中的病原体特异性T细胞 | 空间转录组学 | 病毒感染 | 空间转录组学，单转录本分辨率分析，光学编码基因扰动策略 | NA | 空间转录组数据，基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7332 | 2025-10-06 |
A comprehensive spatio-cellular map of the human hypothalamus
2025-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08504-8
PMID:39910307
|
研究论文 | 通过整合单核测序和空间转录组学技术，构建了人类下丘脑的综合空间细胞转录图谱HYPOMAP | 首次创建了人类下丘脑的空间细胞转录图谱，发现人与小鼠在特定神经元类型和GPCR表达水平上的显著差异，并识别出与BMI相关的新基因CORO1A | 研究主要基于转录组数据，功能验证和机制研究相对有限 | 构建人类下丘脑的细胞组成和空间分布图谱，探索其与代谢疾病的关联 | 人类下丘脑细胞 | 空间转录组学 | 代谢疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 433,369个下丘脑细胞 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7333 | 2025-10-06 |
HiDDEN: a machine learning method for detection of disease-relevant populations in case-control single-cell transcriptomics data
2024-11-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53666-8
PMID:39487129
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研究论文 | 提出一种名为HiDDEN的机器学习方法，用于在病例对照单细胞转录组数据中检测疾病相关细胞群体 | 开发了能够细化病例对照标签以准确反映每个细胞扰动状态的计算方法，解决了标准分析方法在受影响细胞比例小或扰动强度弱时的局限性 | 方法验证主要基于模拟数据集和有限的实际应用案例，需要更多真实世界数据的进一步验证 | 检测病例对照单细胞转录组数据中细微的转录变化和疾病相关细胞群体 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤，脱髓鞘疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习方法 | 单细胞转录组数据 | 模拟数据集、人类多发性骨髓瘤前体条件数据集、小鼠脱髓鞘模型数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7334 | 2025-10-06 |
Prostaglandin E2-EP2/EP4 signaling induces immunosuppression in human cancer by impairing bioenergetics and ribosome biogenesis in immune cells
2024-11-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53706-3
PMID:39487111
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了前列腺素E2通过EP2/EP4受体信号通路损害肿瘤浸润免疫细胞的生物能量和核糖体生物合成，导致免疫抑制的机制 | 首次在人类癌症中系统阐明PGE2-EP2/EP4信号通路通过下调c-Myc和PGC-1，损害免疫细胞的氧化磷酸化、糖酵解和核糖体蛋白合成，从而抑制抗肿瘤免疫的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据，需要在更多人类癌症类型中验证；机制研究尚未完全揭示所有下游信号通路 | 探究前列腺素E2在肿瘤微环境中诱导免疫抑制的具体分子机制 | 人类癌症和雌性小鼠同系肿瘤中浸润的免疫细胞，包括CD8 T细胞和巨噬细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类癌症和雌性小鼠肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7335 | 2025-10-06 |
Synergistic effects of mTOR inhibitors with VEGFR3 inhibitors on the interaction between TSC2-mutated cells and lymphatic endothelial cells
2025-Jun, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2760-4
PMID:39862344
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研究论文 | 本研究探讨TSC2突变细胞与淋巴管内皮细胞的相互作用机制，以及mTOR抑制剂与VEGFR3抑制剂联合治疗的协同效应 | 首次揭示mTOR抑制剂与VEGFR3抑制剂联合使用对TSC2突变疾病治疗的协同作用 | 体外实验可能无法完全模拟体内复杂环境，需要进一步临床验证 | 探索淋巴管平滑肌瘤病（LAM）的新型治疗策略 | TSC2缺失细胞和淋巴管内皮细胞（LECs） | 分子生物学 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞测序，异种移植模型 | NA | 基因表达数据，细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7336 | 2025-10-06 |
Mechanistic insights into Hippo-YAP pathway activation for enhanced DFU healing
2025-Jun-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.01067.2024
PMID:40261295
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序揭示了TFAP2A-LIFR-Hippo-YAP信号轴在调控巨噬细胞M2极化及促进糖尿病足溃疡愈合中的新机制 | 首次发现TFAP2A通过调控LIFR表达和激活Hippo-YAP信号通路诱导巨噬细胞M2极化的免疫调节新功能 | NA | 探究TFAP2A-LIFR-Hippo-YAP信号轴在糖尿病足溃疡愈合中的作用机制 | 糖尿病足溃疡样本中的免疫细胞，特别是巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 体外实验, 小鼠模型 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7337 | 2025-10-06 |
Pathway Enrichment-Based Unsupervised Learning Identifies Novel Subtypes of Cancer-Associated Fibroblasts in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2025-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00705-7
PMID:40272703
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研究论文 | 提出基于通路富集的无监督学习方法识别胰腺导管腺癌中癌症相关成纤维细胞新亚型 | 开发了scPathClus方法，通过通路富集而非基因表达进行单细胞聚类，克服了scRNA-seq数据中dropout事件的影响 | 方法仅在胰腺导管腺癌数据中进行验证，尚未在其他癌症类型中测试 | 开发新的单细胞聚类方法并识别胰腺癌中癌症相关成纤维细胞的新亚型 | 胰腺导管腺癌中的癌症相关成纤维细胞 | 单细胞分析 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组分析，伪时间分析，批量转录组分析 | 社区检测，无监督学习 | 单细胞基因表达数据，空间转录组数据，批量转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7338 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals alterations to cellular dynamics and paracrine signaling in radiation-induced muscle pathology
2025-Jun-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00115.2025
PMID:40316295
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示辐射诱导肌肉病理中细胞动态变化和旁分泌信号传导的改变 | 首次使用单细胞RNA测序技术描述辐射暴露后骨骼肌微环境中的转录变化，揭示FAP细胞呈现促纤维化和衰老转录组特征 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究辐射治疗引起骨骼肌萎缩和纤维化的潜在机制 | 小鼠辐射模型中的骨骼肌细胞 | 单细胞转录组学 | 肌肉病理 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠辐射模型在照射后24小时和56天的时间点 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7339 | 2025-10-06 |
Stromal heterogeneity in the adult lung delineated by single-cell genomics
2025-Jun-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00285.2025
PMID:40353369
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综述 | 通过单细胞基因组学技术揭示成年肺间质细胞的异质性特征 | 整合多研究数据证明肺间质细胞异质性在不同研究中具有保守性，并通过空间分析确定各亚群在肺组织中的独特解剖位置 | NA | 概述单细胞RNA测序研究揭示的肺间质细胞异质性 | 成年肺组织中的间质细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7340 | 2025-10-06 |
Super-resolution imaging informed scRNA sequencing analysis reveals the critical role of GDF15 in rejuvenating aged hematopoietic stem cells
2025-Jun, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000236
PMID:40416726
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研究论文 | 本研究通过超分辨率成像与单细胞RNA测序相结合，揭示了GDF15在衰老造血干细胞线粒体形态调控中的关键作用 | 首次将活细胞超分辨率显微镜与单细胞RNA测序技术整合，发现了GDF15介导线粒体信号和形态影响造血干细胞命运的新机制 | 样本量相对较小（约200个HSCs） | 探索衰老造血干细胞中线粒体形态变化的分子和细胞机制 | 年轻和衰老小鼠的造血干细胞 | 单细胞分析 | 衰老相关疾病 | 超分辨率显微镜, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | 聚类分析 | 显微镜图像, 单细胞基因表达数据 | 约200个造血干细胞（来自年轻和衰老小鼠） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |