单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7221 - 7240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7221 | 2025-10-06 |
Single-cell entropy for accurate estimation of differentiation potency from a cell's transcriptome
2017-06-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms15599
PMID:28569836
|
研究论文 | 提出一种基于信号熵的单细胞分化潜能计算方法 | 首次在相互作用网络背景下通过计算转录组信号熵来量化单细胞分化潜能，无需特征选择 | NA | 开发准确估计单细胞分化潜能的计算方法 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 熵计算模型 | 单细胞转录组数据 | 超过7,000个单细胞RNA-Seq图谱 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7222 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics uncovers distinct molecular signatures of stem cells in chronic myeloid leukemia
2017-Jun, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/nm.4336
PMID:28504724
|
研究论文 | 本研究开发了一种结合高灵敏度突变检测与全转录组分析的单细胞方法，用于揭示慢性髓系白血病干细胞亚群的分子特征 | 开发了同时进行高灵敏度突变检测和全转录组分析的单细胞技术，能够识别传统细胞群体分析无法发现的治疗耐药干细胞亚群 | 该方法可能不适用于所有恶性肿瘤，需要进一步验证其广泛适用性 | 解析慢性髓系白血病干细胞的分子异质性和治疗耐药机制 | 慢性髓系白血病患者的干细胞 | 单细胞转录组学 | 慢性髓系白血病 | 单细胞RNA测序结合突变检测 | NA | 单细胞转录组数据 | 2,000多个来自CML患者的干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7223 | 2025-10-06 |
Identification of preoptic sleep neurons using retrograde labelling and gene profiling
2017-05-25, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature22350
PMID:28514446
|
研究论文 | 本研究通过逆向标记和基因分析技术识别了下丘脑视前区的睡眠神经元 | 首次基于神经元投射目标识别视前区睡眠神经元群体并发现其分子标记 | NA | 解析视前区睡眠控制神经回路机制 | 下丘脑视前区GABA能神经元 | 神经科学 | 睡眠障碍 | 逆向标记,双向光遗传学操作,光电极记录,翻译核糖体亲和纯化,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,电生理记录数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7224 | 2025-10-06 |
Proliferation Drives Aging-Related Functional Decline in a Subpopulation of the Hematopoietic Stem Cell Compartment
2017-05-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2017.04.074
PMID:28538171
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了造血干细胞衰老过程中JAK/STAT信号驱动增殖导致p53介导功能衰退的机制 | 首次在衰老造血干细胞中发现携带p53特征的特殊亚群，并揭示JAK2V617F驱动增殖与该亚群扩增的因果关系 | 研究主要基于小鼠模型，人类造血干细胞衰老机制可能有所不同 | 探究造血干细胞衰老过程中分子机制和细胞异质性 | 小鼠造血干细胞 | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 老年小鼠造血干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7225 | 2025-10-06 |
Lineage-dependent spatial and functional organization of the mammalian enteric nervous system
2017-05-19, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aam7511
PMID:28522527
|
研究论文 | 本研究揭示了小鼠肠道神经系统由迁移后神经嵴祖细胞形成的重叠克隆单元构成，并阐明了其空间功能组织机制 | 发现肠道神经系统的无定形神经胶质网络由重叠的克隆单元组成，揭示了谱系关系在周围神经系统组织中的基础作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他哺乳动物中验证 | 探究哺乳动物肠道神经系统的空间和功能组织机制 | 小鼠肠道神经系统 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学，诱变分析 | NA | 基因表达数据，功能活动数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7226 | 2025-10-06 |
Vitamin A-Retinoic Acid Signaling Regulates Hematopoietic Stem Cell Dormancy
2017-May-18, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2017.04.018
PMID:28479188
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了维生素A-视黄酸信号通路调控造血干细胞休眠的分子机制 | 首次发现休眠造血干细胞具有低Myc水平和高视黄酸程序表达特征，并建立了Gprc5c控制的报告小鼠模型 | 研究主要基于小鼠模型，人类造血干细胞的相关机制仍需进一步验证 | 探索造血干细胞休眠状态的分子特征及其调控机制 | 休眠造血干细胞(dHSCs) | 单细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7227 | 2025-10-06 |
Alternative TSSs are co-regulated in single cells in the mouse brain
2017-05-11, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20167374
PMID:28495919
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA-seq数据揭示了小鼠大脑中替代转录起始位点在单细胞水平上的共调控机制 | 首次在单细胞水平研究替代转录起始位点的使用模式，发现同一细胞类型中不同TSS之间存在高度相关性 | 依赖于已发表的单细胞RNA-seq数据集，未进行实验验证 | 探究单细胞中替代转录起始位点的表达调控模式 | 小鼠大脑细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 数千个细胞 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7228 | 2025-10-06 |
A Gene Regulatory Network Balances Neural and Mesoderm Specification during Vertebrate Trunk Development
2017-05-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2017.04.002
PMID:28457792
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了脊椎动物躯干发育过程中神经中胚层祖细胞(NMPs)的分子特征及其分化调控机制 | 首次识别了NMPs的分子特征，并揭示了整合视黄酸(RA)和Wnt信号的转录调控网络如何平衡神经和中胚层组织的生成 | NA | 解析脊椎动物躯干发育过程中神经中胚层祖细胞的分化调控机制 | 脊椎动物胚胎中的神经中胚层祖细胞(NMPs) | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7229 | 2025-10-06 |
SC3: consensus clustering of single-cell RNA-seq data
2017-May, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.4236
PMID:28346451
|
研究论文 | 开发了一种用于单细胞RNA-seq数据无监督聚类的用户友好工具SC3 | 通过共识方法整合多个聚类解决方案，实现了高精度和鲁棒性的单细胞聚类 | NA | 开发单细胞RNA-seq数据的共识聚类方法 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 共识聚类 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7230 | 2025-10-06 |
Heterogeneity of hypothalamic pro-opiomelanocortin-expressing neurons revealed by single-cell RNA sequencing
2017-05, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2017.02.007
PMID:28462073
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示下丘脑POMC神经元的异质性 | 首次在单细胞水平系统揭示POMC神经元的分子异质性，发现传统认知外的A+P+神经元亚群及其差异表达模式 | 研究仅基于163个小鼠神经元样本，样本量有限；仅关注基因表达层面，未验证功能差异 | 探究下丘脑弓状核POMC神经元的分子异质性 | 小鼠下丘脑弓状核POMC神经元 | 单细胞组学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞基因表达数据 | 163个小鼠神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7231 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq reveals new types of human blood dendritic cells, monocytes, and progenitors
2017-04-21, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aah4573
PMID:28428369
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术重新定义人类血液中树突状细胞和单核细胞的分类体系 | 发现了新型树突状细胞亚群、CD1C树突状细胞的新细分、循环常规树突状细胞前体细胞 | 样本量相对有限（约2400个细胞），仅针对血液样本 | 重新定义人类血液中树突状细胞和单核细胞的分类及其相互关系 | 人类血液中的树突状细胞、单核细胞及其前体细胞 | 单细胞生物学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约2400个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7232 | 2025-10-06 |
Scater: pre-processing, quality control, normalization and visualization of single-cell RNA-seq data in R
2017-04-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btw777
PMID:28088763
|
研究论文 | 开发了一个用于单细胞RNA测序数据预处理、质量控制、标准化和可视化的R/Bioconductor软件包 | 提供了方便灵活的工作流程，将原始测序数据转换为高质量表达数据集，并提供了丰富的单细胞数据绘图工具 | NA | 解决单细胞RNA测序数据预处理中的偏差、伪影和其他不需要的变异问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7233 | 2025-10-06 |
Building a lineage from single cells: genetic techniques for cell lineage tracking
2017-04, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/nrg.2016.159
PMID:28111472
|
综述 | 本文综述了用于细胞谱系追踪的遗传技术，重点关注单细胞层面的谱系重建方法 | 系统比较了外源性标记和单细胞测序等新兴技术在细胞谱系追踪中的应用，实现了更大规模、更详细和更广泛物种的谱系追踪 | NA | 探讨细胞谱系追踪技术的发展及其在发育生物学和病理状态研究中的应用 | 细胞谱系关系，包括发育过程中的细胞和病理状态下的细胞 | 发育生物学 | 癌症 | 外源性标记，单细胞测序 | NA | 遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7234 | 2025-10-06 |
Power analysis of single-cell RNA-sequencing experiments
2017-Apr, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.4220
PMID:28263961
|
研究论文 | 评估单细胞RNA测序实验方案的检测能力和基因表达定量准确性 | 开发了灵活的UMI计数工具，首次系统性地计算评估15种实验方案和实验验证4种方案，并研究spike-in分子降解效应 | NA | 比较不同单细胞RNA测序方案的敏感性和准确性 | 已发表数据集和批次匹配细胞群体 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7235 | 2025-10-06 |
Aging increases cell-to-cell transcriptional variability upon immune stimulation
2017-03-31, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aah4115
PMID:28360329
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析年轻与年老小鼠CD4 T细胞的转录动态，发现衰老会增加免疫刺激后细胞间的转录变异性 | 首次在两种不同物种中揭示衰老会导致免疫激活核心程序紊乱并增加细胞间转录异质性 | 研究仅针对CD4 T细胞，未涉及其他细胞类型或组织 | 探索衰老对免疫细胞转录动态的影响机制 | 年轻与年老小鼠的初始和效应记忆CD4 T细胞 | 单细胞基因组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两种不同物种的年轻和年老小鼠CD4 T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7236 | 2025-10-06 |
Probabilistic modeling of bifurcations in single-cell gene expression data using a Bayesian mixture of factor analyzers
2017-Mar-15, Wellcome open research
DOI:10.12688/wellcomeopenres.11087.1
PMID:28503665
|
研究论文 | 提出首个基于贝叶斯分层因子分析混合模型的生成式概率模型，用于单细胞转录组数据中的分支推断 | 首个完全概率生成模型，采用贝叶斯分层因子分析混合方法和经验贝叶斯扩展处理零膨胀数据 | 讨论了统一概率方法在实践生物信息学分析中的优缺点 | 推断单细胞转录组数据中的分支结构 | 单细胞基因表达数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯分层因子分析混合模型，马尔可夫链蒙特卡洛采样 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7237 | 2025-10-06 |
Planarian Epidermal Stem Cells Respond to Positional Cues to Promote Cell-Type Diversity
2017-03-13, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2017.02.008
PMID:28292427
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示涡虫表皮干细胞如何响应位置信号促进细胞类型多样性 | 发现表皮干细胞在谱系早期就表现出空间身份差异，并揭示BMP信号通路在建立背腹侧表皮身份中的关键作用 | 研究主要聚焦于表皮谱系，其他细胞谱系的位置调控机制尚未探索 | 探究成体祖细胞如何通过位置信号获得不同功能身份 | 涡虫表皮干细胞及其后代细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7238 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq and computational analysis using temporal mixture modelling resolves Th1/Tfh fate bifurcation in malaria
2017-Mar-03, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aal2192
PMID:28345074
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和计算分析解析疟疾感染中Th1/Tfh细胞命运分叉 | 开发了GPfates时间混合模型重建Th1/Tfh细胞发育轨迹，首次在群体和单克隆水平证明Th1/Tfh分叉 | 研究局限于小鼠疟疾感染模型，人类细胞中的适用性需要进一步验证 | 解析CD4 T细胞在疟疾感染中分化为Th1和Tfh细胞的命运决定机制 | 小鼠疟疾感染模型中的 naïve CD4 T细胞、Th1细胞、Tfh细胞和Tr1细胞 | 计算生物学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序，TCR序列追踪，计算建模 | 高斯过程混合模型(GPfates) | 单细胞转录组数据，TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7239 | 2025-10-06 |
Detection of Imprinted Genes by Single-Cell Allele-Specific Gene Expression
2017-Mar-02, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2017.01.028
PMID:28190458
|
研究论文 | 开发了一种结合单细胞RNA测序和全基因组测序的新方法，用于检测特定细胞类型中的印记基因 | 将单细胞RNA-seq与全基因组测序结合到优化的统计框架中，能够在特定细胞类型和不同个体中分析基因组印记 | 样本量相对较小，仅使用了2个家庭三人组和3个无关个体的样本 | 开发检测印记基因的新方法并建立细胞类型特异性的基因组印记图谱 | 人类原代成纤维细胞 | 基因组学 | 糖尿病,癌症 | 单细胞RNA测序,全基因组测序 | beta-二项分布统计模型 | RNA测序数据,基因组测序数据 | 1,084个原代成纤维细胞，来自2个家庭三人组和3个无关个体 | NA | 单细胞RNA-seq,全基因组测序 | NA | NA |
| 7240 | 2025-10-06 |
Pooled CRISPR screening with single-cell transcriptome readout
2017-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.4177
PMID:28099430
|
研究论文 | 开发了一种将CRISPR筛选与单细胞RNA测序相结合的新方法CROP-seq | 首次将CRISPR筛选与单细胞转录组测序整合，实现数千个单细胞中直接关联gRNA表达与转录组响应 | NA | 开发高通量功能基因组学筛选方法 | 复杂调控机制和异质性细胞群体 | 基因组学 | NA | CRISPR筛选，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 数千个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | CRISPR droplet sequencing (CROP-seq) |