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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2026-06-26 |
Molecular signatures and signaling interactions of the hair follicle stem cell niche
2026-Jul, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.11.021
PMID:41407191
|
研究论文 | 通过流式分选和全转录组测序,深入解析毛囊干细胞微环境中的分子特征及信号相互作用 | 利用56个全转录组测量进行跨比较,以前所未有的灵敏度分类细胞类型特异性分子特征,并与过去20年间15项研究联合分析,发现了许多之前未描述的毛乳头、隆突干细胞和毛胚干细胞基因 | 低检测灵敏度限制了基因表达的发现深度 | 深入理解毛囊干细胞及其指导性微环境的独特基因表达程序 | 小鼠背侧皮肤中的毛乳头细胞、隆突干细胞、毛胚干细胞、表皮和毛囊上皮细胞以及真皮成纤维细胞 | 机器学习 | NA | 全转录组测序,流式分选 | NA | 转录组数据 | 4个小鼠背侧皮肤区域的各细胞群体,共56个全转录组测量 | NA | 全转录组测序 | NA | NA |
| 702 | 2026-06-26 |
Single-cell and spatial transcriptomics implicate vascular cell orchestration of inflammatory changes after UV light exposure in skin
2026-Jul, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.11.024
PMID:41419052
|
研究论文 | 利用单细胞和空间转录组学分析紫外线照射后皮肤细胞变化,揭示血管细胞协调炎症反应 | 首次通过空间转录组学和单细胞RNA测序相结合,揭示急性紫外线照射后皮肤中角质形成细胞、成纤维细胞、内皮细胞和免疫细胞的顺序激活机制 | 该研究仅在小鼠模型中评估了紫外线照射后的早期时间点(12小时),且样本量未明确说明 | 阐明急性紫外线照射对皮肤组织的复杂效应及细胞间相互作用机制 | 小鼠皮肤组织(包括表皮、深真皮层和脂肪组织) | 数字病理学 | 皮肤相关疾病(如皮肤狼疮) | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 图像(空间转录组数据)和文本(基因表达数据) | 小鼠皮肤样本,具体数量未在摘要中说明 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium(空间转录组), 10x Chromium(单细胞RNA测序) | 10x Visium用于空间转录组分析,10x Chromium Single Cell 3'用于单细胞RNA测序 |
| 703 | 2026-06-26 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal mTOR-driven cellular fate of spindle cells and immune evasion in classic Kaposi's sarcoma
2026-Jul, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04063-0
PMID:41525037
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研究论文 | 单细胞和空间转录组学揭示了mTOR驱动经典卡波西肉瘤中梭形细胞的命运和免疫逃逸 | 首次利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示mTOR抑制剂二甲双胍在经典卡波西肉瘤患者中的治疗潜力及其分子机制 | 样本量小,仅2名患者,且未设立对照组 | 评估mTOR抑制剂二甲双胍在经典卡波西肉瘤治疗中的潜力并揭示其分子机制 | 经典卡波西肉瘤患者肿瘤组织中的梭形细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 卡波西肉瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 测序数据 | 2名经典卡波西肉瘤患者的肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 704 | 2026-06-26 |
Integrated Stress Response and Drug-Induced Acute Kidney Injury: Involvement of Activating ATF4-STAT1-GBP2 Signaling
2026-Jul-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000984
PMID:41563239
|
研究论文 | 本研究揭示了整合应激反应在药物诱导急性肾损伤中的作用,特别是ATF4-STAT1-GBP2信号通路促进肾小管上皮细胞焦亡的机制 | 首次发现ATF4作为整合应激反应的主调控因子,通过STAT1-GBP2信号通路促进肾小管上皮细胞焦亡,并验证了通过药理或纳米生物技术抑制ATF4可减轻肾损伤 | 未提及具体局限性 | 阐明整合应激反应和ATF4在药物诱导急性肾损伤中调控焦亡的分子机制 | 药物诱导急性肾损伤中肾小管上皮细胞的焦亡机制 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, 荧光素酶报告基因检测, 共免疫沉淀, Western印迹 | NA | 基因表达数据, 图像 | 人类和小鼠急性肾损伤模型(具体样本量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 705 | 2026-06-26 |
Single-Cell Resolution Drug Effects of Renin-Angiotensin-Aldosterone Blockade in ZSF1 Rat Diabetic Kidney Disease
2026-Jul-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000995
PMID:41563360
|
研究论文 | 利用单细胞转录组学揭示依那普利在ZSF1大鼠糖尿病肾病中的远端肾单位药物效应及其与巨噬细胞的相互作用 | 首次在单细胞分辨率下阐明依那普利通过组织肾素-血管紧张素-醛固酮系统效应物组织蛋白酶D调控远端肾单位损伤状态,并发现TREM2+巨噬细胞是远端肾单位信号的主要接收者 | 研究仅在动物模型中进行,人类肾脏样本的基因签名分层验证仍需进一步验证 | 探索依那普利在糖尿病肾病中的细胞靶点和分子机制 | ZSF1大鼠的肾脏细胞和人类肾脏样本 | 机器学习和数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | ZSF1大鼠肾脏样本(具体数量未提及)及人类肾脏样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 706 | 2026-06-26 |
Single-Cell CRISPR: An Efficient Strategy for Decoding Plant Cis-Regulatory Complexity
2026-Jul, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70647
PMID:41854240
|
综述 | 总结单细胞CRISPR系统在解码植物顺式调控复杂性中的策略与进展 | 强调单细胞CRISPR系统在细胞类型特异性水平上解码顺式调控元件功能的新方法 | 植物研究中应用这些方法仍面临挑战 | 探讨单细胞CRISPR系统在植物顺式调控元件功能基因组分析中的应用潜力 | 植物顺式调控元件及基因表达调控机制 | 机器学习 | NA | 单细胞CRISPR | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 707 | 2026-06-26 |
PERK Is Dispensable for Smooth Muscle Cell Phenotype Switching in Atherosclerosis
2026-Jul, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323869
PMID:42131916
|
研究论文 | 探究PERK蛋白在平滑肌细胞表型转换及动脉粥样硬化中的作用,发现其并非必需 | 通过基因敲除、单细胞转录组和空间转录组学技术,首次系统证明PERK UPR通路在平滑肌细胞表型转换和动脉粥样硬化斑块稳定性中不具有关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据为关联性分析而非因果验证,且未评估其他UPR通路分支的可能代偿作用 | 阐明PERK通路在平滑肌细胞表型转换和动脉粥样硬化斑块稳定性中的功能 | 平滑肌细胞、动脉粥样硬化斑块 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、Xenium空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型(Ldlr-/-成年小鼠)和人类颈动脉斑块样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、Xenium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒、Xenium原位空间转录组学 |
| 708 | 2026-06-26 |
Spatial and Single-Cell Mapping Reveals Valvular Interstitial Cell and Macrophage Sex Differences in Calcific Aortic Valve Disease
2026-Jul, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.126.324694
PMID:42206364
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示钙化性主动脉瓣疾病中瓣膜间质细胞和巨噬细胞的性别差异 | 首次利用单细胞和空间转录组学技术系统解析人类主动脉瓣组织中瓣膜间质细胞和巨噬细胞在钙化位点附近的性别依赖性基因表达差异 | 未明确提及样本量及验证实验的局限性 | 探究钙化性主动脉瓣疾病中瓣膜组织纤维钙化的性别依赖性细胞机制 | 人类主动脉瓣组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RNA原位杂交, 组织学分析, 扫描电子显微镜 | NA | 基因表达数据, 图像 | 健康者和钙化性主动脉瓣疾病患者的主动脉瓣组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 709 | 2026-06-26 |
Piecing together the alveolar-capillary unit: arterial-venous capillary polarization
2026-Jul-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00101.2026
PMID:42227649
|
综述 | 综述肺泡-毛细血管单元中动脉-静脉极化的研究进展 | 强调肺毛细血管内皮细胞中CAP1群体的异质性和修复亚群,揭示动脉-静脉极化及基因表达梯度 | 未提及具体局限性 | 总结肺毛细血管内皮细胞异质性,特别是动脉-静脉极化和修复性祖细胞 | 肺毛细血管内皮细胞 | 数字病理学 | 慢性肺病 | 单细胞转录组学、谱系追踪、表观基因组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 710 | 2026-06-26 |
Identification of PSMA4 as a Therapeutic Target for Atherosclerosis: A Comprehensive Multiomics Mendelian Randomization Analysis
2026-Jul, Annals of human genetics
IF:1.0Q4
DOI:10.1111/ahg.70039
PMID:42032825
|
研究论文 | 通过多组学孟德尔随机化整合分析,识别PSMA4作为动脉粥样硬化的潜在治疗靶点 | 首次利用多组学孟德尔随机化框架,整合GWAS、eQTL、mQTL和sQTL数据,系统鉴定并验证PSMA4作为动脉粥样硬化的遗传因果治疗靶点,并通过单细胞RNA测序揭示其在斑块免疫细胞中的高表达 | 研究基于欧洲人群数据,种族多样性有限;MR和共定位分析虽支持因果关系,但无法完全排除残余混杂;药物预测仍需体外和体内实验验证 | 鉴定新的、受遗传支持的动脉粥样硬化治疗靶点 | 动脉粥样硬化患者与对照人群的血液、组织样本及动脉粥样硬化斑块 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | GWAS, eQTL, mQTL, sQTL, scRNA-seq | NA | 基因表达、甲基化、剪接变异、单细胞转录组 | 三个独立队列的cis-eQTL数据及外部AS数据集,具体样本量未详述 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA |
| 711 | 2026-06-26 |
Ythdf2 loss in microglia aggravates ischemic retinopathy by increasing microglia activation and microvascular anomalies
2026-Jul, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.10.024
PMID:41627954
|
研究论文 | 揭示小胶质细胞中Ythdf2缺失通过增加小胶质细胞活化和微血管异常加剧缺血性视网膜病变的机制 | 首次探索m6A阅读蛋白Ythdf2在视网膜小胶质细胞中的作用及其在视网膜血管病变中的调控机制 | 未明确提及限制性 | 研究Ythdf2在小胶质细胞中的作用及其在视网膜血管病变中的参与,并揭示其调控机制 | 小胶质细胞Ythdf2及视网膜微血管 | 机器学习 | 缺血性视网膜病变 | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 氧诱导视网膜病变(OIR)小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 712 | 2026-06-26 |
Mouse, Pig, and Human Atherosclerotic Lesions Have Common and Distinct Mesenchymal Cell Populations
2026-Jul, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323640
PMID:42165148
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序整合分析小鼠、猪和人类的动脉粥样硬化病变,发现共有和特有的间充质细胞群体 | 首次跨物种整合分析小鼠、猪和人类动脉粥样硬化斑块中的间充质细胞异质性,揭示了保守的间充质细胞连续体及多种物种特异性亚群(如DLX5和RERGL标记的平滑肌细胞亚群仅存在于人类颈动脉和冠状动脉斑块) | 未明确提及但隐含限制包括:不同物种间细胞状态的功能验证不足;仅分析了特定血管床和病变阶段,可能无法完全覆盖疾病全貌 | 比较小鼠和猪实验性动脉粥样硬化病变中复杂的间充质细胞群体与人类临床斑块的异同 | 来自人类颈动脉和冠状动脉、猪主动脉和冠状动脉、以及小鼠头臂动脉的动脉粥样硬化病变样本 | 数字病理学、单细胞组学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 整合了人类、猪和小鼠多个动脉样本的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 713 | 2026-06-26 |
Epigenetic Regulation of the Epstein-Barr Virus Latent-Lytic Switch
2026-Jul, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.71031
PMID:42345494
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综述 | 综述爱泼斯坦-巴尔病毒潜伏-裂解转换的表观遗传调控机制 | 整合全基因组CRISPR筛选、单细胞转录组学和整合多组学分析的最新进展,揭示表观遗传抑制、转录控制、代谢适应和免疫微环境信号如何协同调控潜伏-裂解转换的分子逻辑 | 未提及具体限制 | 总结EBV潜伏-裂解转换的表观遗传调控新发现及其对治疗方法的启示 | 爱泼斯坦-巴尔病毒(EBV)的潜伏-裂解转换过程 | 机器学习 | EBV相关恶性肿瘤 | 全基因组CRISPR筛选、单细胞转录组学、整合多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、多组学 | NA | NA |
| 714 | 2026-06-26 |
Epigenetic-Genetic Crosstalk at the Cancer-Diabetes Interface: Convergent Molecular Pathways, Multi-Omics Biomarkers, and Dual Therapeutic Targets
2026-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202602229R
PMID:42313898
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综述 | 该综述系统探讨了癌症与糖尿病之间的表观遗传-遗传互作,揭示了常见的分子通路、多组学生物标志物及双重治疗靶点 | 从表观遗传与遗传互作的新视角,整合多组学技术(如单细胞测序和人工智能),深入分析癌症与糖尿病的共同分子机制,并提出双重治疗靶点的概念 | 未提及具体局限性,但综述性质意味着可能缺乏原始实验数据验证 | 揭示癌症与糖尿病共有的分子通路和生物标志物,为两者共同治疗策略提供理论基础 | 癌症与糖尿病的分子通路、表观遗传修饰(DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA失调)及相关风险因素(肥胖、慢性炎症、氧化应激) | 机器学习, 数字病理学 | 癌症, 糖尿病 | 多组学技术, 单细胞测序 | na | 多组学数据 | na | na | 单细胞RNA测序 | na | na |
| 715 | 2026-06-26 |
Integrating Machine Learning and Single-Cell Analysis to Reveal the Diagnostic and Therapeutic Value of Regulated Cell Death Mechanisms in Hepatocellular Carcinoma
2026-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202504703R
PMID:42338358
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研究论文 | 结合机器学习和单细胞分析,揭示调控细胞死亡机制在肝细胞癌中的诊断和治疗价值 | 构建了一个基于调控细胞死亡相关基因的预后模型RCDI,并通过单细胞RNA测序验证其与肿瘤微环境异质性和免疫检查点分子的关联 | NA | 开发有效的预后模型,以准确预测肝细胞癌患者预后并指导靶向治疗决策 | 肝细胞癌患者的多队列转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 多队列数据(TCGA, GSE14520, ICGC)和单细胞数据(GSE149614) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 716 | 2026-06-26 |
Targeting NOX4 with Quercetagetin-PLGA nanomaterials: a novel therapeutic strategy for Alzheimer's disease
2026-Jun-25, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05599-w
PMID:42343047
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研究论文 | 针对阿尔茨海默病中NOX4驱动的氧化损伤和槲皮万寿菊素生物利用度低的问题,开发了靶向α7烟碱型乙酰胆碱受体的槲皮万寿菊素PLGA纳米载体 | 首次将槲皮万寿菊素PLGA纳米载体与α7-nAChR靶向结合,用于抑制NOX4并实现神经保护,通过单细胞RNA测序和伪时间分析揭示NOX4在少突胶质细胞和内皮细胞中的表达模式 | 缺乏体内验证、非靶向对照、药物暴露标准化及关键制剂参数(如包封效率),脑靶向和转化潜力受限于体外发现 | 开发靶向NOX4的槲皮万寿菊素纳米递送系统,治疗阿尔茨海默病 | NOX4基因、槲皮万寿菊素、α7-nAChR受体、PLGA纳米载体 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、LASSO回归、双乳液法纳米制备、蛋白质印迹、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、图像、流式细胞数据 | GSE97760数据集;Aβ诱导的HT-22神经元损伤模型中的体外实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 717 | 2026-06-26 |
Macrophage-Mediated Mechanisms of Vascular Remodeling in Arteriovenous Malformations
2026-Jun-25, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323163
PMID:42345097
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综述 | 本文综述了巨噬细胞在动静脉畸形中通过介导血管重塑的机制,并探讨了其潜在的研究方向 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了动静脉畸形组织中巨噬细胞的异质性及其对内皮细胞信号通路的直接调控作用,为理解巨噬细胞在动静脉畸形病理生理学中的作用提供了新的视角 | 目前对巨噬细胞如何具体参与动静脉畸形起始和进展的机制理解仍不充分,现有证据主要基于临床样本和动物模型,尚缺乏完整的机制解析 | 阐明巨噬细胞在动静脉畸形血管重塑中的介导机制,并指出未来研究方向 | 动静脉畸形病理组织中的巨噬细胞及其与内皮细胞的相互作用 | 机器学习 | 动静脉畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 临床动静脉畸形样本(具体数量未在摘要中提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 718 | 2026-06-26 |
A cell atlas of the developing human outflow tract of the heart and its adult aortic valve derivatives
2026-Jun-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.107748
PMID:42345287
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研究论文 | 对心脏流出道(OFT)发育过程及其成年主动脉瓣衍生物进行单细胞和空间转录组分析 | 首次在胚胎和胎儿两个时间点以及成年主动脉瓣中提供OFT的全面转录组数据,并利用空间转录组学确定细胞群分布,发现胚胎特征在成人细胞中持续存在,可用于追溯大时间尺度细胞间的关系 | 文中未明确提及研究的局限性 | 定义人类心脏流出道发育及其成年衍生物的细胞和分子特征,以理解先天性心脏缺陷并推动再生医学发展 | 人类心脏流出道(胚胎期和胎儿期)及其成年主动脉瓣衍生物 | 数字病理学 | 先天性心脏缺陷 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 单细胞调控网络推断模型(如SCENIC) | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 人类胚胎期、胎儿期心脏流出道组织样本及成年主动脉瓣样本,具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 719 | 2026-06-26 |
SegJointGene: joint cell segmentation and spatial gene prioritization by information entropy guided convolutional neural networks
2026-Jun-25, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag447
PMID:42345533
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研究论文 | 提出了SegJointGene,一种通过信息熵引导卷积神经网络联合进行细胞分割和空间基因优先级排序的深度学习框架 | 首次将信息熵引导的卷积神经网络与计算信息丢弃评分相结合,实现细胞类型特异性分割的重要基因识别,并迭代优化基因优先级和细胞边界 | 复杂组织中基于核染色的分割不够准确,基因优先级排序仍面临计算挑战 | 开发一种能整合分子信息以改善细胞分割和空间基因优先级排序的方法 | 小鼠海马体、全脑不同区域的空间转录组数据以及人类扁桃体的空间蛋白质组数据 | 深度学习, 计算机视觉 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | 卷积神经网络 | 图像, 基因表达数据 | 包含模拟数据集和多个真实空间数据集,具体样本数量不详 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 720 | 2026-06-26 |
Plant Phosphatidylinositol Signalling Network in Cotton Resistance to Verticillium Wilt
2026-Jun-25, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70701
PMID:42347818
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综述 | 本文综述了磷脂酰肌醇信号网络在棉花抗黄萎病中的作用机制 | 系统揭示了棉花中保守的磷脂酰肌醇信号通路如何形成调控网络赋予抗病性,并强调了棉花特有的调控节点如GhPIP5K9a和GhPLDδ酶的作用 | 未提及具体局限性,但可能因主要基于模式植物拟南芥的比较研究,棉花中特定调控节点的功能验证尚不充分 | 阐明磷脂酰肌醇信号通路在棉花抗黄萎病中的调控网络 | 棉花以及模式植物拟南芥 | 机器学习 | 棉花黄萎病 | 磷酸化蛋白质组学、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |