单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
7321	2024-10-12	Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics of bladder Ewing sarcoma 2024-Oct-18, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.110921 PMID:39386756	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，深入研究了膀胱Ewing肉瘤/原始神经外胚层肿瘤的发病机制	首次揭示了膀胱Ewing肉瘤/原始神经外胚层肿瘤中特化的上皮细胞和肥大细胞的存在，并发现了TNFRSF12A的显著上调	NA	探讨膀胱Ewing肉瘤/原始神经外胚层肿瘤的发病机制	膀胱Ewing肉瘤/原始神经外胚层肿瘤中的特化细胞类型及其相互作用	数字病理学	膀胱癌	单细胞RNA测序、空间转录组学	NA	RNA	涉及膀胱Ewing肉瘤/原始神经外胚层肿瘤的多个细胞类型
7322	2024-10-12	CD8+ T cell associated scoring model helps prognostic diagnosis and immunotherapy selection in patients with colon adenocarcinoma 2024-Oct-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37998 PMID:39386801	研究论文	研究构建了一个基于CD8+ T细胞标记基因的评分模型，用于结肠腺癌患者的预后诊断和免疫治疗选择	首次基于CD8+ T细胞标记基因构建了一个新的预后评分模型，并验证了其在区分患者免疫治疗反应中的有效性	研究仅使用了5个数据集，样本量相对较小，可能影响模型的普适性	开发一种新的预后评分模型，用于结肠腺癌患者的预后预测和免疫治疗选择	结肠腺癌患者及其免疫治疗反应	数字病理学	结肠腺癌	单细胞转录组测序和Bulk转录组测序	Lasso回归模型	转录组数据	5个数据集，包括单细胞和Bulk转录组数据
7323	2024-10-12	Single-cell sequencing analysis revealed that NEAT1 was a potential biomarker and therapeutic target of prostate cancer 2024-Oct-08, BMC cancer IF:3.4Q2 DOI:10.1186/s12885-024-12926-y PMID:39379919	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了NEAT1作为前列腺癌潜在生物标志物和治疗靶点的可能性	首次通过单细胞RNA测序数据探讨NEAT1在前列腺癌中的作用，并验证了其作为潜在生物标志物和治疗靶点的潜力	研究主要基于体外实验和细胞衍生异种移植模型，缺乏临床试验验证	探索前列腺癌发生相关的生物标志物，并验证NEAT1作为潜在治疗靶点的可能性	前列腺癌样本及其相关细胞亚群	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	RNA	包括正常、良性前列腺增生和前列腺癌样本，具体数量未明确提及
7324	2024-10-12	The small inhibitor WM-1119 effectively targets KAT6A-rearranged AML, but not KMT2A-rearranged AML, despite shared KAT6 genetic dependency 2024-Oct-08, Journal of hematology & oncology IF:29.5Q1 DOI:10.1186/s13045-024-01610-0 PMID:39380002	研究论文	研究评估了小分子抑制剂WM-1119对KAT6A重排的AML的疗效，并探讨了其在KMT2A重排的AML中的作用	首次评估了KAT6A抑制剂WM-1119在KAT6A和KMT2A重排的AML中的作用，发现其对KAT6A重排的AML有显著疗效，但对KMT2A重排的AML影响有限	研究主要集中在细胞和分子水平，缺乏临床试验数据支持	评估KAT6A抑制剂WM-1119在不同类型AML中的疗效	KAT6A和KMT2A重排的AML细胞	数字病理学	血液肿瘤	流式细胞术、克隆形成实验、细胞生长实验、shRNA敲减、CRISPR敲除、bulk和单细胞RNA-seq、ChIP-seq	NA	RNA	包括KAT6A和KMT2A重排的AML细胞系及患者原代AML细胞
7325	2024-10-12	Single-cell dissection reveals promotive role of ENO1 in leukemia stem cell self-renewal and chemoresistance in acute myeloid leukemia 2024-Oct-08, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-024-03969-w PMID:39380054	研究论文	研究探讨了ENO1在急性髓系白血病（AML）中对白血病干细胞（LSCs）自我更新和化疗耐药性的促进作用	首次揭示了ENO1在AML中对LSCs自我更新和化疗耐药性的关键作用，并提出了ENO1作为AML靶向治疗和预后标志物的潜力	研究样本量较小，且仅限于AML患者和健康对照组，未来需要更大规模的研究来验证结果	探讨ENO1在AML中对LSCs自我更新和化疗耐药性的影响及其机制	AML患者的骨髓样本和AML细胞系	数字病理学	血液肿瘤	单细胞RNA测序	机器学习	RNA	8名复发/难治性AML患者和4名健康对照者的骨髓样本，以及37名对照者的样本
7326	2024-10-12	Single-cell RNA sequencing reveals the pro-inflammatory roles of liver-resident Th1-like cells in primary biliary cholangitis 2024-Oct-07, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53104-9 PMID:39375367	研究论文	利用单细胞RNA测序技术揭示原发性胆汁性胆管炎中肝脏驻留Th1样细胞的促炎作用	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了原发性胆汁性胆管炎中肝脏驻留Th1样细胞的促炎作用及其分子机制	研究主要基于小鼠模型和PBC患者样本，可能存在种属差异	揭示原发性胆汁性胆管炎的病理机制并寻找潜在治疗靶点	原发性胆汁性胆管炎患者的肝脏免疫细胞	数字病理学	肝脏疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	PBC患者和小鼠PBC模型的肝脏样本
7327	2024-10-12	Single-cell sequencing unveils the impact of aging on the progenitor cell diversity in the telencephalon of the female killifish N. furzeri 2024-Oct, Aging cell IF:8.0Q1 DOI:10.1111/acel.14251 PMID:38949249	研究论文	研究揭示了非洲蓝绿杀鱼（N. furzeri）端脑中衰老对前体细胞多样性的影响	首次通过单细胞RNA测序揭示了年轻成年雌性杀鱼端脑中前体细胞的多样性及其在衰老过程中的变化	研究仅限于特定品系的雌性杀鱼，结果的普适性有待进一步验证	探讨衰老对端脑中前体细胞多样性的影响及其分子机制	非洲蓝绿杀鱼（N. furzeri）端脑中的前体细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	年轻成年雌性杀鱼（GRZ-AD品系）的端脑样本
7328	2024-10-12	Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq reveals immune suppression subtypes and establishes a novel signature for determining the prognosis in lung adenocarcinoma 2024-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands) DOI:10.1007/s13402-024-00948-4 PMID:38616208	研究论文	本文通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，揭示了肺腺癌中的免疫抑制亚型，并建立了一个新的预后标志物	本文首次通过多组学分析揭示了肺腺癌中的免疫抑制亚型，并发现了CDC25C基因作为潜在的预后标志物	本文的样本量较小，仅包括6对肺腺癌和邻近组织，可能影响结果的普适性	探索肺腺癌的生物学特性，识别新的生物标志物和治疗靶点	肺腺癌组织及其邻近组织	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	6对肺腺癌和邻近组织
7329	2024-10-12	SCARF2 is a target for chronic obstructive pulmonary disease: Evidence from multi-omics research and cohort validation 2024-Oct, Aging cell IF:8.0Q1 DOI:10.1111/acel.14266 PMID:38958042	研究论文	本文通过多组学研究和队列验证，发现SCARF2蛋白是慢性阻塞性肺疾病（COPD）的新靶点	首次通过多组学分析和遗传共定位验证了SCARF2蛋白在COPD中的保护作用	单细胞RNA分析结果与全转录组MR结果存在差异，需要进一步研究解释	确定慢性阻塞性肺疾病（COPD）的新治疗靶点	SCARF2蛋白及其在COPD中的作用机制	数字病理学	慢性阻塞性肺疾病	全基因组元分析、转录组和蛋白质组孟德尔随机化、遗传共定位、单细胞转录组分析	NA	基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据	2883例IPF病例和741,929例对照，17,547例COPD病例和617,598例对照，以及UK Biobank的个体数据
7330	2024-10-12	Deciphering the molecular landscape: evolutionary progression from gynecomastia to aggressive male breast cancer 2024-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands) DOI:10.1007/s13402-024-00964-4 PMID:38888848	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了从男性乳腺发育异常（乳腺增生）到侵袭性男性乳腺癌的分子进化过程	首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了乳腺增生与男性乳腺癌之间的细胞景观，并揭示了CD13在驱动这一转变中的关键作用	研究主要集中在单细胞RNA测序和基因表达分析上，可能忽略了其他潜在的致癌机制	揭示从乳腺增生到男性乳腺癌的分子进化过程，并识别潜在的治疗靶点	乳腺增生和男性乳腺癌的细胞景观及其分子特征	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	涉及乳腺增生和男性乳腺癌的多个单细胞样本
7331	2024-10-12	The periosteum provides a stromal defence against cancer invasion into the bone 2024-Oct, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-024-07822-1 PMID:39169177	研究论文	研究揭示了骨膜在癌症侵袭骨组织中的防御作用	首次展示了骨膜反应在抑制癌症侵袭骨组织中的生理作用，并揭示了TIMP1基因在其中的关键作用	研究主要基于小鼠模型和人类头颈部鳞状细胞癌的病理分析，可能需要进一步的临床验证	探讨骨膜在癌症侵袭骨组织中的防御机制	骨膜、头颈部鳞状细胞癌、小鼠模型	NA	头颈部鳞状细胞癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	人类头颈部鳞状细胞癌病变样本和小鼠模型
7332	2024-10-12	Retinoic acid, an essential component of the roof plate organizer, promotes the spatiotemporal segregation of dorsal neural fates 2024-Oct-01, Development (Cambridge, England) DOI:10.1242/dev.202973 PMID:39250350	研究论文	研究视黄酸在胚胎发育中对背侧神经命运分离的影响	通过单细胞转录组学揭示了视黄酸在背侧神经命运分离中的分子机制	研究仅限于鹌鹑胚胎，可能不适用于其他物种	探讨视黄酸在背侧神经命运分离中的作用及其分子机制	鹌鹑胚胎中的背侧神经管及其相关细胞命运	发育生物学	NA	单细胞转录组学	NA	基因表达数据	鹌鹑胚胎中的单个细胞
7333	2024-10-12	Developmental emergence of first- and higher-order thalamic neuron molecular identities 2024-Sep-15, Development (Cambridge, England) DOI:10.1242/dev.202764 PMID:39348458	研究论文	研究了发育过程中丘脑神经元分子身份的形成，特别是第一级和高级神经元的分化过程	首次揭示了高级神经元比第一级神经元更早开始分化的现象，并发现外周输入对第一级视觉丘脑兴奋性神经元的成熟至关重要	研究仅限于小鼠胚胎丘脑，未涉及其他物种或成年丘脑	探讨丘脑神经元在发育过程中分子身份的形成机制	小鼠胚胎丘脑中的第一级和高级神经元	神经科学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	小鼠胚胎丘脑的单细胞RNA测序数据
7334	2024-10-12	Targeting POLRMT by IMT1 inhibits colorectal cancer cell growth 2024-Sep-03, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-07023-8 PMID:39227564	研究论文	研究探讨了新型线粒体RNA聚合酶（POLRMT）抑制剂IMT1在抑制结直肠癌（CRC）细胞生长中的潜力	首次研究了IMT1作为POLRMT抑制剂在结直肠癌中的抗肿瘤活性	研究主要在细胞和动物模型中进行，尚未进行临床试验	探讨IMT1抑制POLRMT在结直肠癌中的抗肿瘤作用	结直肠癌细胞和组织	癌症研究	结直肠癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	包括原代和永生化结直肠癌细胞，以及裸鼠模型
7335	2024-10-12	Apelin (APLN) is a biomarker contributing to the diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma 2024-09-03, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-71495-z PMID:39227683	研究论文	本研究开发了用于肝细胞癌（HCC）诊断和预后的新型模型，并鉴定了新的生物标志物Apelin（APLN）	本研究首次将Apelin（APLN）鉴定为肝细胞癌的生物标志物，并开发了基于机器学习算法的诊断和预后模型	研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据，未涉及临床验证	开发新型诊断和预后模型，并鉴定新的肝细胞癌生物标志物	肝细胞癌（HCC）及其生物标志物Apelin（APLN）	数字病理学	肝癌	单细胞测序	LASSO和Cox回归算法	基因表达数据	基于TCGA数据库的数据，具体样本数量未明确提及
7336	2024-10-12	Prostate cancer cancer-associated fibroblasts with stable markers post-androgen deprivation therapy associated with tumor progression and castration resistant prostate cancer 2024-Sep, Cancer science IF:4.5Q1 DOI:10.1111/cas.16267 PMID:38970292	研究论文	研究了前列腺癌中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的特异性及其在雄激素剥夺治疗（ADT）后的临床相关性	通过细胞谱系多样性和加权基因共表达网络分析（WGCNA）确定了前列腺癌特有的CAF特征，并通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）、细胞系RNA测序和免疫组化验证了其特异性	NA	阐明前列腺癌中CAFs的特异性及其在ADT后的影响	前列腺癌中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）及其在雄激素剥夺治疗（ADT）后的变化	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、免疫组化	NA	RNA	收集的样本数量未明确提及
7337	2024-10-12	Exploring the potential molecular intersection of stroke and major depression disorder 2024-08-06, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2024.150079 PMID:38759300	研究论文	研究探讨了中风和重度抑郁症在分子层面的潜在关联机制	发现了Mlkl和Nlrp3两个关键基因在中风和重度抑郁症共病机制中的重要作用，并预测了六种可能的治疗药物	研究主要基于动物实验和生物信息学分析，缺乏人体临床数据支持	探索中风和重度抑郁症在基因层面的共病机制	中风和重度抑郁症的小鼠模型	生物信息学	神经系统疾病	转录组分析、单细胞测序、RT-PCR、免疫荧光染色	NA	转录组数据	涉及多个GEO数据库中的小鼠样本数据集（GSE104036, GSE131712, GSE81672, GSE146845）
7338	2024-10-12	Bone marrow cells contribute to seven different endothelial cell populations in the heart 2024-08, Basic research in cardiology IF:7.5Q1 DOI:10.1007/s00395-024-01065-x PMID:38963562	研究论文	研究探讨了骨髓细胞在心脏中形成七种不同内皮细胞群体的贡献及其在心肌缺血后的作用	首次揭示了骨髓来源的内皮细胞在心脏中的异质性及其对重复缺血的反应	研究仅限于动物模型，尚未在人体中验证	探讨骨髓细胞在心脏血管再生中的机制，为心肌缺血的治疗提供新策略	骨髓来源的内皮细胞及其在心脏功能和冠状循环中的作用	NA	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	使用了来自GFP雌性大鼠的骨髓细胞移植到照射后的雄性大鼠中，共17天的重复缺血模型
7339	2024-10-12	Altered lipid metabolism promoting cardiac fibrosis is mediated by CD34+ cell-derived FABP4+ fibroblasts 2024-Aug, Experimental & molecular medicine DOI:10.1038/s12276-024-01309-9 PMID:39198543	研究论文	研究探讨了CD34+细胞在脂质代谢异常促进心脏纤维化中的作用机制	首次揭示了CD34+细胞在心脏纤维化中的作用，特别是通过FABP4+成纤维细胞介导的脂质代谢异常	研究主要基于小鼠和人类心脏单细胞转录组数据，缺乏体内实验验证	探索CD34细胞在脂质代谢异常导致心脏纤维化中的分化机制	CD34+细胞及其在心脏纤维化中的作用	心血管疾病	心脏纤维化	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	50,870个小鼠心脏单细胞和76,851个人类心脏单细胞
7340	2024-10-12	An oncolytic HSV-1 armed with Visfatin enhances antitumor effects by remodeling tumor microenvironment against murine pancreatic cancer 2024-07-23, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2024.149931 PMID:38723415	研究论文	研究通过改造溶瘤病毒HSV-1携带Visfatin，增强其对小鼠胰腺癌的抗肿瘤效果	首次揭示Visfatin通过重塑肿瘤微环境增强溶瘤病毒的抗肿瘤效果	NA	研究溶瘤病毒治疗胰腺导管腺癌的抗性机制并开发新型治疗策略	小鼠胰腺癌	NA	胰腺癌	RNA测序、单细胞RNA测序、流式细胞术	NA	RNA	NA