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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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7281 | 2024-10-14 |
A parathyroid hormone/salt-inducible kinase signaling axis controls renal vitamin D activation and organismal calcium homeostasis
2023-05-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI163627
PMID:36862513
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研究论文 | 本文研究了甲状旁腺激素(PTH)和盐诱导激酶(SIK)信号轴在肾脏维生素D激活和机体钙稳态中的作用 | 首次揭示了SIK在PTH信号下游调控肾脏1,25-维生素D生成的机制 | NA | 探讨PTH依赖的维生素D激活的信号机制 | 甲状旁腺激素(PTH)、盐诱导激酶(SIK)、维生素D基因模块 | NA | 慢性肾脏病-矿物质骨病(CKD-MBD) | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 包括小鼠、人胚胎干细胞衍生的肾脏类器官和慢性肾脏病-矿物质骨病(CKD-MBD)模型 |
7282 | 2024-10-14 |
Unveiling the novel immune and molecular signatures of ovarian cancer: insights and innovations from single-cell sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1288027
PMID:38022625
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在卵巢癌中的应用,揭示了其免疫和分子特征 | 单细胞测序技术能够提供比传统批量测序更详细的基因、转录组、蛋白质、表观基因组和代谢信息 | NA | 探讨单细胞测序技术在卵巢癌中的应用及其对诊断、治疗和预后指标开发的指导作用 | 卵巢癌的免疫和分子机制 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | NA | 基因、转录组、蛋白质、表观基因组和代谢数据 | NA |
7283 | 2024-10-14 |
Single cell functional genomics reveals plasticity of subcutaneous white adipose tissue (WAT) during early postnatal development
2021-11, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2021.101307
PMID:34298199
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠皮下白色脂肪组织(iWAT)在出生后早期发育阶段的细胞复杂性和可塑性 | 首次通过单细胞转录组学(scRNA-seq)和表观基因组学(snATAC-seq)技术,详细描述了小鼠皮下白色脂肪组织在出生后早期发育阶段的细胞亚型及其动态变化 | NA | 研究小鼠皮下白色脂肪组织在出生后早期发育阶段的细胞复杂性和可塑性 | 小鼠皮下白色脂肪组织(iWAT)的脂肪基质细胞(ASC)和脂肪细胞核 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学(scRNA-seq)和表观基因组学(snATAC-seq) | NA | 基因表达数据和染色质可及性数据 | 小鼠皮下白色脂肪组织在出生后第6天、第18天和第56天的样本 |
7284 | 2024-10-14 |
A single-cell and single-nucleus RNA-Seq toolbox for fresh and frozen human tumors
2020-05, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-0844-1
PMID:32405060
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研究论文 | 本文开发了一个用于新鲜和冷冻人类肿瘤的单细胞和单核RNA测序工具箱 | 本文首次系统地开发了一个工具箱,用于同时处理新鲜和冷冻临床肿瘤样本的单细胞和单核RNA测序 | 本文主要集中在工具箱的开发和初步验证,未涉及其在实际临床应用中的长期效果 | 开发和验证一个用于新鲜和冷冻人类肿瘤的单细胞和单核RNA测序的系统工具箱 | 新鲜和冷冻的人类肿瘤样本 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)和单核RNA测序(snRNA-Seq) | NA | RNA | 216,490个细胞和核,来自40个样本,涵盖23个标本,涉及8种肿瘤类型 |
7285 | 2024-10-12 |
Single-cell sequencing revealed the microglia-activated cell distribution in gray matter heterotopia
2025-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2024.101235
PMID:39391749
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
7286 | 2024-10-12 |
Single-cell sequencing reveals the immune microenvironment associated with gastric cancer
2025-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2024.101218
PMID:39391750
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
7287 | 2024-10-13 |
Landscape of epithelial cell subpopulations in the human esophageal squamous cell carcinoma microenvironment
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38091
PMID:39391485
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研究论文 | 研究揭示了人食管鳞状细胞癌微环境中上皮细胞亚群的景观及其在食管鳞状细胞癌发展中的作用 | 首次在单细胞分辨率下获得了食管鳞状细胞癌的上皮细胞图谱,并揭示了上皮细胞在癌症进展中的作用及其对NK/T细胞的免疫抑制信号 | NA | 探索上皮细胞亚群在食管鳞状细胞癌进展中的作用 | 食管鳞状细胞癌中的上皮细胞亚群及其在癌症发展中的作用 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及食管鳞状细胞癌及其邻近组织的11个主要细胞亚群和4个上皮细胞亚群 |
7288 | 2024-10-13 |
