单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 7201 - 7220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7201 | 2024-10-19 |
Single-cell DNA methylome and 3D multi-omic atlas of the adult mouse brain
2023-Dec, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06805-y
PMID:38092913
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研究论文 | 本研究使用单核甲基化测序和多组学测序技术，构建了成年小鼠大脑的单细胞DNA甲基化和3D多组学图谱 | 首次在空间背景下全面解析了成年小鼠大脑的DNA甲基化多样性，并整合了转录组和染色质可及性数据，构建了基于甲基化的细胞分类和调控网络 | 研究仅限于成年小鼠大脑，未涵盖其他物种或发育阶段 | 理解大脑发育和神经疾病的DNA甲基化机制，构建全面的分子图谱 | 成年小鼠大脑的单细胞DNA甲基化和染色质构象 | 数字病理学 | NA | 单核甲基化测序（snmC-seq3）和多组学测序（snm3C-seq） | NA | 基因组数据 | 301,626个甲基化图谱和176,003个染色质构象-甲基化联合图谱，来自117个解剖区域 |
| 7202 | 2024-10-19 |
Spatial transcriptomic analysis of the mouse brain following chronic social defeat stress
2023-Dec, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20220133
PMID:38264685
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研究论文 | 研究使用空间转录组学分析慢性社会挫败应激对小鼠大脑的影响 | 首次全面比较了慢性社会挫败应激在多个脑区的转录变化，并揭示了不同脑区基因表达的空间差异 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 探讨慢性社会挫败应激对小鼠大脑多个脑区的转录变化 | 小鼠大脑在慢性社会挫败应激下的基因表达 | 空间转录组学 | 抑郁症 | 空间转录组学 (ST) | NA | 基因表达数据 | 控制组、抗压组 (RES) 和易感组 (SUS) 的小鼠大脑样本 |
| 7203 | 2024-10-19 |
Identification of monocyte-associated pathways participated in the pathogenesis of pulmonary arterial hypertension based on omics-data
2023-Oct, Pulmonary circulation
IF:2.2Q3
DOI:10.1002/pul2.12319
PMID:38130888
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研究论文 | 本研究基于组学数据，探讨了单核细胞相关通路在肺动脉高压发病机制中的作用 | 首次结合微阵列数据和单细胞RNA测序数据，分析了单核细胞在肺动脉高压中的浸润情况及其相关信号通路 | 研究主要基于现有数据库中的数据，缺乏体内实验验证 | 评估免疫细胞浸润在肺动脉高压发病机制中的作用 | 肺动脉高压患者中的单核细胞及其相关信号通路 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 微阵列数据分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基于GEO数据库中的微阵列数据集和单细胞RNA测序数据 |
| 7204 | 2024-10-19 |
Amphiregulin couples IL1RL1+ regulatory T cells and cancer-associated fibroblasts to impede antitumor immunity
2023-08-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add7399
PMID:37611111
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研究论文 | 研究揭示了IL1RL1+调节性T细胞和癌症相关成纤维细胞通过AREG/EGFR轴相互作用，阻碍抗肿瘤免疫 | 首次揭示了AREG/EGFR轴在调节性T细胞和癌症相关成纤维细胞之间的相互作用，控制成纤维细胞功能状态的分叉 | NA | 探讨调节性T细胞和癌症相关成纤维细胞在肿瘤微环境中的相互作用及其分子机制 | 调节性T细胞、癌症相关成纤维细胞、肿瘤微环境 | 肿瘤学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7205 | 2024-10-19 |
Synergism Between IL21 and Anti-PD-1 Combination Therapy is Underpinned by the Coordinated Reprogramming of the Immune Cellular Network in the Tumor Microenvironment
2023-08, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0012
PMID:37546701
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研究论文 | 通过综合分析多个单细胞RNA测序数据集，研究了IL21与抗PD-1联合治疗在肿瘤微环境中通过协调重编程免疫细胞网络的协同机制 | 揭示了IL21在肿瘤微环境中通过增强CD4 T细胞的辅助功能，促进CD8 T细胞介导的免疫反应，并与抗PD-1阻断剂协同驱动肿瘤抗原特异性CD8 T细胞的克隆扩增和功能状态分化 | NA | 探讨IL21与抗PD-1联合治疗在肿瘤微环境中的协同机制 | 肿瘤微环境中的免疫细胞网络 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 多个单细胞RNA测序数据集 |
| 7206 | 2024-10-19 |
Integrative in situ mapping of single-cell transcriptional states and tissue histopathology in a mouse model of Alzheimer's disease
2023-03, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01251-x
PMID:36732642
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STARmap PLUS的方法，结合高分辨率空间转录组学和蛋白质检测，用于在小鼠阿尔茨海默病模型中进行单细胞转录状态和组织病理学的整合原位映射 | 本文创新性地将高分辨率空间转录组学与蛋白质检测结合，提供了疾病进展的综合细胞图谱 | NA | 揭示阿尔茨海默病在小鼠模型中的时空动态变化，理解疾病机制和进展 | 小鼠阿尔茨海默病模型的大脑组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 图像 | 8个月和13个月龄的小鼠阿尔茨海默病模型大脑组织样本 |
| 7207 | 2024-10-19 |
Application of single-cell RNA sequencing methods to develop B cell targeted treatments for autoimmunity
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1103690
PMID:37520578
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研究论文 | 本文探讨了利用单细胞RNA测序方法开发针对自身免疫病的B细胞靶向治疗 | 本文提出利用单细胞RNA测序技术识别自身免疫病中的致病性自身反应性B细胞，以开发更精确的靶向治疗 | NA | 开发针对自身免疫病的B细胞靶向治疗 | 自身反应性B细胞 | 数字病理学 | 自身免疫病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7208 | 2024-10-19 |
Single-cell RNA-sequencing atlas of bovine caudal intervertebral discs: Discovery of heterogeneous cell populations with distinct roles in homeostasis
2021-11, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202101149R
PMID:34591994
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了牛尾椎间盘的细胞图谱，揭示了椎间盘中不同细胞群的异质性及其在稳态中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了牛尾椎间盘中15个独特细胞群的基因表达特征，并识别了这些细胞群在椎间盘稳态和结构维持中的作用 | 研究仅限于牛尾椎间盘，结果的普适性和对人类椎间盘的适用性尚需进一步验证 | 通过单细胞RNA测序技术揭示椎间盘中细胞的异质性，以期为椎间盘再生疗法的开发提供新的见解 | 牛尾椎间盘中的细胞群及其基因表达特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 牛尾椎间盘样本 |
| 7209 | 2024-10-18 |
A regulatory variant rs9379874 in T1D risk region 6p22.2 affects BTN3A1 expression regulating T cell function
2024-Oct-17, Acta diabetologica
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s00592-024-02389-9
PMID:39417845
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研究论文 | 研究揭示了6p22.2区域中的调控变异rs9379874通过影响BTN3A1表达来调节T细胞功能，从而与1型糖尿病（T1D）风险相关 | 发现了rs9379874变异通过FOXA1结合增加BTN3A1表达，扩展了T1D风险的基因组图谱，并提供了潜在的治疗靶点 | 研究未发现该变异与胰岛功能或自身免疫的显著关联 | 揭示6p22.2区域与T1D亚型及相关临床特征的关联，并识别该区域的因果变异和目标基因 | 6p22.2区域中的基因变异与T1D风险的关系 | NA | 糖尿病 | 全基因组关联研究（GWAS）、双荧光素酶报告基因检测、表达数量性状位点（eQTL）分析 | NA | 基因型数据、单细胞RNA测序数据 | 2608例T1D患者和4814例健康对照 |
| 7210 | 2024-10-18 |
Integrating bulk and single-cell transcriptomics to elucidate the role and potential mechanisms of autophagy in aging tissue
2024-Oct-16, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-00996-w
PMID:39414741
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研究论文 | 研究通过整合bulk和单细胞转录组数据，揭示了自噬在衰老组织中的作用及其潜在机制 | 首次通过整合大量bulk RNA-seq和单细胞测序数据，揭示了血液组织中自噬与衰老的最高正相关性，并发现了经典单核细胞在衰老过程中的关键作用 | 研究主要集中在血液组织和急性髓系白血病，其他组织和疾病的相关性未被探讨 | 识别与自噬和衰老最相关的组织，并探索自噬在衰老组织微环境中的功能和机制 | 正常组织样本、不同年龄的血液样本、急性髓系白血病的bulk RNA-seq和单细胞数据 | 生物信息学 | 血液疾病 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 超过7000个正常组织样本、2000多个急性髓系白血病bulk RNA-seq样本和多组AML单细胞数据 |
| 7211 | 2024-10-18 |
Cross-tissue human fibroblast atlas reveals myofibroblast subtypes with distinct roles in immune modulation
2024-Oct-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.08.020
PMID:39303725
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了来自517个人类样本的纤维母细胞，揭示了不同亚型在免疫调节中的独特作用 | 识别了四种转录上不同的肌纤维母细胞亚群，并揭示了它们在肿瘤微环境中的不同功能 | NA | 深入理解纤维母细胞生物学，并探索针对特定纤维母细胞亚群的癌症治疗策略 | 人类纤维母细胞及其在不同组织和病理状态下的亚型 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 517个人类样本，涵盖11种组织类型和多种病理状态 |
| 7212 | 2024-10-18 |
Coagulation factor X promotes resistance to androgen-deprivation therapy in prostate cancer
2024-Oct-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.08.018
PMID:39303726
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研究论文 | 研究探讨了凝血因子X在前列腺癌中促进对雄激素剥夺疗法抵抗的作用 | 首次揭示了免疫抑制性中性粒细胞（PMN-MDSCs）是凝血因子X的关键非肝源性来源，并阐明了其在肿瘤微环境中通过激活PAR2和ERK1/2促进肿瘤生长的机制 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类患者中验证 | 探讨凝血因子X在前列腺癌中的作用及其对雄激素剥夺疗法的影响 | 前列腺癌、免疫抑制性中性粒细胞（PMN-MDSCs）、凝血因子X | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠模型中的前列腺肿瘤微环境样本 |
| 7213 | 2024-10-18 |
Single-cell transcriptomic profiling uncovers cellular complexity and microenvironment in gastric tumorigenesis associated with Helicobacter pylori
2024-Oct-14, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.10.012
PMID:39414226
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了幽门螺杆菌相关胃癌发生过程中的细胞复杂性和微环境变化 | 首次构建了包含幽门螺杆菌感染和未感染的胃炎、胃肠化生和胃癌样本的单细胞图谱，揭示了不同细胞类型的独特癌症相关表达谱和细胞间通信网络 | 研究仅限于特定样本和数据集，可能无法完全代表所有胃癌病例 | 揭示幽门螺杆菌感染驱动胃癌发生过程中的细胞异质性和分子机制 | 胃炎、胃肠化生和胃癌样本中的单细胞转录组 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 18个胃炎、胃肠化生和胃癌样本 |
| 7214 | 2024-10-18 |
Nerve-associated macrophages control adipose homeostasis across lifespan and restrain age-related inflammation
2024-Oct-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.12.618004
PMID:39416197
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研究论文 | 研究探讨了神经相关巨噬细胞在生命周期中控制脂肪稳态的作用，并揭示了其对年龄相关炎症的抑制作用 | 首次定义了生命周期中脂肪组织巨噬细胞的多样性和变化，并发现神经相关巨噬细胞在防止儿茶酚胺抵抗中的关键作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步验证在人类中的适用性 | 探讨脂肪组织巨噬细胞在年龄相关炎症中的作用及其对脂肪稳态的影响 | 脂肪组织巨噬细胞、神经相关巨噬细胞、年龄相关巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 小鼠模型 |
| 7215 | 2024-10-18 |
Cancer cell-specific PD-L1 expression is a predictor of poor outcome in patients with locally advanced oral cavity squamous cell carcinoma
2024-Oct-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009617
PMID:39357980
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研究论文 | 研究探讨了程序性死亡配体1（PD-L1）在局部晚期口腔鳞状细胞癌（OCSCC）中的表达及其对患者预后的影响 | 首次揭示了PD-L1在癌症细胞中的表达对局部晚期OCSCC患者预后的负面影响，并发现PD-L1的表达与免疫细胞无关，而是由复杂的调控网络介导 | 样本量较小，特别是单细胞RNA测序部分仅涉及10个样本 | 研究PD-L1表达在局部晚期口腔鳞状细胞癌中的预后意义及其与免疫微环境的关系 | 局部晚期口腔鳞状细胞癌患者及其肿瘤中的PD-L1表达 | 数字病理学 | 口腔癌 | 多重免疫组化染色、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 132名局部晚期口腔鳞状细胞癌患者，其中10名患者进行单细胞RNA测序 |
| 7216 | 2024-10-18 |
OrganogenesisDB: A Comprehensive Database Exploring the Cell-Type Identities and Gene Expression Dynamics during Organogenesis
2024-Oct, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202301758
PMID:38967205
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研究论文 | 本文介绍了一个名为OrganogenesisDB的综合数据库，用于探索器官发生过程中细胞类型身份和基因表达动态 | 开发了一个包含超过140万个细胞的单细胞RNA测序数据的综合数据库，涵盖49个已发表的数据集，并手动整理了3324个细胞标记 | NA | 旨在填补理解器官发生过程中细胞分化和成熟的数据空白 | 器官发生过程中的细胞类型身份和基因表达动态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过140万个细胞，来自49个已发表的数据集，涵盖9个人类器官和4个老鼠器官 |
| 7217 | 2024-10-18 |
Single Nucleus Total RNA Sequencing of Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Gliomas
2024-Oct, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202301801
PMID:38958078
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研究论文 | 开发了一种名为snRandom-seq的高通量单核总RNA测序平台，用于固定石蜡包埋（FFPE）的胶质瘤样本，并分析了17个FFPE样本中的116,492个单核 | 开发了自动化snRandom-seq平台，优化了FFPE样本的单核总RNA测序，适用于广泛的样本类型，并应用于多种胶质瘤亚型的分析 | NA | 研究胶质瘤的分子多样性和进化过程，以推动新治疗方法的发展 | 固定石蜡包埋的胶质瘤样本及其分子特征 | 数字病理学 | 脑癌 | 单核总RNA测序 | NA | RNA | 17个FFPE样本中的116,492个单核 |
| 7218 | 2024-10-18 |
Role of TOMM34 on NF-κB activation-related hyperinflammation in severely ill patients with COVID-19 and influenza
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105343
PMID:39276680
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研究论文 | 研究探讨了TOMM34在COVID-19和流感重症患者中与NF-κB激活相关的过度炎症中的作用 | 首次揭示了TOMM34在病毒感染中通过招募TRAF6促进NEMO的K63连接的多聚泛素化，从而促进NF-κB激活的机制 | NA | 识别驱动NF-κB激活和炎症的未知宿主因子，以开发免疫干预策略 | COVID-19和流感重症患者 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 健康个体27人，COVID-19重症患者21人，健康个体22人，COVID-19重症患者45人，流感重症患者16人 |
| 7219 | 2024-10-18 |
Damping excessive viral-induced IFN-γ rescues the impaired anti-Aspergillus host immune response in influenza-associated pulmonary aspergillosis
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105347
PMID:39353282
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研究论文 | 研究流感相关肺曲霉病（IAPA）中免疫病理机制，发现过度产生的IFN-γ是主要驱动因素，并探讨了其分子机制和潜在的免疫治疗靶点 | 揭示了流感诱导的IFN-γ过度产生是IAPA中免疫功能障碍的主要驱动因素，并提出了新的免疫治疗靶点 | NA | 揭示流感相关肺曲霉病的免疫病理机制，开发辅助免疫调节疗法 | 流感相关肺曲霉病（IAPA）的免疫病理机制 | NA | 肺曲霉病 | 微计算机断层扫描（μCT）、生物发光成像（BLI）、空间转录组学、免疫荧光染色、功能性吞噬和杀伤试验 | NA | NA | 使用免疫功能正常的鼠模型进行研究 |
| 7220 | 2024-10-18 |
vSPACE: Exploring Virtual Spatial Representation of Articular Chondrocytes at the Single-Cell Level
2024-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.07.577817
PMID:38370845
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研究论文 | 本文介绍了一种名为vSPACE的新方法，用于在二维空间中虚拟表示单细胞RNA测序数据，特别是人类关节软骨细胞 | vSPACE方法通过模拟空间转录组技术，在虚拟二维图中展示了人类关节软骨细胞的区域分布模式，揭示了可解释且在不同供体中一致的基因表达模式 | NA | 开发一种新的方法来虚拟表示单细胞RNA测序数据，揭示人类关节软骨细胞的区域分布模式 | 人类关节软骨细胞的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6名健康供体的样本 |