单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7221 - 7240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7221 | 2025-10-06 |
Probabilistic modeling of bifurcations in single-cell gene expression data using a Bayesian mixture of factor analyzers
2017-Mar-15, Wellcome open research
DOI:10.12688/wellcomeopenres.11087.1
PMID:28503665
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研究论文 | 提出首个基于贝叶斯分层因子分析混合模型的生成式概率模型，用于单细胞转录组数据中的分支推断 | 首个完全概率生成模型，采用贝叶斯分层因子分析混合方法和经验贝叶斯扩展处理零膨胀数据 | 讨论了统一概率方法在实践生物信息学分析中的优缺点 | 推断单细胞转录组数据中的分支结构 | 单细胞基因表达数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯分层因子分析混合模型，马尔可夫链蒙特卡洛采样 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7222 | 2025-10-06 |
Planarian Epidermal Stem Cells Respond to Positional Cues to Promote Cell-Type Diversity
2017-03-13, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2017.02.008
PMID:28292427
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示涡虫表皮干细胞如何响应位置信号促进细胞类型多样性 | 发现表皮干细胞在谱系早期就表现出空间身份差异，并揭示BMP信号通路在建立背腹侧表皮身份中的关键作用 | 研究主要聚焦于表皮谱系，其他细胞谱系的位置调控机制尚未探索 | 探究成体祖细胞如何通过位置信号获得不同功能身份 | 涡虫表皮干细胞及其后代细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7223 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq and computational analysis using temporal mixture modelling resolves Th1/Tfh fate bifurcation in malaria
2017-Mar-03, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aal2192
PMID:28345074
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和计算分析解析疟疾感染中Th1/Tfh细胞命运分叉 | 开发了GPfates时间混合模型重建Th1/Tfh细胞发育轨迹，首次在群体和单克隆水平证明Th1/Tfh分叉 | 研究局限于小鼠疟疾感染模型，人类细胞中的适用性需要进一步验证 | 解析CD4 T细胞在疟疾感染中分化为Th1和Tfh细胞的命运决定机制 | 小鼠疟疾感染模型中的 naïve CD4 T细胞、Th1细胞、Tfh细胞和Tr1细胞 | 计算生物学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序，TCR序列追踪，计算建模 | 高斯过程混合模型(GPfates) | 单细胞转录组数据，TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7224 | 2025-10-06 |
Detection of Imprinted Genes by Single-Cell Allele-Specific Gene Expression
2017-Mar-02, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2017.01.028
PMID:28190458
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研究论文 | 开发了一种结合单细胞RNA测序和全基因组测序的新方法，用于检测特定细胞类型中的印记基因 | 将单细胞RNA-seq与全基因组测序结合到优化的统计框架中，能够在特定细胞类型和不同个体中分析基因组印记 | 样本量相对较小，仅使用了2个家庭三人组和3个无关个体的样本 | 开发检测印记基因的新方法并建立细胞类型特异性的基因组印记图谱 | 人类原代成纤维细胞 | 基因组学 | 糖尿病,癌症 | 单细胞RNA测序,全基因组测序 | beta-二项分布统计模型 | RNA测序数据,基因组测序数据 | 1,084个原代成纤维细胞，来自2个家庭三人组和3个无关个体 | NA | 单细胞RNA-seq,全基因组测序 | NA | NA |
| 7225 | 2025-10-06 |
Pooled CRISPR screening with single-cell transcriptome readout
2017-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.4177
PMID:28099430
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研究论文 | 开发了一种将CRISPR筛选与单细胞RNA测序相结合的新方法CROP-seq | 首次将CRISPR筛选与单细胞转录组测序整合，实现数千个单细胞中直接关联gRNA表达与转录组响应 | NA | 开发高通量功能基因组学筛选方法 | 复杂调控机制和异质性细胞群体 | 基因组学 | NA | CRISPR筛选，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 数千个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | CRISPR droplet sequencing (CROP-seq) |
| 7226 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis of fish immune cells provides insight into the evolution of vertebrate immune cell types
2017-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.207704.116
PMID:28087841
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析比较脊椎动物免疫细胞类型的进化特征 | 首次在非哺乳类脊椎动物（斑马鱼）中获得特定免疫细胞类型的转录组，发现新型NK样细胞和免疫细胞特异性基因 | 仅分析了斑马鱼一种非哺乳类物种，需要更多物种验证普遍性 | 研究脊椎动物免疫细胞类型的进化特征 | 人类、小鼠和斑马鱼的免疫细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7227 | 2025-10-06 |
Xist-dependent imprinted X inactivation and the early developmental consequences of its failure
2017-03, Nature structural & molecular biology
IF:12.5Q1
DOI:10.1038/nsmb.3365
PMID:28134930
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了Xist在早期小鼠胚胎中调控印记X染色体失活的关键作用 | 首次证明印记X染色体失活的启动绝对需要Xist，并发现Xist缺失导致囊胚期全基因组转录失调和胚外发育通路激活失败 | 研究仅限于小鼠胚胎模型，未涉及其他物种 | 探究Xist依赖性印记X染色体失活机制及其早期发育后果 | 小鼠早期植入前胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 早期植入前小鼠胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7228 | 2025-10-06 |
UMI-tools: modeling sequencing errors in Unique Molecular Identifiers to improve quantification accuracy
2017-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.209601.116
PMID:28100584
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研究论文 | 开发了基于网络的方法来建模UMI测序错误，提高高通量测序实验的定量准确性 | 首次提出网络化方法系统处理UMI测序错误，相比传统忽略或临时解决方案有显著改进 | 未明确说明方法在超大规模数据集上的计算效率 | 提高高通量测序中基于UMI的定量分析准确性 | 独特分子标识符(UMI)的测序错误建模 | 生物信息学 | NA | iCLIP, 单细胞RNA测序 | 基于网络的方法 | 测序数据 | 模拟条件和真实iCLIP及单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7229 | 2025-10-06 |
Single-Cell Multiomics: Multiple Measurements from Single Cells
2017-02, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2016.12.003
PMID:28089370
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综述 | 本文综述了单细胞多组学技术，该技术能够从同一单细胞中并行检测多种分子类型 | 首次系统总结了能够从同一单细胞中同时分析多种分子类型的实验方法 | 作为综述文章，不包含原始实验数据，主要关注技术方法的梳理和展望 | 探讨单细胞多组学技术的现状、挑战和未来发展机遇 | 单细胞多组学技术和方法 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞测序，多组学分析 | NA | 多组学数据（RNA、甲基化DNA、开放染色质等） | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 7230 | 2025-10-06 |
The impact of microRNAs on transcriptional heterogeneity and gene co-expression across single embryonic stem cells
2017-01-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms14126
PMID:28102192
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术探究microRNAs在单个胚胎干细胞中对转录异质性和基因共表达的调控作用 | 首次在单细胞水平揭示microRNAs对其多个靶基因的同步调控作用，并发现不同microRNAs对转录异质性和细胞周期基因相位的相反影响 | 研究仅使用了两种microRNAs（miR-294和let-7c），且仅限于小鼠胚胎干细胞模型 | 探究microRNAs在单细胞水平如何影响转录异质性和基因共表达 | microRNA缺陷的Dgcr8敲除小鼠胚胎干细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞测序，microRNA导入 | NA | 单细胞基因表达数据 | 单个胚胎干细胞群体 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 7231 | 2025-10-06 |
The nature and nurture of cell heterogeneity: accounting for macrophage gene-environment interactions with single-cell RNA-Seq
2017-01-07, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-016-3445-0
PMID:28061811
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞培养、活细胞成像和单细胞RNA测序技术，探索巨噬细胞的基因-环境相互作用 | 开发了可编程的Polaris微流控芯片，能够在控制每个细胞微环境的同时进行活细胞成像和单细胞测序 | 转录组数据在描述高级功能表型和蛋白事件方面存在局限 | 研究巨噬细胞异质性的遗传和环境决定因素 | 基因编辑的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | HIV | 单细胞RNA测序, 基因编辑, 活细胞成像 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | Polaris微流控芯片 | 可编程微流控实验室芯片，集成单细胞培养、活细胞成像和单细胞测序功能 |
| 7232 | 2025-10-06 |
Diversity amongst trigeminal neurons revealed by high throughput single cell sequencing
2017, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0185543
PMID:28957441
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研究论文 | 通过高通量单细胞测序揭示三叉神经节神经元的多样性 | 首次利用单细胞测序定义了三叉神经节的13个神经元亚群，发现这些亚群在背根神经节中保守存在 | 研究仅基于小鼠模型，人类三叉神经元的多样性可能有所不同 | 探索三叉神经节神经元的细胞多样性及其功能分类 | 小鼠三叉神经节神经元 | 单细胞组学 | NA | 单细胞测序，原位杂交 | NA | 单细胞基因表达数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7233 | 2025-10-06 |
Intrinsic transcriptional heterogeneity in B cells controls early class switching to IgE
2017-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20161056
PMID:27994069
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研究论文 | 本研究通过新型小鼠报告基因和单细胞RNA测序揭示了B细胞中IL-4诱导的I转录异质性，阐明了早期IgE类别转换的调控机制 | 首次发现IL-4诱导的Iε和Iγ1转录异质性，揭示Iε转录具有较低激活阈值并主导早期IgE类别转换 | 研究主要基于小鼠模型，人类B细胞中的类似机制需要进一步验证 | 阐明B细胞中白细胞介素4诱导的免疫球蛋白类别转换早期选择机制 | 小鼠B细胞 | 免疫学 | 过敏和哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7234 | 2025-10-06 |
Exploring viral infection using single-cell sequencing
2017-07-15, Virus research
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.virusres.2016.10.016
PMID:27816430
|
综述 | 本文综述了利用单细胞测序技术研究病毒感染过程中病毒多样性和细胞变异性的最新进展 | 聚焦于单细胞测序在病毒学领域的应用，从病毒和细胞两个角度综合分析病毒感染动态 | NA | 探索病毒感染机制和细胞异质性 | 病毒感染过程中的病毒序列和宿主细胞转录组 | 基因组学 | 病毒性疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因组序列、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7235 | 2025-10-06 |
Molecular interrogation of hypothalamic organization reveals distinct dopamine neuronal subtypes
2017-02, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/nn.4462
PMID:27991900
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示下丘脑中62种神经元亚型，特别是发现共表达Onecut3和Nmur2基因的多巴胺神经元亚型 | 首次使用单细胞RNA测序系统绘制下丘脑神经元身份图谱，发现具有任务依赖性神经递质转换能力的多巴胺神经元新亚型 | 研究主要基于转录组数据，功能验证和机制研究需要进一步实验证实 | 解析下丘脑神经元多样性及其组织结构和功能 | 下丘脑神经元细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7236 | 2025-10-06 |
Cerebral cortical neuron diversity and development at single-cell resolution
2017-02, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2016.11.001
PMID:27888678
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术研究大脑皮层神经元多样性和发育的最新进展 | 将单细胞RNA测序技术应用于神经元分类，提供全基因组基因表达模式作为新的分类标准 | 仅回顾早期研究成果，尚未涉及具体实验数据验证 | 阐明神经元亚型及其发育过程 | 大脑皮层神经元 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 数十万个单细胞转录组构建的参考图谱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7237 | 2025-10-06 |
XACT Noncoding RNA Competes with XIST in the Control of X Chromosome Activity during Human Early Development
2017-01-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2016.10.014
PMID:27989768
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研究论文 | 本研究揭示了人类早期胚胎发育中X染色体活性调控的新机制，发现非编码RNA XACT与XIST在活性X染色体上共同激活并积累 | 首次发现人类特异性X染色体调控机制，揭示XACT和XIST在早期胚胎中的拮抗作用，以及XIST在此时期呈现异常分散结构 | 功能研究主要在转基因小鼠细胞中进行，需在人类胚胎中进一步验证 | 探究人类早期发育过程中X染色体剂量补偿的调控机制 | 人类早期着床前胚胎和naive人类胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，成像技术 | NA | RNA测序数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7238 | 2025-10-06 |
Evolution of multiple cell clones over a 29-year period of a CLL patient
2016-12-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms13765
PMID:27982015
|
研究论文 | 通过对一名CLL患者29年病程的追踪研究，揭示了白血病细胞克隆的演化规律 | 首次对单个CLL患者进行长达29年的连续基因组和转录组分析，揭示了疾病演化过程中克隆动态变化和表达模式演变 | 仅基于单个病例的研究，结果可能不具有普遍代表性 | 探究慢性淋巴细胞白血病在长期病程中的克隆演化规律 | 一名CLL患者 | 基因组学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单核苷酸多态性微阵列分析,转录组测序,全基因组测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 1名患者29年间的系列样本 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组测序,转录组测序 | NA | NA |
| 7239 | 2025-10-06 |
A Multiplexed Single-Cell CRISPR Screening Platform Enables Systematic Dissection of the Unfolded Protein Response
2016-Dec-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2016.11.048
PMID:27984733
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研究论文 | 开发了一种结合单细胞RNA测序与CRISPR扰动条形码技术的Perturb-seq平台，用于系统解析哺乳动物未折叠蛋白响应 | 首次将液滴单细胞RNA测序与CRISPR扰动条形码技术相结合，实现高通量扰动筛选与复杂表型测量的同步进行 | 未明确说明技术平台的通量限制和实验验证的充分性 | 系统解析哺乳动物未折叠蛋白响应机制 | 哺乳动物细胞 | 功能基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR干扰筛选 | NA | 单细胞基因表达数据 | 约100个基因扰动 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 液滴单细胞RNA测序平台 |
| 7240 | 2025-10-06 |
Perturb-Seq: Dissecting Molecular Circuits with Scalable Single-Cell RNA Profiling of Pooled Genetic Screens
2016-Dec-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2016.11.038
PMID:27984732
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研究论文 | 开发了结合单细胞RNA测序和CRISPR扰动技术的Perturb-seq方法，用于大规模分析基因功能 | 首次将单细胞RNA测序与CRISPR扰动技术结合，实现了在混合样本中大规模分析复杂表型 | NA | 开发能够大规模分析基因功能的高通量方法 | 免疫细胞和细胞系，特别是树突状细胞对脂多糖反应的转录因子 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR基因编辑 | NA | 基因表达数据 | 200,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |