单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7281 - 7300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7281 | 2025-10-06 |
CD5L/AIM Regulates Lipid Biosynthesis and Restrains Th17 Cell Pathogenicity
2015-Dec-03, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2015.10.068
PMID:26607793
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CD5L/AIM是调节Th17细胞致病性的关键因子 | 首次发现CD5L通过调节脂质代谢和胆固醇生物合成来调控Th17细胞的致病性 | Th17细胞致病性和非致病性状态平衡机制仍不完全清楚 | 探索Th17细胞致病性调控机制 | Th17细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7282 | 2025-10-06 |
ZIFA: Dimensionality reduction for zero-inflated single-cell gene expression analysis
2015-Nov-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-015-0805-z
PMID:26527291
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研究论文 | 开发了一种专门针对零膨胀单细胞RNA-seq数据的降维方法ZIFA | 首次明确建模单细胞RNA-seq数据中的dropout特征，相比传统降维方法提高了建模准确性 | NA | 解决单细胞RNA-seq数据因dropout事件导致的零膨胀问题，改进数据降维效果 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 因子分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7283 | 2025-10-06 |
Single-cell genomics of a rare environmental alphaproteobacterium provides unique insights into Rickettsiaceae evolution
2015-Nov, The ISME journal
DOI:10.1038/ismej.2015.46
PMID:25848874
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研究论文 | 通过单细胞基因组学发现并解析了一种罕见环境α-变形菌，为立克次体科的进化提供了新见解 | 发现了立克次体科的深部分支姐妹谱系，首次在该科中发现趋化基因和垂直遗传鞭毛基因 | 仅获得部分基因组序列，样本来源单一（仅从Damariscotta湖采样） | 研究立克次体科细菌的起源和进化机制 | 罕见环境α-变形菌'Candidatus Arcanobacter lacustris' | 微生物基因组学 | 立克次体病 | 单细胞基因组测序 | NA | 基因组数据 | 稀有微生物细胞（具体数量未说明） | NA | 单细胞基因组学 | NA | NA |
| 7284 | 2025-10-06 |
Defining the three cell lineages of the human blastocyst by single-cell RNA-seq
2015-Oct-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.131235
PMID:26487783
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更正 | 本文是对发表于《Development》期刊的一篇论文中图3标签错误的更正说明 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7285 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-Seq resolves cellular complexity in sensory organs from the neonatal inner ear
2015-Oct-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms9557
PMID:26469390
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解析了新生小鼠内耳感觉器官中的细胞复杂性 | 首次对新生小鼠耳蜗和前庭感觉上皮进行单细胞转录组分析，重建了细胞类型特异性分化的时间进程 | 研究仅针对新生小鼠，样本数量有限（301个细胞），未涵盖成年个体 | 解析内耳感觉上皮的细胞异质性和发育过程 | 新生小鼠的椭圆囊（前庭）和耳蜗感觉上皮细胞 | 单细胞组学 | 听力障碍 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 301个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7286 | 2025-10-06 |
Somatic mutation in single human neurons tracks developmental and transcriptional history
2015-Oct-02, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aab1785
PMID:26430121
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研究论文 | 通过单细胞测序研究人类大脑神经元体细胞突变的发育和转录历史 | 首次系统调查人类大脑神经元体细胞单核苷酸变异景观，发现神经元突变反映活跃转录期间的损伤，而非DNA复制错误 | 样本量较小（仅36个神经元），仅来自大脑皮层，未涵盖其他脑区 | 探索人类大脑神经元体细胞突变的特征和形成机制 | 来自三名正常个体大脑皮层的36个神经元 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组序列数据 | 36个神经元（来自3名正常个体） | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 7287 | 2025-10-06 |
Computational assignment of cell-cycle stage from single-cell transcriptome data
2015-Sep-01, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2015.06.021
PMID:26142758
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研究论文 | 本文比较了五种监督机器学习方法和一种定制预测器在基于单细胞转录组数据分配细胞周期阶段方面的性能 | 系统评估不同归一化策略和先验知识使用对细胞周期阶段预测性能的影响，并开发了基于PCA的方法和定制预测器 | 方法在已发布数据集上测试，未在新实验数据上验证 | 开发计算方法来准确分配单细胞的细胞周期阶段 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督机器学习, PCA, 定制预测器 | 单细胞转录组数据 | 已发布数据集中的单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7288 | 2025-10-06 |
BASiCS: Bayesian Analysis of Single-Cell Sequencing Data
2015-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1004333
PMID:26107944
|
研究论文 | 提出一种用于单细胞测序数据贝叶斯分析的集成分层模型BASiCS | 集成贝叶斯分层模型，可同时估计细胞特异性标准化常数、基于spike-in基因量化技术变异、分解总变异为技术和生物组分 | 仅在小鼠胚胎干细胞数据上验证，需要spike-in基因作为技术对照 | 解决单细胞测序数据中技术噪声高的问题，识别真正的基因表达异质性 | 单细胞mRNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞mRNA测序 | 贝叶斯分层模型 | 基因表达计数数据 | 小鼠胚胎干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7289 | 2025-10-06 |
Spatial reconstruction of single-cell gene expression data
2015-May, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.3192
PMID:25867923
|
研究论文 | 提出一种名为Seurat的计算方法，通过整合单细胞RNA测序数据和原位RNA模式来推断细胞的空间定位 | 开发了首个能够整合单细胞RNA-seq数据与空间信息以重建基因表达空间模式的计算策略 | 方法依赖于单细胞RNA-seq数据的质量以及可用的原位RNA模式参考数据 | 开发计算方法来重建单细胞基因表达数据的空间定位 | 斑马鱼胚胎中分离的851个单细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 原位RNA分析 | Seurat算法 | 基因表达数据, 空间定位数据 | 851个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7290 | 2025-10-06 |
Brain structure. Cell types in the mouse cortex and hippocampus revealed by single-cell RNA-seq
2015-Mar-06, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aaa1934
PMID:25700174
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术对小鼠大脑皮层和海马体细胞进行分类研究 | 首次通过大规模单细胞RNA测序揭示了小鼠大脑47种分子特征不同的细胞亚类，发现了新的细胞类型标记基因 | 研究仅限于小鼠体感皮层和海马CA1区域，未涵盖其他脑区 | 解析哺乳动物大脑皮层和海马体的细胞类型组成与分子特征 | 小鼠体感皮层和海马CA1区域的细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7291 | 2025-10-06 |
Integrated genome and transcriptome sequencing of the same cell
2015-Mar, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.3129
PMID:25599178
|
研究论文 | 开发了一种在同一细胞中同时测序基因组DNA和mRNA的集成方法 | 提出准线性扩增策略，无需在扩增前物理分离核酸即可从同一细胞定量基因组DNA和mRNA | NA | 实现同一细胞中基因组变异和转录组异质性的直接比较 | 单细胞 | 单细胞测序技术 | 癌症 | 单细胞基因组测序, 单细胞转录组测序 | NA | 基因组DNA, mRNA | NA | NA | 单细胞基因组测序, 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 7292 | 2025-10-06 |
Biased allelic expression in human primary fibroblast single cells
2015-Jan-08, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2014.12.001
PMID:25557783
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究人类原代成纤维细胞中基因的等位基因偏向性表达模式 | 首次在单细胞水平系统分析人类原代成纤维细胞的等位基因表达模式，发现76.4%的杂合SNV存在随机单等位基因表达 | 仅分析了单一时点的基因表达快照，未追踪等位基因表达的动态变化过程 | 探究单细胞水平等位基因表达的随机性和调控机制 | 人类原代成纤维细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 203个单个人类原代成纤维细胞，覆盖133,633个独特杂合SNV | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7293 | 2025-10-06 |
Dynamics of genomic clones in breast cancer patient xenografts at single-cell resolution
2015-Feb-19, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature13952
PMID:25470049
|
研究论文 | 通过单细胞分辨率研究乳腺癌患者异种移植模型中基因组克隆的动态演化 | 首次在单细胞分辨率系统研究乳腺癌异种移植过程中克隆选择与动态演化的规律 | 研究样本量有限（15例），且仅在免疫缺陷小鼠模型中进行验证 | 探究乳腺癌异种移植过程中基因组克隆架构的变化规律和可重复性 | 原发性和转移性人类乳腺癌样本及免疫缺陷小鼠模型 | 癌症基因组学 | 乳腺癌 | 深度基因组测序,单细胞测序 | NA | 基因组测序数据,单细胞测序数据 | 15例乳腺癌病例 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 7294 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing identifies extracellular matrix gene expression by pancreatic circulating tumor cells
2014-Sep-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2014.08.029
PMID:25242334
