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当前共找到 38991 篇文献，本页显示第 701 - 720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2026-04-25 |
Multiomics immune profiling of a patient-relevant orthotopic lung cancer model using SEPARATE-Seq
2026-Apr-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72247-5
PMID:42026061
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研究论文 | 利用SEPARATE-Seq技术对与患者相关的原位肺癌模型进行多组学免疫分析 | 开发了一种可注射的原位肺腺癌模型，结合SEPARATE-Seq和空间转录组学，实现了血管内和血管外免疫细胞的分离及空间定位分析 | 未提及 | 建立更贴近人类肺癌患者的临床前小鼠模型，并利用多组学方法全面解析其肿瘤免疫微环境 | 原位肺腺癌小鼠模型中的肿瘤及非肿瘤相邻组织中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | SEPARATE-Seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 小鼠模型，具体样本数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 702 | 2026-04-25 |
Oocyte-specific acylglycerol kinase loss leads to infertility in mice via mitochondrial dysfunction
2026-Apr-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10073-7
PMID:42026151
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研究论文 | 通过卵母细胞特异性敲除AGK的小鼠模型，揭示AGK缺失导致线粒体功能障碍，进而引起不孕 | 首次在卵母细胞中揭示AGK通过维持线粒体功能调控卵泡发育及卵母细胞成熟，并识别AGK为女性不孕的潜在诊断标志物和治疗靶点 | 未在人类卵母细胞中验证AGK功能，且机制探索主要依赖转录组和代谢组学，缺乏更直接的蛋白互作或信号通路验证 | 探究AGK在卵母细胞发育及卵巢功能中的作用，并为女性不孕提供潜在生物标志物和治疗靶点 | 卵母细胞特异性敲除Agk的小鼠 | 机器学习 | 女性不孕 | 单细胞RNA测序、空间代谢组学 | NA | 基因表达数据、代谢物数据 | 卵母细胞特异性Agk敲除小鼠样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间代谢组学 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序使用10x Chromium平台，空间代谢组学未指定具体产品 |
| 703 | 2026-04-25 |
Geometry-aware graph attention networks to explain single-cell chromatin states and gene expression with SEAGALL
2026-Apr-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04066-2
PMID:42026624
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研究论文 | 提出SEAGALL深度学习方法，基于几何正则化自编码器和可解释图注意力网络，量化分子特征对细胞表型的影响 | 首次将几何正则化自编码器与可解释图注意力网络结合，用于揭示驱动细胞身份的分子特征，超越传统差异标志基因分析 | 未提及具体局限性 | 解释单细胞染色质状态和基因表达，量化分子特征对细胞表型的影响 | 单细胞测序数据中的细胞身份和分子特征 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 几何正则化自编码器，可解释图注意力网络 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 704 | 2026-04-25 |
Trajectory-guided dimensionality reduction for multi-sample single-cell RNA-seq data reveals biologically relevant sample-level heterogeneity
2026-Apr-22, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag192
PMID:42024616
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研究论文 | 提出一种名为MUSTARD的轨迹引导降维方法，用于多样本单细胞RNA-seq数据，以揭示具有生物学意义的样本异质性 | 创新性地将伪时间信息整合到降维过程中，同时捕获沿伪时间轨迹和跨多个样本的主要基因表达变异模式，实现无监督的样本异质性发现 | 尚未明确讨论方法在高度复杂或大规模数据集上的计算效率及参数敏感性 | 开发适用于多条件单细胞RNA-seq数据的轨迹引导降维方法，以发现样本异质性及其相关基因标记 | 多条件单细胞RNA-seq数据中的生物样本 | 机器学习 | 新冠肺炎、结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个新冠肺炎数据集和一个结核病数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 705 | 2026-04-25 |
Immune modulation promotes heart regeneration through macrophage and Granulin functions in medaka
2026-Apr-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2524705123
PMID:41980096
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research paper | 本研究通过bulk和单细胞转录组学结合功能实验，探究免疫调节如何通过巨噬细胞和颗粒蛋白前体功能加速非再生性的青鳉心脏修复 | 首次揭示免疫调节通过重塑巨噬细胞功能状态以促进心脏再生的机制，并发现巨噬细胞相关的颗粒蛋白前体表达与再生结局的关联 | 研究限于青鳉模型，未在哺乳动物中验证，且未完全明确巨噬细胞亚群特异的再生机制 | 探究免疫调节在促进心脏再生中的作用及其分子机制 | 非再生性的青鳉 | machine learning, 数字病理学 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 杂交链式反应空间分析 | NA | 转录组数据 | 青鳉心脏样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 706 | 2026-04-25 |
Clonal analysis for understanding fate biases in developing embryos
2026-Apr-21, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2026.102475
PMID:42025228
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综述 | 本文综述了利用克隆分析理解发育胚胎中命运偏倚的实验与计算方法 | 强调空间和基于扰动的策略在克隆生物学中的新兴应用 | 未明确提及局限性 | 总结当前用于理解发育胚胎中克隆多样性的前沿实验与计算方法 | 发育胚胎中的多能祖细胞及其命运偏倚 | 机器学习和数字病理学 | NA | 谱系追踪、单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 707 | 2026-04-25 |
Single-cell transcriptomic analysis unveils dysregulated macrophage-podocyte crosstalk in membranous nephropathy
2026-Apr-21, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2026.106958
PMID:42025748
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示膜性肾病中巨噬细胞与足细胞通讯失调的机制 | 首次构建膜性肾病单细胞转录组图谱，发现并验证了致病性巨噬细胞-足细胞轴的双重失衡机制 | 基于小鼠模型，结果是否完全适用于人类膜性肾病需要进一步验证 | 解析膜性肾病中驱动肾损伤的细胞网络机制 | 阳离子牛血清白蛋白诱导的膜性肾病小鼠模型肾细胞 | 数字化病理学 | 膜性肾病 | scRNA-seq, 细胞通讯分析(CellChat) | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肾组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 708 | 2026-04-25 |
Exploring the toxicological impact of perfluorooctanoic acid and perfluorooctane sulfonate on glioblastoma through network toxicology, machine learning, and multi-dimensional bioinformatics analysis
2026-Apr-21, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
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研究论文 | 通过综合网络毒理学、机器学习及单细胞RNA测序等多维度生物信息学分析，探究全氟辛酸（PFOA）和全氟辛烷磺酸（PFOS）对胶质母细胞瘤（GBM）的毒理学影响 | 首次结合网络毒理学、机器学习、免疫浸润分析、单细胞RNA测序、分子对接、孟德尔随机化和分子动力学模拟多种方法，系统揭示PFOA/PFOS在GBM中的潜在毒理学靶点与分子机制，并提出新的不良结局路径框架 | 仍需进一步机制研究验证；基于公开数据集的生物信息学分析，可能受数据质量和样本量限制 | 探索PFOA和PFOS对胶质母细胞瘤的毒理学靶点及分子机制 | PFOA/PFOS暴露与胶质母细胞瘤的关联 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 网络毒理学, 机器学习, 单细胞RNA测序, 分子对接, 孟德尔随机化, 分子动力学模拟 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 三个外部独立数据集（具体数量未在标题和摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 709 | 2026-04-25 |
Macrophage heterogeneity governs the balance between fibrosis and tissue protection in systemic sclerosis
2026-Apr-20, Clinical and experimental rheumatology
IF:3.4Q2
DOI:10.55563/clinexprheumatol/kfkfod
PMID:42024552
|
综述 | 本文综述了巨噬细胞异质性如何超越传统的M1/M2范式，作为连接血管损伤、免疫失调和成纤维细胞介导纤维化的“纤维-免疫轴”的核心调控因子，在系统性硬化症（SSc）及其间质性肺病（SSc-ILD）中发挥作用 | 利用单细胞RNA测序和空间多组学技术，揭示了SSc组织中不同巨噬细胞亚群（如SPP1+、FCGR3A+、TREM2+）的独特角色和功能，并发现“纤维化生态位”中巨噬细胞与成纤维细胞的致病性互作机制，为靶向治疗提供了新视角 | 对时间动态变化和空间信号分辨率的研究仍存在挑战 | 阐明巨噬细胞异质性在系统性硬化症进展中的核心作用，为开发机制导向的治疗策略奠定基础 | 系统性硬化症患者及其间质性肺病中的巨噬细胞亚群 | 机器学习 | 肺病 | 单细胞RNA测序、空间多组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 710 | 2026-04-25 |
Single-cell transcriptomic atlas of shrimp hepatopancreas reveals an endoplasmic reticulum stress-dependent immune response to Vibrio parahaemolyticus infection
2026-Apr-16, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2026.111364
PMID:42000089
|
研究论文 | 利用单细胞核测序技术构建了凡纳滨对虾肝胰腺响应副溶血弧菌感染的细胞图谱，揭示了内质网应激依赖性免疫反应 | 首次通过单细胞核测序技术绘制虾类肝胰腺的细胞图谱，并发现内质网应激在甲壳动物抗菌免疫中的关键作用，提示免疫调节机制的进化保守性 | 未提及具体局限性，但可能包括样本量有限、缺乏功能验证实验以及对免疫反应动态变化的时间分辨率不足 | 探究甲壳动物肝胰腺在细菌感染下的单细胞免疫响应机制 | 凡纳滨对虾（Litopenaeus vannamei）肝胰腺细胞 | 数字病理学 | 细菌感染 | 单细胞核测序（snRNA-Seq）、Western blot、免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据 | 超过20000个高质量细胞 | NA | 单细胞核RNA测序 | NA | NA |
| 711 | 2026-04-25 |
Protocol for isolating stromal cells from lymphoid tissue for performing scRNA-seq
2026-Apr-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104501
PMID:41989919
|
protocol | 提供从淋巴组织中分离基质细胞以进行单细胞RNA测序的协议 | 专门针对低丰度基质细胞（占比小于2%）的分离和纯化步骤优化 | 未提及 | 建立从淋巴组织中纯化成纤维细胞用于单细胞RNA测序分析的标准化流程 | 淋巴组织中的基质细胞（成纤维细胞） | NA | NA | scRNA-seq | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 712 | 2026-04-25 |
Transcriptomic and single-cell analyses reveal the prognostic value of ETV4 and its role in shaping the immune landscape of colorectal cancer
2026-Apr-15, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102775
PMID:41997046
|
研究论文 | 通过转录组和单细胞分析揭示了ETV4在结直肠癌中的预后价值及其通过诱导M2巨噬细胞极化重塑免疫微环境的作用 | 首次综合转录组和单细胞RNA测序数据，明确ETV4通过WNT/β-catenin通路调控，促进M2型巨噬细胞极化，进而塑造结直肠癌免疫抑制微环境 | 未在更大规模独立队列中验证，且ETV4与其他免疫细胞亚群的直接相互作用机制尚需进一步探索 | 研究ETV4在结直肠癌中的预后价值及其对肿瘤免疫微环境的影响机制 | 结直肠癌肿瘤组织及HCT-116细胞系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫组化, Q-PCR, Western blot | CIBERSORT, GSVA, GSEA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 650例CRC肿瘤组织和51例癌旁正常组织（TCGA队列） | NA | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 713 | 2026-04-25 |
Identification of tissue plasminogen activator (PLAT) as a potential target linking osteoarthritis and psoriasis: Integrated bioinformatics analysis and molecular dynamics simulation
2026-Apr-15, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152038
PMID:41997321
|
研究论文 | 通过整合生物信息学分析和分子动力学模拟，识别组织型纤溶酶原激活剂（PLAT）作为连接骨关节炎和银屑病的潜在共同靶点 | 首次通过多组学整合策略（WGCNA、机器学习、单细胞RNA测序）结合分子动力学模拟和体外体内实验，发现PLAT是骨关节炎和银屑病共病的潜在分子靶点，并鉴定核黄素为其候选配体 | 研究主要基于计算分析和有限实验验证，PLAT作为共同靶点的临床相关性尚需进一步验证；核黄素的抑制作用仅通过体外实验和分子模拟支持，缺乏体内药效学数据 | 识别骨关节炎和银屑病之间的共同分子机制和潜在治疗靶点 | 骨关节炎和银屑病相关的基因表达数据、单细胞转录组数据、C28/I2细胞、ACLT+MMx小鼠骨关节炎模型 | 生物信息学 | 骨关节炎, 银屑病 | WGCNA, LASSO, 随机森林, 人工神经网络, 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟, MM/PBSA结合自由能计算, RT-qPCR, CCK-8实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 骨关节炎和银屑病的公共转录组数据集（具体样本数未详述） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 714 | 2026-04-25 |
Advances and limitations in angiogenesis assays: Integrating in vitro, in vivo, and emerging technologies
2026-Apr-13, Vascular pharmacology
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.vph.2026.107607
PMID:41985854
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综述 | 该综述综合探讨了血管生成实验方法的进展与局限，包括体外、体内模型及前沿技术整合，并提供了基于应用驱动的决策框架 | 创新点在于引入综合决策矩阵和算法选择指南，平衡生理保真度、实验约束与3R伦理原则，实现个性化实验设计 | 依赖现有技术综述，未涉及实际实验验证；技术整合的长期有效性尚未评估 | 提供血管生成实验方法的选择框架，优化实验设计的可重复性与转化相关性 | 血管生成实验技术，包括体外、体内模型及新兴技术 | 机器视觉 | NA | NA | NA | 图像、文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 715 | 2026-04-11 |
Integrating machine learning and spatial transcriptomics uncovers shared immunomodulatory deubiquitinases in MAFLD and HCC
2026-Apr-10, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-026-02833-6
PMID:41961303
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 716 | 2026-04-25 |
Linking Genetic Risk to Disease-Relevant Cellular States via Metacell-Informed Modeling with ICePop
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.01.715877
PMID:41959181
|
研究论文 | 提出ICePop框架，通过元细胞分辨率进行疾病-细胞类型关联分析，平衡统计功效与异质性检测能力 | 首次实现元细胞分辨率下进行疾病-细胞类型关联分析，在保持细胞类型级别统计功效的同时检测细胞类型内部的异质性疾病信号 | 依赖单细胞转录组数据质量和注释准确性，对罕见细胞状态的检测可能受样本量限制 | 解决GWAS关联信号向特定细胞状态映射的挑战，建立遗传风险与细胞状态的因果关系 | 81种性状和120种细胞类型（Tabula Muris数据集），包括肠道上皮细胞、肺毛细血管内皮细胞、肠神经元等 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎、自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | ICePop（元细胞建模框架） | 单细胞转录组数据 | Tabula Muris数据集（包含多种组织类型） | 未提及 | 单细胞RNA-seq | 未提及 | NA |
| 717 | 2026-04-25 |
Targeting TPO/MPL Signaling to Mitigate JAK2V617F-driven Cardiac Microvascular Disease
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.01.715884
PMID:41959476
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research paper | 本研究利用JAK2V617F突变嵌合小鼠模型，结合单细胞RNA测序等技术，揭示了靶向TPO/MPL信号通路可缓解JAK2V617F驱动的心脏微血管疾病 | 首次发现MPL主要在心内膜内皮细胞中表达，并证明TPO/MPL信号是JAK2V617F相关心血管并发症中可靶向的关键通路 | 未明确说明 | 探究JAK2V617F突变血细胞驱动心脏微血管功能障碍的机制及TPO/MPL信号的作用 | JAK2V617F突变嵌合小鼠模型及高脂高胆固醇饮食诱导的心脏代谢应激 | machine learning | cardiovascular disease | single-cell RNA sequencing, bone marrow transplantation | NA | gene expression data | 嵌合小鼠（实验组与对照组） | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 718 | 2026-04-25 |
RNA m6A methylation regulates CDH6 to promote epithelial-to-mesenchymal transition in cholangiocytes of biliary atresia
2026-Apr, Journal of pediatric surgery
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.jpedsurg.2025.162492
PMID:40774478
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research paper | 本研究探讨了RNA m6A甲基化通过调控CDH6促进胆道闭锁胆管细胞上皮-间质转化的机制 | 首次揭示了m6A甲基化通过METTL3/YTHDF2轴调控CDH6表达，进而促进胆道闭锁胆管细胞上皮-间质转化的新机制 | 研究主要基于公开单细胞RNA测序数据集和体外实验，缺乏体内动物模型验证及临床样本的大规模验证 | 探究m6A修饰在胆道闭锁胆管细胞上皮-间质转化中的参与作用及其机制 | 胆道闭锁患者的胆管细胞 | machine learning | 胆道闭锁 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, RNA免疫沉淀 | NA | 单细胞RNA测序数据, RNA-seq数据 | 公开单细胞RNA测序数据集HRA003163 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 719 | 2026-04-25 |
Dissecting antibody-mediated natural killer cell effects reveals a cytotoxic CX3CR1+KLRC2-CD16hi subset linked to hepatitis B virus outcomes
2026-Apr, Clinical and molecular hepatology
IF:14.0Q1
DOI:10.3350/cmh.2025.0842
PMID:41414761
|
研究论文 | 本研究揭示了慢性乙肝病毒感染中抗体介导的自然杀伤细胞效应，并鉴定出一个具有细胞毒性的CX3CR1+KLRC2-CD16hi NK细胞亚群与乙肝病毒结局相关 | 首次发现并表征了CX3CR1+KLRC2-CD16hi NK细胞亚群在抗体介导的NK细胞效应中的重要作用，并揭示了其在慢性乙肝病毒感染不同疾病阶段和抗病毒治疗中的动态变化 | 主要基于体外实验和患者队列分析，缺乏体内功能验证；机制研究有待深入；样本量有限 | 研究慢性乙肝病毒感染中抗体介导的NK细胞效应的动态变化及不同NK细胞亚群的参与 | 慢性乙肝病毒感染患者的外周血和肝脏NK细胞 | NA | 慢性乙肝病毒感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 横断面和纵向队列的慢性乙肝患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 720 | 2026-04-25 |
Pre-operative risk assessment of hepatocellular carcinoma recurrence in liver transplant recipients by non-invasive detection of pre-existing genetic lesions
2026-Apr, Clinical and molecular hepatology
IF:14.0Q1
DOI:10.3350/cmh.2025.1069
PMID:41668289
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研究论文 | 基于非侵入性检测肝细胞癌肝移植患者术前遗传学改变预测复发风险 | 通过整合cfDNA拷贝数变化信号与单细胞转录组数据，追溯复发相关cfDNA来源，并建立基于CNA片段和肿瘤标志物的ZJU标准，实现术前精准风险分层 | 未明确提及 | 开发基于液体活检的术前风险分层模型，预测肝细胞癌肝移植后复发风险 | 260名来自三个中心的肝细胞癌患者 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 低覆盖全基因组测序、全外显子测序、单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 血浆cfDNA测序数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 260名肝细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |