单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7301 - 7320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7301 | 2025-10-06 |
Biased allelic expression in human primary fibroblast single cells
2015-Jan-08, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2014.12.001
PMID:25557783
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究人类原代成纤维细胞中基因的等位基因偏向性表达模式 | 首次在单细胞水平系统分析人类原代成纤维细胞的等位基因表达模式，发现76.4%的杂合SNV存在随机单等位基因表达 | 仅分析了单一时点的基因表达快照，未追踪等位基因表达的动态变化过程 | 探究单细胞水平等位基因表达的随机性和调控机制 | 人类原代成纤维细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 203个单个人类原代成纤维细胞，覆盖133,633个独特杂合SNV | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7302 | 2025-10-06 |
Dynamics of genomic clones in breast cancer patient xenografts at single-cell resolution
2015-Feb-19, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature13952
PMID:25470049
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研究论文 | 通过单细胞分辨率研究乳腺癌患者异种移植模型中基因组克隆的动态演化 | 首次在单细胞分辨率系统研究乳腺癌异种移植过程中克隆选择与动态演化的规律 | 研究样本量有限（15例），且仅在免疫缺陷小鼠模型中进行验证 | 探究乳腺癌异种移植过程中基因组克隆架构的变化规律和可重复性 | 原发性和转移性人类乳腺癌样本及免疫缺陷小鼠模型 | 癌症基因组学 | 乳腺癌 | 深度基因组测序,单细胞测序 | NA | 基因组测序数据,单细胞测序数据 | 15例乳腺癌病例 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 7303 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing identifies extracellular matrix gene expression by pancreatic circulating tumor cells
2014-Sep-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2014.08.029
PMID:25242334
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定胰腺循环肿瘤细胞中细胞外基质基因的表达特征 | 首次在单细胞水平揭示循环肿瘤细胞异常表达基质来源的细胞外基质基因，并发现SPARC基因敲低可抑制癌细胞迁移和侵袭 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 解析胰腺癌循环肿瘤细胞的分子特征及其在癌症转移中的作用 | 胰腺癌循环肿瘤细胞、匹配的原发肿瘤 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和有限人类胰腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 表位非依赖性微流控捕获技术结合单细胞RNA测序 |
| 7304 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq reveals dynamic paracrine control of cellular variation
2014-Jun-19, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature13437
PMID:24919153
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示细胞间通讯如何控制细胞异质性 | 首次证明干扰素介导的旁分泌信号传导在协调细胞群体动态响应中的关键作用 | 研究仅限于小鼠骨髓来源的树突状细胞，未验证其他细胞类型 | 理解基因表达变异的程度、基础和功能 | 1,700多个原代小鼠骨髓来源树突状细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过1,700个原代小鼠骨髓来源树突状细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7305 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals T helper cells synthesizing steroids de novo to contribute to immune homeostasis
2014-May-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2014.04.011
PMID:24813893
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现辅助性T细胞能够从头合成类固醇激素孕烯醇酮，并揭示其在免疫稳态中的作用 | 首次发现并表征了免疫细胞（特别是Th2细胞）具有从头合成类固醇的能力，提出了'淋巴类固醇'的新概念 | 研究主要聚焦于Th2细胞，其他免疫细胞类型的类固醇合成能力尚未完全探索 | 探究Th2细胞是否具有合成类固醇的能力及其在免疫调节中的作用 | 辅助性T细胞（Th2细胞）、B细胞、蠕虫感染模型 | 免疫学 | 蠕虫感染、免疫相关疾病 | 单细胞RNA测序，定量PCR | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7306 | 2025-10-06 |
PyClone: statistical inference of clonal population structure in cancer
2014-Apr, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2883
PMID:24633410
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研究论文 | 介绍用于推断癌症克隆群体结构的统计模型PyClone | 开发了贝叶斯聚类方法，能够在考虑片段拷贝数变化和正常细胞污染导致的等位基因不平衡情况下，对深度测序的体细胞突变进行克隆聚类并估计其细胞流行度 | NA | 推断癌症中的克隆群体结构 | 癌症中的体细胞突变 | 生物信息学 | 癌症 | 深度测序，单细胞测序验证 | 贝叶斯聚类模型 | 基因组测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 7307 | 2025-10-06 |
A tripartite transcription factor network regulates primordial germ cell specification in mice
2013-Aug, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/ncb2798
PMID:23851488
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研究论文 | 本研究揭示了一个由BLIMP1、PRDM14和AP2γ组成的三方转录因子网络调控小鼠原始生殖细胞特化的机制 | 首次发现BLIMP1、AP2γ和PRDM14三方相互依赖的转录网络足以实现PGC特化和表观基因组重置 | 研究主要基于小鼠模型，未涉及其他物种验证 | 探究原始生殖细胞特化过程中转录因子的组合功能 | 小鼠原始生殖细胞 | 发育生物学 | NA | 染色质免疫沉淀测序, 单细胞转录组分析 | NA | 基因组测序数据, 转录组数据 | 正常和突变型原始生殖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7308 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals bimodality in expression and splicing in immune cells
2013-Jun-13, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature12172
PMID:23685454
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示小鼠骨髓来源树突状细胞在免疫应答中基因表达和剪接模式的广泛双峰性变异 | 首次在单细胞水平发现关键免疫基因表达和RNA剪接模式的广泛双峰性变异，即使在高表达基因中也存在这种异质性 | 研究仅针对小鼠骨髓来源树突状细胞，结果在其他细胞类型中的普适性需要进一步验证 | 探究免疫细胞在单细胞水平的转录组异质性及其调控机制 | 小鼠骨髓来源树突状细胞(BMDCs) | 单细胞基因组学 | 免疫相关疾病 | 单细胞RNA测序，RNA-荧光原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量的小鼠骨髓来源树突状细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7309 | 2025-10-06 |
DNA template strand sequencing of single-cells maps genomic rearrangements at high resolution
2012-Nov, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2206
PMID:23042453
|
研究论文 | 开发了Strand-seq方法用于单细胞DNA模板链测序，实现了对姐妹染色单体交换的高分辨率定位 | 首次实现独立测序单细胞亲本DNA模板链，将SCE检测分辨率提高了数个数量级 | 仅在小鼠胚胎干细胞中进行了验证，样本量相对有限 | 开发高分辨率检测基因组重排的新方法 | 小鼠胚胎干细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞DNA测序 | NA | DNA序列数据 | 62个单细胞 | NA | 单细胞DNA测序 | NA | Strand-seq技术 |
| 7310 | 2025-10-06 |
Full-length mRNA-Seq from single-cell levels of RNA and individual circulating tumor cells
2012-Aug, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.2282
PMID:22820318
|
研究论文 | 本文介绍了一种适用于单细胞水平的全长mRNA测序方法Smart-Seq，并应用于循环肿瘤细胞的转录组分析 | 开发了改进的Smart-Seq协议，提高了转录本覆盖度，增强了对可变转录异构体和单核苷酸多态性的分析能力 | 单细胞基因表达估计存在增加的噪声 | 开发适用于单细胞水平的全转录组分析方法 | 单细胞RNA和黑色素瘤循环肿瘤细胞 | 基因组学 | 黑色素瘤 | mRNA测序，单细胞转录组学 | NA | RNA测序数据 | 总RNA稀释系列和少量细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | Smart-Seq协议 |
| 7311 | 2025-10-06 |
Drug targets: single-cell transcriptomics hastens unbiased discovery
2012-Jan, Trends in pharmacological sciences
IF:13.9Q1
DOI:10.1016/j.tips.2011.09.006
PMID:22032985
|
综述 | 本文探讨单细胞转录组学在神经精神药理学药物靶点发现中的应用价值 | 提出使用单细胞转录组学可无偏倚地发现被忽视的受体靶点，包括孤儿受体和受体异源二聚体 | 未提及具体实验验证结果和临床应用数据 | 推动神经精神药理学领域的新药靶点发现 | 神经元中的受体和通道蛋白 | 生物信息学 | 神经精神疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7312 | 2025-10-06 |
Development and applications of single-cell transcriptome analysis
2011-Apr, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.1557
PMID:21451510
|
综述 | 本文回顾了单细胞转录组分析技术的发展历程、应用潜力与未来展望 | 整合活细胞成像与谱系追踪技术，探索胚胎和成体个体细胞生理功能的完整基因表达网络 | NA | 解析基因型与表型关系，推动发育生物学和医学研究 | 胚胎和成体中的个体细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7313 | 2025-10-06 |
Transcriptome study for early hematopoiesis--achievement, challenge and new opportunity
2010-Jun, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.22065
PMID:20143329
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综述 | 本文综述了早期造血转录组研究的成就、挑战及单细胞转录组技术带来的新机遇 | 系统阐述了单细胞转录组方法和二代测序技术为早期造血研究提供的新机遇 | 造血干祖细胞稀有性对研究造成物理限制，传统基因组学技术难以实现全面转录组检测 | 理解控制早期造血的遗传程序并识别干预造血疾病的基因靶点 | 造血干祖细胞 | 基因组学 | 造血疾病 | 单细胞转录组测序, 二代测序 | 系统生物学方法 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7314 | 2025-10-06 |
Tracing the derivation of embryonic stem cells from the inner cell mass by single-cell RNA-Seq analysis
2010-May-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2010.03.015
PMID:20452321
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析追踪胚胎干细胞从内细胞团衍生的分子机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示ICM向ESC转化过程中的转录组变异和表观遗传调控变化 | 研究主要关注转录组水平变化，未深入验证功能机制 | 探索内细胞团向胚胎干细胞转化过程中的分子调控机制 | 小鼠胚胎内细胞团和胚胎干细胞 | 单细胞组学 | 发育生物学 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7315 | 2025-10-06 |
Landscape of spatial disruption of homeostasis in the middle temporal gyrus of epileptic patients
2025-Aug-01, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2025.149688
PMID:40350141
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析癫痫患者颞中回的细胞和空间稳态破坏 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学揭示癫痫患者颞中回的细胞空间重组和稳态破坏机制 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证发现 | 阐明癫痫相关的细胞和空间稳态破坏机制 | 癫痫患者和对照组的颞中回脑组织 | 空间转录组学 | 癫痫 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 空间转换张量算法 | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7316 | 2025-10-06 |
Immune checkpoint inhibitor-associated pneumonitis: focus on diagnosis and underlying mechanisms
2025-Jul-01, Current opinion in pulmonary medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/MCP.0000000000001175
PMID:40265506
|
综述 | 本文综述免疫检查点抑制剂相关肺炎的诊断、风险因素、治疗策略及其病理生理机制 | 重点关注支气管肺泡灌洗液单细胞RNA测序等新技术在揭示疾病机制中的应用 | NA | 更新对免疫检查点抑制剂相关肺炎的认识，特别关注其病理生理机制 | 免疫检查点抑制剂相关肺炎 | NA | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7317 | 2025-10-06 |
Improving predictive accuracy in multiple myeloma using a plasma cell profile derived from single-cell RNA sequencing
2025-May-29, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2025.287586
PMID:40438979
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序开发多发性骨髓瘤血浆细胞特征，建立整合风险分层模型改善预后预测准确性 | 首次在单细胞分辨率识别多发性骨髓瘤中具有染色体不稳定、高耐药性和高风险基因特征的侵袭性细胞亚群，并基于此开发7基因特征评分 | 样本量相对较小（12例新诊断患者），需要在更大队列中进一步验证 | 改善多发性骨髓瘤风险分层和预后预测准确性 | 多发性骨髓瘤患者肿瘤细胞 | 单细胞测序分析 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，数字PCR | Cox比例风险模型，整合风险分层模型 | 单细胞RNA测序数据，临床预后数据 | 12例新诊断多发性骨髓瘤患者，并在5个独立数据集中验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7318 | 2025-10-06 |
Elevating single-particle encapsulation in droplet microfluidics by utilizing surface acoustic wave and flow control
2025-May-28, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d4lc00787e
PMID:40302630
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研究论文 | 提出了一种集成表面声波和鞘流控制的液滴微流控系统，显著提高了单颗粒封装效率 | 结合表面声波和鞘流控制实现颗粒线性排列，突破传统方法的泊松分布限制 | 未明确说明系统在更复杂生物样本中的应用限制 | 提高液滴微流控中单颗粒封装效率 | 聚苯乙烯微球、磁珠和H22细胞 | 微流控技术 | NA | 表面声波(SAW)、鞘流控制、液滴微流控 | NA | 实验数据 | 多种浓度溶液的聚苯乙烯微球、磁珠和H22细胞 | NA | 液滴微流控、单细胞分析 | NA | 集成表面声波和鞘流控制的液滴微流控系统 |
| 7319 | 2025-10-06 |
Image guided construction of a common coordinate framework for spatial transcriptome data
2025-May-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-01862-x
PMID:40413226
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研究论文 | 提出深度学习算法STaCker，通过图像配准统一空间转录组切片的坐标框架 | 开发了首个通过整合组织图像和基因表达构建复合图像表示的空间转录组坐标统一算法，仅使用合成数据进行训练 | 未提及算法在极端组织变形情况下的性能表现 | 解决空间转录组切片间缺乏统一坐标框架的问题，实现数据比较和整合 | 空间转录组数据切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 深度学习 | 图像、基因表达数据 | 多个基准测试数据集和真实空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7320 | 2025-10-06 |
Dynamic heterogeneity towards drug resistance in AML cells is primarily driven by epigenomic mechanism unveiled by multi-omics analysis
2025-May-21, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.05.038
PMID:40409464
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研究论文 | 通过多组学分析揭示急性髓系白血病细胞耐药性的动态异质性主要由表观基因组机制驱动 | 开发了新型多重单细胞RNA测序策略NAMUL-seq，并首次系统整合scRNA-seq、scATAC-seq、DNA甲基化分析和全外显子组测序来解析AML耐药机制 | 研究主要使用AML细胞系而非原代患者样本，且样本量有限 | 阐明AML细胞耐药性的细胞和分子机制 | AML细胞系（KG-1a、Kasumi-1和HL-60） | 多组学分析 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 染色质可及性分析, DNA甲基化分析, 全外显子组测序 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 基因组数据 | 3种AML细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 全外显子组测序 | NA | NA |