单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 7201 - 7220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7201 | 2024-10-16 |
Prognostic modeling and Emerging therapeutic targets Unveiled through single-cell sequencing in esophageal squamous Cell carcinoma
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38078
PMID:39397956
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研究论文 | 研究通过单细胞测序揭示食管鳞状细胞癌中的预后模型和新治疗靶点 | 首次通过单细胞转录组测序结合机器学习技术，开发出区分恶性与非恶性细胞的模型，并发现IGFBP2作为潜在的生物标志物和治疗靶点 | 研究样本量较小，仅涉及10名患者，可能影响结果的普适性 | 寻找食管鳞状细胞癌的新诊断和预测生物标志物，以改善治疗效果 | 食管鳞状细胞癌的恶性细胞和非恶性细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 128,688个细胞，来自10名患者 |
| 7202 | 2024-10-16 |
Establish a novel immune-related gene prognostic risk index (IRGPRI) associated with CD8+ cytotoxic T lymphocytes in non-small-cell lung cancer (NSCLC)
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38324
PMID:39397989
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研究论文 | 本研究旨在建立一个与非小细胞肺癌（NSCLC）中CD8+细胞毒性T淋巴细胞相关的免疫相关基因预后风险指数（IRGPRI），用于预测患者的预后和评估免疫检查点抑制剂（ICIs）治疗的疗效 | 本研究创新性地利用单细胞RNA测序技术识别CD8+细胞毒性T淋巴细胞与其他细胞类型的差异表达基因，并通过LASSO Cox回归分析构建IRGPRI | NA | 建立一个能够预测非小细胞肺癌患者预后和评估免疫检查点抑制剂治疗疗效的免疫相关基因预后风险指数 | 非小细胞肺癌患者及其CD8+细胞毒性T淋巴细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归分析 | 基因表达数据 | 109个基因，7个预后相关基因，GSE131907数据集 |
| 7203 | 2024-10-16 |
Breast Cancer Disseminated Tumor Cells: Do They Stay and Fight or Run and Hide?
2024-Oct-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2408
PMID:39402990
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研究论文 | 研究乳腺癌早期扩散的肿瘤细胞在免疫系统中的作用 | 探讨了NK细胞在乳腺癌早期扩散和休眠中的作用，并提出了STING通路和转录因子Sox2、Bach1的机制 | 需要进一步研究不同免疫类型在休眠和复发中的具体机制和重要性 | 探讨乳腺癌早期扩散的肿瘤细胞在免疫系统中的作用及其机制 | 乳腺癌早期扩散的肿瘤细胞和NK细胞 | 癌症研究 | 乳腺癌 | 单细胞基因组学和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7204 | 2024-10-16 |
Targeting HPV for the prevention, diagnosis, and treatment of Cervical Cancer
2024-Oct-14, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjae046
PMID:39402008
|
综述 | 本文综述了HPV在宫颈癌预防、诊断和治疗中的关键作用 | 整合HPV检测与现有筛查方法，如宫颈细胞学和视觉检查，提高了宫颈癌筛查的敏感性和特异性 | NA | 探讨HPV在宫颈癌预防、诊断和治疗中的最新进展 | HPV感染及其相关生物标志物在宫颈癌中的作用 | NA | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7205 | 2024-10-16 |
Differential transcriptomic host responses in the early phase of viral and bacterial infections in human lung tissue explants ex vivo
2024-Oct-12, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-024-02988-8
PMID:39395995
|
研究论文 | 研究了人类肺组织体外培养物在病毒和细菌感染早期阶段的转录组差异反应 | 首次使用RNA测序技术研究了人类肺组织体外培养物在流感病毒A、BCG和铜绿假单胞菌感染早期阶段的转录组变化 | 研究仅限于体外培养的肺组织，无法完全模拟自然感染环境 | 探讨人类肺组织在病毒和细菌感染早期阶段的转录组反应差异 | 人类肺组织体外培养物在流感病毒A、BCG和铜绿假单胞菌感染早期阶段的转录组变化 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 来自肺气肿患者的肺组织体外培养物 |
| 7206 | 2024-10-16 |
Best practices for differential accessibility analysis in single-cell epigenomics
2024-Oct-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53089-5
PMID:39394227
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研究论文 | 本文系统评估了用于识别单细胞ATAC-seq数据中差异可及性区域的统计方法 | 本文通过系统评估多种统计方法，提出了单细胞ATAC-seq数据分析的最佳实践，并开发了相应的R包 | 本文主要关注单细胞ATAC-seq数据的差异可及性分析，未涵盖其他类型的单细胞数据 | 评估和确定单细胞ATAC-seq数据差异可及性分析的最佳统计方法 | 单细胞ATAC-seq数据及其匹配的bulk ATAC-seq或scRNA-seq数据 | 单细胞组学 | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | 单细胞数据 | 多个scATAC-seq实验及其匹配的bulk ATAC-seq或scRNA-seq数据 |
| 7207 | 2024-10-16 |
Resting natural killer cells promote the progress of colon cancer liver metastasis by elevating tumor-derived stem cell factor
2024-Oct-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97201
PMID:39387546
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研究论文 | 研究了自然杀伤细胞在结直肠癌肝转移中的作用及其与肿瘤微环境的关系 | 首次揭示了GZMK+静息状态的自然杀伤细胞在肿瘤组织中的显著增加，并发现其在肿瘤区域中的富集与较差的预后相关 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 探讨自然杀伤细胞在结直肠癌肝转移中的临床相关性和细胞作用 | 自然杀伤细胞在结直肠癌肝转移中的生物学特性和功能 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | NA | RNA | 涉及结直肠癌和肝转移癌的肿瘤组织样本 |
| 7208 | 2024-10-16 |
Detecting Rhythmic Gene Expression in Single-cell Transcriptomics
2024-Oct-08, Journal of biological rhythms
IF:2.9Q2
DOI:10.1177/07487304241273182
PMID:39377613
|
研究论文 | 本文研究了在单细胞转录组数据中检测节律基因表达的方法 | 提出了结合子采样和谐波回归的高效策略来检测单细胞数据中的昼夜节律基因 | 尚未完全解决如何将现有的节律检测算法适应于单细胞RNA测序数据的问题 | 探讨如何将现有的节律检测方法适应于单细胞RNA测序数据，并提出新的检测策略 | 单细胞转录组数据中的昼夜节律基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 谐波回归 | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 7209 | 2024-10-16 |
Multiomic single-cell sequencing defines tissue-specific responses in Stevens-Johnson syndrome and toxic epidermal necrolysis
2024-Oct-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52990-3
PMID:39379371
|
研究论文 | 本文通过多组学单细胞测序技术，研究了Stevens-Johnson综合征和中毒性表皮坏死松解症（SJS/TEN）患者的皮肤组织特异性反应 | 首次在单细胞水平上综合分析了SJS/TEN患者的转录组、表面蛋白质组和T细胞受体，揭示了细胞免疫发病机制中的关键细胞和分子 | 研究样本量较小，仅涉及15名患者，可能影响结果的普适性 | 探讨SJS/TEN的细胞免疫发病机制，并寻找潜在的治疗靶点 | SJS/TEN患者的未受影响皮肤、受影响皮肤和水肿液中的细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞转录组测序、表面蛋白质组测序、T细胞受体测序 | NA | 单细胞数据 | 15名SJS/TEN患者，共109,888个细胞 |
| 7210 | 2024-10-16 |
Visualizing scRNA-Seq data at population scale with GloScope
2024-Oct-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03398-1
PMID:39380041
|
研究论文 | 本文提出了一种名为GloScope的框架，用于在群体规模上可视化和分析scRNA-Seq数据 | GloScope框架能够有效地处理样本间的变异，支持样本级别的可视化和质量控制评估 | NA | 开发一种新的生物信息学方法，用于在群体规模上分析scRNA-Seq数据 | scRNA-Seq数据及其在不同样本中的变异 | 生物信息学 | NA | scRNA-Seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12到300个样本 |
| 7211 | 2024-10-16 |
CRIP1 regulates osteogenic differentiation of bone marrow stromal cells and pre-osteoblasts via the Wnt signaling pathway
2024-10-01, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.150277
PMID:38936225
|
研究论文 | 研究CRIP1通过Wnt信号通路调控骨髓间充质干细胞和前成骨细胞的成骨分化 | 揭示了CRIP1在调控骨髓间充质干细胞成骨分化中的新作用，并通过Wnt信号通路增强成骨分化 | NA | 探索骨髓间充质干细胞分化调控机制，为骨质疏松症的治疗提供新思路 | 骨髓间充质干细胞和前成骨细胞 | NA | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从接受全髋关节置换术的患者中收集的股骨头骨髓细胞 |
| 7212 | 2024-10-16 |
Single-cell transcriptome atlas revealed bronchoalveolar immune features related to disease severity in pediatric Mycoplasma pneumoniae pneumonia
2024-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.748
PMID:39399649
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了支气管肺泡灌洗液样本中的免疫特征，揭示了轻度和重度肺炎患者之间的免疫差异 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了轻度和重度肺炎患者的支气管肺泡灌洗液免疫景观，揭示了不同疾病严重程度下的免疫特征 | 研究样本量有限，且仅限于儿童肺炎患者，可能影响结果的普适性 | 探讨轻度肺炎的保护性免疫机制和重度肺炎的病理机制 | 支气管肺泡灌洗液样本中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 13名健康捐赠者和24名住院的儿童肺炎患者 |
| 7213 | 2024-10-16 |
Mouse Wound Models and Preparation of Single-Cell Suspensions
2024-Sep-27, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66499
PMID:39400188
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研究论文 | 本文研究了优化小鼠伤口模型构建和单细胞悬液制备的方法 | 采用单细胞转录组测序技术来深入理解伤口愈合过程中的细胞功能和机制 | 小鼠伤口模型制备方法的差异可能引入干扰因素，影响实验结果 | 优化小鼠伤口模型的构建，以准确评估伤口闭合变化，并消除影响后续测序结果的变量 | 小鼠伤口模型和单细胞悬液的制备 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠皮肤组织样本 |
| 7214 | 2024-10-16 |
Screening of potential drugs for the treatment of diabetic kidney disease using single-cell transcriptome sequencing and connectivity map data
2024-09-17, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.150263
PMID:38905995
|
研究论文 | 利用单细胞转录组测序数据和连接图谱数据库筛选糖尿病肾病潜在治疗药物 | 结合单细胞转录组测序和连接图谱数据库筛选糖尿病肾病潜在治疗药物 | 需要进一步的临床试验验证筛选出的药物疗效 | 探索利用单细胞转录组测序数据和连接图谱数据库筛选糖尿病肾病潜在治疗药物的可行性 | 糖尿病肾病及其相关药物筛选 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 糖尿病肾病小鼠模型和细胞实验 |
| 7215 | 2024-10-16 |
Visualizing scRNA-Seq Data at Population Scale with GloScope
2024-Aug-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.29.542786
PMID:37398321
|
研究论文 | 提出了一种名为GloScope的框架，用于在群体规模上可视化和分析scRNA-Seq数据 | 开发了一种新的生物信息学方法GloScope，用于处理样本间变异，并支持样本级别的可视化和质量控制评估 | NA | 开发一种新的方法来处理和可视化群体规模的scRNA-Seq数据 | scRNA-Seq数据及其在不同样本中的变异 | 生物信息学 | NA | scRNA-Seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12到超过300个样本 |
| 7216 | 2024-10-16 |
Efficient and accurate mixed model association tool for single-cell eQTL analysis
2024-May-16, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.05.15.24307317
PMID:38798318
|
研究论文 | 本文提出了一种高效且准确的混合模型关联工具SAIGE-QTL，用于单细胞eQTL分析 | SAIGE-QTL可以直接使用单细胞数据进行eQTL映射，无需聚合到伪批量水平，并且支持通过基于集合的测试来检测稀有遗传变异的影响 | NA | 研究基因表达的遗传基础，以帮助理解人类性状和疾病的分子机制 | 单细胞eQTL映射 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 混合模型 | 单细胞数据 | NA |
| 7217 | 2024-10-16 |
Expression of SOX4 Significantly Predicts the Risk of Lymph Node Metastasis for Patients With Early-Stage Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2024-05, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2024.102042
PMID:38431117
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研究论文 | 研究探讨了SOX4基因表达与早期食管鳞状细胞癌患者淋巴结转移风险的关系 | 首次通过单细胞RNA测序发现SOX4基因与侵袭性转移高度相关，并进一步验证了其在预测淋巴结转移中的独立作用 | 样本量相对较小，可能影响结果的普适性 | 研究SOX4基因在早期食管鳞状细胞癌患者淋巴结转移中的预测作用 | SOX4基因表达与食管鳞状细胞癌患者的淋巴结转移风险 | 数字病理学 | 食管癌 | 免疫组化染色 | NA | 组织样本 | 124个组织样本，来自106名患者（106个肿瘤样本和18个淋巴结样本） |
| 7218 | 2024-10-16 |
NSUN2-Mediated m5C Methylation Impairs Endometrial Receptivity
2024-04, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2024.100327
PMID:38237738
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研究论文 | 研究NSUN2介导的m5C甲基化对子宫内膜容受性的影响 | 揭示了NSUN2介导的m5C甲基化与反复植入失败之间的复杂调控机制，并提出了潜在的治疗策略 | NA | 探讨NSUN2介导的m5C甲基化在反复植入失败中的作用机制 | NSUN2在子宫内膜中的表达及其对细胞增殖、自噬和胚胎附着的影响 | NA | NA | mC-BS-seq, dot blot assay, BrdU assay, western blotting, real-time reverse-transcription PCR, Cut&Tag, coimmunoprecipitation | NA | RNA, 蛋白质 | 15个人类子宫内膜样本 |
| 7219 | 2024-10-16 |
Multiomic single-cell sequencing defines tissue-specific responses in Stevens-Johnson Syndrome and Toxic epidermal necrolysis
2024-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.26.568771
PMID:38405793
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研究论文 | 本研究通过多组学单细胞测序技术，分析了Stevens-Johnson综合征和中毒性表皮坏死松解症（SJS/TEN）患者的皮肤和水肿液中的细胞反应 | 首次通过单细胞转录组、表面蛋白质组和TCR测序技术，全面分析了SJS/TEN患者的不同组织中的细胞反应 | 研究样本仅限于17名患者，可能影响结果的普适性 | 探讨SJS/TEN的细胞免疫发病机制 | SJS/TEN患者的未受影响皮肤、受影响皮肤和水肿液中的细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 17名SJS/TEN患者，共119,784个细胞 |
| 7220 | 2024-10-16 |
Multi-omics Data Integration Analysis Identified Therapeutic Targets and Potential Reuse Drugs for Osteoporosis
2024, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过多组学数据整合分析，识别了骨质疏松症的治疗靶点和潜在的再利用药物 | 本研究提供了一种新的基于网络的药物再利用框架，并首次识别了针对CD74的骨质疏松症治疗药物 | NA | 促进骨质疏松症治疗药物的发现和开发 | 骨髓间充质干细胞（BM-MSCs）在骨质疏松症和骨关节炎患者中的主要分子及其潜在再利用药物 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | GSE147287数据集中的BM-MSCs样本，GSE35959数据集中的骨质疏松症样本和对照样本，GSE13850数据集中的差异表达基因 |