单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7241 - 7260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7241 | 2025-10-06 |
Single-Cell Resolution of Temporal Gene Expression during Heart Development
2016-11-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2016.10.001
PMID:27840107
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析小鼠心脏发育过程中不同细胞谱系的时空基因表达程序 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了从胚胎期到出生后心脏发育的完整转录组动态变化 | 研究仅基于小鼠模型，样本数量相对有限（约1200个细胞） | 揭示心脏发育过程中细胞谱系特异性的时空基因表达程序 | 小鼠心脏细胞（包括心肌细胞、内皮细胞和成纤维细胞富集细胞） | 单细胞生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约1200个小鼠心脏细胞，涵盖胚胎期9.5天到出生后21天共7个时间点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7242 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq ties macrophage polarization to growth rate of intracellular Salmonella
2016-Nov-14, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/nmicrobiol.2016.206
PMID:27841856
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了巨噬细胞对胞内沙门氏菌不同生长状态的极化响应机制 | 首次将细菌分裂荧光报告系统与单细胞RNA测序相结合，揭示巨噬细胞对胞内沙门氏菌生长异质性的功能响应谱系 | 研究仅限于沙门氏菌模型，未验证其他胞内病原体的类似机制 | 探究宿主细胞如何响应胞内细菌病原体生长异质性 | 感染沙门氏菌的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序, 荧光报告系统 | 聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 单个感染沙门氏菌的巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7243 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq supports a developmental hierarchy in human oligodendroglioma
2016-11-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature20123
PMID:27806376
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类少突胶质细胞瘤的发育层次结构 | 首次在人类少突胶质细胞瘤中通过单细胞RNA测序无偏倚地鉴定出癌症干细胞群体 | 需要完整的系统发育树来明确遗传进化对细胞层次结构的影响 | 探索人类少突胶质细胞瘤的细胞层次结构和癌症干细胞模型 | 6个IDH1或IDH2突变的人类少突胶质细胞瘤样本 | 单细胞测序分析 | 少突胶质细胞瘤 | 单细胞RNA测序，拷贝数变异分析，点突变分析 | 癌症干细胞模型 | 单细胞RNA测序数据 | 4,347个单细胞来自6个肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7244 | 2025-10-06 |
Revealing the vectors of cellular identity with single-cell genomics
2016-Nov-08, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.3711
PMID:27824854
|
综述 | 本文探讨单细胞基因组学如何揭示细胞身份的多维特征及其计算分析方法 | 提出将细胞身份表示为'基向量'的叠加，从离散细胞类型到连续动态过渡的多维度解析 | 计算方法需克服技术噪音、数据规模等挑战，尚未实现完整的细胞身份参考图谱构建 | 构建细胞身份参考图谱并解析其分子调控机制 | 人类细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7245 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq identifies a PD-1hi ILC progenitor and defines its development pathway
2016-11-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature20105
PMID:27749818
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术鉴定出高表达PD-1的先天淋巴样细胞祖细胞并揭示其发育通路 | 首次发现PD-1高表达可作为定型ILC祖细胞的标志物，并阐明PD-1/IL-25R作为ILC2发育的早期检查点 | 研究主要基于小鼠模型，人类ILC发育路径可能存在差异 | 解析先天淋巴样细胞祖细胞的异质性、发育轨迹和信号依赖性 | 小鼠骨髓祖细胞 | 单细胞生物学 | 免疫相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠骨髓祖细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7246 | 2025-10-06 |
Analysis of allelic expression patterns in clonal somatic cells by single-cell RNA-seq
2016-11, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/ng.3678
PMID:27668657
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析克隆体细胞中的等位基因表达模式 | 首次在克隆原代小鼠成纤维细胞和新鲜分离的人类CD8 T细胞中同时分析克隆性和动态性单等位基因表达模式 | 主要关注最弱表达基因，克隆性aRME检测率极低(<1%) | 解析体细胞中随机单等位基因表达(aRME)的克隆遗传性与动态随机性 | 克隆原代小鼠成纤维细胞和人类CD8 T细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 克隆原代小鼠成纤维细胞和人类CD8 T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7247 | 2025-10-06 |
Direct chromosome-length haplotyping by single-cell sequencing
2016-11, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.209841.116
PMID:27646535
|
研究论文 | 介绍一种通过单细胞测序直接获得染色体长度单倍型的新方法 | 首次使用单细胞DNA模板链测序技术直接构建完整染色体长度的单倍型，无需世代信息或统计推断 | NA | 开发直接绘制每个亲本染色体完整单倍型的方法 | 人类HapMap个体和家系三人的基因组 | 基因组学 | 癌症 | 单细胞DNA模板链测序 | NA | 基因组测序数据 | HapMap个体NA12878和家系三人 | NA | 单细胞测序 | NA | Strand-seq单细胞DNA模板链测序技术 |
| 7248 | 2025-10-06 |
A generic, cost-effective, and scalable cell lineage analysis platform
2016-11, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.202903.115
PMID:27558250
|
研究论文 | 开发了一种通用、经济高效且可扩展的单细胞谱系分析平台 | 整合了生物化学与计算方法，提供回顾性、成本效益高且可扩展的单细胞谱系分析解决方案 | 仅通过体外培养的细胞树进行验证，尚未在复杂体内环境中测试 | 开发改进的单细胞谱系分析方法 | 单个细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 靶向单细胞测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞谱系分析 | NA | 整合生物化学-计算流程，输入单个细胞并生成谱系树 |
| 7249 | 2025-10-06 |
Characterizing polymorphic inversions in human genomes by single-cell sequencing
2016-11, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.201160.115
PMID:27472961
|
研究论文 | 本研究通过单细胞链测序技术开发了一种识别和表征人类基因组中多态性倒位的新方法 | 结合单细胞DNA模板链测序(Strand-seq)与定制分析软件，首次实现了在单细胞水平高分辨率发现、定位和基因分型基因组重排 | NA | 研究人类基因组中的结构变异和基因组异质性 | 人类基因组中的多态性倒位和结构重排 | 基因组学 | NA | 单细胞DNA模板链测序(Strand-seq) | NA | 基因组测序数据 | 两名无关个体的全基因组 | NA | 单细胞DNA测序 | NA | 单细胞链测序(Strand-seq) |
| 7250 | 2025-10-06 |
A Single-Cell Transcriptome Atlas of the Human Pancreas
2016-10-26, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2016.09.002
PMID:27693023
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术构建了人类胰腺细胞图谱 | 开发了结合FACS、机器人和CEL-Seq2协议的自动化平台，首次在单细胞水平系统解析人类胰腺细胞类型 | 样本来源于已故器官捐献者，可能无法完全代表健康人群的胰腺状态 | 建立人类胰腺细胞类型及其标记基因的完整目录 | 人类胰腺细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 数千个单胰腺细胞（来自已故器官捐献者） | NA | 单细胞RNA-seq | CEL-Seq2 | 结合FACS和机器人的自动化单细胞转录组平台 |
| 7251 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptome Profiling of Human Pancreatic Islets in Health and Type 2 Diabetes
2016-10-11, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2016.08.020
PMID:27667667
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析健康人和2型糖尿病患者胰岛细胞的基因表达特征 | 首次在单细胞水平全面表征人类胰岛各细胞类型的转录程序，包括罕见的δ、γ、ε和星状细胞，并发现α、β和腺泡细胞的亚群 | 功能验证研究尚未完成，发现的候选基因需要进一步实验确认 | 研究人类胰岛细胞在健康和2型糖尿病状态下的转录组特征 | 人类胰岛细胞，包括健康供体和2型糖尿病供体 | 单细胞生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 数千个人类胰岛细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7252 | 2025-10-06 |
Molecular Diversity of Midbrain Development in Mouse, Human, and Stem Cells
2016-Oct-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2016.09.027
PMID:27716510
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了人类、小鼠和干细胞来源的中脑发育分子多样性 | 首次在单细胞水平系统定义了人类胚胎腹侧中脑的细胞类型，并建立了评估干细胞来源多巴胺神经元保真度的定量方法 | 研究主要关注发育早期阶段，成年阶段的细胞类型变化仍需进一步探索 | 解析中脑发育的分子程序，为帕金森病细胞替代疗法提供基础 | 人类和小鼠的胚胎腹侧中脑组织，以及人类多能干细胞来源的多巴胺神经元 | 单细胞基因组学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠中脑发育多个阶段的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7253 | 2025-10-06 |
scphaser: haplotype inference using single-cell RNA-seq data
2016-10-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btw484
PMID:27497440
|
研究论文 | 开发了一个用于利用单细胞RNA测序数据进行单倍型推断的R软件包 | 首次利用单细胞RNA-seq数据中的等位基因波动特性进行单倍型推断，能够对稀有变异和基因内远距离变异进行分型 | NA | 开发基于单细胞RNA测序数据的单倍型推断方法 | 人类和小鼠的转录组区域 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7254 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals that Differentiation and Spatial Signatures Shape Epidermal and Hair Follicle Heterogeneity
2016-09-28, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2016.08.010
PMID:27641957
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示小鼠表皮和毛囊异质性的分化与空间特征 | 首次在单细胞水平系统揭示表皮细胞异质性主要由分化状态和空间位置两个维度决定，并发现干细胞区室遵循相同的组织原则 | 研究仅限于小鼠模型，且样本数量相对有限（1,422个细胞） | 解析表皮组织细胞异质性的转录组基础和组织原理 | 小鼠休止期表皮和毛囊细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 1,422个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7255 | 2025-10-06 |
C. elegans Stress-Induced Sleep Emerges from the Collective Action of Multiple Neuropeptides
2016-09-26, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2016.07.048
PMID:27546573
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现秀丽隐杆线虫应激诱导睡眠由多种神经肽集体调控 | 首次揭示应激诱导睡眠由多个神经肽(nlp-8, flp-24, flp-13)协同作用而非单一神经肽控制 | 仅研究了四种最富集的神经肽，可能还有其他神经肽参与睡眠调控 | 探究秀丽隐杆线虫应激诱导睡眠的下游调控机制 | 秀丽隐杆线虫的ALA神经元及其表达的神经肽 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序，基因突变，基因过表达 | NA | 基因表达数据，行为数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7256 | 2025-10-06 |
Zika Virus Disrupts Phospho-TBK1 Localization and Mitosis in Human Neuroepithelial Stem Cells and Radial Glia
2016-09-06, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2016.08.038
PMID:27568284
|
研究论文 | 本研究通过建立人神经上皮干细胞模型，揭示了寨卡病毒通过破坏磷酸化TBK1定位和细胞分裂导致神经发育缺陷的机制 | 首次发现寨卡病毒感染导致神经干细胞中磷酸化TBK1线粒体隔离和中心体耗竭，并建立人神经干细胞模型系统 | 模型系统可能无法完全模拟体内复杂的神经发育环境 | 探究寨卡病毒相关小头畸形和神经发育缺陷的细胞分子机制 | 人神经上皮干细胞、放射状胶质细胞、胎儿脑切片和小头畸形脑组织 | 发育神经生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、组织切片 | 多种神经干细胞类型和脑组织样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7257 | 2025-10-06 |
A single-cell resolution map of mouse hematopoietic stem and progenitor cell differentiation
2016-08-25, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood-2016-05-716480
PMID:27365425
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序绘制了小鼠造血干细胞和祖细胞分化的单细胞分辨率图谱 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统分析超过1600个HSPC，开发了可投射多个独立数据集的单细胞分辨率表达图谱，并创建了便于可视化查询的Web界面 | 研究仅针对小鼠模型，结果在人类系统中的适用性需要进一步验证 | 绘制造血干细胞和祖细胞分化的单细胞分辨率分子图谱 | 小鼠造血干细胞和祖细胞 | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序，索引分选，外部spike-in对照 | NA | 单细胞基因表达数据 | 超过1600个单细胞HSPC | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7258 | 2025-10-06 |
De Novo Prediction of Stem Cell Identity using Single-Cell Transcriptome Data
2016-08-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2016.05.010
PMID:27345837
|
研究论文 | 提出一种基于单细胞转录组数据预测干细胞身份的计算方法StemID | 利用谱系树拓扑结构和转录组组成开发了首个无需先验知识的干细胞识别算法 | 方法依赖于单细胞转录组数据的质量和完整性 | 开发识别干细胞的计算方法 | 小肠Lgr5+细胞、骨髓造血干细胞和人类胰腺细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 谱系树算法 | 单细胞转录组数据 | 多个组织类型的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7259 | 2025-10-06 |
Resolving early mesoderm diversification through single-cell expression profiling
2016-07-14, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature18633
PMID:27383781
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠原肠胚形成期外胚层和新生中胚层细胞的转录组，揭示早期中胚层分化机制 | 首次在哺乳动物原肠胚形成过程中提供转录组范围内的体内视角，并推翻先前关于Tal1基因功能的结论 | 原肠胚形成期细胞数量有限，样本量相对较小 | 解析早期中胚层分化的分子机制 | 小鼠胚胎外胚层和Flk1(+)新生中胚层细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1,205个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7260 | 2025-10-06 |
Oligodendrocyte heterogeneity in the mouse juvenile and adult central nervous system
2016-Jun-10, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aaf6463
PMID:27284195
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小鼠中枢神经系统少突胶质细胞的异质性 | 首次在单细胞水平系统揭示少突胶质细胞谱系存在13个不同亚群，发现不同于传统OPC的第二个Pdgfra(+)血管旁群体 | 研究仅基于小鼠模型，人类中枢神经系统中的情况可能有所不同 | 探究小鼠中枢神经系统中少突胶质细胞的分化和成熟动态 | 小鼠幼年和成年中枢神经系统的少突胶质细胞谱系 | 单细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5072个少突胶质细胞谱系细胞，来自10个不同脑区 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |