单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7321 - 7340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7321 | 2025-10-06 |
Construction of a deep learning model and identification of the pivotal characteristics of FGF7- and MGST1- positive fibroblasts in heart failure post-myocardial infarction
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143171
PMID:40258553
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析构建深度学习模型，揭示了FGF7+和MGST1+成纤维细胞在心肌梗死后心力衰竭中的关键特征 | 首次发现FGF7MGST1成纤维细胞在心肌梗死后心力衰竭中下调，并通过多组学分析揭示其细胞通讯特征和因果关联 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据，需要在人类样本中进一步验证 | 探究成纤维细胞异质性在心肌梗死后心力衰竭中的作用机制 | 心脏组织中的成纤维细胞，特别是FGF7+和MGST1+成纤维细胞亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，qRT-PCR，孟德尔随机化分析 | 深度学习模型，机器学习算法 | 单细胞转录组数据，基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，包含小鼠心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7322 | 2025-10-06 |
Neurotrophin-3/chitosan inhibits cuproptosis-related genes to enable functional recovery after spinal cord injury
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143403
PMID:40268016
|
研究论文 | 本研究探讨了铜死亡相关基因在脊髓损伤中的调控机制，并评估了神经营养因子-3/壳聚糖在促进功能恢复方面的治疗潜力 | 首次整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq分析脊髓损伤后铜死亡相关基因的调控网络，发现神经营养因子-3/壳聚糖可抑制铜死亡相关基因表达 | 需要在更大样本队列中验证研究结果，并进一步探索NT3-壳聚糖调控铜死亡相关基因的详细机制 | 研究脊髓损伤中铜死亡相关基因的调控机制及潜在治疗方法 | 小鼠脊髓组织 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | RNA-seq, scRNA-seq, 分子对接分析 | 机器学习 | 基因表达数据 | 小鼠脊髓组织在不同时间点的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 7323 | 2025-10-06 |
Role of Galactosylceramide Metabolism in Satellite Glial Cell Dysfunction and Neuron-Glia Interactions in Painful Diabetic Peripheral Neuropathy
2025-03-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14060393
PMID:40136642
|
研究论文 | 本研究探讨了半乳糖神经酰胺代谢在痛性糖尿病周围神经病变中卫星胶质细胞功能障碍和神经元-胶质细胞相互作用中的作用 | 首次揭示半乳糖神经酰胺耗竭是痛性糖尿病周围神经病变中卫星胶质细胞功能障碍的核心介质，并识别出易受影响的卫星胶质细胞亚群 | 研究仅使用大鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 研究半乳糖神经酰胺在糖尿病周围神经病变进展过程中对卫星胶质细胞功能和神经元-胶质细胞相互作用的影响 | 痛性糖尿病周围神经病变大鼠模型的背根神经节卫星胶质细胞和神经元 | 神经科学 | 糖尿病周围神经病变 | 单细胞RNA测序、靶向质谱分析、免疫荧光分析 | NA | 基因表达数据、质谱数据、图像数据 | 痛性糖尿病周围神经病变大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7324 | 2025-10-06 |
Multihormone-producing capabilities of normal pancreatic islet cells-spatial transcriptomics analysis using Xenium
2025, Biomedical research (Tokyo, Japan)
DOI:10.2220/biomedres.46.129
PMID:40436764
|
研究论文 | 通过Xenium空间转录组学分析研究成人胰岛细胞的多激素产生能力 | 首次使用Xenium空间转录组技术揭示成人胰岛细胞具有同时产生多种胰腺激素的基因表达潜力 | 样本量较小（仅3例患者），仅基于基因转录水平推测激素产生能力，未验证蛋白质表达 | 阐明成人胰岛细胞是否严格维持单一激素产生能力或保留多激素产生可塑性 | 人胰腺胰岛细胞 | 空间转录组学 | 胰腺肿瘤 | 空间转录组学分析 | NA | 空间基因表达数据 | 3例胰腺肿瘤患者的11个胰岛，共773个胰岛细胞 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium空间基因表达平台，使用477个探针 |
| 7325 | 2025-10-06 |
GRACE: Unveiling Gene Regulatory Networks With Causal Mechanistic Graph Neural Networks in Single-Cell RNA-Sequencing Data
2025-05, IEEE transactions on neural networks and learning systems
IF:10.2Q1
DOI:10.1109/TNNLS.2024.3412753
PMID:38896510
|
研究论文 | 提出一种基于图神经网络和结构因果模型的GRACE框架，用于从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络并进行因果推理 | 将结构因果模型与图神经网络结合，首次在单细胞RNA测序数据中实现基因因果关系的显式建模和推理 | 未明确说明模型的计算复杂度或对大规模数据集的扩展性 | 从单细胞RNA测序数据中准确推断基因调控网络并揭示基因间的因果关系 | 基因调控网络和基因因果关系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络, 自编码器, 结构因果模型 | 基因表达数据 | 7个基准数据集和人类外周血单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7326 | 2025-10-06 |
GALNT5 promotes migration and invasion of pancreatic ductal adenocarcinoma cells by activating Erk signaling pathway
2025-03, Biochimica et biophysica acta. General subjects
DOI:10.1016/j.bbagen.2025.130769
PMID:39870120
|
研究论文 | 本研究揭示了GALNT5通过激活Erk信号通路促进胰腺导管腺癌细胞的迁移和侵袭 | 首次通过TCGA和GTEx数据鉴定GALNT5为PDAC中最显著上调的糖基化相关基因，并阐明其通过Erk信号通路促进肿瘤进展的机制 | 研究主要基于细胞系实验，缺乏体内动物模型验证 | 探究GALNT5在胰腺导管腺癌进展中的作用机制 | 胰腺导管腺癌细胞系（PANC-1、MIAPaCa-2、AsPC-1） | 癌症生物学 | 胰腺癌 | RNA-seq，单细胞测序 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | TCGA和GTEx数据库的RNA-seq数据，公开可用的单细胞测序数据 | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7327 | 2025-10-06 |
Inhibition of CDH11 Activates cGAS-STING by Stimulating Branched Chain Amino Acid Catabolism and Mitigates Lung Metastasis of Adenoid Cystic Carcinoma
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408751
PMID:39739317
|
研究论文 | 本研究揭示CDH11通过调控支链氨基酸代谢促进腺样囊性癌肺转移的机制，并发现塞来昔布可通过抑制CDH11激活cGAS-STING通路抑制转移 | 首次发现CDH11作为混合EMT细胞标志物通过BCAA代谢调控cGAS-STING通路的新机制，并验证塞来昔布的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化仍需进一步验证 | 探索腺样囊性癌肺转移的分子机制并寻找治疗靶点 | 唾液腺腺样囊性癌及其肺转移灶 | 癌症生物学 | 腺样囊性癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NOD-SCID小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 7328 | 2025-10-06 |
Integrative spatial and genomic analysis of tumor heterogeneity with Tumoroscope
2024-10-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53374-3
PMID:39472583
|
研究论文 | 提出首个概率模型Tumoroscope，通过整合病理图像、全外显子组测序和空间转录组数据，在接近单细胞分辨率下推断癌症克隆及其定位 | 首个能够基于体细胞点突变直接定位肿瘤组织中克隆的概率模型，解决了空间转录组位点中克隆比例反卷积的问题 | NA | 研究肿瘤的空间和基因组异质性对癌症进展、治疗和生存的影响 | 前列腺癌和乳腺癌数据集 | 数字病理学 | 前列腺癌,乳腺癌 | 全外显子组测序,空间转录组学 | 概率模型 | 病理图像,基因组测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,全外显子组测序 | NA | NA |
| 7329 | 2025-10-06 |
Interactions between cancer cells and immune cells drive transitions to mesenchymal-like states in glioblastoma
2021-06-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2021.05.002
PMID:34087162
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验揭示了巨噬细胞通过分泌oncostatin M诱导胶质母细胞瘤细胞向间充质样状态转变的机制 | 首次系统阐明巨噬细胞通过OSM-STAT3信号通路驱动胶质母细胞瘤细胞向间充质亚型转变的细胞间相互作用机制 | 研究主要关注巨噬细胞与肿瘤细胞的相互作用，对其他免疫细胞类型的影响可能未完全阐明 | 解析胶质母细胞瘤中间充质亚型的形成机制及其与肿瘤微环境的相互作用 | 人类胶质母细胞瘤肿瘤样本和模型系统中的癌细胞与免疫细胞 | 单细胞测序分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 体外和体内功能实验 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7330 | 2025-10-06 |
Genomic sequencing of single microbial cells from environmental samples
2008-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2008.05.006
PMID:18550420
|
综述 | 本文综述了环境样本中单微生物细胞基因组测序的研究策略与实验方法 | 无需培养即可直接从单个微生物细胞进行基因组测序，突破了传统微生物研究的限制 | 多重置换扩增可能无法完整回收细菌单拷贝基因组，且在DNA扩增过程中可能发生序列重排 | 开发和应用单细胞基因组测序技术以研究环境样本中的微生物 | 环境样本中的单个微生物细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞基因组测序，多重置换扩增 | NA | 基因组DNA序列 | 多个大型测序中心的数据，单细胞基因组回收率通常>70% | NA | 单细胞基因组测序 | NA | NA |
| 7331 | 2025-10-06 |
Decellularised Amniotic Membrane for the Neurogenic Expression of Human Mesenchymal Stem Cells
2025-Jun, Journal of biomedical materials research. Part B, Applied biomaterials
DOI:10.1002/jbm.b.35588
PMID:40424302
|
研究论文 | 本研究探讨脱细胞羊膜促进人间充质干细胞神经源性分化的能力及其在周围神经病变修复中的应用 | 首次结合空间转录组学与网络药理学分析脱细胞羊膜对干细胞神经分化的诱导机制 | 未明确说明样本数量及动物模型的具体细节 | 研究脱细胞羊膜诱导干细胞神经分化以促进神经再生的能力 | 人间充质干细胞和脱细胞羊膜 | 组织工程与再生医学 | 周围神经病变 | 免疫荧光染色、细胞粘附实验、活/死细胞染色、空间转录组测序、网络药理学分析 | NA | 基因表达数据、图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7332 | 2025-10-06 |
Targeting Ferroptosis Alleviates Pulmonary Arterial Hypertension, Insights from Transcriptomic and Experimental Analyses
2025-May-28, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202500001
PMID:40432432
|
研究论文 | 本研究通过转录组学和实验分析探讨铁死亡在肺动脉高压发病机制中的作用 | 首次揭示铁死亡是肺动脉高压内皮细胞损伤的关键机制，并发现HIF1α信号在铁死亡诱导中的重要作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类患者中验证 | 研究铁死亡在肺动脉高压发展中的作用及其分子机制 | 肺动脉高压患者和小鼠模型 | 生物医学 | 肺动脉高压 | 转录组测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,组织学数据 | PAH患者和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7333 | 2025-10-06 |
Single-cell targeted transcriptomics reveals subset-specific immune signatures differentiating asymptomatic and cardiac patients with chronic Chagas disease
2025-May-28, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf269
PMID:40434116
|
研究论文 | 通过单细胞靶向转录组学揭示慢性恰加斯病患者不同临床亚型的免疫特征差异 | 首次应用免疫基因靶向单细胞RNA测序技术比较无症状和心脏型慢性恰加斯病患者的免疫细胞特征 | 研究样本量有限，仅分析外周血单个核细胞 | 揭示慢性恰加斯病不同临床形式的免疫机制和疾病标志物 | 无症状(IND)和心脏型(CCC)慢性恰加斯病患者的免疫细胞 | 单细胞组学 | 恰加斯病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | IND和CCC患者的外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 免疫基因靶向单细胞RNA测序 |
| 7334 | 2025-05-29 |
Author Correction: Single-cell transcriptomics analysis reveals dynamic changes and prognostic signature in tumor microenvironment of PDAC
2025-May-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-02747-9
PMID:40425739
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7335 | 2025-10-06 |
[New technologies serve as accelerators for breakthroughs in modern acupuncture research]
2025-May-25, Zhen ci yan jiu = Acupuncture research
DOI:10.13702/j.1000-0607.20250380
PMID:40390610
|
综述 | 系统回顾现代针灸研究发展历程，探讨不同时期技术对针灸研究的推动作用 | 强调新兴技术（单细胞测序、空间转录组学、神经影像、人工智能等）在未来针灸研究中的重要作用 | NA | 探讨技术发展对现代针灸研究的推动作用 | 针灸研究发展历程与技术应用 | NA | NA | 电生理技术、生化技术、单细胞测序、空间转录组学、神经影像、人工智能 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 7336 | 2025-10-06 |
A regulatory variant rs9379874 in T1D risk region 6p22.2 affects BTN3A1 expression regulating T cell function
2025-May, Acta diabetologica
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s00592-024-02389-9
PMID:39417845
|
研究论文 | 本研究通过功能基因组学方法鉴定了6p22.2区域中影响BTN3A1表达的功能性变异rs9379874及其在1型糖尿病发病机制中的作用 | 首次在6p22.2风险区域鉴定出功能性变异rs9379874，揭示其通过结合FOXA1调控BTN3A1表达影响T细胞功能的机制 | rs4320356变异与胰岛功能或自身免疫无显著关联，研究未完全阐明所有临床特征的遗传基础 | 揭示6p22.2风险区域与1型糖尿病亚群及相关临床特征的关联，鉴定该区域的致病变异和靶基因 | 2608例1型糖尿病患者和4814例健康对照，来自中国东部、中部和南部地区 | 功能基因组学 | 1型糖尿病 | GWAS, 生物信息学分析, 双荧光素酶报告基因检测, eQTL分析, 单细胞RNA测序分析 | NA | 基因分型数据, 表达数据, 表观遗传数据 | 7422个样本（2608例患者+4814例对照） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7337 | 2025-10-06 |
Immune-featured stromal niches associate with response to neoadjuvant immunotherapy in oral squamous cell carcinoma
2025-Mar-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102024
PMID:40107247
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学分析口腔鳞状细胞癌患者对免疫治疗的应答机制 | 首次在口腔鳞癌中揭示免疫特征性基质微环境与免疫治疗应答的关联，发现SELP高内皮微静脉和APOD肌成纤维细胞在免疫化疗应答者中特异性上调 | 样本量较小（22例患者），且为单中心研究 | 探究肿瘤基质细胞在口腔鳞癌免疫治疗应答中的作用机制 | 22例口腔鳞状细胞癌患者的配对肿瘤标本 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 22例患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7338 | 2025-10-06 |
Neuroinflammatory pathways and potential therapeutic targets in neonatal post-hemorrhagic hydrocephalus
2025-Mar, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-024-03733-z
PMID:39725707
|
综述 | 本文综述了新生儿出血后脑积水的神经炎症通路分子机制及潜在治疗靶点 | 系统整合了神经炎症通路、免疫介质和表观遗传机制在PHH中的作用，并评估了基于干细胞的创新疗法 | 新型疗法在新生儿群体中的安全性及其对大脑发育的潜在影响尚未完全明确 | 探讨PHH的病理生理机制并评估新兴治疗方法 | 早产儿出血后脑积水及其分子机制 | NA | 新生儿脑积水 | 全基因组/外显子组测序, 蛋白质组学, 表观遗传学, 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 7339 | 2025-10-06 |
Tissue-resident memory CD8 T cell diversity is spatiotemporally imprinted
2025-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08466-x
PMID:39843748
|
研究论文 | 本研究揭示了小肠组织中驻留记忆CD8 T细胞多样性的空间印记机制 | 开发了计算方法来捕获细胞沿小肠三个解剖轴的位置，并可视化细胞类型和基因表达的时空分布 | NA | 探索组织驻留记忆CD8 T细胞多样性的起源和空间分布机制 | 人类样本和小鼠急性系统性病毒感染模型中的病原体特异性T细胞 | 空间转录组学 | 病毒感染 | 空间转录组学，单转录本分辨率分析，光学编码基因扰动策略 | NA | 空间转录组数据，基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7340 | 2025-10-06 |
A comprehensive spatio-cellular map of the human hypothalamus
2025-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08504-8
PMID:39910307
|
研究论文 | 通过整合单核测序和空间转录组学技术，构建了人类下丘脑的综合空间细胞转录图谱HYPOMAP | 首次创建了人类下丘脑的空间细胞转录图谱，发现人与小鼠在特定神经元类型和GPCR表达水平上的显著差异，并识别出与BMI相关的新基因CORO1A | 研究主要基于转录组数据，功能验证和机制研究相对有限 | 构建人类下丘脑的细胞组成和空间分布图谱，探索其与代谢疾病的关联 | 人类下丘脑细胞 | 空间转录组学 | 代谢疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 433,369个下丘脑细胞 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |