单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7261 - 7280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7261 | 2025-10-06 |
Analysis of allelic expression patterns in clonal somatic cells by single-cell RNA-seq
2016-11, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/ng.3678
PMID:27668657
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析克隆体细胞中的等位基因表达模式 | 首次在克隆原代小鼠成纤维细胞和新鲜分离的人类CD8 T细胞中同时分析克隆性和动态性单等位基因表达模式 | 主要关注最弱表达基因，克隆性aRME检测率极低(<1%) | 解析体细胞中随机单等位基因表达(aRME)的克隆遗传性与动态随机性 | 克隆原代小鼠成纤维细胞和人类CD8 T细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 克隆原代小鼠成纤维细胞和人类CD8 T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7262 | 2025-10-06 |
Direct chromosome-length haplotyping by single-cell sequencing
2016-11, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.209841.116
PMID:27646535
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研究论文 | 介绍一种通过单细胞测序直接获得染色体长度单倍型的新方法 | 首次使用单细胞DNA模板链测序技术直接构建完整染色体长度的单倍型，无需世代信息或统计推断 | NA | 开发直接绘制每个亲本染色体完整单倍型的方法 | 人类HapMap个体和家系三人的基因组 | 基因组学 | 癌症 | 单细胞DNA模板链测序 | NA | 基因组测序数据 | HapMap个体NA12878和家系三人 | NA | 单细胞测序 | NA | Strand-seq单细胞DNA模板链测序技术 |
| 7263 | 2025-10-06 |
A generic, cost-effective, and scalable cell lineage analysis platform
2016-11, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.202903.115
PMID:27558250
|
研究论文 | 开发了一种通用、经济高效且可扩展的单细胞谱系分析平台 | 整合了生物化学与计算方法，提供回顾性、成本效益高且可扩展的单细胞谱系分析解决方案 | 仅通过体外培养的细胞树进行验证，尚未在复杂体内环境中测试 | 开发改进的单细胞谱系分析方法 | 单个细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 靶向单细胞测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞谱系分析 | NA | 整合生物化学-计算流程，输入单个细胞并生成谱系树 |
| 7264 | 2025-10-06 |
Characterizing polymorphic inversions in human genomes by single-cell sequencing
2016-11, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.201160.115
PMID:27472961
|
研究论文 | 本研究通过单细胞链测序技术开发了一种识别和表征人类基因组中多态性倒位的新方法 | 结合单细胞DNA模板链测序(Strand-seq)与定制分析软件，首次实现了在单细胞水平高分辨率发现、定位和基因分型基因组重排 | NA | 研究人类基因组中的结构变异和基因组异质性 | 人类基因组中的多态性倒位和结构重排 | 基因组学 | NA | 单细胞DNA模板链测序(Strand-seq) | NA | 基因组测序数据 | 两名无关个体的全基因组 | NA | 单细胞DNA测序 | NA | 单细胞链测序(Strand-seq) |
| 7265 | 2025-10-06 |
A Single-Cell Transcriptome Atlas of the Human Pancreas
2016-10-26, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2016.09.002
PMID:27693023
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术构建了人类胰腺细胞图谱 | 开发了结合FACS、机器人和CEL-Seq2协议的自动化平台，首次在单细胞水平系统解析人类胰腺细胞类型 | 样本来源于已故器官捐献者，可能无法完全代表健康人群的胰腺状态 | 建立人类胰腺细胞类型及其标记基因的完整目录 | 人类胰腺细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 数千个单胰腺细胞（来自已故器官捐献者） | NA | 单细胞RNA-seq | CEL-Seq2 | 结合FACS和机器人的自动化单细胞转录组平台 |
| 7266 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptome Profiling of Human Pancreatic Islets in Health and Type 2 Diabetes
2016-10-11, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2016.08.020
PMID:27667667
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析健康人和2型糖尿病患者胰岛细胞的基因表达特征 | 首次在单细胞水平全面表征人类胰岛各细胞类型的转录程序，包括罕见的δ、γ、ε和星状细胞，并发现α、β和腺泡细胞的亚群 | 功能验证研究尚未完成，发现的候选基因需要进一步实验确认 | 研究人类胰岛细胞在健康和2型糖尿病状态下的转录组特征 | 人类胰岛细胞，包括健康供体和2型糖尿病供体 | 单细胞生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 数千个人类胰岛细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7267 | 2025-10-06 |
Molecular Diversity of Midbrain Development in Mouse, Human, and Stem Cells
2016-Oct-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2016.09.027
PMID:27716510
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了人类、小鼠和干细胞来源的中脑发育分子多样性 | 首次在单细胞水平系统定义了人类胚胎腹侧中脑的细胞类型，并建立了评估干细胞来源多巴胺神经元保真度的定量方法 | 研究主要关注发育早期阶段，成年阶段的细胞类型变化仍需进一步探索 | 解析中脑发育的分子程序，为帕金森病细胞替代疗法提供基础 | 人类和小鼠的胚胎腹侧中脑组织，以及人类多能干细胞来源的多巴胺神经元 | 单细胞基因组学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠中脑发育多个阶段的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7268 | 2025-10-06 |
scphaser: haplotype inference using single-cell RNA-seq data
2016-10-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btw484
PMID:27497440
|
研究论文 | 开发了一个用于利用单细胞RNA测序数据进行单倍型推断的R软件包 | 首次利用单细胞RNA-seq数据中的等位基因波动特性进行单倍型推断，能够对稀有变异和基因内远距离变异进行分型 | NA | 开发基于单细胞RNA测序数据的单倍型推断方法 | 人类和小鼠的转录组区域 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7269 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals that Differentiation and Spatial Signatures Shape Epidermal and Hair Follicle Heterogeneity
2016-09-28, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2016.08.010
PMID:27641957
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示小鼠表皮和毛囊异质性的分化与空间特征 | 首次在单细胞水平系统揭示表皮细胞异质性主要由分化状态和空间位置两个维度决定，并发现干细胞区室遵循相同的组织原则 | 研究仅限于小鼠模型，且样本数量相对有限（1,422个细胞） | 解析表皮组织细胞异质性的转录组基础和组织原理 | 小鼠休止期表皮和毛囊细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 1,422个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7270 | 2025-10-06 |
C. elegans Stress-Induced Sleep Emerges from the Collective Action of Multiple Neuropeptides
2016-09-26, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2016.07.048
PMID:27546573
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现秀丽隐杆线虫应激诱导睡眠由多种神经肽集体调控 | 首次揭示应激诱导睡眠由多个神经肽(nlp-8, flp-24, flp-13)协同作用而非单一神经肽控制 | 仅研究了四种最富集的神经肽，可能还有其他神经肽参与睡眠调控 | 探究秀丽隐杆线虫应激诱导睡眠的下游调控机制 | 秀丽隐杆线虫的ALA神经元及其表达的神经肽 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序，基因突变，基因过表达 | NA | 基因表达数据，行为数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7271 | 2025-10-06 |
Zika Virus Disrupts Phospho-TBK1 Localization and Mitosis in Human Neuroepithelial Stem Cells and Radial Glia
2016-09-06, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2016.08.038
PMID:27568284
|
研究论文 | 本研究通过建立人神经上皮干细胞模型，揭示了寨卡病毒通过破坏磷酸化TBK1定位和细胞分裂导致神经发育缺陷的机制 | 首次发现寨卡病毒感染导致神经干细胞中磷酸化TBK1线粒体隔离和中心体耗竭，并建立人神经干细胞模型系统 | 模型系统可能无法完全模拟体内复杂的神经发育环境 | 探究寨卡病毒相关小头畸形和神经发育缺陷的细胞分子机制 | 人神经上皮干细胞、放射状胶质细胞、胎儿脑切片和小头畸形脑组织 | 发育神经生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、组织切片 | 多种神经干细胞类型和脑组织样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7272 | 2025-10-06 |
A single-cell resolution map of mouse hematopoietic stem and progenitor cell differentiation
2016-08-25, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood-2016-05-716480
PMID:27365425
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序绘制了小鼠造血干细胞和祖细胞分化的单细胞分辨率图谱 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统分析超过1600个HSPC，开发了可投射多个独立数据集的单细胞分辨率表达图谱，并创建了便于可视化查询的Web界面 | 研究仅针对小鼠模型，结果在人类系统中的适用性需要进一步验证 | 绘制造血干细胞和祖细胞分化的单细胞分辨率分子图谱 | 小鼠造血干细胞和祖细胞 | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序，索引分选，外部spike-in对照 | NA | 单细胞基因表达数据 | 超过1600个单细胞HSPC | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7273 | 2025-10-06 |
De Novo Prediction of Stem Cell Identity using Single-Cell Transcriptome Data
2016-08-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2016.05.010
PMID:27345837
|
研究论文 | 提出一种基于单细胞转录组数据预测干细胞身份的计算方法StemID | 利用谱系树拓扑结构和转录组组成开发了首个无需先验知识的干细胞识别算法 | 方法依赖于单细胞转录组数据的质量和完整性 | 开发识别干细胞的计算方法 | 小肠Lgr5+细胞、骨髓造血干细胞和人类胰腺细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 谱系树算法 | 单细胞转录组数据 | 多个组织类型的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7274 | 2025-10-06 |
Resolving early mesoderm diversification through single-cell expression profiling
2016-07-14, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature18633
PMID:27383781
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠原肠胚形成期外胚层和新生中胚层细胞的转录组，揭示早期中胚层分化机制 | 首次在哺乳动物原肠胚形成过程中提供转录组范围内的体内视角，并推翻先前关于Tal1基因功能的结论 | 原肠胚形成期细胞数量有限，样本量相对较小 | 解析早期中胚层分化的分子机制 | 小鼠胚胎外胚层和Flk1(+)新生中胚层细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1,205个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7275 | 2025-10-06 |
Oligodendrocyte heterogeneity in the mouse juvenile and adult central nervous system
2016-Jun-10, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aaf6463
PMID:27284195
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小鼠中枢神经系统少突胶质细胞的异质性 | 首次在单细胞水平系统揭示少突胶质细胞谱系存在13个不同亚群，发现不同于传统OPC的第二个Pdgfra(+)血管旁群体 | 研究仅基于小鼠模型，人类中枢神经系统中的情况可能有所不同 | 探究小鼠中枢神经系统中少突胶质细胞的分化和成熟动态 | 小鼠幼年和成年中枢神经系统的少突胶质细胞谱系 | 单细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5072个少突胶质细胞谱系细胞，来自10个不同脑区 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7276 | 2025-10-06 |
Distinct myeloid progenitor-differentiation pathways identified through single-cell RNA sequencing
2016-06, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/ni.3412
PMID:27043410
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别出不同的髓系祖细胞分化途径 | 发现早期造血谱系分叉在髓系谱系与其他造血谱系分离之前就已存在，挑战了现有造血模型 | NA | 探索髓系祖细胞的分化途径 | 前粒细胞-巨噬细胞祖细胞(pre-GMs) | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7277 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Lineage and X Chromosome Dynamics in Human Preimplantation Embryos
2016-May-05, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2016.03.023
PMID:27062923
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术绘制人类胚胎发育转录图谱，揭示谱系分化和X染色体动态 | 首次在人类胚胎中揭示谱系特异性基因共表达中间状态，发现与小鼠不同的X染色体剂量补偿机制 | 样本数量有限（88个胚胎），仅关注植入前发育阶段 | 探索人类早期胚胎发育过程中的细胞谱系分化和X染色体调控机制 | 人类植入前胚胎细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 88个人类胚胎中的1,529个单个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7278 | 2025-10-06 |
Single-Cell Genomics for Virology
2016-05-04, Viruses
DOI:10.3390/v8050123
PMID:27153082
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综述 | 本文总结了单细胞测序技术在病毒学领域的应用进展 | 首次系统总结了单细胞测序技术在病毒学研究中的最新应用 | NA | 探讨单细胞测序技术在病毒学研究中的应用价值 | 病毒多样性和细胞对病毒感染的反应 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7279 | 2025-10-06 |
Pooling across cells to normalize single-cell RNA sequencing data with many zero counts
2016-Apr-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-016-0947-7
PMID:27122128
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研究论文 | 提出一种通过细胞池化来标准化单细胞RNA测序数据的新方法 | 通过跨细胞池求和表达值进行标准化，再将池化大小因子解卷积为基于细胞的因子 | NA | 消除单细胞RNA测序数据中的细胞特异性偏差 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 解卷积方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7280 | 2025-10-06 |
OncoNEM: inferring tumor evolution from single-cell sequencing data
2016-Apr-15, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-016-0929-9
PMID:27083415
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研究论文 | 提出一种从单细胞测序数据推断肿瘤内进化谱系树的计算方法 | 开发了首个专门针对单细胞测序数据的概率性肿瘤进化推断方法 | 仅适用于体细胞单核苷酸变异数据，未验证其他类型突变 | 推断肿瘤细胞的克隆进化关系 | 肌肉浸润性膀胱癌和原发性血小板增多症患者样本 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞测序 | 概率模型 | 基因组变异数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |