单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7201 - 7220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7201 | 2025-10-06 |
Targeted reconstruction of T cell receptor sequence from single cell RNA-seq links CDR3 length to T cell differentiation state
2017-Sep-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkx615
PMID:28934479
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研究论文 | 开发了TRAPeS工具从短读长单细胞RNA测序数据中高效提取T细胞受体序列，并揭示了CDR3区域长度与T细胞分化状态的关系 | 开发了首个能够从短读长scRNA-seq数据中高效提取TCR序列的公开工具TRAPeS，相比现有方法具有更高灵敏度 | NA | 研究T细胞受体序列与T细胞状态异质性之间的关系 | 人类和小鼠的CD8+ T细胞，特别是针对黄热病病毒单一表位的T细胞 | 生物信息学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7202 | 2025-10-06 |
Anatomically and Functionally Distinct Lung Mesenchymal Populations Marked by Lgr5 and Lgr6
2017-Sep-07, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2017.07.028
PMID:28886383
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研究论文 | 本研究通过遗传谱系追踪、单细胞RNA测序和类器官培养方法，揭示了Lgr5和Lgr6作为肺间充质细胞标志物的新功能 | 首次发现Lgr5和Lgr6在肺间充质细胞中的表达，揭示了它们通过Wnt信号通路调控上皮细胞分化的新机制 | NA | 探索肺间充质细胞的多样性及其在上皮稳态和再生中的作用 | 小鼠肺组织中的Lgr5和Lgr6阳性间充质细胞 | 细胞生物学 | 肺疾病 | 遗传谱系追踪,单细胞RNA测序,类器官培养 | NA | 基因表达数据,细胞图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7203 | 2025-10-06 |
A practical guide to single-cell RNA-sequencing for biomedical research and clinical applications
2017-08-18, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-017-0467-4
PMID:28821273
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综述 | 为生物医学研究和临床应用提供单细胞RNA测序的实用指南 | 系统整合了单细胞RNA测序从实验设计到数据分析的完整流程，为非专业研究人员提供实用指导 | 作为方法学指南未涉及具体研究数据验证 | 促进单细胞RNA测序技术在生物医学研究和临床中的广泛应用 | 生物医学研究人员和临床医生 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7204 | 2025-10-06 |
Adventitial SCA-1+ Progenitor Cell Gene Sequencing Reveals the Mechanisms of Cell Migration in Response to Hyperlipidemia
2017-08-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2017.06.011
PMID:28757161
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了外膜SCA-1+祖细胞在高脂血症条件下迁移的分子机制 | 首次发现高脂血症通过miRNA-29b/sirtuin-1/MMP-9信号轴增强血管祖细胞迁移能力 | 研究仅针对小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究高脂血症对血管外膜祖细胞迁移功能的影响机制 | 野生型和ApoE缺陷型小鼠的外膜SCA-1+祖细胞 | 单细胞生物学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型和ApoE缺陷型小鼠的外膜SCA-1+细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7205 | 2025-10-06 |
Single-Cell Landscape of Transcriptional Heterogeneity and Cell Fate Decisions during Mouse Early Gastrulation
2017-08-01, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2017.07.009
PMID:28768204
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序系统描绘了小鼠早期原肠胚形成过程中的转录异质性和细胞命运决定 | 首次系统性地揭示了早期胚胎发育过程中X染色体再激活与失活的调控机制，并发现了与多能性退出相关的转录噪声特征 | 研究仅限于小鼠胚胎发育的特定阶段（E3.5至E6.5），且主要基于转录组数据分析 | 探究小鼠早期原肠胚形成过程中的基因调控机制和细胞命运决定原理 | 小鼠胚胎的内细胞团、外胚层和原始内胚层细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | E3.5至E6.5阶段的小鼠胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7206 | 2025-10-06 |
A TRPV1-to-secretagogin regulatory axis controls pancreatic β-cell survival by modulating protein turnover
2017-07-14, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.201695347
PMID:28637794
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研究论文 | 本研究揭示了TRPV1通过调控secretagogin表达维持胰腺β细胞存活的新机制 | 发现了TRPV1-to-secretagogin调控轴通过调节蛋白质折叠和USP9X去泛素化酶活性维持β细胞结构完整性的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，在人类糖尿病胰腺中的直接验证仍需进一步研究 | 探究TRPV1和secretagogin在胰腺β细胞存活和功能维持中的调控机制 | 人类胰腺胰岛、糖尿病供体β细胞、secretagogin敲除小鼠 | 分子生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7207 | 2025-10-06 |
