单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 40345 篇文献，本页显示第 7221 - 7240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7221 | 2026-02-24 |
Generation of human pineal gland organoids with melatonin production for disease modeling
2026-Jan-08, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.12.004
PMID:41475351
|
研究论文 | 本研究开发了人松果体类器官，用于模拟松果体发育和功能，并应用于疾病建模 | 首次从多能干细胞生成人松果体类器官，成功模拟松果体发育和褪黑素生产，并应用于Angelman综合征疾病模型 | 研究基于体外模型，可能无法完全复制体内复杂环境，且样本来源有限 | 开发人松果体类器官平台，用于研究松果体发育、昼夜节律调节及相关疾病 | 人松果体类器官、Angelman综合征患者来源的iPSCs、松果体切除小鼠 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7222 | 2026-02-24 |
SLC25A37 as a novel therapeutic target for benign prostatic hyperplasia: integrative analyses of single-cell RNA sequencing and genome-wide association studies
2026-Jan, Open medicine (Warsaw, Poland)
DOI:10.1515/med-2025-1371
PMID:41726128
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和全基因组关联分析，鉴定出SLC25A37是良性前列腺增生（BPH）的一个新型致病基因，并探索了其作为治疗靶点的潜力 | 首次将单细胞RNA测序与全基因组关联研究相结合，在BPH的经典单核细胞中鉴定出SLC25A37这一新的致病基因，并探索了靶向该基因的潜在治疗药物 | 未明确说明样本的具体数量，且体外实验验证可能不足以完全代表体内复杂的病理生理环境 | 识别良性前列腺增生（BPH）的致病基因并探索潜在的治疗靶点 | 良性前列腺增生（BPH）患者与健康对照者的前列腺组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），全基因组关联研究（GWAS），孟德尔随机化（MR），贝叶斯共定位，分子对接，流式细胞术，qRT-PCR，蛋白质印迹，免疫组织化学，免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据，基因组关联数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7223 | 2026-02-24 |
Multi-scale systems toxicology defines a KLF5-centered adverse outcome pathway linking DEHP exposure to pancreatic cancer progression and signaling programs relevant to therapy tolerance
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1769023
PMID:41727317
|
研究论文 | 本研究通过多尺度系统毒理学框架，揭示了DEHP暴露通过KLF5中心的不良结局通路促进胰腺癌进展的机制 | 整合了异质集成机器学习、孟德尔随机化、分子对接与动力学、单细胞转录组学等多种方法，首次提出KLF5为中心的DEHP-PDAC关联通路 | 研究结果主要为假设生成性质，需要进一步实验验证 | 阐明DEHP暴露与胰腺癌进展之间的分子机制和不良结局通路 | 胰腺导管腺癌（PDAC）相关基因、KLF5蛋白、PANC-1细胞系 | 系统毒理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学、分子对接、分子动力学模拟、孟德尔随机化 | TabPFN增强集成模型、异质集成机器学习 | 基因表达数据、单细胞RNA-seq数据、分子结构数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7224 | 2026-02-24 |
Single-cell RNA sequencing suggests different progenitor lineages between IDH mutant and IDHwt glioma
2026 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdag003
PMID:41727340
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了IDH突变型和IDH野生型胶质瘤在祖细胞谱系标记表达上的差异 | 首次将胎儿脑神经祖细胞分类系统应用于IDH突变型和野生型胶质瘤的单细胞分析，揭示了THY1表达在两类胶质瘤中的显著差异 | 研究依赖于公开数据集，样本量有限，且未进行实验验证 | 比较IDH突变型和IDH野生型胶质瘤的祖细胞谱系差异 | IDH突变型星形细胞瘤、少突胶质细胞瘤和IDH野生型胶质母细胞瘤样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 90个样本（74个IDHwt原发和复发样本，6个原发少突胶质细胞瘤样本，10个原发IDH突变型星形细胞瘤样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7225 | 2026-02-24 |
Multi-omics comprehensive analysis identified KIF22 and KRAS as highly synthetic lethal pairs for triple-negative breast cancer
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1748954
PMID:41727639
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析识别出KIF22和KRAS作为三阴性乳腺癌的合成致死基因对 | 首次通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序等多组学数据，结合机器学习方法，系统性地鉴定出三阴性乳腺癌中具有高合成致死活性的新型细胞亚型，并实验验证了KIF22和KRAS作为合成致死基因对的功能 | 研究主要基于生物信息学分析和体外体内实验验证，临床转化潜力尚需进一步临床试验评估 | 探索三阴性乳腺癌的异质性，识别与疾病进展相关的合成致死基因对，为靶向治疗提供新策略 | 三阴性乳腺癌细胞及其微环境细胞亚群 | 生物信息学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | 随机森林, 机器学习 | RNA测序数据 | 未明确指定具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 7226 | 2026-02-24 |
ESRP1 drives epithelial-mesenchymal transition by activating EPAC-RAP1A signaling axis
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1734619
PMID:41728622
|
研究论文 | 本研究揭示了ESRP1通过激活EPAC-RAP1A信号轴驱动上皮-间质转化，从而促进特发性肺纤维化进展 | 首次在单细胞水平上识别ESRP1作为EMT的关键上游调控因子，并阐明其通过EPAC-RAP1A轴的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，人类样本验证不足，且未探讨其他潜在信号通路 | 探究特发性肺纤维化中上皮-间质转化的分子机制 | 小鼠肺组织、原代肺泡上皮细胞、MLE-12肺泡上皮细胞系 | 单细胞转录组学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、qPCR、Western blot、免疫荧光、Co-IP | NA | 单细胞转录组数据、基因表达数据、蛋白质互作数据 | 未明确样本数量，包括BLM处理的小鼠模型和细胞培养实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7227 | 2026-02-24 |
Decoding muscle-resident Schwann cell dynamics during neuromuscular junction remodeling
2025-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.06.561193
PMID:38370853
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了肌肉驻留雪旺细胞在神经肌肉接头重塑中的作用，并发现了调控该过程的关键分子通路 | 发现了神经肌肉接头重塑过程中一种新型的终末雪旺细胞亚型，并确定了SPP1信号通路作为调控雪旺细胞增殖和肌肉再神经支配的关键调节因子 | 研究主要基于小鼠模型，其在人类疾病中的直接适用性尚需进一步验证 | 阐明肌肉驻留雪旺细胞在神经肌肉接头重塑中的细胞动力学和分子机制 | 肌肉驻留雪旺细胞及其在稳定神经支配、部分去神经支配和完全去神经支配再神经支配模型中的亚型 | 单细胞组学 | 神经肌肉疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7228 | 2026-02-24 |
Human vascularized macrophage-islet organoids to model immune-mediated pancreatic β cell pyroptosis upon viral infection
2024-Nov-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.08.007
PMID:39232561
|
研究论文 | 本研究开发了一种人源血管化巨噬细胞-胰岛类器官模型，用于模拟病毒感染下免疫介导的胰腺β细胞焦亡 | 首次利用人源多能干细胞构建血管化巨噬细胞-胰岛类器官，结合GeoMx空间多组学平台和单细胞RNA测序技术，揭示了TNFSF12-TNFRSF12A信号通路在促炎巨噬细胞介导的β细胞焦亡中的作用 | 研究主要基于体外类器官模型，可能无法完全模拟体内复杂免疫微环境；样本来源和数量可能有限 | 研究病毒感染下免疫介导的胰腺β细胞损伤机制 | 人源多能干细胞衍生的血管化巨噬细胞-胰岛类器官、COVID-19胰腺尸检样本、暴露于SARS-CoV-2或CVB4病毒的人胰岛 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、空间多组学分析 | 类器官模型 | 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 未明确具体样本数量，包括COVID-19胰腺尸检样本和病毒感染的人胰岛样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间多组学平台 |
| 7229 | 2026-02-24 |
Single cell RNA-seq reveals cellular and transcriptional heterogeneity in the splenic CD11b+Ly6Chigh monocyte population expanded in sepsis-surviving mice
2024-Nov-06, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00970-0
PMID:39506629
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脓毒症存活小鼠脾脏CD11b+Ly6Chigh单核细胞群体的细胞和转录异质性 | 首次在脓毒症存活小鼠模型中，利用单细胞RNA测序技术深入解析了脾脏CD11b+Ly6Chigh髓系细胞的转录异质性，并识别出具有免疫抑制能力的增殖性M-MDSCs亚群 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类样本中验证；且仅关注了脾脏中的特定髓系细胞群体，可能未全面反映全身免疫状态 | 旨在理解脓毒症幸存者免疫失调的细胞和分子基础 | C57BL/6J和BALB/c小鼠脾脏中的CD11b+Ly6Chigh髓系细胞 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，吞噬和糖酵解功能测定 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | C57BL/6J和BALB/c小鼠的假手术和CLP手术组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7230 | 2026-02-24 |
Review of multi-omics data resources and integrative analysis for human brain disorders
2021-07-17, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elab024
PMID:33969380
|
综述 | 本文综述了人类脑部疾病的多组学数据资源及整合分析方法 | 及时更新了快速发展的多组学数据资源，并涵盖了单细胞组学和空间转录组学等新兴技术 | NA | 总结人类脑部健康与疾病的多组学数据资源及整合分析方法 | 人类大脑，包括健康对照和神经精神疾病患者 | 生物信息学 | 神经精神疾病 | 多组学数据整合分析 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7231 | 2026-02-23 |
Therapeutic reprogramming of circulating myeloid cells via signal regulatory protein α extracellular vesicles in acute kidney injury
2026-Mar, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.12.012
PMID:41448459
|
研究论文 | 本文探讨了通过表达高亲和力信号调节蛋白α变体的细胞外囊泡靶向CD47，以治疗急性肾损伤 | 开发了表达高亲和力SIRPα变体的细胞外囊泡，用于系统性靶向循环髓系细胞中的CD47，提供了一种新型免疫调节策略 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限，且长期疗效和安全性未充分评估 | 研究靶向CD47的细胞外囊泡在急性肾损伤中的治疗潜力 | 人类急性肾损伤样本和小鼠模型（顺铂和双侧缺血/再灌注） | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序，CD47蛋白染色 | NA | RNA测序数据，蛋白质染色图像 | 人类急性肾损伤标本和两种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7232 | 2026-02-23 |
Mechanistic insights from transcript analysis of long-term pig to non-human primate kidney xenografts
2026-Mar, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.11.018
PMID:41478397
|
研究论文 | 本文通过转录分析探讨了猪到非人灵长类动物肾脏异种移植物的长期机制，揭示了稳定移植物中转录升高、VEGFA损失与血栓性微血管病相关，以及异种移植物中供体内皮转录损失和受体内皮转录获得的新颖过程 | 研究发现异种移植物中供体内皮转录损失和受体内皮转录及蛋白的意外获得，这是一种在异种移植物中检测到的新过程，与同种异体移植中的抗体介导排斥反应形成对比 | 研究基于非人灵长类动物模型，可能不完全适用于人类临床环境，样本数量有限（58个样本），且依赖于转录分析，需要进一步功能验证 | 研究猪肾脏异种移植物在非人灵长类动物中的长期转录机制，以了解异种移植与同种异体移植的不同机制 | eGenesis猪肾脏异种移植物在猕猴中的样本，包括供体、灌注后、协议和终末样本 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 转录分析、空间转录组学、抗体检测 | NA | 转录数据、空间转录组数据、蛋白质表达数据 | 58个样本来自猕猴中的猪肾脏异种移植物 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7233 | 2026-02-23 |
Lactate metabolism-driven tumor heterogeneity and molecular signatures in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Feb-21, World journal of gastroenterology
IF:4.3Q1
DOI:10.3748/wjg.v32.i7.113973
PMID:41694488
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，系统表征了肝内胆管癌中乳酸代谢驱动的异质性及其分子和功能意义 | 首次在单细胞水平系统表征了肝内胆管癌中乳酸代谢的异质性，并利用多种机器学习算法识别出12个与乳酸代谢相关的特征基因，其中CYC1被鉴定为主要驱动基因 | 研究主要基于转录组数据，功能验证仅限于细胞系实验，缺乏体内模型和临床样本的进一步验证 | 系统表征肝内胆管癌中乳酸代谢驱动的异质性及其分子和功能意义 | 肝内胆管癌恶性细胞 | 机器学习 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 定量PCR, 细胞功能实验 | LASSO, 随机森林, 梯度提升机, 自适应最佳子集选择, 决策树 | RNA测序数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 7234 | 2026-02-05 |
Single-cell transcriptomics identifies fibroblast associated immune heterogeneity and prognostic signatures in bladder cancer
2026-Feb-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-38219-x
PMID:41634289
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7235 | 2026-02-05 |
Integrative analysis of transcriptome and single-cell sequencing combined with experimental validation identifies biomarkers associated with T cell and senescence in sepsis
2026-Feb-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-38559-8
PMID:41634312
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7236 | 2026-02-23 |
Interpretable inflammation landscape of circulating immune cells
2026-Feb, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-04126-3
PMID:41526507
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，描绘了感染、免疫介导炎症性疾病和癌症中循环免疫细胞的炎症过程，构建了一个包含超过650万个外周血单个核细胞的单细胞图谱 | 通过大规模单细胞图谱学习循环免疫细胞的全面炎症模型，并利用无监督和可解释机器学习开发疾病分类框架 | 研究主要基于外周血单个核细胞，可能未完全涵盖组织特异性炎症反应 | 全面理解循环免疫细胞的炎症过程，开发炎症性疾病的分类框架 | 循环免疫细胞，特别是外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 感染、免疫介导炎症性疾病、癌症 | 单细胞转录组学 | 无监督机器学习、可解释机器学习 | 单细胞RNA-seq数据 | 1,047名患者（56%女性，43%男性），超过650万个外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7237 | 2026-02-23 |
An integrated single-cell lung cancer atlas reveals distinct fibroblast phenotypes between adenocarcinoma and squamous cell carcinomas
2026-Jan-23, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01279-3
PMID:41577803
|
研究论文 | 本研究通过整合公共可用的单细胞RNA测序数据，构建了一个非小细胞肺癌的综合图谱，揭示了肺腺癌和肺鳞状细胞癌之间肿瘤微环境异质性、细胞组成以及癌症相关成纤维细胞亚型的显著差异 | 首次通过整合大规模公共单细胞RNA测序数据，系统比较了肺腺癌和肺鳞状细胞癌中肿瘤微环境的异质性，并明确了两种亚型中占主导地位的癌症相关成纤维细胞亚型及其与预后的不同关联 | 研究依赖于公共数据集，可能存在批次效应；研究结果主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平验证；共培养实验在体外进行，可能无法完全模拟体内复杂的肿瘤微环境 | 探究非小细胞肺癌中肺腺癌和肺鳞状细胞癌之间肿瘤微环境，特别是癌症相关成纤维细胞亚型的差异及其与预后的关系 | 非小细胞肺癌患者肿瘤组织中的细胞，特别是癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 整合了公共可用的大规模单细胞RNA测序数据集（具体样本数量未在摘要中明确给出） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7238 | 2026-02-23 |
Expression Atlas in 2026: enabling FAIR and open expression data through community collaboration and integration
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1238
PMID:41370097
|
研究论文 | 本文介绍了Expression Atlas知识库在2026年的更新，包括内容扩展、功能增强和社区协作，以支持FAIR原则下的基因和蛋白质表达数据 | 新增了批量基线实验的标记基因分析模块，整合了单细胞RNA-seq数据集如Tabula Sapiens和GTEx单核图谱，并计划提供AI就绪数据格式 | 未明确提及具体的技术或数据局限性，主要关注资源更新和未来方向 | 通过社区协作和集成，实现FAIR和开放的表达数据，支持基础和转化研究 | 基因和蛋白质表达数据，涵盖组织、细胞类型、条件和多种物种 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq，蛋白质组学 | NA | 基因表达数据，蛋白质表达数据 | 超过4500项研究，涉及67个物种，包括数百个单细胞RNA-seq实验 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 7239 | 2026-02-23 |
Coronary Artery Calcification: Decoding Mechanisms, Innovations, and Translational Strategies from Bench to Bedside
2025-Dec-26, Journal of cardiovascular translational research
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12265-025-10720-0
PMID:41454180
|
综述 | 本文综述了冠状动脉钙化（CAC）的病理机制、技术创新及临床管理策略，强调其从被动标志物向主动调控过程的转变 | 整合了30年研究，通过单细胞测序识别了内膜与中膜钙化亚型，并强调了AI在影像分割（99.2%准确率）和血管内碎石术（IVL，≥98%成功率）等创新技术的应用 | 他汀类药物对钙化的双重效应、亚型诊断缺口以及先进工具（如IVL在>70%资源有限设施中不可用）的可及性有限 | 总结CAC的病理机制、技术进展和临床证据，推动从被动治疗向主动血管健康优化的转变 | 冠状动脉钙化（CAC）及其相关的动脉粥样硬化病理 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | AI | 影像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7240 | 2026-02-23 |
Spatial analysis of IPMNs defines a paradoxical KRT17-positive, low-grade epithelial population harboring malignant features
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.18.643943
PMID:40166305
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析，识别了胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤中一个表达恶性特征的KRT17阳性低级别上皮细胞亚群 | 首次在组织学低级别IPMN中发现了一个表达恶性转录特征（如KRT17、S100A10和CEACAM5）的上皮细胞亚群，该亚群可能代表向高级别不典型增生进展的过渡状态 | 研究样本数量可能有限，且需要进一步验证该KRT17阳性亚群在更大队列中的临床意义和预测价值 | 探究IPMN进展过程中的转录变化，以改善患者风险分层和治疗决策 | 胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤患者样本，包括低级别不典型增生、高级别不典型增生和IPMN来源的癌组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据，免疫荧光图像 | 包含IPMN疾病全谱的患者样本，具体数量未明确说明 | Nanostring | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | Nanostring GeoMx | Nanostring GeoMx空间转录组平台 |