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定胰腺循环肿瘤细胞中细胞外基质基因的表达特征 | 首次在单细胞水平揭示循环肿瘤细胞异常表达基质来源的细胞外基质基因，并发现SPARC基因敲低可抑制癌细胞迁移和侵袭 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 解析胰腺癌循环肿瘤细胞的分子特征及其在癌症转移中的作用 | 胰腺癌循环肿瘤细胞、匹配的原发肿瘤 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和有限人类胰腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 表位非依赖性微流控捕获技术结合单细胞RNA测序 |
| 7295 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq reveals dynamic paracrine control of cellular variation
2014-Jun-19, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature13437
PMID:24919153
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示细胞间通讯如何控制细胞异质性 | 首次证明干扰素介导的旁分泌信号传导在协调细胞群体动态响应中的关键作用 | 研究仅限于小鼠骨髓来源的树突状细胞，未验证其他细胞类型 | 理解基因表达变异的程度、基础和功能 | 1,700多个原代小鼠骨髓来源树突状细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过1,700个原代小鼠骨髓来源树突状细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7296 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals T helper cells synthesizing steroids de novo to contribute to immune homeostasis
2014-May-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2014.04.011
PMID:24813893
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现辅助性T细胞能够从头合成类固醇激素孕烯醇酮，并揭示其在免疫稳态中的作用 | 首次发现并表征了免疫细胞（特别是Th2细胞）具有从头合成类固醇的能力，提出了'淋巴类固醇'的新概念 | 研究主要聚焦于Th2细胞，其他免疫细胞类型的类固醇合成能力尚未完全探索 | 探究Th2细胞是否具有合成类固醇的能力及其在免疫调节中的作用 | 辅助性T细胞（Th2细胞）、B细胞、蠕虫感染模型 | 免疫学 | 蠕虫感染、免疫相关疾病 | 单细胞RNA测序，定量PCR | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7297 | 2025-10-06 |
PyClone: statistical inference of clonal population structure in cancer
2014-Apr, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2883
PMID:24633410
|
研究论文 | 介绍用于推断癌症克隆群体结构的统计模型PyClone | 开发了贝叶斯聚类方法，能够在考虑片段拷贝数变化和正常细胞污染导致的等位基因不平衡情况下，对深度测序的体细胞突变进行克隆聚类并估计其细胞流行度 | NA | 推断癌症中的克隆群体结构 | 癌症中的体细胞突变 | 生物信息学 | 癌症 | 深度测序，单细胞测序验证 | 贝叶斯聚类模型 | 基因组测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 7298 | 2025-10-06 |
A tripartite transcription factor network regulates primordial germ cell specification in mice
2013-Aug, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/ncb2798
PMID:23851488
|
研究论文 | 本研究揭示了一个由BLIMP1、PRDM14和AP2γ组成的三方转录因子网络调控小鼠原始生殖细胞特化的机制 | 首次发现BLIMP1、AP2γ和PRDM14三方相互依赖的转录网络足以实现PGC特化和表观基因组重置 | 研究主要基于小鼠模型，未涉及其他物种验证 | 探究原始生殖细胞特化过程中转录因子的组合功能 | 小鼠原始生殖细胞 | 发育生物学 | NA | 染色质免疫沉淀测序, 单细胞转录组分析 | NA | 基因组测序数据, 转录组数据 | 正常和突变型原始生殖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7299 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals bimodality in expression and splicing in immune cells
2013-Jun-13, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature12172
PMID:23685454
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示小鼠骨髓来源树突状细胞在免疫应答中基因表达和剪接模式的广泛双峰性变异 | 首次在单细胞水平发现关键免疫基因表达和RNA剪接模式的广泛双峰性变异，即使在高表达基因中也存在这种异质性 | 研究仅针对小鼠骨髓来源树突状细胞，结果在其他细胞类型中的普适性需要进一步验证 | 探究免疫细胞在单细胞水平的转录组异质性及其调控机制 | 小鼠骨髓来源树突状细胞(BMDCs) | 单细胞基因组学 | 免疫相关疾病 | 单细胞RNA测序，RNA-荧光原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量的小鼠骨髓来源树突状细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7300 | 2025-10-06 |
DNA template strand sequencing of single-cells maps genomic rearrangements at high resolution
2012-Nov, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2206
PMID:23042453
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研究论文 | 开发了Strand-seq方法用于单细胞DNA模板链测序，实现了对姐妹染色单体交换的高分辨率定位 | 首次实现独立测序单细胞亲本DNA模板链，将SCE检测分辨率提高了数个数量级 | 仅在小鼠胚胎干细胞中进行了验证，样本量相对有限 | 开发高分辨率检测基因组重排的新方法 | 小鼠胚胎干细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞DNA测序 | NA | DNA序列数据 | 62个单细胞 | NA | 单细胞DNA测序 | NA | Strand-seq技术 |