单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 7181 - 7200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7181 | 2024-10-19 |
Characterization of Ucp1-iCre knockin mice reveals the recombination activity in male germ cells
2024-Oct-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00128.2024
PMID:39230395
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研究论文 | 本文研究了Ucp1-iCre敲入小鼠的Cre重组活性，特别是在雄性生殖细胞中的表现 | 通过靶向插入IRES-Cre盒，生成了Ucp1-iCre小鼠，减少了Cre在非脂肪组织中的异位活性 | Ucp1-iCre小鼠在某些组织中仍表现出有限的Cre活性，需要谨慎进行小鼠交配和基因分型 | 验证Ucp1-iCre敲入小鼠在脂肪组织中的特异性基因操作能力 | Ucp1-iCre敲入小鼠及其在脂肪组织和生殖细胞中的Cre重组活性 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 涉及Ucp1-iCre小鼠和Rosa-tdTomato报告小鼠的杂交后代 |
| 7182 | 2024-10-19 |
vSPACE: exploring virtual spatial representation of articular chondrocytes at the single-cell level
2024-Oct-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae568
PMID:39363499
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研究论文 | vSPACE是一个基于网络的应用程序，通过模拟空间转录组技术，以虚拟方式展示人类关节软骨细胞的单细胞RNA测序数据的空间表达模式 | vSPACE通过虚拟二维图展示人类关节软骨细胞的基因表达模式，揭示了科学家可以理解的沿区域轴的推断空间分布模式 | NA | 探索关节软骨细胞在单细胞水平上的虚拟空间表达模式 | 人类关节软骨细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7183 | 2024-10-19 |
Integrated analysis of bulk and single-cell RNA-seq data reveals cell differentiation-related subtypes and a scoring system in bladder cancer
2024-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70111
PMID:39400959
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据，揭示了膀胱癌中与细胞分化相关的分子亚型及其预后意义 | 首次探索了与细胞分化相关基因（CDR）相关的分子亚型及其预后影响，并开发了CDR评分系统 | NA | 揭示膀胱癌中与细胞分化相关的分子亚型及其预后意义 | 膀胱癌患者及其分子亚型 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序 | Lasso回归和Cox回归 | 单细胞RNA测序数据 | 两个GEO单细胞数据集 |
| 7184 | 2024-10-19 |
Clustering scRNA-seq data with the cross-view collaborative information fusion strategy
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae511
PMID:39402696
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研究论文 | 本文介绍了一种基于信息瓶颈（IB）和跨视图融合策略的新型单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据聚类算法scCFIB | scCFIB算法通过信息瓶颈处理高维稀疏数据，并采用跨视图融合策略实现稳健的细胞聚类 | NA | 开发一种高效的scRNA-seq数据聚类方法 | scRNA-seq数据中的细胞聚类 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 信息瓶颈（IB） | 基因表达数据 | 多种scRNA-seq数据集 |
| 7185 | 2024-10-19 |
Deciphering the Complexities of Pulmonary Hypertension: The Emergent Role of Single-Cell Omics
2024-Aug-14, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0145PS
PMID:39141563
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综述 | 本文探讨了单细胞组学技术在肺动脉高压研究中的新兴作用 | 利用单细胞转录组学技术，研究人员能够解析肺部复杂的细胞生态系统，识别出在肺动脉高压发病机制中起关键作用的细胞类型，如内皮细胞、平滑肌细胞、周细胞和免疫细胞 | 需要提高单细胞转录组学的分辨率以捕捉更精细的细胞变化，克服处理人类组织样本的物流障碍，并整合多种组学方法以全面理解肺动脉高压的分子基础 | 深入探讨单细胞组学技术在肺动脉高压研究中的应用，揭示其对理解这一复杂疾病的贡献 | 肺动脉高压的细胞生态系统及其在疾病发病机制中的作用 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞转录组学（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 7186 | 2024-10-19 |
The role of HPV11 E7 in modulating STING-dependent interferon β response in recurrent respiratory papillomatosis
2024-May-14, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01925-23
PMID:38624230
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研究论文 | 研究HPV11 E7在复发性呼吸道乳头状瘤病中调节STING依赖性干扰素β反应的作用 | 首次揭示了HPV11 E7通过抑制STING蛋白的磷酸化来逃避宿主的抗病毒反应，并展示了激活的巨噬细胞在抗病毒免疫中的潜在作用 | 研究主要集中在细胞模型和单细胞RNA测序分析上，缺乏临床试验数据支持 | 探讨HPV在复发性呼吸道乳头状瘤病中逃避宿主先天免疫反应的机制 | 复发性呼吸道乳头状瘤病样本中的免疫细胞状态和HPV感染的细胞模型 | NA | 复发性呼吸道乳头状瘤病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个复发性呼吸道乳头状瘤病样本 |
| 7187 | 2024-10-19 |
Human Motor Neurons Elicit Pathological Hallmarks of ALS and Reveal Potential Biomarkers of the Disease in Response to Prolonged IFNγ Exposure
2024-Apr-17, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1787-23.2024
PMID:38413232
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研究论文 | 研究探讨了人类运动神经元在长时间IFNγ暴露下表现出ALS病理特征，并揭示了潜在的ALS生物标志物 | 首次展示了长时间IFNγ暴露下人类运动神经元中TDP-43的严重细胞质聚集，并发现PD-L1表达增加可能与ALS发展有关 | 研究主要集中在体外实验，缺乏体内验证；样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探讨IFNγ暴露对人类运动神经元的影响，揭示ALS病理机制和潜在治疗靶点 | 人类诱导多能干细胞衍生的脊髓运动神经元 | 神经科学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 7188 | 2024-10-19 |
Single-cell and Spatial Transcriptomics Identified Fatty Acid-binding Proteins Controlling Endothelial Glycolytic and Arterial Programming in Pulmonary Hypertension
2024-Apr-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.11.579846
PMID:38370670
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研究论文 | 研究通过单细胞和空间转录组学技术，发现脂肪酸结合蛋白在肺动脉高压中的调控作用 | 首次揭示了FABP4和FABP5在肺动脉高压中的异常表达及其对内皮细胞糖酵解和远端动脉编程的影响 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本，需要进一步在更多临床样本中验证 | 探讨肺动脉高压的细胞和分子机制，为开发新的治疗方法提供依据 | 肺动脉高压患者的内皮细胞和肺组织 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、空间转录组学分析 | NA | RNA | 包括CKO小鼠、IPAH患者和PH大鼠的肺动脉内皮细胞及肺组织 |
| 7189 | 2024-10-19 |
Aneuploid embryonic stem cells drive teratoma metastasis
2024-Feb-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45265-4
PMID:38316790
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研究论文 | 研究探讨了非整倍体胚胎干细胞驱动的畸胎瘤转移机制 | 首次证明了非整倍体胚胎干细胞衍生的畸胎瘤能够转移到多个器官，且不需要额外的拷贝数变异 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类癌症中验证 | 探索非整倍体在癌症转移中的因果关系 | 非整倍体和二倍体胚胎干细胞衍生的畸胎瘤 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胚胎干细胞及其衍生的畸胎瘤 |
| 7190 | 2024-10-19 |
Single-cell sequencing dissects the transcriptional identity of activated fibroblasts and identifies novel persistent distal tubular injury patterns in kidney fibrosis
2024-01-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-50195-0
PMID:38172172
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析，揭示了激活的成纤维细胞和肾小管上皮细胞损伤的转录特征，并发现了肾纤维化中新的远端小管损伤模式 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了肾纤维化中激活的成纤维细胞的分子和细胞景观，并发现了新的远端小管损伤模式 | NA | 深入理解肾纤维化的机制，并为慢性肾病（CKD）的靶向治疗提供新策略 | 肾纤维化中的激活成纤维细胞和肾小管上皮细胞损伤 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 两个临床相关的肾纤维化模型 |
| 7191 | 2024-10-19 |
An overview of the detection of bovine respiratory disease complex pathogens using immunohistochemistry: emerging trends and opportunities
2024-Jan, Journal of veterinary diagnostic investigation : official publication of the American Association of Veterinary Laboratory Diagnosticians, Inc
IF:1.2Q3
DOI:10.1177/10406387231210489
PMID:37982437
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综述 | 本文综述了使用免疫组织化学（IHC）检测牛呼吸道疾病复合体（BRDC）病原体的技术和方法，并探讨了新兴趋势和机会 | 本文介绍了多重IHC用于检测共感染、数字成像和自动化、改进的荧光染料检测系统以及IHC与空间转录组学的整合等新兴趋势 | NA | 探讨IHC在BRDC研究中的应用及其未来发展方向 | 牛呼吸道疾病复合体（BRDC）病原体及其相关技术 | NA | 牛呼吸道疾病 | 免疫组织化学（IHC） | NA | NA | NA |
| 7192 | 2024-10-19 |
Inflammatory Alterations to Renal Lymphatic Endothelial Cell Gene Expression in Mouse Models of Hypertension
2024, Kidney & blood pressure research
IF:2.3Q2
DOI:10.1159/000539721
PMID:38972305
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研究论文 | 研究了高血压模型小鼠肾脏淋巴内皮细胞基因表达的炎症变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了高血压模型小鼠肾脏淋巴内皮细胞的基因表达变化，并发现了与炎症相关的基因和通路 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 评估高血压状态下肾脏淋巴内皮细胞的具体变化 | 高血压模型小鼠的肾脏淋巴内皮细胞 | 心血管疾病 | 高血压 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了高血压模型小鼠的肾脏CD31+和podoplanin+细胞 |
| 7193 | 2024-10-19 |
Lung lymphatic endothelial cells undergo inflammatory and prothrombotic changes in a model of chronic obstructive pulmonary disease
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1344070
PMID:38440076
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研究论文 | 研究了慢性阻塞性肺疾病（COPD）模型中肺淋巴内皮细胞的炎症和促凝血变化 | 首次探讨了香烟烟雾和凝血酶对肺淋巴内皮细胞的直接影响，并发现这些因素导致细胞的纤维蛋白溶解活性降低和炎症标志物表达增加 | 需要进一步研究这些变化如何影响淋巴功能并驱动COPD中的组织损伤 | 探讨COPD中肺淋巴内皮细胞的炎症和促凝血变化 | 肺淋巴内皮细胞 | NA | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA测序，免疫组织化学染色 | NA | RNA | 使用了来自COPD患者和对照组的肺组织样本，以及暴露于香烟烟雾的小鼠肺淋巴内皮细胞 |
| 7194 | 2024-10-19 |
Cluster of differentiation-44 as a novel biomarker of lupus nephritis and its role in kidney inflammation and fibrosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1443153
PMID:39411720
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研究论文 | 研究CD44作为狼疮性肾炎的新型生物标志物及其在肾脏炎症和纤维化中的作用 | 首次探讨CD44在狼疮性肾炎中的病理作用，并验证其作为早期诊断标志物的潜力 | 研究仅限于小鼠模型和部分患者样本，需进一步临床验证 | 探讨CD44在狼疮性肾炎中的作用及其作为生物标志物的潜力 | CD44在狼疮性肾炎患者和小鼠模型中的表达及其与肾脏炎症和纤维化的关系 | NA | 狼疮性肾炎 | ELISA, ScRNA-Seq | NA | 血液, 肾脏组织 | NZB/W F1小鼠模型, 狼疮性肾炎患者 |
| 7195 | 2024-10-19 |
Single-cell profiling of cellular changes in the somatic peripheral nerves following nerve injury
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1448253
PMID:39415832
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在周围神经损伤后背根神经节和周围神经中的最新发现，揭示了周围神经的细胞异质性和损伤后的变化 | 提供了单细胞分辨率下周围神经损伤后细胞变化的全面和深入的视角 | NA | 探讨周围神经损伤后的病理变化，为神经再生治疗的发展提供基础 | 周围神经损伤后的背根神经节和周围神经的单细胞转录组状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 7196 | 2024-10-19 |
Attenuation of aggressive tumor progression of anaplastic thyroid cancer by p53
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/KXJJ8824
PMID:39417187
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研究论文 | 研究探讨了野生型p53在抑制未分化甲状腺癌（ATC）进展中的作用 | 首次证明了外源表达的野生型p53能够抑制突变型p53的致癌作用，并提出了使用CRISPR/Cas9基因编辑技术修改p53等位基因以治疗ATC的可能性 | 研究仅限于细胞和动物模型，尚未在临床试验中验证 | 探讨野生型p53在抑制未分化甲状腺癌进展中的作用 | 未分化甲状腺癌细胞（8505C细胞）和其异种移植小鼠模型 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用了8505C细胞及其表达野生型和突变型p53的变体，以及相应的异种移植小鼠模型 |
| 7197 | 2024-10-19 |
Comprehensive analysis of the potential biological significance of cuproptosis-related gene LIPT2 in pan-cancer prognosis and immunotherapy
2023-12-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-50039-x
PMID:38129565
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研究论文 | 本文分析了铜死亡相关基因LIPT2在泛癌预后和免疫治疗中的潜在生物学意义 | 首次全面评估了LIPT2基因在多种癌症中的表达水平及其对预后的影响，并探讨了其在免疫治疗中的潜在作用 | 研究主要基于生物信息学方法，缺乏实验验证 | 探讨LIPT2在泛癌中的生物学功能及其在预后和免疫治疗中的潜在意义 | LIPT2基因在多种癌症中的表达及其对预后和免疫治疗的影响 | NA | NA | 生物信息学方法，单细胞测序 | NA | 基因表达数据，突变数据，甲基化数据，免疫状态数据 | 涉及多种癌症类型的样本 |
| 7198 | 2024-10-19 |
Assessing GPT-4 for cell type annotation in single-cell RNA-seq analysis
2023-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.16.537094
PMID:37131626
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研究论文 | 评估GPT-4在单细胞RNA测序分析中进行细胞类型注释的性能 | 利用GPT-4这一强大的大型语言模型，自动且准确地通过标准单细胞RNA测序分析管道生成的标记基因信息进行细胞类型注释 | NA | 评估GPT-4在细胞类型注释中的应用潜力，并开发相应的开源软件包 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | GPT-4 | 基因表达数据 | 数百种组织类型和细胞类型 |
| 7199 | 2024-10-19 |
Fishing Innate Immune System Properties through the Transcriptomic Single-Cell Data of Teleostei
2023-Dec-12, Biology
DOI:10.3390/biology12121516
PMID:38132342
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研究论文 | 本文总结了与鱼类先天免疫系统（IIS）相关的单细胞RNA测序（scRNAseq）和空间转录组学实验数据 | 本文首次系统地总结了鱼类先天免疫系统的单细胞RNA测序数据，并提出了对非模式鱼类进行新实验的必要性 | 目前只有少数scRNAseq数据可用于其他鱼类，且缺乏对非模式鱼类的研究 | 研究鱼类先天免疫系统的特性和多样性 | 鱼类的先天免疫系统 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | 涉及多种鱼类器官和发育阶段的多个scRNAseq实验数据 |
| 7200 | 2024-10-19 |
Consensus scHPF Identifies Cell Type-Specific Drug Responses in Glioma by Integrating Large-Scale scRNA-seq
2023-Dec-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.05.570193
PMID:38105955
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研究论文 | 本文介绍了一种名为共识scHPF的贝叶斯矩阵分解算法，用于整合大规模单细胞RNA测序数据，以识别胶质瘤中特定细胞类型的药物反应 | 提出了共识scHPF算法，通过分析多个随机初始化的scHPF模型，识别最稳健的基因特征并自动确定给定数据集的因子数量 | NA | 开发一种新的算法来整合复杂的单细胞RNA测序数据，以识别特定细胞类型的药物反应 | 胶质瘤切片培养样本，包括19名患者、10种药物治疗条件和52个样本 | 单细胞RNA测序 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯矩阵分解 | 基因表达数据 | 19名患者，10种药物治疗条件，52个样本 |