单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 7181 - 7200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7181 | 2024-10-17 |
POLYseq: A poly(β-amino ester)-based vector for multifunctional cellular barcoding
2021-09-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.07.020
PMID:34450040
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研究论文 | 本文介绍了一种基于聚（β-氨基酯）的新型载体POLYseq，用于多功能细胞条形码标记 | 开发了一种新的聚（β-氨基）酯标记系统POLYseq，能够高效地传递荧光分子或样本区分DNA条形码，并通过非共价结合快速创建自定义样本池 | NA | 解决当前NGS文库制备技术在单细胞水平上多重化的限制问题 | 聚（β-氨基酯）载体POLYseq在细胞标记和单细胞RNA测序中的应用 | NA | NA | NGS | NA | 图像 | 90%的细胞 |
| 7182 | 2024-10-16 |
A comprehensive overview of graph neural network-based approaches to clustering for spatial transcriptomics
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.11.055
PMID:38089467
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综述 | 本文全面概述了基于图神经网络的空间转录组学聚类方法 | 本文提供了对最新GNN-based空间聚类方法的全面概述，并比较分析了这些方法在空间聚类中的性能 | 本文指出了现有方法的局限性，并提出了未来研究的方向 | 探讨和评估基于图神经网络的空间转录组学聚类方法 | 空间转录组学数据的空间聚类 | 机器学习 | NA | 图神经网络 | 图神经网络 | 空间转录组学数据 | 60个聚类场景 |
| 7183 | 2024-10-16 |
Hunger signalling in the olfactory bulb primes exploration, food-seeking and peripheral metabolism
2024-Nov, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.102025
PMID:39236785
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研究论文 | 研究探讨了嗅球中的胃饥饿素受体（GHSRs）对嗅觉功能、觅食行为和代谢的影响 | 首次评估了嗅球中胃饥饿素受体对嗅觉功能、觅食行为和代谢的具体机制及其影响 | 研究仅限于小鼠模型，结果的普遍性和在人类中的适用性尚不清楚 | 探讨胃饥饿素受体在嗅球中的作用及其对行为和代谢的影响 | 小鼠的嗅觉功能、觅食行为和代谢 | NA | NA | scRNA-seq和空间转录组学 | NA | NA | 小鼠模型，具体数量未明确 |
| 7184 | 2024-10-16 |
Localized ablative immunotherapy enhances antitumor immunity by modulating the transcriptome of tumor-infiltrating Gamma delta T cells
2024-Nov-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217267
PMID:39307410
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研究论文 | 研究局部消融免疫疗法通过调节肿瘤浸润γδT细胞的转录组增强抗肿瘤免疫 | 首次使用单细胞RNA测序研究局部消融免疫疗法对肿瘤浸润γδT细胞的影响，并发现其与免疫检查点抑制剂治疗的转录组特征相似 | 研究仅在乳腺癌小鼠模型中进行，结果的普适性需进一步验证 | 探讨局部消融免疫疗法对肿瘤浸润γδT细胞转录组的影响及其在抗肿瘤免疫中的作用 | 肿瘤浸润γδT细胞及其在不同治疗条件下的功能动态 | 免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型中的乳腺癌肿瘤样本 |
| 7185 | 2024-10-16 |
Spatial Transcriptomic Signatures of Early Acute T Cell-mediated Rejection in Kidney Transplants
2024-Nov, Transplantation direct
IF:1.9Q3
DOI:10.1097/TXD.0000000000001705
PMID:39399058
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研究论文 | 研究肾脏移植中急性T细胞介导排斥反应的早期空间转录组特征 | 发现非T细胞因素在急性T细胞介导排斥反应中的潜在作用，并揭示了先天免疫系统在排斥反应中的作用 | 研究样本量较小，需要进一步验证和扩大样本以确认结果的普遍性 | 探讨急性T细胞介导排斥反应的早期空间转录组特征及其相关免疫机制 | 肾脏移植中的急性T细胞介导排斥反应 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 9天手术后的活检样本，包括疑似急性T细胞介导排斥反应和非T细胞介导排斥反应患者 |
| 7186 | 2024-10-16 |
Tumor-Secreted Extracellular Vesicles Counteract Therapy Response by Triggering Inflammatory Mesenchymal Stem Cell Development
2024-Oct-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-4097
PMID:39115426
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研究论文 | 本文研究了肿瘤分泌的细胞外囊泡通过触发炎症性间充质干细胞的发育来对抗治疗反应的机制 | 首次揭示了肿瘤分泌的细胞外囊泡触发炎症性间充质干细胞的发育，并提出了通过阻断下游通路来克服药物抵抗的策略 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本的单细胞RNA测序数据，需要进一步的临床验证 | 探讨骨癌治疗中药物抵抗的微环境因素，并寻找克服这种抵抗的策略 | 炎症性间充质干细胞及其在骨癌治疗中的作用 | 数字病理学 | 骨癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括骨癌和多发性骨髓瘤患者的活检样本以及小鼠模型 |
| 7187 | 2024-10-16 |
Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneity of ALI model and epithelial cell alterations after exposure to electronic cigarette aerosol
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38552
PMID:39397927
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序揭示了电子烟气溶胶暴露后ALI模型和人支气管上皮细胞的异质性及上皮细胞的改变 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示了电子烟气溶胶对人类支气管上皮细胞的转录异质性和细胞类型特异性反应 | 研究仅限于急性暴露后的短期效应，未探讨长期暴露的影响 | 探讨电子烟气溶胶对支气管上皮细胞的影响及其潜在机制 | 人支气管上皮细胞（ALI-HBE）及其在电子烟气溶胶暴露后的转录变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多种细胞类型，包括基底细胞、纤毛细胞和分泌细胞 |
| 7188 | 2024-10-16 |
Prognostic modeling and Emerging therapeutic targets Unveiled through single-cell sequencing in esophageal squamous Cell carcinoma
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38078
PMID:39397956
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研究论文 | 研究通过单细胞测序揭示食管鳞状细胞癌中的预后模型和新治疗靶点 | 首次通过单细胞转录组测序结合机器学习技术，开发出区分恶性与非恶性细胞的模型，并发现IGFBP2作为潜在的生物标志物和治疗靶点 | 研究样本量较小，仅涉及10名患者，可能影响结果的普适性 | 寻找食管鳞状细胞癌的新诊断和预测生物标志物，以改善治疗效果 | 食管鳞状细胞癌的恶性细胞和非恶性细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 128,688个细胞，来自10名患者 |
| 7189 | 2024-10-16 |
Establish a novel immune-related gene prognostic risk index (IRGPRI) associated with CD8+ cytotoxic T lymphocytes in non-small-cell lung cancer (NSCLC)
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38324
PMID:39397989
|
研究论文 | 本研究旨在建立一个与非小细胞肺癌（NSCLC）中CD8+细胞毒性T淋巴细胞相关的免疫相关基因预后风险指数（IRGPRI），用于预测患者的预后和评估免疫检查点抑制剂（ICIs）治疗的疗效 | 本研究创新性地利用单细胞RNA测序技术识别CD8+细胞毒性T淋巴细胞与其他细胞类型的差异表达基因，并通过LASSO Cox回归分析构建IRGPRI | NA | 建立一个能够预测非小细胞肺癌患者预后和评估免疫检查点抑制剂治疗疗效的免疫相关基因预后风险指数 | 非小细胞肺癌患者及其CD8+细胞毒性T淋巴细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归分析 | 基因表达数据 | 109个基因，7个预后相关基因，GSE131907数据集 |
| 7190 | 2024-10-16 |
Breast Cancer Disseminated Tumor Cells: Do They Stay and Fight or Run and Hide?
2024-Oct-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2408
PMID:39402990
|
研究论文 | 研究乳腺癌早期扩散的肿瘤细胞在免疫系统中的作用 | 探讨了NK细胞在乳腺癌早期扩散和休眠中的作用，并提出了STING通路和转录因子Sox2、Bach1的机制 | 需要进一步研究不同免疫类型在休眠和复发中的具体机制和重要性 | 探讨乳腺癌早期扩散的肿瘤细胞在免疫系统中的作用及其机制 | 乳腺癌早期扩散的肿瘤细胞和NK细胞 | 癌症研究 | 乳腺癌 | 单细胞基因组学和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7191 | 2024-10-16 |
Targeting HPV for the prevention, diagnosis, and treatment of Cervical Cancer
2024-Oct-14, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjae046
PMID:39402008
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综述 | 本文综述了HPV在宫颈癌预防、诊断和治疗中的关键作用 | 整合HPV检测与现有筛查方法，如宫颈细胞学和视觉检查，提高了宫颈癌筛查的敏感性和特异性 | NA | 探讨HPV在宫颈癌预防、诊断和治疗中的最新进展 | HPV感染及其相关生物标志物在宫颈癌中的作用 | NA | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7192 | 2024-10-16 |
Differential transcriptomic host responses in the early phase of viral and bacterial infections in human lung tissue explants ex vivo
2024-Oct-12, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-024-02988-8
PMID:39395995
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研究论文 | 研究了人类肺组织体外培养物在病毒和细菌感染早期阶段的转录组差异反应 | 首次使用RNA测序技术研究了人类肺组织体外培养物在流感病毒A、BCG和铜绿假单胞菌感染早期阶段的转录组变化 | 研究仅限于体外培养的肺组织，无法完全模拟自然感染环境 | 探讨人类肺组织在病毒和细菌感染早期阶段的转录组反应差异 | 人类肺组织体外培养物在流感病毒A、BCG和铜绿假单胞菌感染早期阶段的转录组变化 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 来自肺气肿患者的肺组织体外培养物 |
| 7193 | 2024-10-16 |
Best practices for differential accessibility analysis in single-cell epigenomics
2024-Oct-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53089-5
PMID:39394227
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研究论文 | 本文系统评估了用于识别单细胞ATAC-seq数据中差异可及性区域的统计方法 | 本文通过系统评估多种统计方法，提出了单细胞ATAC-seq数据分析的最佳实践，并开发了相应的R包 | 本文主要关注单细胞ATAC-seq数据的差异可及性分析，未涵盖其他类型的单细胞数据 | 评估和确定单细胞ATAC-seq数据差异可及性分析的最佳统计方法 | 单细胞ATAC-seq数据及其匹配的bulk ATAC-seq或scRNA-seq数据 | 单细胞组学 | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | 单细胞数据 | 多个scATAC-seq实验及其匹配的bulk ATAC-seq或scRNA-seq数据 |
| 7194 | 2024-10-16 |
Resting natural killer cells promote the progress of colon cancer liver metastasis by elevating tumor-derived stem cell factor
2024-Oct-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97201
PMID:39387546
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研究论文 | 研究了自然杀伤细胞在结直肠癌肝转移中的作用及其与肿瘤微环境的关系 | 首次揭示了GZMK+静息状态的自然杀伤细胞在肿瘤组织中的显著增加，并发现其在肿瘤区域中的富集与较差的预后相关 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 探讨自然杀伤细胞在结直肠癌肝转移中的临床相关性和细胞作用 | 自然杀伤细胞在结直肠癌肝转移中的生物学特性和功能 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | NA | RNA | 涉及结直肠癌和肝转移癌的肿瘤组织样本 |
| 7195 | 2024-10-16 |
Detecting Rhythmic Gene Expression in Single-cell Transcriptomics
2024-Oct-08, Journal of biological rhythms
IF:2.9Q2
DOI:10.1177/07487304241273182
PMID:39377613
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研究论文 | 本文研究了在单细胞转录组数据中检测节律基因表达的方法 | 提出了结合子采样和谐波回归的高效策略来检测单细胞数据中的昼夜节律基因 | 尚未完全解决如何将现有的节律检测算法适应于单细胞RNA测序数据的问题 | 探讨如何将现有的节律检测方法适应于单细胞RNA测序数据，并提出新的检测策略 | 单细胞转录组数据中的昼夜节律基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 谐波回归 | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 7196 | 2024-10-16 |
Multiomic single-cell sequencing defines tissue-specific responses in Stevens-Johnson syndrome and toxic epidermal necrolysis
2024-Oct-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52990-3
PMID:39379371
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研究论文 | 本文通过多组学单细胞测序技术，研究了Stevens-Johnson综合征和中毒性表皮坏死松解症（SJS/TEN）患者的皮肤组织特异性反应 | 首次在单细胞水平上综合分析了SJS/TEN患者的转录组、表面蛋白质组和T细胞受体，揭示了细胞免疫发病机制中的关键细胞和分子 | 研究样本量较小，仅涉及15名患者，可能影响结果的普适性 | 探讨SJS/TEN的细胞免疫发病机制，并寻找潜在的治疗靶点 | SJS/TEN患者的未受影响皮肤、受影响皮肤和水肿液中的细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞转录组测序、表面蛋白质组测序、T细胞受体测序 | NA | 单细胞数据 | 15名SJS/TEN患者，共109,888个细胞 |
| 7197 | 2024-10-16 |
Visualizing scRNA-Seq data at population scale with GloScope
2024-Oct-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03398-1
PMID:39380041
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研究论文 | 本文提出了一种名为GloScope的框架，用于在群体规模上可视化和分析scRNA-Seq数据 | GloScope框架能够有效地处理样本间的变异，支持样本级别的可视化和质量控制评估 | NA | 开发一种新的生物信息学方法，用于在群体规模上分析scRNA-Seq数据 | scRNA-Seq数据及其在不同样本中的变异 | 生物信息学 | NA | scRNA-Seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12到300个样本 |
| 7198 | 2024-10-16 |
CRIP1 regulates osteogenic differentiation of bone marrow stromal cells and pre-osteoblasts via the Wnt signaling pathway
2024-10-01, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.150277
PMID:38936225
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研究论文 | 研究CRIP1通过Wnt信号通路调控骨髓间充质干细胞和前成骨细胞的成骨分化 | 揭示了CRIP1在调控骨髓间充质干细胞成骨分化中的新作用，并通过Wnt信号通路增强成骨分化 | NA | 探索骨髓间充质干细胞分化调控机制，为骨质疏松症的治疗提供新思路 | 骨髓间充质干细胞和前成骨细胞 | NA | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从接受全髋关节置换术的患者中收集的股骨头骨髓细胞 |
| 7199 | 2024-10-16 |
Single-cell transcriptome atlas revealed bronchoalveolar immune features related to disease severity in pediatric Mycoplasma pneumoniae pneumonia
2024-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.748
PMID:39399649
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了支气管肺泡灌洗液样本中的免疫特征，揭示了轻度和重度肺炎患者之间的免疫差异 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了轻度和重度肺炎患者的支气管肺泡灌洗液免疫景观，揭示了不同疾病严重程度下的免疫特征 | 研究样本量有限，且仅限于儿童肺炎患者，可能影响结果的普适性 | 探讨轻度肺炎的保护性免疫机制和重度肺炎的病理机制 | 支气管肺泡灌洗液样本中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 13名健康捐赠者和24名住院的儿童肺炎患者 |
| 7200 | 2024-10-16 |
Mouse Wound Models and Preparation of Single-Cell Suspensions
2024-Sep-27, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66499
PMID:39400188
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研究论文 | 本文研究了优化小鼠伤口模型构建和单细胞悬液制备的方法 | 采用单细胞转录组测序技术来深入理解伤口愈合过程中的细胞功能和机制 | 小鼠伤口模型制备方法的差异可能引入干扰因素，影响实验结果 | 优化小鼠伤口模型的构建，以准确评估伤口闭合变化，并消除影响后续测序结果的变量 | 小鼠伤口模型和单细胞悬液的制备 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠皮肤组织样本 |