Single-cell RNA sequencing profiling of mouse cardiac cells in response to retinoic acid
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38301
PMID:39391486
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研究论文 | 研究了视黄酸对小鼠心脏细胞的单细胞RNA测序分析 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析视黄酸对小鼠心脏发育过程中细胞和分子机制的影响 | 仅限于小鼠模型,未涉及人类心脏疾病的研究 | 揭示视黄酸对心脏畸形的影响机制 | 小鼠心脏细胞 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 69,447个细胞,来自从E8.5到E17.5的七个发育阶段 |
7289 | 2024-10-13 |
Cross-species comparison of airway epithelium transcriptomics
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38259
PMID:39391497
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了人类、猴子、小鼠和大鼠在健康和哮喘条件下的肺细胞转录组相似性和差异 | 首次进行了跨物种的肺细胞转录组全面比较,揭示了跨物种细胞特异性标记基因、转录因子和生物通路的保守性 | 研究仅限于四种物种,且未涵盖所有可能的肺部疾病状态 | 探讨不同物种间肺细胞转录组的相似性和差异,以及这些差异在哮喘中的作用 | 人类、猴子、小鼠和大鼠的肺细胞在健康和哮喘条件下的转录组 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及四种物种的肺细胞样本 |
7290 | 2024-10-13 |
Germinal center B-cell subgroups in the tumor microenvironment cannot be overlooked: Their involvement in prognosis, immunotherapy response, and treatment resistance in head and neck squamous carcinoma
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37726
PMID:39391510
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了头颈部鳞状细胞癌中的B细胞亚群,并构建了相关的风险预测模型 | 首次将生发中心B细胞(GCB)识别为B细胞特异性预后生物标志物,填补了头颈部鳞状细胞癌遗传预后预测模型的研究空白 | NA | 寻找新的生物标志物以实现头颈部鳞状细胞癌的早期诊断和预测早期复发和转移 | 头颈部鳞状细胞癌中的B细胞亚群及其在预后、免疫治疗反应和治疗抵抗中的作用 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 头颈部鳞状细胞癌组织和外周血样本 |
7291 | 2024-10-13 |
Single-cell RNA sequencing reveals vascularization-associated cell subpopulations in dental pulp: PDGFRβ+ DPSCs with activated PI3K/AKT pathway
2024-Oct-09, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxae051
PMID:39167061
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了牙髓中与血管化相关的细胞亚群,特别是PDGFRβ+ DPSCs,并探讨了其通过激活PI3K/AKT通路在牙髓再生中的作用 | 本研究首次定义了PDGFRβ+ DPSCs亚群,并揭示了其在牙髓再生中的重要作用和临床转化潜力 | 本研究主要集中在体外和基因编辑小鼠模型中,尚未进行临床试验验证 | 解决牙髓再生治疗中的挑战,特别是不同年龄和条件供体来源的DPSCs异质性问题 | 牙髓中的DPSCs及其亚群PDGFRβ+ DPSCs | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 基因编辑小鼠模型和体外培养的DPSCs |
7292 | 2024-10-13 |
Intestinal newborn regulatory B cell antibodies modulate microbiota communities
2024-Oct-09, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2024.08.010
PMID:39243760
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研究论文 | 研究新生儿调节性B细胞产生的抗体如何调节微生物群落 | 首次发现新生儿调节性B细胞通过IL-10负调节IgM的产生,影响早期微生物群落的多样性和合作 | NA | 探讨新生儿调节性B细胞在早期生命中对微生物群落的影响 | 新生儿调节性B细胞及其产生的抗体 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 205个单克隆抗体 |
7293 | 2024-10-13 |
Colorectal cancer-associated bacteria are broadly distributed in global microbiomes and drivers of precancerous change
2024-10-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-70702-1
PMID:39384807
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研究论文 | 研究分析了全球微生物组中与结直肠癌相关的细菌,并探讨了这些细菌在癌前病变中的作用 | 首次通过基因水平聚类方法识别出与结直肠癌或健康相关的细菌基因簇,并验证了这些细菌在癌前病变中的作用 | 研究主要基于已发表的宏基因组数据,缺乏对新样本的验证 | 确定全球人群中与结直肠癌和健康相关的肠道细菌的规模和成员 | 全球微生物组中的肠道细菌及其与结直肠癌的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 宏基因组测序 | NA | 基因数据 | 使用已发表的全球微生物组调查中的超深度宏基因组测序数据 |
7294 | 2024-10-13 |
Single-cell analysis reveals alternations between the aged and young mice prostates
2024-Oct-09, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00666-x
PMID:39385256
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了老年和年轻小鼠前列腺的细胞类型和基因表达变化 | 首次揭示了老年小鼠前列腺中细胞类型和基因表达的显著变化,包括间充质细胞和免疫细胞比例的增加,以及与细胞衰老、氧化应激和再生相关的基因和通路的改变 | 研究仅限于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类 | 探讨老年和年轻小鼠前列腺的细胞和分子变化 | 2个月和24个月的小鼠前列腺组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | UMAP算法 | 基因表达数据 | 2个月和24个月的小鼠前列腺组织样本 |
7295 | 2024-10-13 |
Exosomal miR-106a-5p from highly metastatic colorectal cancer cells drives liver metastasis by inducing macrophage M2 polarization in the tumor microenvironment
2024-Oct-09, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03204-7
PMID:39385295
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研究论文 | 研究了高度转移性结直肠癌细胞分泌的外泌体miR-106a-5p如何通过诱导肿瘤微环境中巨噬细胞M2极化来驱动肝转移 | 揭示了外泌体miR-106a-5p在结直肠癌肝转移中的新机制,并发现其作为潜在生物标志物的可能性 | NA | 探讨外泌体miR-106a-5p在结直肠癌肝转移中的作用及其机制 | 结直肠癌细胞、巨噬细胞、外泌体miR-106a-5p | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、外泌体分离、免疫荧光、qRT-PCR、ELISA、流式细胞术 | NA | RNA | NA |
7296 | 2024-09-07 |
Bridging gaps: a neural network approach for cross-species scRNA-seq analysis in COVID-19
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105324
PMID:39236555
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
7297 | 2024-10-13 |
High mortality of Acinetobacter baumannii infection is attributed to macrophage-mediated induction of cytokine storm but preventable by naproxen
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105340
PMID:39303669
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研究论文 | 研究探讨了多药耐药鲍曼不动杆菌感染的高死亡率机制,并发现萘普生可预防由巨噬细胞介导的细胞因子风暴 | 揭示了鲍曼不动杆菌感染中巨噬细胞介导的细胞因子风暴机制,并发现萘普生可有效抑制炎症反应和M1极化,从而保护宿主免受致命感染 | NA | 解析鲍曼不动杆菌感染的高死亡率机制,并探索控制耐药感染的新策略 | 鲍曼不动杆菌感染的免疫反应和细胞因子风暴机制 | 免疫学 | 感染性疾病 | 流式细胞术、RNA测序、qRT-PCR、ELISA和单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
7298 | 2024-10-13 |
Neural network-assisted humanisation of COVID-19 hamster transcriptomic data reveals matching severity states in human disease
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105312
PMID:39317638
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研究论文 | 本文利用神经网络辅助的方法,分析了COVID-19仓鼠和人类单细胞转录组数据,揭示了不同疾病严重程度下的跨物种相似性 | 首次使用变分自编码器神经网络量化跨物种和疾病严重程度的转录组相似性,并识别出与疾病相关的关键基因和信号通路 | 仅限于分析仓鼠和人类的数据,未涉及其他动物模型 | 研究COVID-19在仓鼠和人类中的疾病机制,并开发跨物种的精确治疗策略 | COVID-19仓鼠和人类的单细胞转录组数据 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞转录组测序(scRNAseq) | 变分自编码器(VAE) | 转录组数据 | 来自人类和仓鼠的血液白细胞样本 |
7299 | 2024-10-13 |
Single-cell multi-omics map of human fetal blood in Down syndrome
2024-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07946-4
PMID:39322663
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研究论文 | 研究整合了单细胞转录组学、染色质可及性和空间转录组学数据,分析了唐氏综合征胎儿血液中的造血异常 | 首次建立了唐氏综合征胎儿血液的单细胞多组学图谱,揭示了基因表达差异依赖于细胞类型和环境,并发现了造血干细胞在唐氏综合征中的分化倾向 | 研究样本量较小,仅包括3个二体和15个三体胎儿,可能影响结果的普适性 | 理解唐氏综合征中造血异常的分子机制 | 唐氏综合征胎儿的肝脏和骨髓样本 | 数字病理学 | 唐氏综合征 | 单细胞转录组学、染色质可及性分析、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | 3个二体和15个三体胎儿的肝脏和骨髓样本,共110万个细胞 |
7300 | 2024-10-13 |
Revealing a cancer-associated fibroblast-based risk signature for pancreatic adenocarcinoma through single-cell and bulk RNA-seq analysis
2024-Sep-26, Aging
DOI:10.18632/aging.206043
PMID:39332020
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研究论文 | 通过单细胞和批量RNA测序分析揭示胰腺腺癌中基于癌症相关成纤维细胞的风险特征 | 首次探索了癌症相关成纤维细胞(CAF)在胰腺腺癌(PAAD)中的预后意义,并构建了一个基于CAF的七基因风险特征 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据,可能存在数据偏差和样本量不足的问题 | 探索胰腺腺癌中癌症相关成纤维细胞的预后意义,并构建预测模型 | 胰腺腺癌中的癌症相关成纤维细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序 | LASSO回归和诺模图模型 | RNA测序数据和微阵列数据 | TCGA-PAAD队列中的正常和肿瘤样本,以及GSE155698数据集中的单细胞RNA测序数据 |