单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7281 - 7300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7281 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals molecular and functional platelet bias of aged haematopoietic stem cells
2016-Mar-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms11075
PMID:27009448
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示衰老造血干细胞在分子和功能上向血小板分化的偏向性 | 首次在单细胞水平识别出衰老造血干细胞中分子血小板启动和功能血小板偏向性增加，并发现一类专门产生血小板的HSCs新亚群 | NA | 探究衰老造血干细胞谱系输出改变的机制 | 衰老造血干细胞(HSCs) | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7282 | 2025-10-06 |
Parallel single-cell sequencing links transcriptional and epigenetic heterogeneity
2016-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.3728
PMID:26752769
|
研究论文 | 开发了可并行进行单细胞全基因组甲基化组和转录组测序的scM&T-seq方法，用于探索转录与表观遗传变异之间的关联 | 首次实现了单细胞水平上甲基化组和转录组的并行测序，发现了异质性甲基化远端调控元件与多能性基因转录之间未被认知的关联 | 仅对61个小鼠胚胎干细胞进行了分析，样本规模有限 | 探索单细胞水平转录与表观遗传变异之间的关联 | 小鼠胚胎干细胞 | 表观遗传学 | NA | 单细胞全基因组甲基化测序, 单细胞转录组测序 | NA | 甲基化数据, 转录组数据 | 61个小鼠胚胎干细胞 | NA | 单细胞多组学 | NA | scM&T-seq（单细胞甲基化组和转录组测序） |
| 7283 | 2025-10-06 |
Assessing similarity to primary tissue and cortical layer identity in induced pluripotent stem cell-derived cortical neurons through single-cell transcriptomics
2016-Mar-01, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddv637
PMID:26740550
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学评估iPSC来源的皮质神经元与原始组织的相似性及皮质层身份 | 首次在单细胞分辨率系统评估iPSC来源皮质神经元与原始皮质神经元的相似性，发现神经元层标记共表达现象 | 现有层标记可能无法完全区分所有细胞的皮质层身份 | 评估iPSC来源皮质神经元与原始组织的相似性及层身份特征 | iPSC来源的皮质神经元 | 单细胞转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RT-qPCR, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7284 | 2025-10-06 |
Classification of low quality cells from single-cell RNA-seq data
2016-Feb-17, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-016-0888-1
PMID:26887813
|
研究论文 | 提出一种从单细胞RNA测序数据中检测低质量细胞的通用方法 | 使用超过20个生物和技术特征组成的精选特征集，相比传统方法分类准确率提高30%以上 | NA | 开发单细胞RNA测序数据中低质量细胞的检测方法 | CD4+ T细胞、骨髓树突状细胞和小鼠胚胎干细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过5,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7285 | 2024-08-07 |
Corrigendum: Characterizing noise structure in single-cell RNA-seq distinguishes genuine from technical stochastic allelic expression
2016-Jan-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms10415
PMID:26752026
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7286 | 2025-10-06 |
A step-by-step workflow for low-level analysis of single-cell RNA-seq data with Bioconductor
2016, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.9501.2
PMID:27909575
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研究论文 | 本文介绍了一个用于单细胞RNA测序数据低水平分析的逐步计算工作流程 | 提供了基于Bioconductor开源项目的完整单细胞RNA测序数据分析流程，涵盖从质量控制到细胞亚群识别的全过程 | 主要基于公开数据集进行演示，未涉及实验设计或特定生物学问题的深入探讨 | 开发单细胞RNA测序数据的标准化分析流程 | 造血干细胞、脑源性细胞、T辅助细胞和小鼠胚胎干细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因水平计数数据 | 多个公开数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7287 | 2025-10-06 |
Integration of electrophysiological recordings with single-cell RNA-seq data identifies neuronal subtypes
2016-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.3443
PMID:26689544
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研究论文 | 开发了一种结合电生理记录和单细胞RNA测序的方法来识别神经元亚型 | 首次将全细胞膜片钳记录与单细胞转录组测序相结合，揭示了神经元电生理特性与分子表型之间的直接联系 | 研究仅限于小鼠新皮质锥体细胞和中间神经元，样本规模相对有限 | 探索神经元电生理特性与分子表型之间的关系并识别神经元亚型 | 小鼠脑切片中的新皮质锥体细胞和中间神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 全细胞膜片钳记录, 逆转录, cDNA扩增 | NA | 电生理记录数据, 转录组数据 | 单个新皮质锥体细胞和中间神经元 | Illumina | 单细胞RNA-seq | Illumina测序平台 | Illumina文库制备和测序 |
| 7288 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing in cancer research
2016, Expert review of molecular diagnostics
IF:3.9Q1
DOI:10.1586/14737159.2016.1115345
PMID:26594792
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在癌症研究中的应用与前景 | 系统阐述单细胞测序技术在解析肿瘤异质性、识别细胞亚群方面的突破性能力 | 仍需解决技术、生物学和计算方面的挑战才能实现临床应用 | 探讨单细胞测序在癌症研究和精准医疗中的应用价值 | 肿瘤组织中的单个细胞 | 基因组学 | 癌症 | 单细胞DNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞DNA测序 | NA | NA |
| 7289 | 2025-10-06 |
Human cerebral organoids recapitulate gene expression programs of fetal neocortex development
2015-Dec-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1520760112
PMID:26644564
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较人类大脑类器官与胎儿新皮质的细胞组成和基因表达程序 | 首次系统比较大脑类器官与胎儿新皮质在神经祖细胞增殖和神经元分化过程中的基因表达程序相似性 | 类器官系统在多大程度上能完全重现体内发育过程仍不完全清楚 | 研究人类大脑类器官是否重现胎儿新皮质发育的基因表达程序 | 人类大脑类器官和胎儿新皮质组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 协变网络分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7290 | 2025-10-06 |
CD5L/AIM Regulates Lipid Biosynthesis and Restrains Th17 Cell Pathogenicity
2015-Dec-03, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2015.10.068
PMID:26607793
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CD5L/AIM是调节Th17细胞致病性的关键因子 | 首次发现CD5L通过调节脂质代谢和胆固醇生物合成来调控Th17细胞的致病性 | Th17细胞致病性和非致病性状态平衡机制仍不完全清楚 | 探索Th17细胞致病性调控机制 | Th17细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7291 | 2025-10-06 |
ZIFA: Dimensionality reduction for zero-inflated single-cell gene expression analysis
2015-Nov-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-015-0805-z
PMID:26527291
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研究论文 | 开发了一种专门针对零膨胀单细胞RNA-seq数据的降维方法ZIFA | 首次明确建模单细胞RNA-seq数据中的dropout特征，相比传统降维方法提高了建模准确性 | NA | 解决单细胞RNA-seq数据因dropout事件导致的零膨胀问题，改进数据降维效果 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 因子分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7292 | 2025-10-06 |
Single-cell genomics of a rare environmental alphaproteobacterium provides unique insights into Rickettsiaceae evolution
2015-Nov, The ISME journal
DOI:10.1038/ismej.2015.46
PMID:25848874
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研究论文 | 通过单细胞基因组学发现并解析了一种罕见环境α-变形菌，为立克次体科的进化提供了新见解 | 发现了立克次体科的深部分支姐妹谱系，首次在该科中发现趋化基因和垂直遗传鞭毛基因 | 仅获得部分基因组序列，样本来源单一（仅从Damariscotta湖采样） | 研究立克次体科细菌的起源和进化机制 | 罕见环境α-变形菌'Candidatus Arcanobacter lacustris' | 微生物基因组学 | 立克次体病 | 单细胞基因组测序 | NA | 基因组数据 | 稀有微生物细胞（具体数量未说明） | NA | 单细胞基因组学 | NA | NA |
| 7293 | 2025-10-06 |
Defining the three cell lineages of the human blastocyst by single-cell RNA-seq
2015-Oct-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.131235
PMID:26487783
|
更正 | 本文是对发表于《Development》期刊的一篇论文中图3标签错误的更正说明 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7294 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-Seq resolves cellular complexity in sensory organs from the neonatal inner ear
2015-Oct-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms9557
PMID:26469390
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解析了新生小鼠内耳感觉器官中的细胞复杂性 | 首次对新生小鼠耳蜗和前庭感觉上皮进行单细胞转录组分析，重建了细胞类型特异性分化的时间进程 | 研究仅针对新生小鼠，样本数量有限（301个细胞），未涵盖成年个体 | 解析内耳感觉上皮的细胞异质性和发育过程 | 新生小鼠的椭圆囊（前庭）和耳蜗感觉上皮细胞 | 单细胞组学 | 听力障碍 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 301个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7295 | 2025-10-06 |
Somatic mutation in single human neurons tracks developmental and transcriptional history
2015-Oct-02, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aab1785
PMID:26430121
|
研究论文 | 通过单细胞测序研究人类大脑神经元体细胞突变的发育和转录历史 | 首次系统调查人类大脑神经元体细胞单核苷酸变异景观，发现神经元突变反映活跃转录期间的损伤，而非DNA复制错误 | 样本量较小（仅36个神经元），仅来自大脑皮层，未涵盖其他脑区 | 探索人类大脑神经元体细胞突变的特征和形成机制 | 来自三名正常个体大脑皮层的36个神经元 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组序列数据 | 36个神经元（来自3名正常个体） | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 7296 | 2025-10-06 |
Computational assignment of cell-cycle stage from single-cell transcriptome data
2015-Sep-01, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2015.06.021
PMID:26142758
|
研究论文 | 本文比较了五种监督机器学习方法和一种定制预测器在基于单细胞转录组数据分配细胞周期阶段方面的性能 | 系统评估不同归一化策略和先验知识使用对细胞周期阶段预测性能的影响，并开发了基于PCA的方法和定制预测器 | 方法在已发布数据集上测试，未在新实验数据上验证 | 开发计算方法来准确分配单细胞的细胞周期阶段 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督机器学习, PCA, 定制预测器 | 单细胞转录组数据 | 已发布数据集中的单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7297 | 2025-10-06 |
BASiCS: Bayesian Analysis of Single-Cell Sequencing Data
2015-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1004333
PMID:26107944
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研究论文 | 提出一种用于单细胞测序数据贝叶斯分析的集成分层模型BASiCS | 集成贝叶斯分层模型，可同时估计细胞特异性标准化常数、基于spike-in基因量化技术变异、分解总变异为技术和生物组分 | 仅在小鼠胚胎干细胞数据上验证，需要spike-in基因作为技术对照 | 解决单细胞测序数据中技术噪声高的问题，识别真正的基因表达异质性 | 单细胞mRNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞mRNA测序 | 贝叶斯分层模型 | 基因表达计数数据 | 小鼠胚胎干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7298 | 2025-10-06 |
Spatial reconstruction of single-cell gene expression data
2015-May, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.3192
PMID:25867923
|
研究论文 | 提出一种名为Seurat的计算方法，通过整合单细胞RNA测序数据和原位RNA模式来推断细胞的空间定位 | 开发了首个能够整合单细胞RNA-seq数据与空间信息以重建基因表达空间模式的计算策略 | 方法依赖于单细胞RNA-seq数据的质量以及可用的原位RNA模式参考数据 | 开发计算方法来重建单细胞基因表达数据的空间定位 | 斑马鱼胚胎中分离的851个单细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 原位RNA分析 | Seurat算法 | 基因表达数据, 空间定位数据 | 851个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7299 | 2025-10-06 |
Brain structure. Cell types in the mouse cortex and hippocampus revealed by single-cell RNA-seq
2015-Mar-06, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aaa1934
PMID:25700174
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术对小鼠大脑皮层和海马体细胞进行分类研究 | 首次通过大规模单细胞RNA测序揭示了小鼠大脑47种分子特征不同的细胞亚类，发现了新的细胞类型标记基因 | 研究仅限于小鼠体感皮层和海马CA1区域，未涵盖其他脑区 | 解析哺乳动物大脑皮层和海马体的细胞类型组成与分子特征 | 小鼠体感皮层和海马CA1区域的细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7300 | 2025-10-06 |
Integrated genome and transcriptome sequencing of the same cell
2015-Mar, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.3129
PMID:25599178
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研究论文 | 开发了一种在同一细胞中同时测序基因组DNA和mRNA的集成方法 | 提出准线性扩增策略，无需在扩增前物理分离核酸即可从同一细胞定量基因组DNA和mRNA | NA | 实现同一细胞中基因组变异和转录组异质性的直接比较 | 单细胞 | 单细胞测序技术 | 癌症 | 单细胞基因组测序, 单细胞转录组测序 | NA | 基因组DNA, mRNA | NA | NA | 单细胞基因组测序, 单细胞转录组测序 | NA | NA |