Overcoming confounding plate effects in differential expression analyses of single-cell RNA-seq data
2017-Jul-01, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxw055
PMID:28334062
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研究论文 | 本文提出了一种通过计数求和方法来克服单细胞RNA测序数据中板效应对差异表达分析的影响 | 首次系统性地证明忽略板效应会导致统计错误控制失效，并提出简单有效的计数求和方法来解决此问题 | 方法在模拟数据中验证有效，但在真实数据中的应用仍需进一步验证 | 解决单细胞RNA测序数据分析中板效应对差异表达基因检测的干扰问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 差异表达分析统计模型 | 基因表达计数数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7208 | 2025-10-06 |
Defining epithelial cell dynamics and lineage relationships in the developing lacrimal gland
2017-07-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.150789
PMID:28576768
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了泪腺发育过程中的上皮细胞动态变化和谱系关系 | 首次发现泪腺发育早期存在多种免疫、上皮和间充质细胞亚群，并提供了KRT5上皮细胞单能性的直接证据 | 主要基于小鼠模型研究，人类样本验证有限 | 阐明泪腺发育过程中的细胞类型和谱系关系 | 发育中的小鼠和人类泪腺 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序,谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 发育不同阶段的小鼠泪腺样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7209 | 2025-10-06 |
Deconstructing Olfactory Stem Cell Trajectories at Single-Cell Resolution
2017-06-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2017.04.003
PMID:28506465
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和谱系追踪技术解析嗅觉干细胞发育轨迹 | 首次在单细胞分辨率下揭示嗅觉干细胞通过直接命运转换产生支持细胞，并证明群体水平的多能性源于单个干细胞的集体单能性命运决定 | 研究主要关注出生后嗅觉上皮，未涉及胚胎发育阶段或其他干细胞微环境 | 阐明干细胞命运决定机制和组织稳态调控 | 嗅觉上皮干细胞及其后代细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 体内谱系追踪, 统计分析 | NA | 单细胞基因表达数据, 谱系追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7210 | 2025-10-06 |
Mex3a Marks a Slowly Dividing Subpopulation of Lgr5+ Intestinal Stem Cells
2017-06-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2017.02.007
PMID:28285904
|
研究论文 | 本研究发现了Lgr5+肠道干细胞池中存在异质性，Mex3a标记了一个缓慢分裂的Lgr5+干细胞亚群 | 首次在Lgr5+肠道干细胞池中发现并表征了Mex3a标记的缓慢循环干细胞亚群 | NA | 探索Lgr5+肠道干细胞池的异质性和功能特性 | Lgr5+肠道干细胞及其Mex3a+亚群 | 干细胞生物学 | 肠道疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7211 | 2025-10-06 |
Normalizing single-cell RNA sequencing data: challenges and opportunities
2017-Jun, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.4292
PMID:28504683
|
综述 | 本文讨论单细胞RNA测序数据标准化面临的挑战与机遇 | 评估传统标准化方法在单细胞转录组学中的适用性并提出替代方案 | 未进行实证数据验证，主要基于方法论讨论 | 分析单细胞RNA测序数据标准化方法的适用性 | 单细胞转录组数据标准化方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7212 | 2025-10-06 |
Single-cell entropy for accurate estimation of differentiation potency from a cell's transcriptome
2017-06-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms15599
PMID:28569836
|
研究论文 | 提出一种基于信号熵的单细胞分化潜能计算方法 | 首次在相互作用网络背景下通过计算转录组信号熵来量化单细胞分化潜能，无需特征选择 | NA | 开发准确估计单细胞分化潜能的计算方法 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 熵计算模型 | 单细胞转录组数据 | 超过7,000个单细胞RNA-Seq图谱 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7213 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics uncovers distinct molecular signatures of stem cells in chronic myeloid leukemia
2017-Jun, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/nm.4336
PMID:28504724
|
研究论文 | 本研究开发了一种结合高灵敏度突变检测与全转录组分析的单细胞方法，用于揭示慢性髓系白血病干细胞亚群的分子特征 | 开发了同时进行高灵敏度突变检测和全转录组分析的单细胞技术，能够识别传统细胞群体分析无法发现的治疗耐药干细胞亚群 | 该方法可能不适用于所有恶性肿瘤，需要进一步验证其广泛适用性 | 解析慢性髓系白血病干细胞的分子异质性和治疗耐药机制 | 慢性髓系白血病患者的干细胞 | 单细胞转录组学 | 慢性髓系白血病 | 单细胞RNA测序结合突变检测 | NA | 单细胞转录组数据 | 2,000多个来自CML患者的干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7214 | 2025-10-06 |
Identification of preoptic sleep neurons using retrograde labelling and gene profiling
2017-05-25, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature22350
PMID:28514446
|
研究论文 | 本研究通过逆向标记和基因分析技术识别了下丘脑视前区的睡眠神经元 | 首次基于神经元投射目标识别视前区睡眠神经元群体并发现其分子标记 | NA | 解析视前区睡眠控制神经回路机制 | 下丘脑视前区GABA能神经元 | 神经科学 | 睡眠障碍 | 逆向标记,双向光遗传学操作,光电极记录,翻译核糖体亲和纯化,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,电生理记录数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7215 | 2025-10-06 |
Proliferation Drives Aging-Related Functional Decline in a Subpopulation of the Hematopoietic Stem Cell Compartment
2017-05-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2017.04.074
PMID:28538171
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了造血干细胞衰老过程中JAK/STAT信号驱动增殖导致p53介导功能衰退的机制 | 首次在衰老造血干细胞中发现携带p53特征的特殊亚群，并揭示JAK2V617F驱动增殖与该亚群扩增的因果关系 | 研究主要基于小鼠模型，人类造血干细胞衰老机制可能有所不同 | 探究造血干细胞衰老过程中分子机制和细胞异质性 | 小鼠造血干细胞 | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 老年小鼠造血干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7216 | 2025-10-06 |
Lineage-dependent spatial and functional organization of the mammalian enteric nervous system
2017-05-19, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aam7511
PMID:28522527
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠肠道神经系统由迁移后神经嵴祖细胞形成的重叠克隆单元构成，并阐明了其空间功能组织机制 | 发现肠道神经系统的无定形神经胶质网络由重叠的克隆单元组成，揭示了谱系关系在周围神经系统组织中的基础作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他哺乳动物中验证 | 探究哺乳动物肠道神经系统的空间和功能组织机制 | 小鼠肠道神经系统 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学，诱变分析 | NA | 基因表达数据，功能活动数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7217 | 2025-10-06 |
Vitamin A-Retinoic Acid Signaling Regulates Hematopoietic Stem Cell Dormancy
2017-May-18, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2017.04.018
PMID:28479188
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了维生素A-视黄酸信号通路调控造血干细胞休眠的分子机制 | 首次发现休眠造血干细胞具有低Myc水平和高视黄酸程序表达特征，并建立了Gprc5c控制的报告小鼠模型 | 研究主要基于小鼠模型，人类造血干细胞的相关机制仍需进一步验证 | 探索造血干细胞休眠状态的分子特征及其调控机制 | 休眠造血干细胞(dHSCs) | 单细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7218 | 2025-10-06 |
Alternative TSSs are co-regulated in single cells in the mouse brain
2017-05-11, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20167374
PMID:28495919
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA-seq数据揭示了小鼠大脑中替代转录起始位点在单细胞水平上的共调控机制 | 首次在单细胞水平研究替代转录起始位点的使用模式，发现同一细胞类型中不同TSS之间存在高度相关性 | 依赖于已发表的单细胞RNA-seq数据集，未进行实验验证 | 探究单细胞中替代转录起始位点的表达调控模式 | 小鼠大脑细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 数千个细胞 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7219 | 2025-10-06 |
A Gene Regulatory Network Balances Neural and Mesoderm Specification during Vertebrate Trunk Development
2017-05-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2017.04.002
PMID:28457792
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了脊椎动物躯干发育过程中神经中胚层祖细胞(NMPs)的分子特征及其分化调控机制 | 首次识别了NMPs的分子特征，并揭示了整合视黄酸(RA)和Wnt信号的转录调控网络如何平衡神经和中胚层组织的生成 | NA | 解析脊椎动物躯干发育过程中神经中胚层祖细胞的分化调控机制 | 脊椎动物胚胎中的神经中胚层祖细胞(NMPs) | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7220 | 2025-10-06 |
SC3: consensus clustering of single-cell RNA-seq data
2017-May, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.4236
PMID:28346451
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研究论文 | 开发了一种用于单细胞RNA-seq数据无监督聚类的用户友好工具SC3 | 通过共识方法整合多个聚类解决方案，实现了高精度和鲁棒性的单细胞聚类 | NA | 开发单细胞RNA-seq数据的共识聚类方法 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 共识聚类 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |