单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 7261 - 7280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7261 | 2024-10-14 |
Prognostic risk model of LIHC T-cells based on scRNA-seq and RNA-seq and the regulation of the tumor immune microenvironment
2024-Oct-10, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01424-z
PMID:39388011
|
研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序和RNA测序数据，构建了LIHC患者的T细胞标记基因的预后风险模型，并探讨了该模型对肿瘤免疫微环境的影响 | 首次基于T细胞标记基因构建了LIHC患者的预后风险模型，并验证了其在独立数据集中的有效性 | 研究仅限于TCGA和GEO数据库的数据，未涵盖所有可能的临床样本 | 开发一种基于T细胞标记基因的预后风险模型，用于预测LIHC患者的生存结果和免疫治疗效果 | LIHC患者的T细胞标记基因及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序和RNA测序 | 风险模型 | 基因数据 | 860个T细胞标记基因，TCGA-LIHC数据集和独立GEO数据集 |
| 7262 | 2024-10-14 |
Discovery of prognostic lncRNAs in colorectal cancer using spatial transcriptomics
2024-Oct-10, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00728-1
PMID:39390212
|
研究论文 | 研究利用空间转录组学技术在结直肠癌中发现与预后相关的长链非编码RNA（lncRNA） | 首次利用空间转录组学技术研究结直肠癌中的lncRNA，提供更精确的细胞类型特异性表达数据 | 研究仅限于结直肠癌，且样本量较小，需要进一步验证和扩大样本量 | 发现结直肠癌中与转移相关的lncRNA，作为早期风险评估的潜在生物标志物 | 结直肠癌中的lncRNA及其在肿瘤转移中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | NA | RNA | 301个与恶性结直肠癌区域相关的lncRNA |
| 7263 | 2024-10-14 |
Rewriting cellular fate: epigenetic interventions in obesity and cellular programming
2024-Oct-10, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00944-2
PMID:39390356
|
研究论文 | 本文讨论了表观遗传干预在肥胖和细胞编程中的机制 | 本文详细分析了表观遗传调控在肥胖中的作用，并介绍了多种用于揭示这些调控的方法 | NA | 探讨表观遗传干预如何影响肥胖，并分析相关的方法 | 肥胖和细胞编程 | 表观遗传学 | 肥胖 | DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA、单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀、体细胞核移植、细胞融合 | NA | 基因表达数据、表观遗传标记数据 | NA |
| 7264 | 2024-10-14 |
Key platelet genes play important roles in predicting the prognosis of sepsis
2024-10-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-74052-w
PMID:39384856
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（RNA-seq）数据，结合多种算法分析，构建了一个稳定的脓毒症预后模型 | 首次通过scRNA-seq技术识别脓毒症患者中的关键细胞，并结合批量RNA-seq数据和多种算法构建预后模型 | 研究样本量较小，且仅基于GEO数据库的数据，可能影响模型的普适性 | 通过scRNA-seq和批量RNA-seq数据，结合多种算法分析，构建一个稳定的脓毒症预后模型 | 脓毒症患者的预后预测 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（RNA-seq），定量实时PCR（qRT-PCR） | Cox回归模型 | RNA测序数据 | 9个样本的scRNA-seq数据，批量RNA-seq数据来自GEO数据库，qRT-PCR在CLP诱导的脓毒症小鼠模型中进行 |
| 7265 | 2024-10-14 |
Single-cell sequencing analysis reveals the dynamic tumour ecosystems of primary and metastatic lymph nodes in nasopharyngeal carcinoma
2024-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70137
PMID:39392128
|
研究论文 | 研究分析了鼻咽癌原发和转移淋巴结的单细胞转录组，揭示了肿瘤生态系统的动态变化 | 首次系统地描述了鼻咽癌原发和转移淋巴结肿瘤的生态系统，揭示了免疫微环境和细胞间通讯的复杂性 | 样本量相对较小，可能影响结果的普适性 | 揭示鼻咽癌淋巴结转移的肿瘤生态系统，为治疗策略提供依据 | 鼻咽癌原发和转移淋巴结的单细胞转录组 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 47,618个单细胞，来自8个样本 |
| 7266 | 2024-10-14 |
Single-cell transcriptome and chromatin accessibility mapping of upper lip and primary palate fusion
2024-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70128
PMID:39392189
|
研究论文 | 研究使用单细胞转录组和染色质可及性测序技术，分析了小鼠胚胎在关键发育阶段的唇腭融合过程 | 首次结合单细胞RNA测序和染色质可及性测序技术，揭示了唇腭融合过程中不同细胞亚群的转录特征和染色质可及性变化 | 研究仅限于C57BL/6J小鼠模型，结果的普适性有待进一步验证 | 揭示唇腭融合的分子机制 | 小鼠胚胎的唇腭融合过程 | 数字病理学 | 先天性畸形 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和染色质可及性测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达数据和染色质可及性数据 | C57BL/6J小鼠胚胎在10.5、11.5和12.5胚胎日的样本 |
| 7267 | 2024-10-14 |
Self-regulating CAR-T cells modulate cytokine release syndrome in adoptive T-cell therapy
2024-Jun-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221988
PMID:38607370
|
研究论文 | 本文报道了一种自我调节的CAR-T细胞，通过分泌与CRS相关的细胞因子抑制剂来减轻细胞因子释放综合征的严重程度 | 开发了一种自我调节的CAR-T细胞，通过分泌tocilizumab衍生的单链可变片段（Toci）来减少CRS相关毒性，并显示出比传统CAR-T细胞更好的体内抗肿瘤疗效 | NA | 研究如何通过工程化T细胞来自我调节炎症细胞因子的产生，以同时增强CAR-T细胞疗法的安全性和疗效 | 自我调节的CAR-T细胞及其在减轻细胞因子释放综合征和提高抗肿瘤疗效中的作用 | 生物医学工程 | 癌症 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用人源化NSG-SGM3小鼠模型进行研究 |
| 7268 | 2024-10-14 |
Utilization of an Artery-on-a-Chip to Unravel Novel Regulators and Therapeutic Targets in Vascular Diseases
2024-03, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202302907
PMID:37797407
|
研究论文 | 本研究利用器官芯片技术开发了一种体外中大型动脉模型，旨在重现动脉壁结构和影响管腔细胞的血液动力学力 | 首次使用动脉芯片模型来揭示剪切应力调节的新基因，并将其应用于药物测试 | NA | 揭示血管疾病中的新调节因子和治疗靶点 | 中大型动脉的结构和功能 | 生物医学工程 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括患病和非患病（内部对照）血管区域的患者样本 |
| 7269 | 2024-10-14 |
Hidden syndinian and perkinsid infections in dinoflagellate hosts revealed by single-cell transcriptomics
2024-Jan-08, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wrae188
PMID:39325969
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示了寄生在甲藻宿主中的隐秘的syndinian和perkinsid感染 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了这些难以直接观察或培养的寄生虫的感染情况，并构建了基于192个基因的系统发育树 | 研究仅限于14个感染宿主细胞，且仅通过光显微镜在收集时识别出5个含有寄生虫的细胞 | 揭示隐秘的单细胞寄生虫的进化历史及其与宿主的关系 | 自由生活的甲藻及其寄生虫 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 14个感染宿主细胞 |
| 7270 | 2024-10-14 |
Single-cell transcriptomic atlas of distinct early immune responses induced by SARS-CoV-2 Proto or its variants in rhesus monkey
2023-Dec, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.432
PMID:38020713
|
研究论文 | 研究了SARS-CoV-2原型及其变种在恒河猴模型中诱导的早期免疫反应的单细胞转录组图谱 | 首次在非人灵长类动物模型中系统分析了SARS-CoV-2原型及其变种诱导的早期免疫反应的动态变化 | 研究仅限于恒河猴模型，结果可能不完全适用于人类 | 揭示SARS-CoV-2及其变种在感染早期诱导的免疫反应动态变化 | SARS-CoV-2原型及其Alpha、Beta和Delta变种在恒河猴中的免疫反应 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 恒河猴模型中的外周血单核细胞 |
| 7271 | 2024-10-14 |
SPACEL: deep learning-based characterization of spatial transcriptome architectures
2023-Nov-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43220-3
PMID:37990022
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于深度学习的空间转录组数据分析方法SPACEL | SPACEL通过三个模块实现细胞类型反卷积、空间域识别和3D组织架构构建，优于现有的19种先进方法 | NA | 开发一种新的方法来分析空间转录组数据，特别是多切片数据的联合分析和3D组织架构的构建 | 空间转录组数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 多层感知器、图卷积网络、对抗学习算法 | 空间转录组数据 | 多种组织和空间转录组技术的模拟和真实数据 |
| 7272 | 2024-10-14 |
Exploration of the molecular mechanism of intercellular communication in paediatric neuroblastoma by single-cell sequencing
2023-11-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-47796-0
PMID:37990103
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和转录组测序构建了一个与神经母细胞瘤患者预后相关的细胞间通讯相关基因模型，以实现精准管理 | 开发了一个基于21个基因的预测模型，用于神经母细胞瘤的预后评估 | 需要进一步的外部验证和临床试验来确认模型的有效性和适用性 | 构建和验证一个基于细胞间通讯相关基因的预后模型，以预测神经母细胞瘤患者的预后 | 神经母细胞瘤患者的单细胞数据和转录组数据 | 数字病理学 | 儿童疾病 | 单细胞测序 | Lasso回归 | 基因表达数据 | 来自基因表达综合数据库的神经母细胞瘤患者单细胞数据 |
| 7273 | 2024-10-14 |
Functional genomics in Spiralia
2023-11-17, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad036
PMID:37981859
|
综述 | 本文综述了螺旋动物基因表达调控的五个方面，旨在揭示动物基因组功能中的祖先和衍生特征 | 本文填补了螺旋动物基因组功能研究的知识空白，特别是染色质可及性、DNA甲基化、组蛋白翻译后修饰和基因组结构方面的研究 | 目前对螺旋动物基因表达调控的研究仍处于初级阶段，尤其是染色质可及性、DNA甲基化和组蛋白翻译后修饰等方面的研究 | 揭示动物基因组功能中的祖先和衍生特征，并探讨其对社会的潜在影响 | 螺旋动物的基因表达调控机制 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 7274 | 2024-10-14 |
Single-cell transcriptomics refuels the exploration of spiralian biology
2023-11-17, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad038
PMID:37609674
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学在螺旋动物生物学研究中的应用 | 介绍了单细胞转录组学这一新兴技术在螺旋动物分类和基因表达特征分析中的创新应用 | 讨论了将该技术应用于海洋生物的方法学挑战和需求 | 探讨单细胞转录组学在螺旋动物生物学和进化研究中的潜力 | 螺旋动物的细胞类型分类和基因表达特征 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及多个螺旋动物分类群的样本 |
| 7275 | 2024-10-14 |
Single-cell RNAseq analysis of spinal locomotor circuitry in larval zebrafish
2023-Nov-17, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.89338
PMID:37975797
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了斑马鱼幼体脊髓运动回路的分子基础 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了运动神经元类型在游泳行为中的功能差异的分子基础 | NA | 识别控制特定行为的专业化回路中的神经元类型 | 斑马鱼幼体的脊髓运动回路 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7276 | 2024-10-14 |
Rabies virus-based barcoded neuroanatomy resolved by single-cell RNA and in situ sequencing
2023-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.532873
PMID:36993334
|
研究论文 | 本文结合条形码狂犬病毒与单细胞和原位测序技术，在鼠脑中进行逆行标记和跨突触标记，以解析神经解剖结构 | 本文首次将条形码狂犬病毒与单细胞RNA测序和原位测序结合，用于鼠脑中的逆行标记和跨突触标记，提供了大规模映射神经元类型突触连接的潜在途径 | 本文仅在鼠脑中进行了实验，尚未在其他物种或更大规模上验证其方法的有效性 | 本文旨在通过结合条形码狂犬病毒与单细胞和原位测序技术，解析神经解剖结构，以理解神经回路的结构和功能 | 本文的研究对象是鼠脑中的神经元类型及其连接 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和原位测序 | NA | RNA | 96个逆行标记细胞和295个跨突触标记细胞使用单细胞RNA测序，4130个逆行标记细胞和2914个跨突触标记细胞使用原位测序 |
| 7277 | 2024-10-14 |
Proximal immune-epithelial progenitor interactions drive chronic tissue sequelae post COVID-19
2023-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.13.557622
PMID:37745354
|
研究论文 | 研究探讨了COVID-19后慢性组织后遗症的机制，特别是免疫细胞与上皮祖细胞之间的异常相互作用 | 首次揭示了肺驻留CD8 T细胞与巨噬细胞相互作用在维持异常上皮祖细胞和驱动纤维化后遗症中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，临床相关性需进一步验证 | 探究COVID-19后慢性组织后遗症的细胞和分子机制 | COVID-19后遗症患者和相关小鼠模型 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 空间转录组学和成像技术 | NA | 转录组数据和图像 | 三个独立临床队列的PASC患者和相关小鼠模型 |
| 7278 | 2024-10-14 |
Single-cell transcriptomics provide insight into metastasis-related subsets of breast cancer
2023-10-19, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-023-01728-y
PMID:37858183
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术，深入探讨了乳腺癌转移相关的特殊或罕见细胞亚群 | 结合空间转录组分析，实时可视化肿瘤微环境中恶性与非恶性细胞的异质性，并系统总结了这些细胞亚群的功能、分子特征及相应的治疗策略 | NA | 深入研究乳腺癌转移相关的特殊或罕见细胞亚群，为乳腺癌转移的机制研究提供依据，并为个性化精准治疗提供新线索 | 乳腺癌转移相关的特殊或罕见细胞亚群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 7279 | 2024-10-14 |
Dual spatially resolved transcriptomics for human host-pathogen colocalization studies in FFPE tissue sections
2023-10-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03080-y
PMID:37858234
|
研究论文 | 本文介绍了一种空间转录组学方法，用于在福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织切片中同时捕获宿主和病原体转录组的空间基因表达信息 | 本文提出了一种新的空间转录组学方法，能够在FFPE样本中同时无偏检测宿主和病原体的转录组 | NA | 研究宿主与病原体相互作用的空间转录组学方法 | COVID-19患者的肺样本 | 空间转录组学 | COVID-19 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | COVID-19患者的肺样本 |
| 7280 | 2024-10-14 |
Predicting gene regulatory links from single-cell RNA-seq data using graph neural networks
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad414
PMID:37985457
|
研究论文 | 本文提出了一种基于图神经网络的框架GNNLink，用于从单细胞RNA测序数据中预测基因调控关系 | 本文的创新点在于将基因调控网络推断问题转化为图链接预测任务，并利用图卷积网络捕捉基因间的相互依赖关系 | 本文未详细讨论GNNLink在处理大规模数据集时的计算效率问题 | 本文的研究目的是从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络 | 本文的研究对象是单细胞RNA测序数据中的基因调控关系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图卷积网络 | 基因表达数据 | 本文使用了七个单细胞RNA测序数据集进行实验 |