单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 7241 - 7260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7241 | 2024-10-15 |
Hepatic stellate cells promote hepatocellular carcinoma development by regulating histone lactylation: Novel insights from single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics analyses
2024-Nov-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217243
PMID:39260669
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研究论文 | 本研究评估了肝细胞癌（HCC）的细胞异质性和分子机制，通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析揭示了肝星状细胞（HSC）在HCC发展中的关键作用 | 首次揭示了肝星状细胞通过调节组蛋白乳酸化在肝细胞癌发展中的重要作用 | NA | 评估肝细胞癌的细胞异质性和分子机制 | 肝星状细胞和肝细胞癌细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学分析 | NA | RNA测序数据 | 从公共数据库收集的数据 |
| 7242 | 2024-10-15 |
Identification of SPP1+ macrophages in promoting cancer stemness via vitronectin and CCL15 signals crosstalk in liver cancer
2024-Nov-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217199
PMID:39216547
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研究论文 | 研究分析了肝癌患者的单细胞RNA测序数据，发现SPP1+巨噬细胞通过vitronectin和CCL15信号的交叉对话促进肝癌干细胞特性 | 首次揭示了SPP1+巨噬细胞通过vitronectin依赖的旁分泌机制上调肿瘤干细胞特性，并建立了巨噬细胞与肿瘤干细胞之间的正反馈回路 | 研究样本仅限于12名肝癌患者，可能影响结果的普适性 | 探讨巨噬细胞在肝癌进展中的作用机制，为肝癌治疗提供新思路 | 肝癌患者的单细胞RNA测序数据，SPP1+巨噬细胞及其与肝癌干细胞的关系 | NA | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 12名肝癌患者 |
| 7243 | 2024-10-15 |
Network Medicine Approach Unravels Endophenotype Signature in Alzheimer's Disease through Large-Scale Comparative Proteomics Analysis: Vascular Dysfunction as a Prime Example
2024-Oct-14, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.4c01344
PMID:39322987
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研究论文 | 研究通过大规模比较蛋白质组学分析，揭示了阿尔茨海默病中的内表型特征，特别是血管功能障碍 | 提出了基于网络的框架来识别阿尔茨海默病病理内表型的蛋白质特征，并发现了新的生物标志物候选者 | NA | 揭示阿尔茨海默病中的内表型特征 | 阿尔茨海默病患者的蛋白质特征 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质数据 | 23个蛋白质数据集，包括阿尔茨海默病患者和转基因小鼠模型 |
| 7244 | 2024-10-15 |
Investigating PPT2's role in ovarian cancer prognosis and immunotherapy outcomes
2024-Oct-11, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-024-01527-9
PMID:39394143
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研究论文 | 研究探讨了PPT2基因在卵巢癌预后和免疫治疗结果中的作用 | 首次系统研究了PPT2基因在卵巢癌中的表达与预后、免疫浸润及分子机制的关系 | 需要进一步研究PPT2与免疫治疗效果在卵巢癌患者中的关系 | 确定PPT2表达与卵巢癌预后、免疫浸润及潜在分子机制的关联 | PPT2基因在卵巢癌中的表达及其对预后和免疫治疗结果的影响 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 使用了来自TCGA、GTEx和GEO数据库的RNA-seq和临床数据，以及内部数据集 |
| 7245 | 2024-10-15 |
Immunometabolic changes and potential biomarkers in CFS peripheral immune cells revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Oct-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05710-w
PMID:39394558
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了慢性疲劳综合征患者外周血单核细胞的免疫代谢变化，并发现了潜在的生物标志物 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了慢性疲劳综合征患者外周血单核细胞的免疫代谢变化，并识别出ESRRA-APP-CD74信号通路作为潜在的生物标志物 | 样本量较小且仅评估了外周血 | 探讨慢性疲劳综合征的病理机制及其潜在的生物标志物 | 慢性疲劳综合征患者和健康对照的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 慢性疲劳综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4名慢性疲劳综合征患者和4名健康对照 |
| 7246 | 2024-10-15 |
Single-cell RNA transcriptomic analyses of tumor microenvironment of ovarian metastasis in gastric cancer
2024-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-00974-2
PMID:39162990
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了胃癌卵巢转移的肿瘤微环境 | 首次综合分析了胃癌卵巢转移的免疫微环境，并识别了与转移相关的特定细胞类型和基因特征 | 样本量较小，仅分析了两对临床样本 | 揭示胃癌卵巢转移的免疫微环境，促进新治疗策略的发现 | 胃癌卵巢转移的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两对临床样本 |
| 7247 | 2024-09-25 |
Unveiling Molecular Diversity in Cerebral Thrombi via Spatial Transcriptomics
2024-Oct, Stroke
IF:7.8Q1
DOI:10.1161/STROKEAHA.124.047907
PMID:39206540
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7248 | 2024-10-15 |
Somatic mitochondrial DNA mutations are a source of heterogeneity among primary leukemic cells
2024-Sep-27, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.09.26.24314381
PMID:39398996
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研究论文 | 本研究探讨了体细胞线粒体DNA（mtDNA）突变在儿童白血病中的异质性来源及其生物学意义 | 通过整合单细胞测序（SCS）与数学建模和网络系统生物学方法，揭示了肿瘤富集的mtDNA突变与细胞状态变化之间的关联 | 研究主要基于两个儿童癌症患者队列的批量全基因组测序数据，样本量有限 | 探讨体细胞线粒体DNA突变在白血病细胞中的异质性及其生物学意义 | 儿童白血病患者的肿瘤和正常样本 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序（SCS） | 数学建模 | 基因组数据 | 两个儿童癌症患者队列的匹配肿瘤和正常样本 |
| 7249 | 2024-10-15 |
Bioinformatics-based diagnosis and evaluation of several pivotal genes and pathways associated with immune infiltration at different time points in spinal cord injury
2024-Apr, Biotechnology & genetic engineering reviews
DOI:10.1080/02648725.2023.2178970
PMID:36841940
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研究论文 | 本研究利用生物信息学方法分析脊髓损伤后不同时间点的关键基因和信号通路，评估免疫浸润情况 | 首次通过基因表达数据和功能富集分析方法，揭示了脊髓损伤后不同时间点的免疫相关基因和信号通路 | 研究仅基于两个基因表达数据集，样本量有限，可能影响结果的普适性 | 探讨脊髓损伤后不同时间点的免疫相关基因和信号通路，为干预策略提供理论基础 | 脊髓损伤后的关键基因和信号通路 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 两个基因表达数据集（GSE464和GSE45006），分别包含370个和111个共享基因 |
| 7250 | 2024-10-15 |
Aggressive high-grade NF2 mutant meningiomas downregulate oncogenic YAP signaling via the upregulation of VGLL4 and FAT3/4
2024 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdae148
PMID:39380691
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研究论文 | 研究了NF2突变型脑膜瘤中YAP信号通路的调控机制 | 发现了高级别NF2突变型脑膜瘤通过上调VGLL4和FAT3/4来下调YAP信号通路 | 研究仅限于体外细胞实验和RNA测序数据分析 | 探讨不同级别NF2突变型脑膜瘤中YAP信号通路的依赖性 | NF2突变型脑膜瘤 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大量人类脑膜瘤样本 |
| 7251 | 2024-10-15 |
STmut: a framework for visualizing somatic alterations in spatial transcriptomics data of cancer
2023-11-30, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03121-6
PMID:38037084
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STmut的新软件，用于在Visium空间转录组数据中可视化体细胞点突变、等位基因不平衡和拷贝数变异 | STmut软件的创新之处在于它能够在空间转录组数据中可视化体细胞突变和拷贝数变异 | FFPE平台的化学性质不允许分析单核苷酸变异 | 本文旨在为空间转录组数据添加遗传维度，并描述不同数据类型的局限性 | 本文研究了新鲜冷冻Visium数据、福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）Visium数据以及有无匹配DNA测序数据的肿瘤 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 基因表达数据 | 涉及新鲜冷冻Visium数据、FFPE Visium数据以及有无匹配DNA测序数据的肿瘤样本 |
| 7252 | 2024-10-15 |
PD-1- CD45RA+ effector-memory CD8 T cells and CXCL10+ macrophages are associated with response to atezolizumab plus bevacizumab in advanced hepatocellular carcinoma
2023-Nov-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43381-1
PMID:38030622
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研究论文 | 研究了atezolizumab和bevacizumab联合治疗晚期肝细胞癌（HCC）的免疫反应机制 | 通过单细胞转录组学分析，揭示了PD-1- CD45RA+效应记忆CD8 T细胞和CXCL10+巨噬细胞在患者对atezolizumab和bevacizumab联合治疗反应中的作用 | 研究仅限于晚期肝细胞癌患者，且样本量未明确 | 探讨atezolizumab和bevacizumab联合治疗晚期肝细胞癌的免疫反应机制 | 晚期肝细胞癌患者的肿瘤内和外周免疫环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 7253 | 2024-10-15 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics data using deep generative models with SpatialScope
2023-Nov-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43629-w
PMID:38030617
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpatialScope的统一方法，通过深度生成模型整合单细胞转录组数据和空间转录组数据，以解决当前空间转录组技术在细胞分辨率或转录组全面分析方面的局限性 | SpatialScope通过模型和算法设计的创新，不仅提升了基于测序的空间转录组数据的单细胞分辨率，还能准确推断基于图像的空间转录组数据的转录组全面表达水平 | NA | 解决当前空间转录组技术在细胞分辨率或转录组全面分析方面的局限性 | 单细胞转录组数据和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组技术 | 深度生成模型 | 转录组数据 | NA |
| 7254 | 2024-10-15 |
Detection of isoforms and genomic alterations by high-throughput full-length single-cell RNA sequencing in ovarian cancer
2023-Nov-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43387-9
PMID:38012143
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研究论文 | 本文通过高深度长读长单细胞RNA测序技术，研究了卵巢癌患者的临床样本，揭示了新的基因组变异和基因融合 | 本文首次在高深度长读长单细胞RNA测序中捕获了大量未报道的转录本，并发现了细胞类型特异性的转录本和多聚腺苷酸位点使用情况 | 本文仅在三个卵巢癌患者的样本中进行了研究，样本量较小，可能影响结果的普适性 | 本文旨在通过高深度长读长单细胞RNA测序技术，揭示卵巢癌中的基因组变异和基因融合 | 本文研究了卵巢癌患者的临床样本，重点关注了肿瘤细胞和间皮细胞的转录本和基因组变异 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 长读长单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三个卵巢癌患者的临床样本 |
| 7255 | 2024-10-15 |
Lobular Carcinoma of the Breast: A Comprehensive Review with Translational Insights
2023-Nov-20, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15225491
PMID:38001750
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综述 | 本文综述了乳腺浸润性小叶癌的多个病理方面及其转化特征 | 探讨了空间转录组学和其他高复杂度技术在肿瘤微环境特征和最新研究成果中的应用 | NA | 深入理解乳腺浸润性小叶癌的独特实体及其在个性化治疗时代的新治疗选择 | 乳腺浸润性小叶癌的病理特征、遗传途径、生物学特性及治疗策略 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 7256 | 2024-10-15 |
Integrated multi-omics single cell atlas of the human retina
2023-Nov-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3471275/v1
PMID:38014002
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研究论文 | 本文构建了一个综合的多模态人类视网膜单细胞图谱 | 本文首次整合了人类视网膜的转录组和染色质可及性数据，揭示了超过110种细胞类型，并细化了细胞本体论，识别了特异性标记基因和基因调控网络 | NA | 构建一个综合的多模态人类视网膜单细胞图谱，以促进对视网膜功能和病理的理解 | 人类视网膜的单细胞转录组和染色质可及性 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据和染色质可及性数据 | 来自55名捐赠者的约240万细胞，其中包括140万未发表的数据点 |
| 7257 | 2024-10-15 |
What Links Chronic Kidney Disease and Ischemic Cardiomyopathy? A Comprehensive Bioinformatic Analysis Utilizing Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data with Machine Learning
2023-Nov-16, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life13112215
PMID:38004354
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研究论文 | 本研究通过整合公开的bulk和单细胞RNA测序数据，利用机器学习算法揭示慢性肾病与缺血性心肌病之间的分子机制 | 本研究首次整合bulk和单细胞RNA测序数据，利用机器学习算法识别出13个候选基因，并构建了诊断模型用于CKD相关ICM的诊断 | 本研究主要依赖公开数据，未涉及体内实验验证候选基因的功能 | 揭示慢性肾病与缺血性心肌病之间的分子机制 | 慢性肾病和缺血性心肌病 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA测序 | 高斯朴素贝叶斯模型 | RNA测序数据 | 两个ICM心脏组织数据集和一个CKD外周血单核细胞数据集 |
| 7258 | 2024-10-15 |
Human brain single nucleus cell type enrichments in neurodegenerative diseases
2023-Nov-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3390225/v1
PMID:38014237
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研究论文 | 本文研究了神经退行性疾病中人脑单核细胞类型的富集情况 | 利用全基因组关联研究、单细胞测序数据和批量表达研究，识别了神经退行性疾病中重要的细胞类型和基因 | NA | 识别神经退行性疾病中重要的细胞类型和基因，以促进治疗靶点的开发 | 阿尔茨海默病、肌萎缩侧索硬化症和帕金森病的脑组织 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多个脑区组织的多样本 |
| 7259 | 2024-10-15 |
Identification of Cellular Compositions in Different Microenvironments and Their Potential Impacts on Hematopoietic Stem Cells HSCs Using Single-Cell RNA Sequencing with Systematical Confirmation
2023-Nov-02, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life13112157
PMID:38004297
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，系统地确认了不同微环境中细胞组成的识别及其对造血干细胞（HSCs）的潜在影响 | 首次系统地研究了不同微环境中细胞组成对HSCs的影响，并结合多种技术验证了研究结果 | 研究主要集中在小鼠模型上，结果的普适性可能有限 | 探讨不同微环境中细胞组成对造血干细胞的影响及其调控机制 | 造血干细胞（HSCs）及其微环境中的单核细胞（MNCs） | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 包括小鼠胎儿肝脏单核细胞（FL-MNCs）、骨髓单核细胞（BM-MNCs）和培养的胎儿肝脏基质细胞 |
| 7260 | 2024-10-15 |
The heterocellular heart: identities, interactions, and implications for cardiology
2023-07-26, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-023-01000-6
PMID:37495826
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综述 | 本文综述了心脏的异质细胞特性，包括主要的心脏细胞类型及其在稳态中的作用，并讨论了这些细胞间相互作用对心脏病学基础研究和治疗干预的潜在影响 | 利用单细胞测序技术识别心脏细胞的细微差异，并重新探讨了细胞身份的定义 | NA | 探讨心脏异质细胞特性及其对心脏病学的影响 | 心脏中的主要细胞类型及其相互作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |