单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 7181 - 7200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7181 | 2024-10-17 |
Macrophage Dysfunction in Respiratory Disease
2024, Results and problems in cell differentiation
DOI:10.1007/978-3-031-65944-7_9
PMID:39406908
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研究论文 | 本文探讨了肺泡巨噬细胞在呼吸系统疾病中的功能障碍及其机制 | 利用谱系追踪和单细胞RNA测序技术，深入理解了肺泡巨噬细胞在肺部稳态调节中的作用 | 未详细讨论具体的靶向治疗方法 | 研究肺泡巨噬细胞在呼吸系统疾病中的功能障碍及其机制，为开发针对性治疗提供理论基础 | 肺泡巨噬细胞及其在呼吸系统疾病中的功能变化 | NA | 呼吸系统疾病 | 谱系追踪、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 7182 | 2024-10-17 |
Transcription factors in fibroblast plasticity and CAF heterogeneity
2023-Dec-20, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02934-4
PMID:38124183
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综述 | 本文综述了转录因子在癌症相关成纤维细胞（CAF）异质性和可塑性中的作用 | 强调了单细胞RNA测序技术在揭示转录因子在不同癌症类型中将正常成纤维细胞转化为不同CAF亚型中的作用 | 目前尚未形成统一的CAF亚群功能分类，这为临床上开发靶向CAF疗法带来了挑战 | 揭示CAF的异质性，并识别不同肿瘤中的共性，以更有效地靶向肿瘤微环境中的促肿瘤基质 | 癌症相关成纤维细胞（CAF）及其异质性和可塑性 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7183 | 2024-10-17 |
scNAT: a deep learning method for integrating paired single-cell RNA and T cell receptor sequencing profiles
2023-12-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03129-y
PMID:38111007
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scNAT的深度学习方法，用于整合配对的单细胞RNA和T细胞受体测序数据 | scNAT方法能够将配对的scRNA-seq和scTCR-seq数据整合到一个统一的潜在空间中，用于下游分析 | NA | 开发一种能够整合单细胞RNA和T细胞受体测序数据的深度学习方法 | 单细胞RNA测序数据和T细胞受体测序数据 | 机器学习 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞T细胞受体测序（scTCR-seq） | 深度学习 | 单细胞RNA和T细胞受体测序数据 | NA |
| 7184 | 2024-10-17 |
Atypical B cells consist of subsets with distinct functional profiles
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108496
PMID:38098745
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了慢性暴露于疟疾寄生虫的个体中非典型B细胞的转录组、细胞表面标记和B细胞受体，发现了三种先前未被描述的非典型B细胞亚群，并揭示了它们在适应性免疫反应中的不同功能 | 发现了三种先前未被描述的非典型B细胞亚群，并揭示了它们在适应性免疫反应中的不同功能 | NA | 更好地定义非典型B细胞在人类适应性免疫反应中的作用 | 非典型B细胞的转录组、细胞表面标记和B细胞受体 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 慢性暴露于疟疾寄生虫的个体 |
| 7185 | 2024-10-17 |
Challenges and opportunities to computationally deconvolve heterogeneous tissue with varying cell sizes using single-cell RNA-sequencing datasets
2023-12-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03123-4
PMID:38098055
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研究论文 | 本文讨论了使用单细胞RNA测序数据进行异质组织解卷积的挑战和机遇 | 提出了使用正交的“黄金标准”数据集来评估解卷积方法 | 现有方法可能量化总mRNA而非细胞类型比例，缺乏细胞参考图谱和单细胞与空间转录组数据整合的标准 | 探讨如何解决使用单细胞RNA测序数据进行异质组织解卷积的关键挑战 | 异质组织中的细胞混合物 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 7186 | 2024-10-17 |
GNTD: reconstructing spatial transcriptomes with graph-guided neural tensor decomposition informed by spatial and functional relations
2023-Dec-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44017-0
PMID:38092776
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GNTD的图引导神经张量分解模型，用于重建组织中的全空间转录组 | GNTD模型通过分层张量结构和三层神经网络的非线性分解，结合捕获点之间的空间关系和基因功能关系，提高了从高度稀疏的空间转录组数据中进行准确重建的能力 | NA | 开发一种新的方法来克服空间转录组技术在组织切片制备和RNA捕获与固定方面的技术限制，从而实现全空间转录组的重建 | 组织中的空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组技术 | 神经网络 | 基因表达数据 | 22个Visium空间转录组数据集和3个高分辨率Stereo-seq数据集以及模拟数据 |
| 7187 | 2024-10-17 |
The molecular cytoarchitecture of the adult mouse brain
2023-Dec, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06818-7
PMID:38092915
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研究论文 | 本文通过结合高通量单核RNA测序和Slide-seq空间转录组学方法，构建了成年小鼠大脑中每个脑结构的细胞类型图谱 | 本文首次全面揭示了小鼠大脑中不同神经解剖结构的细胞类型组成，并开发了一个框架用于遗传访问每种细胞类型 | NA | 构建一个全面的成年小鼠大脑细胞类型图谱，并揭示其分子身份和空间位置 | 成年小鼠大脑的细胞类型及其在神经解剖结构中的分布 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序和Slide-seq空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | 整个小鼠大脑的细胞样本 |
| 7188 | 2024-10-17 |
STAT4 facilitates PD-L1 level via IL-12R/JAK2/STAT3 axis and predicts immunotherapy response in breast cancer
2023-Dec, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.464
PMID:38107057
|
研究论文 | 研究STAT4在乳腺癌中的作用及其通过IL-12R/JAK2/STAT3轴调节PD-L1水平的机制，并探讨其作为免疫治疗反应预测因子的潜力 | 揭示了STAT4通过STAT4/IL-12R/JAK2-STAT3-STAT4轴间接调节PD-L1表达的新分子机制，并提出其作为预测抗PD-1免疫治疗反应的潜在应用 | NA | 探讨STAT4在乳腺癌中的功能及其在免疫治疗中的作用 | STAT4在乳腺癌中的表达及其对PD-L1水平的影响 | NA | 乳腺癌 | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个临床乳腺癌队列 |
| 7189 | 2024-10-17 |
Identification of RP11-770J1.4 as immune-related lncRNA regulating the CTXN1-cGAS-STING axis in histologically lower-grade glioma
2023-Dec, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.458
PMID:38116063
|
研究论文 | 本文研究了长非编码RNA RP11-770J1.4在低级别胶质瘤中的免疫调节作用 | 揭示了RP11-770J1.4-CTXN1作为潜在的免疫调节轴，具有治疗低级别胶质瘤的潜力 | NA | 探讨长非编码RNA在低级别胶质瘤中的免疫调节机制 | 长非编码RNA RP11-770J1.4及其在低级别胶质瘤中的作用 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括胶质母细胞瘤干细胞模型和患者样本 |
| 7190 | 2024-10-17 |
Genetic Insights of Schizophrenia via Single Cell RNA-Sequencing Analyses
2023-07-04, Schizophrenia bulletin
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/schbul/sbad002
PMID:36805283
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，揭示了精神分裂症的遗传机制 | 本文首次使用单细胞RNA测序数据识别出54个精神分裂症风险基因，其中三分之二未在传统组织测序数据中被发现 | 本文的研究结果依赖于单细胞RNA测序数据，未来需要更多研究来进一步验证这些发现 | 揭示精神分裂症的遗传机制 | 精神分裂症风险基因及其在特定脑细胞类型中的表达 | 基因组学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 54个精神分裂症风险基因 |
| 7191 | 2024-10-17 |
Adversarial training improves model interpretability in single-cell RNA-seq analysis
2023, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbad166
PMID:38099262
|
研究论文 | 本文探讨了通过对抗训练提高单细胞RNA测序数据分析中模型鲁棒性和可解释性的方法 | 本文首次展示了对抗训练不仅提高了模型的鲁棒性，还增强了模型的可解释性 | 本文仅在一个特定任务上验证了方法的有效性，需要在更多任务上进行评估 | 提高预测计算模型在生物学和医学领域的鲁棒性和可解释性 | 单细胞RNA测序数据的细胞类型预测 | 机器学习 | NA | 对抗训练 | 深度学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 7192 | 2024-10-17 |
Macrophages in intestinal fibrosis and regression
2022-11, Cellular immunology
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cellimm.2022.104614
PMID:36182587
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综述 | 本文综述了肠道巨噬细胞在肠道纤维化和消退中的作用 | 基于最新进展的谱系追踪和单细胞测序技术，详细描述了肠道巨噬细胞的特征，并提出了针对巨噬细胞的潜在抗肠道纤维化疗法 | NA | 探讨肠道巨噬细胞在肠道纤维化和消退中的作用，并提出潜在的治疗策略 | 肠道巨噬细胞及其在肠道纤维化中的作用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 7193 | 2024-10-17 |
Synthesis and application of POLYseq for profiling human liver organoids
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100976
PMID:34934958
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研究论文 | 本文详细介绍了POLYseq的合成、表征及其在单细胞测序中的应用 | POLYseq通过商业化试剂合成，具有高度可定制性，并且在合成过程中仅需要一个能保持90°C的恒温浴 | 合成过程中需注意试剂的初始混合比例，因为最终产品对初始混合比例敏感 | 开发和应用POLYseq技术以进行单细胞测序 | 人类肝脏类器官细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 7194 | 2024-10-17 |
POLYseq: A poly(β-amino ester)-based vector for multifunctional cellular barcoding
2021-09-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.07.020
PMID:34450040
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于聚（β-氨基酯）的新型载体POLYseq，用于多功能细胞条形码标记 | 开发了一种新的聚（β-氨基）酯标记系统POLYseq，能够高效地传递荧光分子或样本区分DNA条形码，并通过非共价结合快速创建自定义样本池 | NA | 解决当前NGS文库制备技术在单细胞水平上多重化的限制问题 | 聚（β-氨基酯）载体POLYseq在细胞标记和单细胞RNA测序中的应用 | NA | NA | NGS | NA | 图像 | 90%的细胞 |
| 7195 | 2024-10-16 |
A comprehensive overview of graph neural network-based approaches to clustering for spatial transcriptomics
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.11.055
PMID:38089467
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综述 | 本文全面概述了基于图神经网络的空间转录组学聚类方法 | 本文提供了对最新GNN-based空间聚类方法的全面概述，并比较分析了这些方法在空间聚类中的性能 | 本文指出了现有方法的局限性，并提出了未来研究的方向 | 探讨和评估基于图神经网络的空间转录组学聚类方法 | 空间转录组学数据的空间聚类 | 机器学习 | NA | 图神经网络 | 图神经网络 | 空间转录组学数据 | 60个聚类场景 |
| 7196 | 2024-10-16 |
Hunger signalling in the olfactory bulb primes exploration, food-seeking and peripheral metabolism
2024-Nov, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.102025
PMID:39236785
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研究论文 | 研究探讨了嗅球中的胃饥饿素受体（GHSRs）对嗅觉功能、觅食行为和代谢的影响 | 首次评估了嗅球中胃饥饿素受体对嗅觉功能、觅食行为和代谢的具体机制及其影响 | 研究仅限于小鼠模型，结果的普遍性和在人类中的适用性尚不清楚 | 探讨胃饥饿素受体在嗅球中的作用及其对行为和代谢的影响 | 小鼠的嗅觉功能、觅食行为和代谢 | NA | NA | scRNA-seq和空间转录组学 | NA | NA | 小鼠模型，具体数量未明确 |
| 7197 | 2024-10-16 |
Localized ablative immunotherapy enhances antitumor immunity by modulating the transcriptome of tumor-infiltrating Gamma delta T cells
2024-Nov-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217267
PMID:39307410
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研究论文 | 研究局部消融免疫疗法通过调节肿瘤浸润γδT细胞的转录组增强抗肿瘤免疫 | 首次使用单细胞RNA测序研究局部消融免疫疗法对肿瘤浸润γδT细胞的影响，并发现其与免疫检查点抑制剂治疗的转录组特征相似 | 研究仅在乳腺癌小鼠模型中进行，结果的普适性需进一步验证 | 探讨局部消融免疫疗法对肿瘤浸润γδT细胞转录组的影响及其在抗肿瘤免疫中的作用 | 肿瘤浸润γδT细胞及其在不同治疗条件下的功能动态 | 免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型中的乳腺癌肿瘤样本 |
| 7198 | 2024-10-16 |
Spatial Transcriptomic Signatures of Early Acute T Cell-mediated Rejection in Kidney Transplants
2024-Nov, Transplantation direct
IF:1.9Q3
DOI:10.1097/TXD.0000000000001705
PMID:39399058
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研究论文 | 研究肾脏移植中急性T细胞介导排斥反应的早期空间转录组特征 | 发现非T细胞因素在急性T细胞介导排斥反应中的潜在作用，并揭示了先天免疫系统在排斥反应中的作用 | 研究样本量较小，需要进一步验证和扩大样本以确认结果的普遍性 | 探讨急性T细胞介导排斥反应的早期空间转录组特征及其相关免疫机制 | 肾脏移植中的急性T细胞介导排斥反应 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 9天手术后的活检样本，包括疑似急性T细胞介导排斥反应和非T细胞介导排斥反应患者 |
| 7199 | 2024-10-16 |
Tumor-Secreted Extracellular Vesicles Counteract Therapy Response by Triggering Inflammatory Mesenchymal Stem Cell Development
2024-Oct-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-4097
PMID:39115426
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研究论文 | 本文研究了肿瘤分泌的细胞外囊泡通过触发炎症性间充质干细胞的发育来对抗治疗反应的机制 | 首次揭示了肿瘤分泌的细胞外囊泡触发炎症性间充质干细胞的发育，并提出了通过阻断下游通路来克服药物抵抗的策略 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本的单细胞RNA测序数据，需要进一步的临床验证 | 探讨骨癌治疗中药物抵抗的微环境因素，并寻找克服这种抵抗的策略 | 炎症性间充质干细胞及其在骨癌治疗中的作用 | 数字病理学 | 骨癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括骨癌和多发性骨髓瘤患者的活检样本以及小鼠模型 |
| 7200 | 2024-10-16 |
Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneity of ALI model and epithelial cell alterations after exposure to electronic cigarette aerosol
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38552
PMID:39397927
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序揭示了电子烟气溶胶暴露后ALI模型和人支气管上皮细胞的异质性及上皮细胞的改变 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示了电子烟气溶胶对人类支气管上皮细胞的转录异质性和细胞类型特异性反应 | 研究仅限于急性暴露后的短期效应，未探讨长期暴露的影响 | 探讨电子烟气溶胶对支气管上皮细胞的影响及其潜在机制 | 人支气管上皮细胞（ALI-HBE）及其在电子烟气溶胶暴露后的转录变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多种细胞类型，包括基底细胞、纤毛细胞和分泌细胞 |