单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28914 篇文献，本页显示第 7261 - 7280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7261 | 2024-12-20 |
Mechanisms of Berberine in anti-pancreatic ductal adenocarcinoma revealed by integrated multi-omics profiling
2024-10-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-74943-y
PMID:39358545
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研究论文 | 本研究通过整合药理学数据库与bulk RNA-seq和scRNA-seq数据，揭示了小檗碱在抗胰腺导管腺癌中的潜在机制 | 首次通过多组学分析揭示了小檗碱在胰腺导管腺癌中的潜在抗肿瘤机制，并识别了关键的药物靶点和免疫调节作用 | 研究主要基于体外数据和计算分析，缺乏体内实验验证 | 揭示小檗碱在抗胰腺导管腺癌中的潜在机制 | 小檗碱在胰腺导管腺癌中的作用机制及潜在靶点 | NA | 胰腺癌 | RNA-seq, scRNA-seq | PPI网络 | 基因表达数据 | NA |
| 7262 | 2024-12-20 |
Intestinal Tuft Cells Are Enriched With Protocadherins
2024-10, The journal of histochemistry and cytochemistry : official journal of the Histochemistry Society
DOI:10.1369/00221554241287267
PMID:39360911
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研究论文 | 研究揭示了肠绒毛细胞中富含原钙粘蛋白（protocadherins），并探讨了其在细胞微绒毛组织中的作用 | 首次发现原钙粘蛋白在肠绒毛细胞中的富集，并证明了其在小鼠和人类肠绒毛细胞中的关键作用 | 研究主要集中在小鼠和人类的小肠和结肠样本，未涵盖其他器官或物种 | 探讨肠绒毛细胞的结构和功能，特别是微绒毛组织的调控机制 | 肠绒毛细胞及其中的原钙粘蛋白 | NA | NA | 免疫染色和单细胞RNA测序 | NA | 组织样本和RNA序列 | 小鼠和人类的肠组织样本 |
| 7263 | 2024-12-20 |
Oligoclonal CD4+CXCR5+ T cells with a cytotoxic phenotype appear in tonsils and blood
2024-07-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06563-1
PMID:39025930
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研究论文 | 研究比较了外周血和扁桃体中CD3CD4CXCR5 T细胞的异质性，发现了一种具有细胞毒性表型的寡克隆CD4+CXCR5+ T细胞亚群 | 首次发现了一种具有细胞毒性表型的寡克隆CD4+CXCR5+ T细胞亚群，并描述了其在扁桃体和外周血中的分布特征 | 研究仅限于扁桃体和外周血样本，未涉及其他组织或疾病状态 | 探讨外周血和扁桃体中CD3CD4CXCR5 T细胞的异质性及其在临床中的潜在应用 | 外周血和扁桃体中的CD3CD4CXCR5 T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组织化学 | NA | 转录组、TCR库、细胞表面蛋白表达 | 外周血和扁桃体中的CD3CD4CD45RACXCR5细胞 |
| 7264 | 2024-12-20 |
PPPCT: Privacy-Preserving framework for Parallel Clustering Transcriptomics data
2024-05, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108351
PMID:38520921
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研究论文 | 本文提出了一种隐私保护的并行聚类转录组数据框架，用于处理单细胞RNA测序数据 | 该方法通过使用Intel SGX处理器确保敏感代码和数据的安全性，并采用对数变换、非负矩阵分解和并行k-means聚类等技术，在保证隐私的同时提高了聚类质量和计算效率 | NA | 解决单细胞转录组数据聚类中的隐私保护问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、非负矩阵分解、并行k-means聚类 | 并行计算框架 | 转录组数据 | 5000个基因和6000个细胞的单细胞RNA测序数据集 |
| 7265 | 2024-12-20 |
Heterogeneous immune landscapes and macrophage dynamics in primary and lung metastatic adenoid cystic carcinoma of the head and neck
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1483887
PMID:39697346
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研究论文 | 研究探讨了头颈部腺样囊性癌原发肿瘤和肺转移瘤的免疫微环境及巨噬细胞动态 | 首次通过RNA测序和单细胞测序分析了原发肿瘤和肺转移瘤的免疫景观，揭示了肺转移瘤中免疫抑制性肿瘤相关巨噬细胞的存在 | 研究样本量相对较小，可能影响结果的普适性 | 探讨头颈部腺样囊性癌原发肿瘤和肺转移瘤的肿瘤免疫微环境，理解免疫治疗的挑战 | 头颈部腺样囊性癌的原发肿瘤和肺转移瘤 | 数字病理学 | 头颈部肿瘤 | RNA测序、免疫组织化学、单细胞测序 | NA | RNA序列数据、图像 | 25个原发肿瘤和34个肺转移瘤 |
| 7266 | 2024-12-20 |
Identification of Macrophage-Related Biomarkers for Abdominal Aortic Aneurysm Through Combined Single-Cell Sequencing and Machine Learning
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S499593
PMID:39697792
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞测序和机器学习技术，揭示了巨噬细胞在腹主动脉瘤（AAA）进展中的作用机制，并识别了相关的生物标志物 | 首次通过单细胞测序和机器学习结合的方法，揭示了THBS1-CD47信号通路在巨噬细胞驱动AAA进展中的关键作用，并验证了THBS1作为潜在治疗靶点的可能性 | 研究主要基于单细胞测序和机器学习分析，未来需要更多临床样本验证和进一步的功能实验 | 揭示巨噬细胞在腹主动脉瘤进展中的作用机制，并识别相关的生物标志物，以开发新的靶向治疗和改善患者预后 | 腹主动脉瘤患者样本中的巨噬细胞及相关基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序，机器学习 | NA | 基因表达数据 | 腹主动脉瘤患者样本 |
| 7267 | 2024-12-20 |
Deciphering the evolving niche interactome of human hematopoietic stem cells from ontogeny to aging
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1479605
PMID:39698109
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据，系统地描述了从胚胎发育到衰老过程中人类造血干细胞（HSC）微环境的相互作用网络 | 首次系统地揭示了HSC微环境在不同发育阶段和衰老过程中的动态变化，特别是细胞间相互作用和信号通路的变化 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能无法完全捕捉到所有细胞间的相互作用和微环境的复杂性 | 揭示从胚胎发育到衰老过程中HSC微环境的动态变化，为维持HSC功能和促进健康衰老提供新的干预策略 | 人类造血干细胞（HSC）及其微环境中的细胞间相互作用网络 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及不同发育阶段和衰老时期的HSC微环境样本 |
| 7268 | 2024-12-20 |
Narrative Review of Mesenchymal Stem Cell Therapy in Renal Diseases: Mechanisms, Clinical Applications, and Future Directions
2024, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/sci/8658246
PMID:39698513
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综述 | 本文综述了间充质干细胞在肾脏疾病中的应用，讨论了其机制、临床应用及未来发展方向 | 本文探讨了间充质干细胞在肾脏疾病治疗中的潜力，并展望了结合单细胞测序、CRISPR/Cas9基因编辑等前沿技术的未来研究方向，以实现更安全、更有效的个性化治疗 | 本文主要基于过去五年内的研究，可能未能涵盖所有相关研究，且未来研究方向仍需进一步验证 | 探讨间充质干细胞在肾脏疾病治疗中的应用及其未来发展方向 | 间充质干细胞在急性肾损伤和慢性肾病中的应用 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞测序、CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | NA | NA |
| 7269 | 2024-12-20 |
Revealing induced pluripotent stem cells' potential as a better alternative to embryonic stem cells for Parkinson's disease treatment based on single-cell RNA-seq
2024, Brazilian journal of medical and biological research = Revista brasileira de pesquisas medicas e biologicas
DOI:10.1590/1414-431X2024e13482
PMID:39699375
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据比较了诱导多能干细胞（iPSCs）和胚胎干细胞（ESCs）在帕金森病（PD）治疗中的细胞类型差异，探讨了iPSCs作为ESCs替代品的潜力 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了iPSCs在细胞类型多样性和基因表达上与ESCs的差异，并提出了iPSCs在PD治疗中的潜在优势 | 研究主要基于GEO数据库的数据，未进行体内实验验证iPSCs在PD治疗中的实际效果 | 探讨iPSCs作为ESCs替代品在帕金森病治疗中的可行性 | 诱导多能干细胞（iPSCs）和胚胎干细胞（ESCs）在帕金森病（PD）治疗中的细胞类型差异 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从GEO数据库收集的ESCs和iPSCs的单细胞RNA测序数据和微阵列数据 |
| 7270 | 2024-12-19 |
Abatacept Induces Long-Term Reconstitution of the B-Cell Niche in a Patient With CTLA-4 Haploinsufficiency: A Case Report
2025-Mar, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200351
PMID:39689284
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病例报告 | 本文报告了一例CTLA-4单倍体不足患者在接受abatacept治疗后，B细胞微环境长期重建的病例 | 首次展示了abatacept在CTLA-4单倍体不足患者中对骨髓功能的长期影响，并通过单细胞RNA测序验证了B细胞的重建 | 由于是单一病例报告，缺乏对照组，证据级别较低 | 探讨abatacept在CTLA-4单倍体不足患者中的长期疗效及其对骨髓功能的影响 | 一名39岁CTLA-4单倍体不足女性患者，伴有中枢神经系统受累、多器官自身免疫和淋巴细胞减少 | NA | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 单一病例 |
| 7271 | 2024-12-19 |
Dedifferentiation of vascular smooth muscle cells upon vessel injury
2025-Jan-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113691
PMID:39591824
|
综述 | 本文综述了血管平滑肌细胞在血管损伤后的去分化过程及其机制 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了血管平滑肌细胞在健康和病理状态下的复杂多样性 | NA | 探讨血管损伤后血管平滑肌细胞去分化的动态过程及其机制 | 血管平滑肌细胞在血管损伤后的去分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7272 | 2024-12-19 |
Aging and head and neck cancer insights from single cell and spatial transcriptomic analyses
2024-Dec-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01672-z
PMID:39692961
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学分析，深入探讨了衰老相关基因（ARGs）在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的表达及其预后意义 | 本研究首次结合单细胞测序和空间转录组学分析，揭示了ARGs在HNSCC中的表达及其对预后的影响 | 本研究主要基于数据库数据和现有工具进行分析，缺乏实验验证 | 提供新的理论支持并为个性化治疗提供方向 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的衰老相关基因（ARGs） | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞测序、空间转录组学分析 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 使用GSE139324系列数据和TCGA数据库中的样本 |
| 7273 | 2024-12-19 |
An improved bacterial single-cell RNA-seq reveals biofilm heterogeneity
2024-Dec-17, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97543
PMID:39689163
|
研究论文 | 本研究提出了一种改进的细菌单细胞RNA测序方法RiboD-PETRI，用于探索生物膜异质性 | 引入了一种新的方法RiboD，通过去除核糖体RNA衍生的cDNA，显著提高了mRNA检测率，解决了细菌单细胞RNA测序中rRNA过多的问题 | NA | 解决细菌单细胞RNA测序中rRNA过多的问题，并探索生物膜的异质性 | 细菌单细胞RNA测序和生物膜异质性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 7274 | 2024-12-19 |
Enhancing immuno-oncology investigations through multidimensional decoding of tumor microenvironment with IOBR 2.0
2024-Dec-16, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100910
PMID:39626665
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研究论文 | 本文介绍了IOBR 2.0工具包，用于通过多组学数据对肿瘤微环境进行多维解码，以增强免疫肿瘤学研究 | IOBR 2.0通过多组学数据整合和单细胞RNA测序数据构建基因特征和参考矩阵，提供了更全面的肿瘤-免疫相互作用分析 | 研究结果仍需在大规模临床队列中进行验证 | 通过多组学数据整合推进肿瘤微环境研究 | 肿瘤微环境及其与免疫疗法的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 7275 | 2024-12-19 |
A statistical approach for systematic identification of transition cells from scRNA-seq data
2024-Dec-16, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100913
PMID:39644902
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研究论文 | 本文提出了一种名为CellTran的统计方法，利用配对基因表达相关性从scRNA-seq数据中识别过渡细胞 | 该方法无需明确解析基因调控网络，即可检测过渡细胞，并揭示其独特的基因表达特征 | NA | 揭示驱动细胞状态转换的分子机制，并增强识别疾病干预治疗靶点的能力 | 从scRNA-seq数据中识别过渡细胞及其基因表达特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 统计方法 | 基因表达数据 | 涉及多种生物学背景的样本，包括组织再生、胚胎发育、癌前病变和疫苗接种后的体液反应 |
| 7276 | 2024-12-19 |
Single-cell RNA sequencing algorithms underestimate changes in transcriptional noise compared to single-molecule RNA imaging
2024-Dec-16, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100933
PMID:39662473
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研究论文 | 本文通过小分子扰动和单细胞RNA测序算法，比较了转录噪音在单细胞RNA测序和单分子RNA荧光原位杂交中的量化差异 | 首次通过单分子RNA荧光原位杂交验证了单细胞RNA测序算法在量化转录噪音时的系统性低估 | 所有单细胞RNA测序算法在量化噪音变化时均存在系统性低估 | 评估和比较不同单细胞RNA测序算法在量化转录噪音方面的准确性 | 人类和小鼠的单细胞RNA测序数据以及代表性基因的单分子RNA荧光原位杂交数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单分子RNA荧光原位杂交（smFISH） | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠的单细胞RNA测序数据以及代表性基因的单分子RNA荧光原位杂交数据 |
| 7277 | 2024-12-19 |
Expanding the landscape of antibody discovery
2024-Dec-16, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100936
PMID:39689694
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研究论文 | 本文介绍了一种结合抗体-核糖体-mRNA复合物、抗原细胞表面展示和单细胞RNA测序技术的方法，用于筛选多样化的抗体基因库 | 本文创新性地将抗体-核糖体-mRNA复合物、抗原细胞表面展示和单细胞RNA测序技术结合，成功筛选出多样化的抗体基因库 | NA | 开发一种新的方法用于抗体-抗原配对发现 | 抗体基因库和病毒受体蛋白库 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7278 | 2024-12-19 |
Supervised Screening of EGFR Inhibitors Validated through Computational Structural Biology Approaches
2024-Dec-12, ACS medicinal chemistry letters
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acsmedchemlett.4c00385
PMID:39691517
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研究论文 | 本研究整合多组学数据，利用机器学习方法筛选EGFR抑制剂，并通过计算结构生物学方法验证其有效性 | 本研究创新性地结合了多组学数据和机器学习方法，筛选出具有潜在抗乳腺癌活性的EGFR抑制剂，并通过计算结构生物学方法验证其分子相互作用和构象动力学 | 本研究主要基于细胞系数据和计算模型，尚未进行体内实验验证 | 筛选和验证针对乳腺癌中EGFR过表达的有效治疗化合物 | 乳腺癌细胞系中的EGFR抑制剂 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 支持向量机、人工神经网络、随机森林 | 多组学数据 | 使用了来自Cancer Cell Line Encyclopedia和Genomics of Drug Sensitivity in Cancer数据库的乳腺癌细胞系数据 |
| 7279 | 2024-12-19 |
Association of circulating cytokine levels and tissue-infiltrating myeloid cells with achalasia: results from Mendelian randomization and validation through clinical characteristics and single-cell RNA sequencing
2024-12, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-024-02155-2
PMID:39377966
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研究论文 | 本文研究了食管失弛缓症与循环细胞因子水平及组织浸润髓系细胞之间的关系，通过孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序验证了潜在机制 | 首次通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序结合的方法，揭示了食管失弛缓症中特定细胞因子和髓系细胞的作用机制 | 研究样本量较小，且仅基于FinnGen数据库的数据，可能存在地域和人群的局限性 | 探讨食管失弛缓症的免疫失调机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 循环细胞因子水平、组织浸润髓系细胞、食管失弛缓症患者 | NA | 食管失弛缓症 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、酶联免疫吸附测定 | NA | 基因组数据、蛋白质数据、单细胞RNA测序数据 | 47种细胞因子的cis-eQTLs/pQTLs数据，以及来自FinnGen的食管失弛缓症GWAS数据 |
| 7280 | 2024-12-19 |
Gastric Cancer Actively Remodels Mechanical Microenvironment to Promote Chemotherapy Resistance via MSCs-Mediated Mitochondrial Transfer
2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202404994
PMID:39392399
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研究论文 | 本文研究了胃癌通过间充质基质细胞介导的线粒体转移重塑机械微环境以促进化疗耐药的机制 | 首次揭示了胃癌细胞通过间充质基质细胞介导的线粒体转移，利用细胞外基质的机械信号促进化疗耐药的机制 | 研究仅限于体外实验和部分患者的样本分析，需要进一步的临床验证 | 探讨胃癌对奥沙利铂耐药的机制，并寻找可能的干预策略 | 胃癌患者的肿瘤组织和间充质基质细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 组织 | 部分奥沙利铂耐药的胃癌患者 |