单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31986 篇文献，本页显示第 7301 - 7320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7301 | 2025-10-06 |
High-definition spatial transcriptomics for in situ tissue profiling
2019-10, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-019-0548-y
PMID:31501547
|
研究论文 | 开发了一种高分辨率空间转录组学方法，用于原位组织分析 | 创建了密集空间条形码珠阵列，能在2微米分辨率下同时捕获RNA和空间信息 | NA | 开发高分辨率空间转录组学技术用于组织分析 | 小鼠脑组织和原发性乳腺癌组织 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间RNA表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 密集空间条形码珠阵列 |
| 7302 | 2025-10-06 |
Single-Cell Applications of Next-Generation Sequencing
2019-10-01, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a026898
PMID:30617056
|
综述 | 本文为非专业人士提供单细胞测序技术的高层次概述，并展示其在胚胎学、发育遗传学和癌症研究中的基础与临床应用 | 系统阐述下一代测序技术在单细胞生物学中开启的新前沿，实现数百至数百万细胞的并行分析 | NA | 概述单细胞测序技术及其在基础研究和临床应用中的影响 | 异质性细胞群体（包括组织、生物体、微生物生态系统和癌细胞） | 基因组学 | 癌症 | 下一代测序（NGS） | NA | RNA和DNA序列数据 | 数百至数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞DNA测序 | NA | NA |
| 7303 | 2025-10-06 |
Machine learning predicts putative hematopoietic stem cells within large single-cell transcriptomics data sets
2019-10, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2019.08.009
PMID:31513832
|
研究论文 | 开发了一种名为hscScore的机器学习工具，用于从单细胞转录组数据中识别小鼠骨髓造血干细胞 | 首次开发了基于机器学习的方法来替代传统流式细胞术鉴定造血干细胞，能够在缺乏表面标志物信息的情况下从大规模单细胞转录组数据中识别HSCs | 目前仅在小鼠骨髓数据上验证，尚未在人类样本或其他组织中测试 | 建立从单细胞转录组数据中识别造血干细胞的替代方法 | 小鼠骨髓造血干细胞 | 机器学习 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 单细胞转录组数据 | 多个实验室的小鼠骨髓单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7304 | 2025-10-06 |
Proliferation-competent Tcf1+ CD8 T cells in dysfunctional populations are CD4 T cell help independent
2019-10-01, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1902701116
PMID:31530725
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索了CD4 T细胞帮助对慢性感染和癌症中CD8 T细胞前体群体功能的影响 | 发现功能失调群体中具有增殖能力的Tcf1+ CD8 T细胞前体不依赖CD4 T细胞帮助，这与传统记忆T细胞形成鲜明对比 | 研究主要关注慢性感染和癌症模型中的T细胞反应，可能不适用于其他免疫环境 | 探究CD4 T细胞帮助对CD8 T细胞前体群体维持和分化的调控机制 | 慢性感染和癌症模型中的CD8 T细胞群体 | 免疫学 | 慢性感染和癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7305 | 2025-10-06 |
Epigenomics and Single-Cell Sequencing Define a Developmental Hierarchy in Langerhans Cell Histiocytosis
2019-10, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-19-0138
PMID:31345789
|
研究论文 | 通过单细胞测序和表观基因组分析揭示朗格汉斯细胞组织细胞增生症中的发育层次结构 | 首次在LCH病变中识别出多种复发性LCH细胞类型，包括推定的LCH祖细胞和分化LCH细胞亚群，并定义了不同LCH细胞亚群的表观基因组和基因调控基础 | NA | 探索LCH病理生理学的分子机制及其临床异质性特征 | 原发性LCH病变 | 单细胞组学 | 朗格汉斯细胞组织细胞增生症 | 单细胞RNA测序,染色质可及性分析,免疫组织化学 | NA | 转录组数据,表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7306 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal immune zonation of the human kidney
2019-09-27, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aat5031
PMID:31604275
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类肾脏免疫系统的时空分区特征 | 首次系统揭示人类肾脏上皮细胞中免疫基因的解剖学定位表达模式，以及出生后获得性感染防御能力的转录程序 | NA | 解析人类肾脏免疫系统的时空拓扑结构 | 人类肾脏组织（胎儿和成熟期） | 单细胞生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7307 | 2025-10-06 |
Discovery of a CD10-negative B-progenitor in human fetal life identifies unique ontogeny-related developmental programs
2019-09-26, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2019001289
PMID:31383639
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和功能分析鉴定了人类胎儿B细胞发育层次中的新型CD10阴性前体B祖细胞 | 首次发现并表征了人类胎儿组织中存在的CD10阴性PreProB祖细胞，这是人类胎儿生命中最早期的B淋巴细胞限制性祖细胞 | 研究主要聚焦于胎儿发育阶段，成人样本中PreProB祖细胞数量极少，可能限制直接比较的统计效力 | 解析人类胎儿B淋巴细胞发育的层次结构和分子特征 | 人类胎儿和成人的B祖细胞 | 发育生物学 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞转录组学，功能分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 胎儿和成人骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7308 | 2025-10-06 |
A single-cell transcriptome atlas of the adult human retina
2019-09-16, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2018100811
PMID:31436334
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了成人视网膜的转录组图谱 | 首次在人类视网膜中系统鉴定18种转录特征不同的细胞群体，并发现MALAT1在视杆细胞退化中的潜在新作用 | 仅包含3名捐赠者的样本，样本量相对有限 | 全面解析人类视网膜细胞的分子特征 | 成人视网膜细胞 | 单细胞转录组学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 3名捐赠者的20,009个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7309 | 2025-10-06 |
Redefining the Etiologic Landscape of Cerebellar Malformations
2019-09-05, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2019.07.019
PMID:31474318
|
研究论文 | 通过大规模外显子组测序重新定义小脑畸形的病因学图谱 | 首次系统分析小脑畸形的遗传和产前非遗传病因，发现PDGFRB基因功能获得性变异与血管发育异常的新关联 | 样本量相对有限，部分遗传机制仍需进一步验证 | 系统解析小脑畸形的遗传病因和发病机制 | 282名来自100个家庭的丹迪-沃克畸形和小脑发育不全患者 | 遗传学 | 小脑畸形 | 外显子组测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 282名患者+131名额外个体的神经影像学回顾 | NA | 外显子组测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7310 | 2025-10-06 |
Defining the Identity and Dynamics of Adult Gastric Isthmus Stem Cells
2019-09-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.07.008
PMID:31422913
|
研究论文 | 本研究通过遗传标记和生物物理建模揭示了胃体腺体被划分为两个独立区域，并定义了胃峡部干细胞的身份和功能行为 | 首次证明胃体腺体存在两个独立分区，并发现胃峡部干细胞通过'间断性'中性漂移动力学维持胃小凹-峡部-颈部区域 | 胃峡部干细胞与其他干细胞群体相互作用的详细机制仍需进一步研究 | 确定成年胃峡部干细胞的身份和动力学特征 | 胃体上皮组织和胃峡部干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 遗传标记, 生物物理建模, 谱系追踪 | 中性漂移动力学模型 | 基因表达数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7311 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals multi-step adaptations to endocrine therapy
2019-09-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-11721-9
PMID:31477698
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示乳腺癌内分泌治疗耐药性的多步骤适应机制 | 首次在单细胞分辨率下解析内分泌治疗早期和晚期阶段克隆遗传多样性与转录可塑性的共同作用，发现预适应细胞亚群并通过多步骤模型描述耐药性发展过程 | 研究主要关注luminal型乳腺癌，模型在其他乳腺癌亚型中的普适性需要进一步验证 | 探究乳腺癌内分泌治疗耐药性的形成机制 | luminal型乳腺癌细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，成像技术 | 多步骤耐药发展模型 | 单细胞转录组数据，影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7312 | 2025-10-06 |
An Nfil3-Zeb2-Id2 pathway imposes Irf8 enhancer switching during cDC1 development
2019-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-019-0449-3
PMID:31406377
|
研究论文 | 本研究揭示了cDC1发育过程中Nfil3-Zeb2-Id2通路调控Irf8增强子转换的分子机制 | 首次发现Nfil3通过调控Zeb2和Id2表达来阻断E蛋白活性，从而解释cDC1发育中Irf8增强子使用的转换机制 | 研究主要聚焦于转录因子网络，可能未完全涵盖其他调控因子或信号通路的影响 | 阐明经典1型树突状细胞发育过程中Irf8增强子转换的分子机制 | 经典1型树突状细胞及其祖细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7313 | 2025-10-06 |
Transcriptome analysis of LRRK2 knock-out microglia cells reveals alterations of inflammatory- and oxidative stress-related pathways upon treatment with α-synuclein fibrils
2019-09, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2019.05.012
PMID:31102768
|
研究论文 | 通过LRRK2敲除小胶质细胞的转录组分析，揭示α-突触核蛋白纤维处理对炎症和氧化应激相关通路的影响 | 首次结合LRRK2基因敲除与α-突触核蛋白纤维处理，发现LRRK2通过调节线粒体SOD2影响氧化应激通路 | 研究主要基于体外细胞模型，体内验证数据有限 | 探究LRRK2基因在小胶质细胞功能中的作用及其与帕金森病发病机制的关系 | LRRK2野生型和敲除型小胶质细胞 | 转录组学 | 帕金森病 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 体外培养的小胶质细胞系，以及小鼠脑内急性分离的小胶质细胞 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7314 | 2025-10-06 |
The Eleventh ENBDC Workshop: Advances in Technology Help to Unveil Mechanisms of Mammary Gland Development and Cancerogenesis
2019-09, Journal of mammary gland biology and neoplasia
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10911-019-09436-0
PMID:31494779
|
综述 | 介绍第十一届欧洲乳腺发育与癌症网络研讨会的主要内容和技术进展 | 聚焦高分辨率基因组学和蛋白质组学技术在乳腺发育与癌症研究中的最新应用 | NA | 探讨乳腺发育机制和乳腺癌发生机理 | 乳腺腺体发育和乳腺癌 | 发育生物学与癌症研究 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,遗传条形码,谱系追踪,空间转录组学,光遗传学 | NA | 基因组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 7315 | 2025-10-06 |
Spatial sorting enables comprehensive characterization of liver zonation
2019-09, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-019-0109-9
PMID:31535084
|
研究论文 | 本研究通过空间分选技术构建了肝脏分区中多种细胞特征的空间图谱 | 利用分区表面标记物对肝小叶特定区域肝细胞进行高分辨率分选，首次重建了转录组、miRNA和蛋白质组的多维空间图谱 | 技术方法可能不适用于所有组织类型，空间分辨率仍有提升空间 | 构建肝脏分区中多种细胞特征的综合空间图谱 | 哺乳动物肝脏肝细胞 | 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组学, miRNA阵列测量, 质谱蛋白质组学 | NA | 转录组数据, miRNA数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 空间分辨单细胞转录组学 | NA | NA |
| 7316 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analyses reveal novel targets modulating cardiac neovascularization by resident endothelial cells following myocardial infarction
2019-08-07, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehz305
PMID:31162546
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示心肌梗死后心脏新生血管形成的新调控靶点 | 首次在单细胞分辨率下定义了小鼠心脏内皮细胞的异质性，并发现Plvap蛋白在缺血心脏中特异性调控内皮细胞增殖 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究心肌梗死后心脏新生血管形成的细胞起源和分子机制 | 成年小鼠心脏驻留内皮细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，谱系追踪 | Pdgfb-iCreERT2-R26R-Brainbow2.1转基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7317 | 2025-10-06 |
Intrinsic Resistance to Immune Checkpoint Blockade in a Mismatch Repair-Deficient Colorectal Cancer
2019-08, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-18-0683
PMID:31217164
|
研究论文 | 描述一例错配修复缺陷结直肠癌患者对免疫检查点抑制剂产生内在耐药性的机制研究 | 首次在MSI-H结直肠癌中发现β2-微球蛋白双等位基因缺失导致抗原呈递缺陷的耐药机制 | 仅基于单例患者研究，需要更大样本验证 | 探究MSI-H结直肠癌对免疫检查点抑制剂产生内在耐药性的分子机制 | 错配修复缺陷结直肠癌患者肿瘤样本 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 基因组测序,转录组分析,单细胞转录组测序,多重免疫荧光 | NA | 基因组数据,转录组数据,病理图像 | 1例耐药患者样本及数百例其他结直肠癌标本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7318 | 2025-10-06 |
Locally renewing resident synovial macrophages provide a protective barrier for the joint
2019-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1471-1
PMID:31391580
|
研究论文 | 本研究通过时空分析揭示了关节滑膜中CX3CR1组织驻留巨噬细胞形成免疫屏障保护关节的新机制 | 首次发现滑膜内存在形成上皮样紧密连接屏障的巨噬细胞亚群，这些细胞通过局部增殖维持数量，与单核细胞来源的炎症性巨噬细胞功能截然不同 | 研究主要基于小鼠模型，人类关节中是否存在完全相同的机制仍需验证 | 阐明关节炎中巨噬细胞的起源、分化和功能多样性 | 健康与炎症状态下关节内的巨噬细胞亚群 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 命运示踪技术，三维光片荧光显微镜，单细胞RNA测序 | NA | 显微镜图像，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7319 | 2025-10-06 |
Gene expression atlas of a developing tissue by single cell expression correlation analysis
2019-08, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-019-0492-x
PMID:31363221
|
研究论文 | 通过单细胞表达相关性分析开发果蝇翅盘基因表达图谱 | 开发了基于基因表达相关性而非细胞定位的单细胞RNA测序数据分析方法 | 仅针对果蝇翅盘组织进行研究，方法在其他组织的适用性有待验证 | 构建发育中组织的完整基因表达图谱 | 果蝇翅盘组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 基因表达相关性分析 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7320 | 2025-10-06 |
A human liver cell atlas reveals heterogeneity and epithelial progenitors
2019-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1373-2
PMID:31292543
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人类肝脏细胞图谱，揭示肝脏细胞异质性和上皮祖细胞 | 首次在人类肝脏中发现内皮细胞、库普弗细胞和肝细胞的未知亚型，并鉴定出具有双向分化潜能的TROP2祖细胞群 | 样本量相对有限（9名供体），仅包含正常肝组织 | 解析人类肝脏细胞组成和异质性 | 人类正常肝脏组织细胞 | 单细胞生物学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 9名人类供体的约10,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |