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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7261 | 2025-11-09 |
Vascular Niches Are the Primary Hotspots in Cardiac Aging
2025-Nov-07, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.327060
PMID:41090219
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研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学技术,揭示了血管微环境是心脏衰老过程中的主要热点区域 | 首次通过整合单核RNA测序和空间转录组学技术系统描绘了心脏衰老过程中的微环境变化,并识别出血管相关细胞生态位作为衰老的关键热点 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类心脏组织中验证 | 探究心脏组织中驱动年龄相关变化的微环境特征 | 3月龄和18月龄小鼠的心脏组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 衰老细胞清除治疗 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 不同年龄阶段的小鼠心脏组织 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7262 | 2025-11-09 |
Spatial and functional dissection of cancer-associated fibroblasts-mediated immune modulation in H. pylori-associated gastric cancer
2025-Nov-06, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02490-9
PMID:41194113
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA-seq分析,揭示了幽门螺杆菌相关胃癌中癌症相关成纤维细胞的空间分布和免疫调节功能 | 首次系统解析了幽门螺杆菌阳性胃癌中CAF亚型的空间分布特征及其通过WNT5-FZD相互作用和ZFP36介导的FN1 mRNA稳定性调控免疫抑制的新机制 | 研究样本量相对有限(71例GC患者),且主要基于回顾性队列分析 | 阐明癌症相关成纤维细胞在幽门螺杆菌相关胃癌中的空间组织和免疫调节功能 | 胃癌患者的肿瘤组织样本 | 空间转录组学 | 胃癌 | 空间转录组学,单细胞RNA-seq,LACE-seq,CIBERSORT-ABS,Kaplan-Meier分析 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA-seq数据,临床数据 | 71例GC患者肿瘤组织,整合三个独立队列(中国、美国、新加坡)数据 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7263 | 2025-11-09 |
Spatial transcriptomic landscape and cellular neighborhood heterogeneity in cervical cancer: integrative single-cell and spatial RNA sequencing analysis
2025-Nov-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03788-2
PMID:41191175
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,构建了首个宫颈癌综合空间分子图谱 | 首次建立宫颈癌综合空间转录组图谱,识别38个具有独特分子特征的细胞邻域,揭示肿瘤微环境的空间组织模式 | NA | 构建宫颈癌空间转录组图谱,解析肿瘤微环境的空间组织和细胞间关系 | 宫颈癌组织样本和HeLa、SiHa细胞系 | 空间转录组学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 定量PCR | NA | 基因表达数据, 空间位置数据 | 公共GEO数据库数据集和实验验证细胞系 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 7264 | 2025-11-09 |
Exploration of prognosis and immune infiltration characteristics in glioblastoma multiforme based on lipid metabolism related genes
2025-Nov-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03865-6
PMID:41191203
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研究论文 | 本研究基于脂代谢相关基因探索多形性胶质母细胞瘤的预后和免疫浸润特征 | 首次基于脂代谢相关基因将GBM患者分为两个预后不同的亚群,并鉴定出四个新的预后相关枢纽基因 | 研究主要依赖公共数据库的回顾性数据,需要进一步实验验证 | 识别GBM中与脂代谢相关的预后生物标志物和治疗靶点 | 多形性胶质母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 多形性胶质母细胞瘤 | 转录组分析,单细胞测序,生物信息学算法 | LASSO-Cox回归分析 | 转录组数据,临床数据 | TCGA和GEO数据库中的GBM患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7265 | 2025-11-09 |
Identification of lactylation-related biomarkers in HNSC by integrating machine learning and Spatial transcriptomics analysis
2025-Nov-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03849-6
PMID:41191207
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研究论文 | 通过整合机器学习和空间转录组学分析识别头颈部鳞状细胞癌中与乳酸化修饰相关的生物标志物 | 首次结合12种机器学习方法和空间转录组学技术系统筛选HNSC中乳酸化相关关键基因,并揭示其在肿瘤核心区域的优先表达模式 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证这些基因在乳酸化修饰中的具体分子机制 | 识别头颈部鳞状细胞癌中关键的乳酸化相关基因及其预后影响 | 头颈部鳞状细胞癌患者基因表达数据 | 机器学习 | 头颈部鳞状细胞癌 | 空间转录组学,单细胞分析,Western blotting,RT-qPCR | 多种机器学习方法,WGCNA,CIBERSORT | 基因表达数据,空间转录组数据 | TCGA-HNSC队列和GSE6631数据集 | NA | 空间转录组学,单细胞转录组学 | NA | NA |
| 7266 | 2025-11-09 |
Spatial single-cell atlas reveals regional variations in healthy and diseased human lung
2025-Nov-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65704-0
PMID:41193468
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据构建了人类肺部空间单细胞图谱,揭示了健康与疾病状态下肺组织的区域变异 | 首次在人类肺部应用三种空间转录组学方法,构建了具有空间分辨率的三维组织参考图谱,并发现了慢性阻塞性肺病中上皮细胞类型组成的未知失衡 | 研究仅关注了三个代表性肺部区域,可能未完全覆盖整个肺部的空间异质性 | 理解肺组织地形和外部因素对细胞类型内基因表达变异的影响 | 人类肺部细胞,包括罕见上皮细胞 | 空间转录组学 | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间定位数据 | 数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 三种不同的空间转录组学方法 |
| 7267 | 2025-11-09 |
Bone marrow-derived emergency monopoiesis drives brain-lung axis injury after traumatic brain injury via IL-1
2025-Nov-05, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03589-y
PMID:41194087
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研究论文 | 本研究揭示了创伤性脑损伤后骨髓来源的紧急单核细胞生成通过IL-1驱动脑-肺轴损伤的机制 | 首次发现颅骨骨髓在TBI后24小时内发生IL-1驱动的紧急单核细胞生成,并阐明其作为多器官损伤核心驱动因素的新机制 | NA | 探索创伤性脑损伤引发外周器官损伤的机制基础 | 创伤性脑损伤患者和小鼠模型 | 单细胞生物学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7268 | 2025-11-09 |
Integrating genetics and transcriptome analyses identify potential biomarkers and immune interactions in metabolic syndrome-related sarcopenia
2025-Nov-05, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07191-x
PMID:41194111
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研究论文 | 本研究通过整合遗传学和转录组学分析,识别代谢综合征相关肌肉减少症的潜在生物标志物和免疫相互作用 | 首次从遗传学角度揭示代谢综合征与肌肉减少症的共病机制,发现9个多效性基因作为潜在干预靶点 | 研究结果需要在更大样本和更多人群中进一步验证 | 探索代谢综合征与肌肉减少症之间的潜在机制和生物标志物 | 代谢综合征和肌肉减少症相关的遗传和转录组数据 | 生物信息学 | 代谢综合征和肌肉减少症 | 全基因组关联研究,连锁不平衡评分回归,孟德尔随机化,转录组范围关联研究,单细胞RNA测序 | 临床预测模型 | 遗传数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7269 | 2025-11-09 |
Harnessing multi-omics approaches to decipher tumor evolution and improve diagnosis and therapy in lung cancer
2025-Nov-05, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00859-y
PMID:41194170
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综述 | 本文综述了多组学方法在解析肺癌肿瘤进化及改善诊疗中的应用前景 | 系统阐述多组学方法在构建肺癌生态系统全景中的整合应用价值 | NA | 探讨多组学方法在肺癌研究中的潜力与应用 | 肺癌肿瘤异质性与肿瘤微环境 | 生物信息学 | 肺癌 | 全基因组测序,单细胞测序,空间转录组学 | 多组学整合模型 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 7270 | 2025-11-09 |
In vitro derivation of midbrain dopaminergic neurons from porcine embryonic stem cells in multi-dimensional conditions
2025-Nov-05, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04693-9
PMID:41194288
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研究论文 | 本研究建立了从猪胚胎干细胞在二维和三维条件下高效分化中脑多巴胺能神经元的物种优化方案 | 首次建立了从猪干细胞生成功能验证的中脑多巴胺能神经元和中脑类器官的稳健平台,揭示了物种特异性信号动态 | 仅使用猪胚胎干细胞进行研究,未与其他物种进行直接比较 | 建立物种优化的条件,从猪胚胎干细胞在二维和三维环境中衍生功能性中脑多巴胺能神经元 | 体外受精和孤雌生殖激活来源的猪胚胎干细胞 | 干细胞生物学 | 神经系统疾病 | 免疫荧光、膜片钳电生理学、微电极阵列记录、多巴胺ELISA、RNA测序 | NA | 基因表达数据、电生理数据、蛋白质数据 | 猪胚胎干细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7271 | 2025-11-09 |
The molecular complexity of deep vein thrombosis was preliminarily explored based on the ceRNA network, scRNA-seq and AlphaFold 2
2025-Nov-04, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-025-02239-9
PMID:41188916
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研究论文 | 本研究通过ceRNA网络、单细胞RNA测序和AlphaFold 2技术初步探索深静脉血栓形成的分子复杂性 | 首次结合ceRNA网络构建、多种PPI网络算法、AlphaFold 2结构预测和单细胞RNA测序技术系统研究深静脉血栓的分子机制 | 样本量较小(内部测试集10例,外部验证集14例,单细胞测序6例),需要更大规模研究验证 | 识别与深静脉血栓相关的高度特异性基因并研究其复杂性 | 深静脉血栓患者和健康对照者的血液样本 | 生物信息学 | 深静脉血栓 | 单细胞RNA测序, 全转录组分析, 蛋白质结构预测 | ceRNA网络模型, PPI网络分析 | RNA测序数据, 基因表达数据 | 内部测试集10例(4例患者+6例对照),外部验证集14例,单细胞测序6例(3例患者+3例对照) | NA | 单细胞RNA测序, 全转录组测序 | NA | NA |
| 7272 | 2025-11-09 |
USP2-mediated PPARγ stabilization promotes hepatocellular carcinoma progression and M2 macrophage polarization via oleic acid
2025-Nov-04, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012721
PMID:41193183
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研究论文 | 本研究揭示USP2通过稳定PPARγ促进肝癌进展和M2巨噬细胞极化的分子机制 | 首次发现USP2通过去泛素化稳定PPARγ,促进脂肪酸合成和油酸产生,进而驱动M2巨噬细胞极化的新机制 | 研究主要基于体外模型和动物实验,需要进一步临床验证 | 探索USP2在肝细胞癌进展和肿瘤微环境调控中的作用机制 | 肝癌患者来源类器官、肝癌细胞系、动物模型和巨噬细胞 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫共沉淀、CUT&RUN、ELISA、质谱分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7273 | 2025-11-09 |
Emodin Alleviates Sepsis-Induced Multiorgan Damage by Inhibiting NETosis through Targeting Neutrophils BCL-10
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417129
PMID:40779122
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研究论文 | 本研究揭示大黄素通过靶向中性粒细胞BCL-10抑制NETosis,缓解脓毒症引起的多器官损伤 | 首次发现大黄素可直接靶向BCL-10蛋白,通过调节BCL-10/MALT1复合物抑制NF-κB信号通路和NETs形成 | NA | 探究大黄素在脓毒症中对多器官保护作用的分子机制 | 中性粒细胞及其NETs形成过程 | 分子生物学 | 脓毒症 | 蛋白质微阵列,表面等离子共振,分子对接,单细胞测序 | NA | 体外实验数据,体内实验数据,蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 7274 | 2025-11-09 |
HLA-A*02:01 Presents Penicillin-Modified Cysteinylated Peptides for T Cell Recognition
2025-Nov, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.70025
PMID:40906332
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研究论文 | 本研究揭示HLA-A*02:01通过半胱氨酸修饰呈递青霉素修饰肽段激活T细胞反应的分子机制 | 首次发现青霉素优先修饰HLA肽段中的半胱氨酸残基,并证实通过二硫键介导的肽段修饰机制可诱导T细胞识别 | 研究仅聚焦于HLA-A*02:01单倍型和青霉素特异性反应,未涵盖其他HLA类型或β-内酰胺类药物 | 阐明青霉素诱导T细胞介导过敏反应的分子机制 | HLA-A*02:01呈递的青霉素修饰肽段及患者来源的青霉素特异性T细胞 | 免疫学 | 药物过敏 | 免疫肽组学、单细胞测序、报告细胞系检测 | NA | 蛋白质组数据、单细胞TCR序列数据 | 过敏患者来源的CD8+ T细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 7275 | 2025-11-09 |
Globotriaosylceramide Gb3 Influences Wound Healing and Scar Formation by Orchestrating Fibroblast Heterogeneity
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509733
PMID:40810720
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研究论文 | 本研究系统探讨了globotriaosylceramide (Gb3)通过调控成纤维细胞异质性影响伤口愈合和瘢痕形成的机制 | 发现了HEXB-Gb3-FGF2调控轴在成纤维细胞表型可塑性中的新作用机制 | 研究主要基于特定烧伤模型,在其他类型伤口中的适用性需进一步验证 | 阐明Gb3在皮肤再生过程中的功能作用及其调控机制 | 皮肤成纤维细胞、浅二度烧伤和深二度烧伤临床标本 | 单细胞组学 | 皮肤烧伤 | 单细胞RNA测序, 空间组学, 脂质组学, 组织学评估 | NA | 单细胞转录组数据, 空间组学数据, 脂质组学数据, 组织学图像 | 临床烧伤标本(浅二度和深二度烧伤) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 脂质组学 | NA | NA |
| 7276 | 2025-11-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Redefines Macrophage Heterogeneity and Function in Wound Healing
2025 Nov-Dec, Wound repair and regeneration : official publication of the Wound Healing Society [and] the European Tissue Repair Society
IF:3.8Q1
DOI:10.1111/wrr.70107
PMID:41204881
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综述 | 本文综述单细胞测序技术在皮肤伤口愈合研究中揭示巨噬细胞异质性和功能多样性的进展 | 通过单细胞测序技术系统揭示巨噬细胞在伤口愈合过程中的异质性、功能多样性及动态变化特征 | NA | 阐明巨噬细胞在皮肤伤口愈合过程中的细胞异质性和功能作用 | 皮肤伤口愈合过程中的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 皮肤伤口愈合 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7277 | 2025-11-09 |
Multi-omics integrative analysis of the mechanisms linking environmental pollutant exposure to bladder cancer pathogenesis
2025-Oct-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119251
PMID:41110307
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研究论文 | 通过多组学整合分析揭示环境污染物暴露与膀胱癌发病机制之间的分子联系 | 首次通过整合多组学数据和孟德尔随机化分析,系统构建了环境-基因相互作用网络,识别出三个因果枢纽基因及其与34种高风险污染物的关联 | 研究主要基于现有数据库和队列数据,需要进一步实验验证污染物与基因相互作用的生物学机制 | 探究环境污染物暴露与膀胱癌发病的分子机制 | 膀胱癌相关基因和环境污染物 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 多组学整合分析, 转录组学, 单细胞RNA测序, 分子对接, 孟德尔随机化 | 孟德尔随机化模型, 分子对接模型 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 多个膀胱癌队列的转录组数据 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 7278 | 2025-11-09 |
Deciphering the crucial role of IGF2BP3 in modulating stemness traits of salivary adenoid cystic carcinoma
2025-Oct-13, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-03068-7
PMID:41082045
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研究论文 | 本研究系统阐明了IGF2BP3在唾液腺腺样囊性癌干细胞特性调控中的关键作用及机制 | 首次通过单细胞测序数据验证IGF2BP3与SACC干细胞特性的关联,并系统揭示其调控干细胞特性的分子机制 | 未明确IGF2BP3下游具体作用靶点及信号通路细节 | 探究IGF2BP3在唾液腺腺样囊性癌中的功能作用及调控机制 | 唾液腺腺样囊性癌细胞 | 癌症生物学 | 唾液腺腺样囊性癌 | RNA测序, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7279 | 2025-11-09 |
Hdac1 as an early determinant of intermediate-exhausted CD8+ T cell fate in chronic viral infection
2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2502256122
PMID:40333757
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白去乙酰化酶1在慢性病毒感染中作为中间耗竭CD8+ T细胞命运早期决定因子的关键作用 | 首次发现Hdac1特异性调控抗原特异性中间耗竭T细胞的形成,并揭示其通过染色质可及性调控耗竭程序基因的双重功能 | T细胞亚群分化的表观遗传决定因素仍未完全阐明 | 探索慢性病毒感染中CD8+ T细胞耗竭亚群分化的表观遗传调控机制 | 慢性病毒感染模型中的CD8+ T细胞亚群 | 免疫学 | 慢性病毒感染 | 单细胞转录组测序,染色质可及性分析 | NA | 基因表达数据,表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7280 | 2025-11-09 |
Interferon-induced activation of dendritic cells and monocytes by yellow fever vaccination correlates with early antibody responses
2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2422236122
PMID:40333758
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研究论文 | 本研究通过黄热病疫苗接种模型,揭示了树突状细胞和单核细胞早期干扰素激活状态与抗体反应的相关性 | 首次在单细胞水平系统描绘黄热病疫苗接种后树突状细胞和单核细胞的早期先天免疫应答动态,并发现SIGLEC1/CD169作为敏感的生物标志物 | 研究仅关注早期免疫反应(28天内),未评估长期免疫记忆;样本时间点有限 | 阐明黄热病疫苗接种后早期先天免疫事件与保护性 immunity 生成的关系 | 人类血液树突状细胞和单核细胞亚群 | 免疫学 | 传染病 | 转录组分析, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 大型疫苗接种者队列 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | NA |