单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 39758 篇文献，本页显示第 701 - 720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2026-05-21 |
Infection of 5xFAD mice with a mouse-adapted SARS-CoV-2 does not alter Alzheimer's disease neuropathology yet induces widespread changes in gene expression across diverse cell types
2026-04, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.71394
PMID:42029189
|
研究论文 | 研究小鼠适应性SARS-CoV-2感染对5xFAD小鼠阿尔茨海默病神经病理学及基因表达的影响 | 首次使用小鼠适应性SARS-CoV-2感染老年5xFAD小鼠模型，结合空间转录组学分析未直接感染脑部病毒情况下对多种细胞类型基因表达的广泛影响 | 未在脑内检测到病毒RNA，感染可能未直接作用于中枢神经系统，且研究仅限于小鼠模型，可能无法完全反映人类SARS-CoV-2感染对阿尔茨海默病的影响 | 探究SARS-CoV-2感染是否加重阿尔茨海默病神经病理学及疾病进展 | 老年5xFAD和野生型小鼠 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 老年5xFAD和野生型小鼠 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 702 | 2026-05-19 |
Dysregulated landscape of RNA-binding proteins in unexplained recurrent spontaneous abortion revealed by bulk and single-cell transcriptome
2026-Apr-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-45052-9
PMID:41922522
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 703 | 2026-05-21 |
Delta family protocadherins contribute to protoglomerular targeting of olfactory sensory neuron axons in the olfactory bulb
2026-Apr, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1012090
PMID:41920906
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别斑马鱼嗅觉感觉神经元中差异表达的轴突导向基因，发现δ-原钙黏蛋白家族成员在嗅球原肾小球靶向中发挥关键作用 | 首次揭示δ1-和δ2-原钙黏蛋白家族成员分别特异性调控不同亚群嗅觉感觉神经元轴突靶向特定原肾小球区域 | 未明确阐述研究限制 | 阐明嗅觉感觉神经元轴突定向连接嗅球原肾小球的分子机制 | 斑马鱼嗅觉感觉神经元及其轴突在原肾小球中的靶向行为 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼嗅觉感觉神经元（具体样本数未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 704 | 2026-05-21 |
Spike-in probe-enhanced single-cell RNA-seq reveals post-infusion transcriptomic remodeling of "prime-and-kill" synNotch-CAR-T cells
2026-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.26.713760
PMID:41929125
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研究论文 | 开发了一种带有外源探针的增强型单细胞RNA测序工作流程，用于追踪和分析“prime-and-kill” synNotch-CAR-T细胞输注后的转录组重塑 | 首次采用定制外源探针增强单细胞RNA测序技术检测synNotch-CAR转录本，结合机器学习辅助分类器实现工程化细胞的高特异性和高灵敏度检测 | 外源探针检测敏感性在不同细胞类型间存在差异（E-SYNC细胞78.2% vs B-SYNC细胞60.0%），可能影响低丰度细胞的全面捕获 | 开发能够同时检测工程化细胞并进行转录组分析的单细胞RNA测序工作流程，以解析synNotch-CAR-T细胞输注后的动态行为 | 针对胶质母细胞瘤的synNotch-CAR-T细胞（E-SYNC和B-SYNC系统） | 机器学习、数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、外源探针设计、机器学习辅助分类器 | NA | 单细胞转录组数据 | 胶质母细胞瘤异种移植模型中的脾脏、肺和脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 705 | 2026-05-21 |
NetTracer3D Enables User-Friendly Analysis of Diverse Microscopic and Medical 3D Datasets
2026-Mar-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.25.714104
PMID:41929015
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研究论文 | NetTracer3D 是一个用于分析多样化显微与医学3D数据集的用户友好型工具 | NetTracer3D 提供了三种广泛适用的网络分析模式（连接网络、分支邻接与分支点网络、邻近网络），并支持标准化数据格式和交互式探索，简化了3D图像分析流程 | 文章未明确提及局限性 | 开发一个集成工具，简化三维图像分析，促进不同数据集之间的整合、共享和分析 | 人类和小鼠肾脏、小鼠支气管、人类脑血管造影、淋巴结以及3D光片癌症图像 | 计算机视觉 | 癌症 | CODEX, 无标记拉曼光谱, 光片显微镜 | 网络分析模型（连接网络、分支邻接与分支点网络、邻近网络） | 图像 | 多种样本，包括人类和小鼠肾脏、小鼠支气管、人类脑血管造影、淋巴结及3D光片癌症图像 | NA | 空间转录组学, CODEX | NA | NA |
| 706 | 2026-05-21 |
Cross-Species Multi-Omics Profiling Identifies Conserved Activated Valvular Interstitial Cell Population Driving Myxomatous Mitral Valve Degeneration
2026-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.23.713796
PMID:41929066
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研究论文 | 跨物种多组学分析揭示了在粘液样二尖瓣退行性变中保守的活化瓣膜间质细胞群 | 首次通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学，跨物种（小鼠和人类）鉴定出一个保守的活化瓣膜间质细胞群，该细胞群富集促纤维化细胞外基质重塑程序，并优先定位于机械脆弱区域 | 研究生效细胞群的因果关系验证尚不充分，且人类样本数量有限 | 解析粘液样二尖瓣退行性变中瓣膜间质细胞的分子异质性及其在疾病发病机制中的状态特异性贡献 | 纤维蛋白-1缺陷小鼠模型和人类二尖瓣组织标本（包括正常、散发性二尖瓣脱垂和马凡综合征相关二尖瓣脱垂） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间表达数据 | 包含小鼠和人类样本，具体样本数未在摘要中说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 707 | 2026-05-21 |
Vascular invasion-associated gene expression is detectable in pre-surgical biopsies of stage I lung adenocarcinoma
2026-Mar-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70600-2
PMID:41876493
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研究论文 | 检测I期肺腺癌术前活检标本中与血管侵犯相关的基因表达，以预测复发和手术获益 | 发现血管侵犯相关的基因特征在肿瘤侵袭灶之外也可检测到，并在术前活检中具有区分VI的潜力，支持术前风险分层 | 文中未明确提及具体局限性 | 识别能预测I期肺腺癌血管侵犯的生物标志物，以改善术前风险分层 | I期肺腺癌肿瘤样本，包括切除肿瘤和术前活检标本 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 162个切除肿瘤样本，及其子集用于空间转录组学；独立验证队列和多区域采样数据；术前活检队列 | Illumina | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | Illumina NovaSeq, 空间转录组平台未详述 | bulk RNA测序使用Illumina平台，空间转录组学用于部分子集 |
| 708 | 2026-05-21 |
ZMAP: A single-cell meta-atlas of zebrafish embryonic development reveals a consensus hierarchy of cell identities
2026-Mar-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.23.713599
PMID:41928926
|
研究论文 | 整合8个斑马鱼胚胎单细胞RNA测序数据集，构建统一参考图谱ZMAP，揭示细胞身份的分层共识 | 通过整合多个独立数据集，建立斑马鱼胚胎发育的共识层次注释本体和标记基因发现流水线，并提供交互式网络工具 | 未提及具体局限性，但跨研究整合可能受限于数据批次效应和原始注释差异 | 构建斑马鱼胚胎发育的单细胞整合参考图谱，实现跨研究一致性注释和细胞身份共识推断 | 斑马鱼胚胎发育中的单个细胞 | 计算生物学， 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 798,790个细胞，覆盖15个发育时间窗口 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 整合8个已发表的斑马鱼全胚胎scRNA-seq数据集 |
| 709 | 2026-05-21 |
Endometrial Hyperplasia Risk Is Increased by High-Fat Diet Via Estrogen-Driven Stromal Fibroblast Reprogramming Toward a Pro-Fibrotic State
2026-Mar-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.20.713224
PMID:41929061
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析高脂饮食如何通过雌激素驱动的基质成纤维细胞重编程增加子宫内膜增生风险 | 首次揭示高脂饮食通过雌激素信号驱动成纤维细胞向促纤维化状态重编程，从而连接雌激素优势、基质纤维化、免疫清除缺陷和子宫内膜增生易感性之间的机制 | 研究基于小鼠模型，可能不完全代表人类子宫内膜增生的病理机制 | 阐明肥胖如何改变子宫内膜细胞状态并增加子宫内膜增生风险 | 对照饮食或高脂饮食喂养的对照小鼠和易发子宫内膜增生小鼠的子宫内膜组织 | 数字病理学 | 子宫内膜增生 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 对照饮食和高脂饮食喂养的小鼠子宫内膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 710 | 2026-05-21 |
Intranasal HSV-1 Infection Drives Region-Specific Interferon-Dominant Microglial Remodeling
2026-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.13.711627
PMID:41928984
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研究论文 | 利用多组学框架研究鼻内HSV-1感染如何驱动小胶质细胞区域特异性干扰素主导的重塑 | 首次整合单核RNA测序、染色质可及性分析和空间转录组学，在生理相关的鼻内HSV-1感染模型中解析小胶质细胞反应的转录和表观遗传机制 | 未提及明确限制 | 阐明急性HSV-1感染体内小胶质细胞反应的转录和表观遗传机制 | 鼻内HSV-1感染小鼠模型中的小胶质细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单核RNA测序、染色质可及性分析、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 711 | 2026-05-21 |
Spatial transcriptomics identifies dysregulated programs across neural and non-neural tissues in spinal muscular atrophy
2026-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.20.713154
PMID:41929160
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研究论文 | 利用空间转录组学技术识别脊髓性肌萎缩症中神经和非神经组织的失调程序 | 首次在症状前SMA小鼠模型中使用空间转录组学分析整个腰椎区域的多组织转录变化，揭示了SMN缺乏在运动神经元丢失前即引起广泛组织重编程 | NA | 阐明SMN缺乏在神经和周围组织中的早期转录后果 | 症状前SMA小鼠和对照小鼠的腰椎横截面 | 数字病理学 | 脊髓性肌萎缩症 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | SMA小鼠和对照小鼠（数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 712 | 2026-05-21 |
Longitudinal Profiling of Tumor and Immune Compartments Uncovers Patterns of Dysregulation and Associations with Response in Multiple Myeloma
2026-Mar-04, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-25-0205
PMID:41364805
|
研究论文 | 通过对多发性骨髓瘤患者的纵向多组学分析，揭示了肿瘤与免疫微环境的动态相互作用及其与治疗反应的相关性 | 首次在纵向队列中整合单细胞RNA测序和批量测序数据，系统描绘多发性骨髓瘤免疫微环境的动态变化，并识别幼稚B细胞重建作为持久治疗反应的生物标志物 | 未详细阐述样本异质性或验证队列的局限性，可能限制结论的普适性 | 探究多发性骨髓瘤中治疗反应与疾病进展的免疫相关因素 | 102例多发性骨髓瘤患者的243份骨髓样本，包含631,226个细胞 | 自然语言处理 | 多发性骨髓瘤 | RNA-seq、全基因组测序、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据、基因组序列数据 | 102名患者的243份骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq、全基因组测序 | NA | NA |
| 713 | 2026-05-21 |
Tumor-infiltrating natural killer cell profiling for therapeutic stratification in patients with resectable non-small cell lung cancer
2026-Mar-04, The Journal of thoracic and cardiovascular surgery
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.jtcvs.2026.02.030
PMID:41791482
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肿瘤浸润自然杀伤细胞亚型，为非小细胞肺癌患者治疗分层提供依据 | 首次发现吸烟相关的两种自然杀伤细胞亚型（应激反应性和适应性免疫调节性）可预测手术或新辅助化学免疫治疗的疗效，为治疗策略优化提供细胞层面标志 | 样本量有限（单细胞RNA测序61例，验证集19例，转录组去卷积102例及24例新辅助治疗患者），结论需更大规模队列验证；仅基于转录组分析，缺乏功能性实验验证 | 识别与吸烟相关的免疫细胞决定因素，以指导可切除非小细胞肺癌的治疗分层 | 非小细胞肺癌患者肿瘤组织及相邻肺组织中的自然杀伤细胞亚型 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 61例肺组织（单细胞RNA测序）、19例侵袭性肺腺癌（验证）、102例切除非小细胞肺癌（批量RNA测序）、24例新辅助化学免疫治疗患者（批量RNA测序） | Illumina, 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | Illumina NovaSeq, 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台处理单细胞RNA-seq；Illumina NovaSeq用于批量RNA测序 |
| 714 | 2026-05-21 |
Multiscale confidence quantification for virtual spatial transcriptomics with UTOPIA
2026-Mar-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.01.708850
PMID:41847009
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研究论文 | 提出了UTOPIA框架，用于虚拟空间转录组学的多尺度置信度量化，从组织学图像预测基因表达或细胞类型 | 提出了模型无关的UTOPIA框架，能对虚拟空间转录组预测进行统计校准的置信度评分，并控制基因和细胞类型检测的假发现率 | NA | 解决虚拟空间转录组学预测的统计可靠性问题，确保预测的可信度并防止虚假生物学结论 | 虚拟空间转录组学预测的空间分辨率和生物粒度 | 计算机视觉, 机器学习 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 715 | 2026-05-21 |
Chronic cerebral hypoperfusion exacerbates amyloid and tau pathology by impairing glymphatic transport via AQP4- and VEGF-mediated pathways: insights from a vascular to mixed-type dementia model
2026-03, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.71290
PMID:41841574
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研究论文 | 本研究探讨慢性脑低灌注通过AQP4和VEGF介导的通路损伤类淋巴运输，加剧淀粉样蛋白和tau蛋白病理，并构建从血管性到混合型痴呆的模型 | 首次揭示CCH通过AQP4去极化和VEGF抑制导致类淋巴功能障碍及毒性蛋白积累的机制，并发现恢复血管张力可改善认知功能 | 未提及具体局限性 | 阐明慢性脑低灌注导致认知障碍的机制及其与神经退行性疾病的关系 | APP/PS1转基因小鼠和野生型小鼠 | 神经科学 | 血管性痴呆,阿尔茨海默病 | 磁共振成像,单细胞RNA测序,免疫荧光染色 | NA | 图像,基因表达数据 | 小鼠模型样本量未明确说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 716 | 2026-05-21 |
Population and single-cell analyses reveal immune cell-specific expression profiles associated with Alzheimer's disease risk
2026-03, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.71282
PMID:41866337
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研究论文 | 通过群体和单细胞分析揭示了与阿尔茨海默病风险相关的免疫细胞特异性表达谱 | 整合孟德尔随机化、共定位分析和单细胞表达数量性状位点数据，结合脑组织空间转录组学，鉴定了13个与AD风险相关的基因，并揭示了其在未刺激和刺激的外周免疫细胞及脑浸润免疫细胞中的细胞类型和状态特异性表达 | NA | 探究外周免疫系统失调增加阿尔茨海默病风险的细胞类型特异性机制 | 阿尔茨海默病患者的外周免疫细胞和脑组织样本 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 基因组关联研究 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 基因组关联研究样本量455,258 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 717 | 2026-05-21 |
Harnessing Inflammatory Monocytes to Overcome Resistance to Anti-PD-1 Immunotherapy
2026-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.05.704029
PMID:41676732
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研究论文 | 研究利用炎症单核细胞克服抗PD-1免疫治疗耐药性的机制 | 发现CD40激动剂抗体可通过诱导炎症单核细胞产生IFNγ应答，在缺乏抗原呈递的肿瘤中激活CD8+ T细胞和NK细胞，从而克服免疫检查点抑制剂耐药性 | 研究基于小鼠模型和公开数据库分析，尚未在临床试验中验证 | 探索克服抗PD-1免疫治疗获得性耐药的策略 | B2m缺失的黑色素瘤和结直肠癌小鼠模型以及人类肿瘤样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤，结直肠癌 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，体外功能实验，RNA测序数据分析 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据，体外功能数据 | 小鼠模型（具体数量未说明）及已发表的人类RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 718 | 2026-05-21 |
Gain of function NOTCH4 variants disrupt angiogenesis in systemic sclerosis
2026-Feb-04, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.12.015
PMID:41644364
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研究论文 | 本研究揭示了NOTCH4基因功能获得性变异在系统性硬化症中破坏血管生成的作用机制 | 首次发现NOTCH4基因变异与非洲裔美国系统性硬化症患者更严重的血管表型相关，并证明通过抑制NOTCH4信号可恢复血管生成 | 未明确说明研究局限性 | 探讨NOTCH4基因在系统性硬化症血管病变中的作用及其治疗潜力 | 非洲裔美国系统性硬化症患者 | 机器学习 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 719 | 2026-05-21 |
Identification of potential drug targets for Alzheimer's disease from genetic insights: A Mendelian randomization study
2026-Jan-30, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000045715
PMID:41630303
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研究论文 | 通过孟德尔随机化研究，从遗传学角度识别阿尔茨海默病的潜在药物靶点 | 结合孟德尔随机化分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络、分子对接和单细胞测序等多种方法，系统性地识别了10个与阿尔茨海默病相关的核心基因，并预测了5个候选药物 | 血浆蛋白数据来源于公开的GWAS汇总统计，样本可能具有人群特异性；孟德尔随机化分析无法完全排除潜在混杂因素；分子对接结果需要进一步的实验验证 | 探索血浆蛋白与阿尔茨海默病之间的因果关系，识别潜在的药物靶点 | 4907种血浆蛋白和阿尔茨海默病 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 孟德尔随机化、分子对接 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 720 | 2026-05-21 |
BDCD: a comprehensive Brain Disease Cell-cell communication Database
2026-Jan-15, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baag017
PMID:41925140
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研究论文 | BDCD是首个专注于脑疾病细胞间通讯网络的综合数据库，整合了来自单细胞RNA-seq和空间转录组学的大量数据 | 首次构建了覆盖多种脑疾病的特异性细胞间通讯资源，整合了配体-受体相互作用与遗传关联、通路和药物调节剂等多维度数据，支持跨疾病比较和动态假说生成 | 现有资源在脑部特异性、区域覆盖和功能注释方面仍存在局限，且数据库可能尚未涵盖所有已知脑疾病或最新研究数据 | 为脑疾病病理机制和治疗发现提供综合性的细胞间通讯资源 | 脑疾病中涉及的单细胞和空间转录组数据，覆盖阿尔茨海默病、帕金森病、精神分裂症、双相情感障碍和多发性硬化症 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病, 帕金森病, 精神分裂症, 双相情感障碍, 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 8519425个单细胞和140744个空间转录组点，来自38个手动整理的数据集，涵盖14个脑区和13种经典细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |